生物信息学ATAC 第23页

生物信息 Python 库 - Dash Bio 究竟厉害在哪里？

翻译|Lemonbit来源|Plotly责编|胡巍巍推荐一个牛逼的生物信息Python库-DashBioDashBio是一个免费的开源Python库，用于生物信息学和药物开发应用。

CSDN资讯·2020-07-11 04:16

Graphviz 中文教程

在网络、生物信息学、软件工程、数据库和Web设计、机器学习、可视化接口等众多其他技术领域都有着重要的应用。

bluebird_shao·2020-07-11 02:08

【算法学习笔记】动态规划：解题思考步骤分析

动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。

NONAME7246·2020-07-10 23:44

Ubuntu 17.04安装后配置分析平台

这次准备安装Ubuntu17.04配置一个简单的R和Python分析的平台，用来做生物信息学一些简单的数据处理和分析的工作。笔记是个好东西，以后忘了可以便捷地查询。

王诗翔·2020-07-10 22:44

Ubuntu中安装Biopython

Biopython是Python的计算分子生物学和生物信息学工具包，它使得python在生物学数据处理中变得更加强大和高效，在Windows中安装biopython非常简单，下载之后，双击然后一路点下一步就可以了

XIUXIU179·2020-07-10 16:22

如何选择一门编程语言？

有很多方向可选，有什么数据库，编程语言和编译器，生物信息学，操作系统等。如果从语言来看，我目前对C，JAVA,Python很感兴趣。Javasc

Python之禅·2020-07-10 14:07

sam/bam格式说明

在生物信息学中尤其是高通量测序数据分析中，大部分的操作都是在实现短片段序列与参考序列的比对（mapping），比如bowtie等，这就涉及到如何使用一个统一的格式来表示这种mapping结果呢，sam（

xcaryyz·2020-07-10 12:53

我的生物信息之路

一个农业资源与环境专业的本科生，天天和瓶瓶罐罐打交道，半路被出家做土壤微生物生态，最大的难关就是生物信息学的学习，如今又被写文章的相关云云所缠绕，认为文章就像是一个婴儿，只有孕育到位了，自然就顺产下来了

刘永鑫Adam·2020-07-10 12:17

演讲稿丨李衍达沿着Simon开拓下去

因为我是做生物信息学的，对人工智能从生物信息学的角度有了一些领悟，所以想跟大家分享一下。

weixin_34206899·2020-07-10 08:56

使用Bioconda管理生信软件(以bwa为例)

miniconda的体积较小，但是能满足正常的生物信息学使用，如果你的网速较慢或者硬盘空间较小，可以优先选择此版本。

wangchuang2017·2020-07-10 03:00

重新认识TBtools，减少你的生信分析烦恼（20190422）

有的人觉得TBtools就是耽误了他们所谓的生物信息学习。有的人说，TBtools保了他们毕业。也有的人说，TBtools帮助了他发了文章更或者，TBto

生信札记·2020-07-09 23:07

基因组生物信息学实验（三）：基因组模拟测序（1）

基因组模拟测序（1）：主线的内容step1：方法通过NCBI的子库Genome获得YJM1386菌株的基因组测序数据。使用art系列软件中的art_illumina程序,对下载基因组序列进行测序平台为Hiseq2000的全基因组测序模拟5次,参数设置见下表。统计模拟结果,计算理论覆盖度(m)、丢失率和覆盖率。-l-f-m-s第一次100215010第二次100415010第三次100615010第

楚鸿·2020-07-09 19:51

QIIME 2教程. 29参考数据库DataResources(2020.2)

feature-classifie使用的分类学分类器标记基因参考数据库Greengenes(16SrRNA)数据库的各种版本及下载链接如下：Silva(16S/18SrRNA)数据库UNITE(fungalITS)数据库微生物组生物信息学评估

刘永鑫Adam·2020-07-09 00:17

2019年计算机、软件保研经历及LaTeX简历模板分享

计算机南京大学计算机清华大学计算法学浙江大学计算机个人总结简历模板个人情况本科学校与专业：华南技工大学软件工程排名：8/292四六级：594、538获奖情况：一次国奖，其余都是水水的acm经历：无科研经历：有生物信息学及机器学习的相关科研经历

Rue11e·2020-07-08 06:33

我们问了Yann LeCun等16个顶级数据科学家，这是他们给数据新人的建议

语音识别，计算机视觉中的物体识别，机器人，自动驾驶汽车，生物信息学，神经科学，系外行星的发现，对宇宙起源的理解，以及在经费有限的条件下，组织一支胜出的棒球队。数据科学家是整个产业的核心。

大数据文摘·2020-07-07 20:29

生物信息学数据库大全

综合数据库★INSD,国际核酸序列数据库（InternationalNucleotideSequenceDatabank）。由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护。★EMBL库，欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA序列库。http://www.ebi.ac.uk/embl.html★GenBank，美国国家生物技术信息中心（NCBI）所维护的供公众自由读取的、

qiuxue198598·2020-07-07 19:58

学习小组Day2笔记--初识linux（李其龙）

学习小组Day2笔记--初识linux摘要：本文将从以下五方面介绍linux系统的安装及基础操作，包括Linux的基本常识、生物信息学分析使用Linux的必要性、Windows操作系统下安装Linux、

