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生物信息
IF: 6+ m6A信号与肿瘤免疫微环境在胶质瘤中的预后分析及验证
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你84篇原创内容-->公众号这期分享一篇贼简单的6+
桓峰基因
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2023-07-19 02:25
不要害怕不完美
老师向我们介绍了
生物信息
学相关的知识。今天的课程除了对于专业知识的学习,老师更是对在
生物信息
就业方面给我们提供了一定的指导。
崇识
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2023-07-18 10:29
全基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 重测序(re-sequencing)
从头测序(denovo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用
生物信息
学分析方法进行拼接、组装,获得该物种的基因组序列图谱,从而推进该物种的后续研究。
flynnchan
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2023-07-17 14:08
windows系统下装载wsl2,安装Miniconda3或Anaconda进行生信准备工作
生信环境搭建WSL2与Miniconda3生信环境搭建前言一、下载WSL2二、安装Miniconda3三、安装Anaconda总结前言
生物信息
学需要处理大量数据,然而在Windows系统下有些操作显得尤为复杂
Bio大恐龙
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2023-07-17 10:03
生物信息
windows
linux
运维
生物信息
学常见的数据下载,包括基因组,gtf,bed,注释
cd~/referencemkdir-pgenome/hg19&&cdgenome/hg19nohupwgethttp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bigZips/chromFa.tar.gz&tarzvfxchromFa.tar.gzcat*.fa>hg19.farmchr*.facd~/referencemkdir-pgenome/hg3
很酷的女超人s
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2023-07-17 09:06
安装软件、conda的重新安装及其使用
一、软件安装软件安装可以参考Jimmy写的软件的安装代码:
生物信息
学常见1000个软件的安装代码!
SNAKE____
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2023-07-16 23:19
[GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析
前言在
生物信息
学数据分析中,许多分析软件都是基于R开发的。
何物昂
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2023-07-16 19:11
理解非负矩阵和张量分解:快速算法的Matlab实现与优化实践
NMF的应用范围广泛,包括图像处理、文本挖掘、
生物信息
学等。实战项目下载首先,我们需要理解一下什么是非负矩阵。
快撑死的鱼
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2023-07-16 18:06
算法
矩阵
matlab
[1]Big data哪里找?
前言对于没有接触过数据挖掘,
生物信息
数据的生物医学研究人员、学生而言,让他们从头去找数据,开辟新的研究方向是无比艰巨的;面临的第一个问题就是不知道有哪些数据,去哪里找数据?
医科研
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2023-07-16 07:00
生物信息
学——常见的OrgDB包
物种OrgDB人(Humanm)org.Hs.eg.db小鼠(Mouse)org.Mm.eg.db猪(Pig)org.Ss.eg.db按蚊(Anopheles)org.Ag.eg.db拟南芥(Arabidopsis)org.At.tair.db牛(Brovine)org.Bt.eg.db蠕虫(Worm)org.Ce.eg.db犬(Canine)org.Cf.eg.db苍蝇(Fly)org.Dm.e
福旺旺
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2023-07-15 17:26
生物信息学
生物信息
r语言
测序技术
[转]snakemake使用笔记
的方法有多种,snakemake官方推荐的是conda,安装方法如下:condainstall-cbiocondasnakemake2、一个简单的snakemake脚本虽然snakemake广泛的应用于
生物信息
方
BioLearner
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2023-07-15 04:20
生信在线讲座:Sentieon--基于机器学习的多组学分析
在二月份DahShu免费线上讲座中,我们将聚焦
生物信息
基因测序领域,邀请了来自硅谷的明星创业公司–基因测序数据软件Sentieon高级数据科学家胡晋南博士(Dr.FrankHu)同我们分享Sentieon
毅硕科技
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2023-07-14 13:53
大数据
算法
概率论
机器学习
碱基周报(第 003 期):人类起源的故事
记录每周值得分享的生命科学和
生物信息
学进展内容,周日发布。封面图图源:www.sciencemag.org本周话题:人类起源的故事从东非大裂谷形成直到演变成东非稀树草原,地球就进入了人类纪元。
黄树嘉
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2023-07-14 05:23
GWAS+自然选择:62个样本的GWAS分析,没信号,如何巧妙的发文章
欢迎来到"bio
生物信息
"的世界6天前,BMCGenomics推了一篇文献“PopulationhistoryandgeneticadaptationoftheFulaninomads:inferencesfromgenome-widedataandthelactasepersistencetrait
橙子牛奶糖
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2023-06-24 12:20
花花的读书笔记——那些《白金数据》里的感慨
所谓DNA检索数据库就是采集所有国民的
生物信息
样本存档,最终通过凶手留在案发现场的信息比对提供的犯罪侧写来抓获凶手的辅助破案工具。起初,警察浅间对这
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2023-06-24 11:00
渐进式学习:如何用R和GO富集可视化捕捉生命的关键信号?
