生物信息学ATAC

python的UML类图自动生成工具--pyreverse安装和使用

是常用的用来分析Python代码和类关系的工具将两者结合起来使用可以绘制Python的UML类图1.linux环境下graphviz安装graphviz是一个开源做图软件，她能画结构化的抽象和网络图形，在网络，生物信息学
zhnlion·2020-08-21 10:17

ATAC-Seq入门加高阶传送门

最近看到小伙伴们很希望看到完整的ATAC-Seq分析教程，甚至在某群里呼吁众筹。
六六_ryx·2020-08-20 19:36

Linux入门1：远程登录服务器

然而，在常规的生物信息学
曹务强·2020-08-20 14:17

生物信息学 第一课 什么是生物信息学

什么是生物信息学?
weixin_30539835·2020-08-20 12:37

中国人终于拥有自己的综合性基因组数据库！

生物科班出身，后专攻生物信息学，已不下十年。
基因空间·2020-08-20 11:33

生物信息学相关网站

生物信息学与生物计算：http://bioinformatics.weizmann.ac.il/这是生物信息学和生物计算学的网站，由Weizmann科学研究所，生物服务部和Crown人类基因组学中心支持
weixin_33904756·2020-08-20 08:23

2018-12-02

突然之间被加进实验室，而且方向还是生物信息学，有点不知所措。自己最开始感兴趣的是深度学习，但是实验室没有这方面的项目，便投了机器学习和数据挖掘，现在回想觉得自己没投图像分析有点傻，但是又不敢去反悔。
渣叉子·2020-08-19 09:11

“突发性死亡”的终结者

该论文在2017年IEEE生物信息学和生物医学国际会议上获得最佳学习论文奖。改善住院病人临终关怀的质量是医疗保健机构的首要任务。
阿里云云栖号·2020-08-19 07:38

#3D基因组 #表观遗传

本篇简单介绍3D基因组在近期主流的两个获得数据的手段：Hi-C及ATAC-seq。
土豆_leah·2020-08-18 23:04

ATAC-seq基础知识（资源整理）

ATAC-seq全名AssayforTransposaseAccessibleChromatinwithhigh-throughputsequencing(基于高通量测序的染色质转座酶可接近性实验)，该技术使用改造后的
皈依yyy·2020-08-18 23:55

Nomogram（诺莫图） | Logistic、Cox生存分析结果可视化

本文首发于“生信补给站”公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/BWpy3F-nEKXCdVXmY3GYZg当然还有更多R语言，生物信息学相关知识。。。?
生信补给站·2020-08-18 12:22

关联规则

今天，关联规则已广泛应用于金融、营销以及生物信息学等领域。2、概念1）基本概念：项集：一个或多个项目的集合。例如:{Milk,Bread,Diaper}，包含k个项目的项集称为k-
aizhouqian5537·2020-08-18 10:01

图计算系统小调研

一.费马科技五篇知乎文图计算系统发展简史https://zhuanlan.zhihu.com/p/83202666社交网络分析、网页排序、社区发现、天体物理学、计算化学、生物信息学、超大规模集成电路的设计
叶子心情你不懂·2020-08-18 09:07

【LeetCode】Longest Common Subsequence最长公共子序列（求出某一解+LCS长度） - Medium

该问题是典型的计算机科学问题，是文件差异比较程序的基础，在生物信息学中也有所应用。•https://en.wikipedia.org/wiki/Lon
Lindsay.Lu丶·2020-08-17 23:00

免疫组库数据分析||immunarch教程：快速开始

immunarch是一个R包，旨在成为分析T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的工具箱，主要针对医学科学家和生物信息学家。
周运来就是我·2020-08-17 21:44

基于线性支持向量机的深度学习

2015-2摘要最近，全连接神经网络和卷积神经网络在语音识别、图像分类、自然语言处理和生物信息学等广泛地任务中实现了最先进的性能。
七度银尘·2020-08-17 16:15