李其龙_ec81·2020-07-07 11:02

Cell重磅综述：关于人类转录因子，你想知道的都在这

▼生物信息学习的正确姿势（第三版）NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析

生信宝典·2020-07-07 08:00

生物信息学入门

（2）生物学方面，首先需要了解生物信息学的一些基本概念和研究内容等，这方面可以选择一两本生物信息学教材来学习；其次学习掌握测序、数据库、数据格式等基础知识，学习关于生物信息的研究领域，如全基因组、外显子

水晶城大王·2020-07-07 07:49

【调剂】集美大学招收基于人工智能技术的生物信息学领域研究生1名

集美大学水产学院方铭教授团队招收从事生物信息学的学生1名，最好从事过人工智能领域研究。

计算机与软件考研·2020-07-07 06:47

几个国外出名的跟生物信息学相关的会议

会议列表：ASGH会议-AnnualMeetingoftheAmericanSocietyofHumanGeneticsAGBT会议-AdvancesinGenomeBiology&Technology(AGBT)ASM会议-annualmeetingoftheAmericanSocietyforMicrobiologyASHI会议-TheAmericanSocietyforHistocompat

生信技能树·2020-07-07 04:58

GWAS基本分析内容

之前给大家大致介绍了GWAS在临床生信分析中的概况，包括一些基本概念，原理和注意事项（出门左手边—>临床生物信息学中的GWAS分析），这次具体讲讲GWAS基本分析内容及结果解读（这篇也是我在百迈客云课堂的个人学习笔记

rapunzel0103·2020-07-07 03:20

朴素贝叶斯·浅辄

我们都知道有一类他们的人生轨迹是这样的：生物学||生物信息学||机器学习||人工智能看看知道自己在什么位置了吧？向贝叶斯靠近的第一步就是去了解他，然后就是安装R（当然Python也完全可以胜任）。

周运来就是我·2020-07-07 02:32

生信人的R使用

专题历史目录：3个学生的linux视频学习笔记接下来介绍R语言：【生信技能树】生信人应该这样学R语言R语言在你开始R之旅前，建议你看看下面这两个1.课前准备：周末生物信息学培训班准备工作2.致学员：无敌无脑的

泥人吴·2020-07-06 23:15

Smith-Waterman算法、Needleman-Wunsch算法的算法原理及算法比较

尼德曼-翁施算法（Needleman-WunschAlgorithm）是基于生物信息学的知识来匹配蛋白序列或者DNA序列的算法。这是将动态算法应用于生物序列的比较的最早期的几个实例之一。该算法是

Steve_Stone·2020-07-06 11:31

ROSLIND网站中的python village中的答案

网站:[http://rosalind.info/problems/list-view/]一个关于生物信息学基础Python的网站，再次我对于其中关于pythonvillage中的问题提供一些解决方案。

承豆·2020-07-06 10:02

xgboost: 速度快效果好的boosting模型

PythonR本文作者：何通，SupStatInc(总部在纽约，中国分部为北京数博思达信息科技有限公司）数据科学家，加拿大SimonFraserUniversity计算机学院研究生，研究兴趣为数据挖掘和生物信息学

hzyido·2020-07-06 09:03

微生物组—宏基因组分析专题培训7月开课啦！北京

关于学习生物信息学分析的重要性，请阅读《生物信息9天速成班—成为团队中不可或缺

刘永鑫Adam·2020-07-06 07:26

微生物组——宏基因组分析专题培训开课啦！！！

关于学习生物信息学分析的重要性，请阅读《生物信息9天速成班—成为团队中不可或缺的人》。课程

刘永鑫Adam·2020-07-06 07:25

2019最后一期—宏基因组分析技术研讨会

关于学习生物信息学

刘永鑫Adam·2020-07-06 07:54

2019微生物组—宏基因组分析技术研讨会第六期

关于学习生物信息学

刘永鑫Adam·2020-07-06 07:24

2019微生物组—宏基因组分析技术研讨会第五期

关于学习生物信息学分

刘永鑫Adam·2020-07-06 07:23

生物信息软件安装1：Linux软件背景知识

在生物信息学的学习过程中，生物信息学软件的安装绝对是一个大坑，在我们的生信学习群中，经常看到有人抱怨，一个软件安装了一天还没搞定。

曹务强·2020-07-05 22:21

生物信息学-张红-三四五章

记住：界、门、纲、目、科、属、种后三节：模式生物、构成生物的四类分子、分子生物学的中心法则模式生物噬菌体--病毒--大肠杆菌--酿酒酵母--秀丽线虫--果蝇--拟南芥--水稻--非洲爪蟾--斑马鱼--家鼠--人构成生物的四类分子糖、脂肪酸、核苷酸、氨基酸小分子：单糖、双糖、脂肪酸、核苷酸、氨基酸大分子：【多糖、淀粉、糖原、纤维素、】【核糖核酸RNA、脱氧核糖核酸DNA】、【蛋白质】单糖、双糖和多糖