在这个领域,GO(GeneOntology)富集分析已成为一种常见的技术,用于识别在给定的基因集合中与特定生物过程和机制有关的基因集合,是研究
生物信息
学、基因组学和转录组学的重要方法之一[1,2]。
笑不语
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2023-06-23 23:14
R语言
R语言新星计划
r语言
学习
golang
LIBSVM与LIBLINEAR支持向量机库对模式识别与回归的可视化代码实践
虽然提出时间到现在有70来年了,但在90年代获得了很好的发展和扩展,在人像识别、文本分类、手写字符识别、
生物信息
学等模式识别问题中有得到应用。
寅恪光潜
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2023-06-22 13:19
Python
支持向量机
heart_scale数据集
LIBSVM格式数据集
np.c_和np.stack
svm_train
bioconvert:各种各样的
生物信息
数据格式转换工具
今天找计算测序覆盖度的时候发现了这个工具,github主页是https://github.com/bioconvert/bioconvert;帮助文档的链接是https://bioconvert.readthedocs.io/en/master/关于各种各样的文件格式可以参考下图image.png看帮助文档的时候还发现他可以直接下载测序数据下面我们尝试一下内容主要来自https://bioconv
小明的数据分析笔记本
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2023-06-22 08:46
BioXFinder生物数据库
BioXFinder是目前国内第一个也是国内唯一一个
生物信息
数据库,由享融智云公司精心研发,主要针对生物科研工作者的综合性生物数据检索及分析平台,汇集了核酸、蛋白、蛋白结构、代谢通路和信号通路信息,解决海外数据访问难
Yiyaoshujuku
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2023-06-22 02:09
数据库
r语言t检验输出检验统计量_[转载]R语言:常用统计检验
R语言:常用统计检验方法写在前面R已经成为当前国际学术界最流行的统计和绘图软件之一,该语言较为简单易学,统计分析功能强大,且具有很强的绘图功能,能够绘制学术出版要求的多种图表.R语言在
生物信息
学,进化生物学
weixin_39843431
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2023-06-21 19:44
r语言t检验输出检验统计量
r语言平均值显著性检验_R语言:常用统计检验方法(一)数据分析师
写在前面R已经成为当前国际学术界最流行的统计和绘图软件之一,该语言较为简单易学,统计分析功能强大,且具有很强的绘图功能,能够绘制学术出版要求的多种图表.在
生物信息
学,进化生物学、生态学与环境、经济学、语言学等领域有着极为广泛的应用
cici xiang
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2023-06-21 19:13
r语言平均值显著性检验
kfb格式文件转jpg格式
KFB格式的全视野数字病理切片(Wholeslideimages,WSIs)是国内一种病理切片扫描仪扫描出来的私有格式,该扫描仪是宁波江丰
生物信息
技术有限公司的一款产品。
Dai_Haijiao
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2023-06-21 16:33
其他
Java
java
kfb转tif或svs
kfb转jpg
tif转jpg
对称性与几何深度学习|Python案例
而现实世界中,许多重要信息都是以图的形式存在,如社交网络、
生物信息
、交通系统等,因此,如何有效处理这类数据成为了迫切需要解决的问题。几何深度
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2023-06-21 14:31
【Linux学习】— 6. 软件的安装
主要来源:兄弟连Linux视频教学、Linux操作与
生物信息
——基因学苑2021.2.181.软件安装核心思想Linux在开机之后,每输入一个命令,系统会自动从相应的环境变量配置文件中搜索该命令,如果能够找到该软件的路径
lkj666
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2023-06-20 03:28
【
生物信息
】调控基因组学 (Regulatory Genomics) 和Deep CNN
文章目录RegulatoryGenomicsBiologicalmotivationofDeepCNNMulti-taskCNN来自ManolisKellis教授(MIT计算生物学主任)的课《人工智能与机器学习》主要内容就是调控基因组学和深度卷积网络的结合由于这部分在我学习的课程中内容很少,下面贴出油管链接(这个每节课一个半小时):教授详细的课1:DeepLearningforRegulatory
丸丸丸子w
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2023-06-18 00:55
深度学习
生物信息
cnn
深度学习
神经网络
生物信息
专访 | 徐鹏程:开源,就是酷
徐鹏程:我本科就读于上海交通大学,硕士在伊利诺伊大学香槟分校,专业都是电子与计算机工程,感兴趣的方向有机器学习在
生物信息
等领域的应用、计算机系统与架构、分布式系统等。
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2023-06-17 21:17
碱基周报(第 005 期):人类寿命的极限
记录每周值得分享的生命科学和
生物信息
学进展内容,周日发布。
黄树嘉
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2023-06-17 15:20