用动态规划法求解生物信息学中DNA序列比对的问题 （交叉学科应用实验）

#include#include#includeusingnamespacestd;stacks;//当前搜索路径的LCSstacklcs[100];//所有的LCSintcount=0;//记录LCS的数量boollcs_have_exist(stacklcs[],intcount,stacks){//判断当前搜索的LCS是否已存在于stack_lcs[MAX]inti;boolexist=fa
Hugo_scnu·2020-08-15 12:18

NCBI组学数据上传流程

论文发表之前我们常常会有递交测序数据到NCBI的需求，这些数据例如：基因组，转录组，ChIP-seq，ATAC-seq，基因组注释文件，三代测序原始数据等都有不同的NCBI子数据库将其收集。
王忙·2020-08-13 15:58

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十二章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
xuzhougeng·2020-08-13 14:51

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十一章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
xuzhougeng·2020-08-13 14:41

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第九章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
xuzhougeng·2020-08-13 14:30

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
xuzhougeng·2020-08-13 14:21

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第八章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
xuzhougeng·2020-08-13 14:07

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第七章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
xuzhougeng·2020-08-13 14:54

代谢工程的相关术语

基因组注释基因组注释(Genomeannotation)是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前功能基因组学研究的一个热点。
玖零猴·2020-08-11 19:58

高通量数据中批次效应的鉴定和处理（六）- 直接校正表达矩阵

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述
生信宝典·2020-08-11 17:07

「R」ggplot2拼图包patchwork推荐与使用

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述
生信宝典·2020-08-11 17:07

学习全基因组测序数据分析2：FASTA和FASTQ

黄树嘉写了WGS系列的文章，堪称教科书级别的生物信息学习材料。虽然本平台只关注宏基因组领域，但此系列文章知识体系完善、干货满满，是值得每位专门从事二代测序数据分析人员必读材料。
刘永鑫Adam·2020-08-11 14:45

【算法】动态规划：适合新手的动态规划入门常见题目详解

题目练练手1.斐波那契数列2.爬楼梯3.最大连续子数组和4.打家劫舍一、什么是动态规划1.官方定义动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的
Moo_Lavender·2020-08-10 12:47

R语言交互式可视化包CanvasXpress

2014年在中科院遗传发育所获生物信息学博士学位，2016年博士后出站留所工作，任宏基因组学实验室工程师，目前主要研究方向为宏基因组学数据分析方法、培养组学方法优化。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:59

宏基因组分析教程-Analysis of Metagenomic Data

加拿大生信网加拿大安大略研究所建立的生物信息网(https://bioinformatics.ca/)，每年组织多场生物信息学线下培训，并线上共享培训资料。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:27

ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源编者按：数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:24

基因组注释1. 重复序列repeatmasker, trf

本文转自“美格基因”,已获授权基因组注释（Genomeannotation）是利用生物信息学方法和工具，对基因组所有基因和其他结构进行高通量注释。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:47

学习全基因组测序数据分析1：测序技术

黄树嘉写了WGS系列的文章，堪称教科书级别的生物信息学习材料。虽然本平台只关注宏基因组领域，但此系列文章知识体系完善、干货满满，是值得每位专门从事二代测序数据分析人员必读材料。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:46

QIIME 2教程. 30补充资源SupplementaryResources(2020.2)

文章目录前情提要补充资源Supplementaryresources教学内容Educationalcontent应用生物信息学导论肠道检查：探索身体中的微生物群系微生物生态学统计分析指南译者简介Reference
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:43

QIIME 2教程. 28社区Community(2020.2)

CommunityPluginSupport一般讨论GeneralDiscussion开发人员讨论DeveloperDiscussion社区贡献CommunityContributions公告内容Announcements其他生物信息学工具
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:43

众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人...