耗奇害死猫·2020-07-05 06:06

学习计划安排 2016年底

1需要学习的内容总的来说分为四个部分：python，R，前段以及部分生物信息学软件。python目前已经基本完成了《利用python进行数据分析》这本书。

github_28385625·2020-07-04 16:30

生物信息学干货~你要的工具在这里~

这里有你要的分析工具镜像https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI3MTM4NTAzOQ==&mid=2247483834&idx=1&sn=d1239380b0646eadbaee22f6db8e8202&chksm=eac3e91addb4600c93b4e7be859afd8c4811ca0e3a6770591a4450ff55a107663205b97b3ab

ChrisLou·2020-07-04 05:08

部分研究兴趣

干湿结合的生物学表观测序可观测值是每个基因的表达量，隐变量是不同细胞类型的组成，比如建立某一类细胞和基因表达的关系，推断细胞丰度feature表达，可以是signature或者转录本，chromState等ATAC-seq

Shaoqian_Ma·2020-07-02 15:05

生信宝典：生物信息学习系列教程、视频、资源

生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么参数需要修改，结果可以出来，却把握不住对还是错。学习生信从来就不是一个简单的事，需要做好持久战的心理准备。在学习时，我们都希望

生信宝典·2020-07-02 15:27

皮尔森系数与斯皮尔曼等级相关系数在生物信息学上的使用

onlyme_862a·2020-07-02 12:41

利用Docker搭建Galaxy

pythonWeb开发实践》时发现一个神奇的工具---Docker，官网介绍是Dockeristheworld'sleadingsoftwarecontainerizationplatform我不禁想到生物信息学中有许多软件都要在类

徐洲更hoptop·2020-07-02 09:49

Rosalind工具库：使用Fastx-toolkit或trimmomatic进行质量控制

解决这种错误可以从源头，也就是测序仪改进，也可以通过生物信息学的手段，将可能错误的序列过滤掉。测序仪的下机数据一般都是FASTQ，第二列存放序列，第四列存放对应碱基的质量。

徐洲更hoptop·2020-07-01 23:05

图计算系统发展简史（一）

如今，基于图模型的数据分析方法已经应用在了互联网的很多场景：社交网络分析、网页排序、社区发现……在天体物理学、计算化学、生物信息学等自然科学领域，图也有广泛的应用。

Fmacloud·2020-07-01 09:57

Python调用Graphviz画流程图

它在网络，生物信息学，软件工程，数据库和网页设计，机器学习以及其他技术领域的可视界面中具有重要的应用。引自Graphviz官网+谷歌翻译就是一个应用性很好的画流程图

BBJG_001·2020-07-01 08:29

ATAC-Seq 数据分析（上）

背景：染色质和染色体的结构和功能每一条染色单体由单个线性DNA分子组成。细胞核中的DNA是经过高度有序的包装，否则就是一团乱麻，不利于DNA复制和表达调控。这种有序的状态才能保证基因组的复制和表达调控能准确和高效进行。包装分为多个水平，核小体核心颗粒(nucleosomecoreparticle)、染色小体(chromatosome)、30nm水平染色质纤丝(30nmfibre)和高于30nm水平

徐洲更hoptop·2020-06-30 20:21

双端测序中read1和read2的关系

在跟着健明老师学习生物信息学的过程中，少走了很多弯路，躲过了很多坑，在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理，又双叒叕落坑，百思不得其解。

Biofantasy·2020-06-30 17:57

【读书笔记】生信札记第二章

1.简介生物信息学涉及的数据库可大致分为二种：初级数据库和二级数据库。初级数据库贮存原始的生物数据，如DNA序列，由晶体衍射(Crystallography)获得的蛋白质结构等。

oddxix·2020-06-30 16:05

最优间隔分布学习的优越性

它催生出了包括信息检索、计算机视觉、生物信息学等在内的大量新研究，并且不同的聚类算法已被提出超过十年（JainandDubes1988;XuandWunsch2005;Jain2010）。

Promise_魅眸·2020-06-30 15:04

RNA-seq流程学习笔记（1）-Ubuntu系统安装SRA数据下载软件Aspera connect和SRT-Toolkit

自己本身是做分子生物学的，有关生物信息学的知识接触很少，于是按照自己的习惯从头摸索。

垚垚爸爱学习·2020-06-30 00:11

学习Linux常用命令网站链接整理[持续]

命令大全http://man.linuxde.net/Linux命令大全完整版http://blog.csdn.net/first_starrysky/article/details/745741072、生物信息学

xcaryyz·2020-06-29 23:54

《生物信息学：导论与方法》--新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq--听课笔记（十七）

第八章新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq8.10学生课堂报告-----NormalizationmethodsforIlluminahigh-throughputRNAsequencingdataanalysis1IntroductionTermsinNGS:Flowcell;Lane;Library;ReadsVariation:Intra-sample:genelength;GCcon

wxw060709·2020-06-29 22:48

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