DNA 7. 基因组拷贝数变异分析及可视化 (GISTIC2.0)
桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你119篇原创内容公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程
桓峰基因
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2023-06-17 08:44
基因组分析
perl
开发语言
数据挖掘
数据分析
r语言
StatQuest——
生物信息
相关原理的入门系列(二)
这篇笔记继续学习StatQuest的视频。还是建议按照顺序看视频。推荐视频:(1)“正态分布/高斯分布”,“标准差”都是好熟悉的名字,你知道它们到底是什么吗?为什么正态分布的曲线有的是“瘦高的”,有的是“矮胖的”,它们的区别是什么?StatQuest:TheNormalDistribution,ClearlyExplained!!!(2)Statisticpower是什么?用正态分布的曲线告诉你:
生信start_site
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2023-06-16 09:18
热图5:ggplot2画热图及个性化修饰
ggplot2与pheatmap热图对比读取文件和一些需要的包:setwd("D:/
生物信息
学")A%scale()%>%as.data.frame()#缩放数据C%scale(center=T)%>%
TS的美梦
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2023-06-15 20:43
热图
r语言
数据挖掘
开发语言
药物靶点信息数据库有哪些?都有哪些特点?
随着
生物信息
学的快速发展,科研人员的工作更加垂直,孕育而生的药物靶点信息数据库也是各有专攻,导致部分不熟悉的科研人员不能高效的选取合适的目标药物靶点信息数据库,主要
Yiyaoshujuku
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2023-06-15 07:37
数据库
YRCloudFile 分布式存储加速基因测序 解锁生命密码
生物信息
学(Bioinformatics)是在生命科学的研究中,以计算机为工具对
生物信息
进行储存、检索和分析的科学。
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2023-06-13 17:55
人工智能的未来趋势和发展方向
文章目录前言1.通用人工智能2.人机协作3.强化学习4.迁移学习5.边缘计算6.道德和法律议题7.虚拟现实与增强现实8.情感计算9.
生物信息
学和基因编辑10.量子计算11.空间探
PyTechShare
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2023-06-13 01:31
Python教程-高阶
人工智能
机器人
深度学习
R语言学习系列之“多变的热图”
公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程:
生物信息
学教学前段时间我们更新过一篇推文热图系列1,隶属R语言学习系列,今天我们继续热图系列2导入数据library(pheatmap)TEST=read.csv
生信小课堂
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2023-06-12 20:13
生物信息
与样本建库
7月20日上午,由李河南老师从概念、应用等方面给大学生考研行动协会赴安徽微分基因科技有限公司暑期社会实践团队成员讲解了
生物信息
学的相关知识。
X之痕
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2023-06-12 16:47
生物信息
学常见的数据下载,包括基因组,gtf,bed,注释
生物信息
学常见的数据下载,包括基因组,gtf,bed,注释cd~/referencemkdir-pgenome/hg19&&cdgenome/hg19nohupwgethttp://hgdownload.cse.ucsc.edu
程凉皮儿
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2023-06-10 23:48
生物信息
学基础知识(一)
基本类型及测序技术一、类型1、核苷酸序列数据DNA:ATCGRNA:AUCG2、蛋白序列20种氨基酸排列的顺序3、其他(1)分子标记数据(2)生物芯片数据(3)生物表型数据二、测序技术1、一代测序主要是sanger法2、二代测序illuminaMGI还有其他用的不多的方法3、三代测序pacbionanopore常用数据库一、基因序列数据库GeneBankEMBLDDBJRefSeqGDB二、蛋白数
jkl_bio
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2023-06-10 23:39
python
linux
r语言
[DEBUG] springboot: map数据在js和java中的传递和转换
更多技术文章请访问我的博客园账户:点击这里那边会更新有关
生物信息
学,javaWeb,统计学理论和一些杂七杂八的记录:)leetcode刷题记录争取日更(github):点击这里部分敏感信息已打码。
陆书生
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2023-06-10 18:03
Golang中的pprof分析环境搭建【Windows环境】
它在网络,
生物信息
学,软件工程,数据库和网页设计,机器学习以及其他技术领域的可视化界面中具有重要的应用。二
玉言心
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2023-06-09 22:51
golang
开发语言
后端
拷贝数变异CNV的
生物信息