微生物组的数据分析和解读需要微生物学、生物信息学、统计学、Shell和R语言、宏基因组学等多学科的知识，无论是中国还是世界范围内仍缺少系统的学习教材。
刘永鑫Adam·2020-08-07 23:22

图形化开放式生信分析系统开发 - 1 需求分析及技术实现V2（2020.7更新）

工作的原因接触到了NGS（高通量测序技术High-throughputsequencing又称“下一代”测序技术"Next-generation"sequencingtechnology）技术和相关的生物信息学分析
Sliverworkspace.com·2020-08-07 20:23

生物信息学练习题-亚磊

ANNOROAD0922生物信息学练习题一、data/newBGIseq500_1.fq和data/newBGIseq500_2.fq中是基于BGIseq500测序平台的一种真核生物基因组DNA的PE101
ANNOROAD·2020-08-07 11:07

数据结构之动态规划问题

希望对读者朋友也能有帮助，文章基本框架如下：什么是动态规划小偷的背包问题LeetCode刷题什么是动态规划定义动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的
小詹学 Python·2020-08-05 20:36

北京大学生物信息学-第二周-序列比对

序列比对中的基本概念Biology–Whatisthebiologicalquestionorproblem?Data–Whatistheinputdata?–Whatothersupportivedatacanbeused?Model–Howistheproblemformulatedcomputationally?–Or,what’sthedatamodel?Algorithm–Whatist
Leesuha·2020-08-05 12:11

北京大学生物信息学-第三周-序列数据库 BLAST

序列数据库Genbank是美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI)建立的DNA序列数据库，从公共资源中获取序列数据SRA（SequenceReadArchive）数据库是用于存储二代测序的原始数据，包括454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos和CompleteGenomics。除了原始
Leesuha·2020-08-05 12:38

矩阵连乘问题（从动态规划超详细解析）

动态规划1.概念动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法
JYpluto·2020-08-02 16:40

字符串匹配(BF,BM,Sunday,KMP算法解析)

字符串匹配算法有着很强的实用价值，应用于信息搜索，拼写检查，生物信息学等多个领域。
Linux_染尘·2020-08-01 13:32

2019年河北专接本生物信息学/康复治疗学专业分析

一、专业介绍生物信息学是一门以生物学、数学和信息科学为基础的交叉科学，它通过综合运用数学和信息科学等多领域的方法和工具对生物信息进行获取、加工、存储、分析和解释，来阐明大量生物数据所包含的生物学意义。
河北冠人教育·2020-08-01 07:18

自学生信Python（第十一天）|如何写一个简单的蛋白质序列环的预测程序

写在前面的话：本人是一枚生物学的学生，由于对生物信息学特别感兴趣，于是想自学生物信息学（新手莫怪）。了解到生物信息学要有编程基础，尤其是要会一门编程语言，例如：R语言、Python、Perl等
天明豆豆·2020-08-01 05:51

机器学习：决策树(四) —— sklearn决策树的使用及其可视化

它在网络、生物信息学、软件工程、数据库和网页设计、机器学习以及其他技术领域
JacksonKim·2020-07-31 23:53

转载ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析

转自：生信技能树这是目前发现不错的ATAC系列，原作者在也有更新https://www.jianshu.com/u/d5b900bea027ATAC系列连载：ATAC-Seq入门加高阶传送门（点击进入交流群
土豆学生信·2020-07-31 18:16

2019-3-18晨间日记

今天是什么日子起床：06:00就寝：23:58天气：晴心情：一般纪念日：无任务清单昨日完成的任务，最重要的三件事：周总结+计划肺癌专家共识思维导图跑步7km改进：习惯养成：周目标·完成进度一大：生物信息学
左大肚·2020-07-31 18:09

常用生物信息学格式介绍

前言更多内容，请访问我的个人博客。fastafasta（维基百科）格式是最基本的表示序列信息（核苷酸或者蛋白质）的格式。这里简单介绍下，fasta格式的文件通常后缀名为.fasta或者.fa，其实这都无所谓，因为都是文本文件。fasta格式文件（可以包含多条序列）中的一条序列的通常表示方法如下：>gi|129295|sp|P01013|OVAX_CHICKGENEXPROTEIN(OVALBUMI
潘高PG·2020-07-30 12:12
上一页 17 18 19 20 21 22 23 24 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他