学分析(一)
欢迎同行一起交流讨论微信forensic_JSQQ1956238898(一)CNV介绍由基因组发生重排而导致的,一般指长度1kb以上的基因组片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的重复或者缺失。因此称为“微”缺失/重复变异。拷贝数变异模式图二.pnghttps://www.jianshu.com/p/d5a0fadde763https://www.jianshu.com/p/0b7a513
Dr家硕的科研之路
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2023-06-08 08:35
Ubuntu 组建 HPC 团队
“HPC是支撑几个主要行业和关键研究领域的基石,如AI/ML、能源、
生物信息
学、药理学、工程学和气象学。HPC团队致力于提供最佳的免费开源HPC堆栈,
csdn_linuxprobe
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2023-06-08 00:48
ubuntu
linux
运维
科普:四大学术出版社
这篇文章年代稍微有点久了,一些实际内容也有些不一样了,但这不妨碍粗浅的了解一下:国际学术期刊的四大巨头(360doc.com)(67条消息)iMeta|宏基因组&
生物信息
期刊-创刊背景和简介_刘永鑫Adam
BI_wan
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2023-05-19 14:31
ubuntu 下非root权限安装perl模块
Ubuntu20.04亦可用,检测日期2021-02-27转载自如何安装perl模块-由于
生物信息
早期最多用的语言是perl,因此不可避免就要用别人的perl脚本或者基于perl的项目来处理数据。
煮梦斋_bioinfo
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2023-05-06 14:50
R语言可视化学习笔记之ggridges包
作者:严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生(
生物信息
学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源。严涛老师的绘图教程还有:gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了!!
生信宝典
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2023-04-21 21:34
生物信息
学有哪些SCI期刊推荐? - 易智编译EaseEditing
以下是几个
生物信息
学领域的SCI期刊推荐:Bioinformatics:该期刊是
生物信息
学领域最具影响力的SCI期刊之一,涵盖了
生物信息
学、计算生物学、系统生物学、生物医学工程等多个研究方向。
易智编译
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2023-04-21 19:57
期刊推荐
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凌恩生物美文分享|3月客户文章盘点——累计IF=105,平均IF=8.08
凌恩生物以打造国内一流生物公司为目标,在科研测序领域深耕不辍,吸纳多名在
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高级技术人员的加盟,参与并完成多个高科技项目。
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2023-04-21 14:55
组学
测序
哈佛大学教授刘小乐:我与
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学的不解之缘
受华中科技大学生命科学与技术学院教授薛宇邀请,今天,由哈佛大学教授刘小乐来分享她与
生物信息
学的故事。从北大到斯坦福,生物与计算机相遇和很多人一样,在少年时期我就有了自己的梦想。
Seurat_
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2023-04-21 09:41
【mongo 系列】聚合知识点梳理
聚类也称聚类分析,亦称为群集分析,是对于统计数据分析的一门技术,在许多领域受到广泛应用,包括机器学习,数据挖掘,模式识别,图像分析以及
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。什么是聚合查询?
阿兵云原生
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2023-04-20 21:24
【免费工具】3分钟搞定GO/KEGG富集分析
DAVID是一个
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数据库,其整合了生物学数据和分析工具,为大规模的基因或蛋白列表提供系统综合的生物功能注释信息,帮助用户从中提取生物学信息。
南博屹生物医学
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2023-04-20 06:42
终于要开始学python了
所谓“没有记录就没有生活”,这里汇总了我在学习python用到的好资源和学习笔记,贵在坚持,加油ヾ(◍°∇°◍)ノ゙学习python的7个理由书籍《python
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学数据管理》当当购书:http:/
rapunzel0103
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2023-04-20 03:17
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