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生物信息
生物信息
学——文件格式 pileup详解
生物信息
学
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学——文件格式pileup详解文章目录
生物信息
学概述一、pileup文件格式二、碱基序列(Readbases)符号详解概述每一种生物软件都有固定的文件格式要求。
福旺旺
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2023-10-18 18:09
生物信息学
pileup
生物信息学
文件格式
Linux系统中如何安装生信软件?保姆式全攻略
Linux生信软件安装攻略
生物信息
分析软件在Linux系统下的安装通常有多种途径,其中包括使用包管理工具(如conda)进行安装和通过源代码进行编译安装。
生信分析笔记
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2023-10-18 11:22
后端
RDKit计算分子属性
RDKit计算分子属性 分子属性的计算在化学、药物研发和
生物信息
学等领域中具有重要意义。
MurphyStar
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2023-10-17 10:29
药物设计软件
python
甲状腺乳头状癌piRNA诊断标志
想必很多同学对piRNAs都不是很熟悉吧,那么到底什么是piRNAs,我们又该如何通过常用的
生物信息
学方法识别出可以作为标志物的关键piRNAs呢?就让我们带着这样的疑问开始今天的学习吧。
概普生信
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2023-10-17 09:22
Cluster聚类算法大比拼:性能、应用场景和可视化对比总结
聚类分析是一种无监督学习方法,广泛应用于各种领域,包括市场细分、社交网络分析、
生物信息
学和推荐系统等。
Mr数据杨
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2023-10-16 17:01
Python
数据分析师
算法
聚类
数据挖掘
linux视频-P13-fasta和fastq格式文件的shell小练习
fasta和fastq格式文件的shell小练习这个是有机结合
生物信息
学的linux和数据格式的练习题:下载bowtie2软件后拿到示例数据:mkdir-p~/biosoftcd~/biosoftwgethttps
小梦游仙境
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2023-10-16 15:09
计算机方向的计算生物学,美国
生物信息
学和计算生物学的研究课题
留学美国,可能了解
生物信息
学和计算生物学的人仅仅局限在计算机科学专业,因为
生物信息
学和计算生物学是在计算机科学专业下的分支。
weixin_39979948
·
2023-10-16 10:13
计算机方向的计算生物学
生物信息
学所需的计算机知识,
生物信息
学专业计算机课程的探讨
摘要:介绍了
生物信息
学专业教学的特点,分析了生物专业学生进行计算机课程教学中存在的问题,提出了生物专业计算机课程教学方法。
weixin_39704971
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2023-10-16 10:43
生物信息学所需的计算机知识
计算机专业
生物信息
学方向怎么样,2019年
生物信息
学本科专业怎么样?
2019年本科
生物信息
学专业怎么样?就业方向和就业前景如何?专业代码:071003修业年限:四年学科门类:理学专业类:生物科学类
生物信息
学专业怎么样?
哎不想起名
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2023-10-16 10:12
计算机专业生物信息学方向怎么样
生物学和计算机科学结合的学科,美国
生物信息
学和计算生物学解析
一、
生物信息
学
生物信息
学(Bioinformatics)是研究
生物信息
的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科
Triple A
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2023-10-16 10:12
生物学和计算机科学结合的学科
美国计算机生物学要求,美国研究生
生物信息
学与计算生物学学校列表
综排学校名称项目名称项目英文名开设学位隶属科系1计量与计算生物学QuantitativeandComputationalBiologyPhD自然科学部
生物信息
学与计算生物学Bioinformatics&
琉璃与大大
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2023-10-16 10:42
美国计算机生物学要求
生物信息
学还是跨专业计算机,生物统计学与
生物信息
学的区别
生物信息
学(Bioinformatics)
生物信息
学(Bioinformatics)利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学方法研究生物学的问题。
yisac
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2023-10-16 10:12
生物信息学还是跨专业计算机
计算机科学在
生物信息
中的应用,计算机科学在
生物信息
学中的应用
生物信息
学计算机科学在
生物信息
学中的应用万卫兵①施鹏飞摘要
生物信息
学是一门新兴的交叉学科,计算机科学如何更快更好地发挥其在
生物信息
学中的作用是计算机研究和开发人员面临的一个重要的新课题。
干啥勒
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2023-10-16 10:12
计算机科学在生物信息中的应用
生物信息
学 陈铭_
生物信息
学Bioinformatics-山东大学课程中心.PDF
生物信息
学Bioinformatics-山东大学课程中心
生物信息
学Bioinformatics巩晶癌症研究中心山东大学基础医学院2016.09.0877PERSONALINFORMATION姓名:巩晶年龄
aganztracy
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2023-10-16 10:41
生物信息学
陈铭
生物信息
学基础知识Day1
文章目录前言一、生物大分子1.DNA2.RNA3.蛋白质二、基因组、转录组和蛋白质组1.基因2.基因组3.转录组4.蛋白质组总结前言个人学习《R语言与Bioconductor
生物信息
学应用》的一些笔记。
抱紧我自己
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2023-10-16 10:09
生物信息学
生物信息学
生物信息
学在心血管系统疾病中的应用
生物信息
学在心血管系统疾病中的应用心血管疾病简介心血管疾病是一组心脏和血管疾患的名称,心血管疾病是全球的头号死因:每年死于心血管疾病的人数多于其它任何病因。
荞麦agan
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2023-10-16 10:06
生物信息学
生物信息学
生物学
生物信息
学的研究方向
1.
生物信息
数据库:是用于
生物信息
学研究的原始数据,是
生物信息
学赖以生存和发展的基础。
终是蝶衣梦晓楼
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2023-10-16 10:34
笔记
生物信息
学研究方向
具体的研究方向1、序列分析2、计算进化生物学3、生物多样性的度量4、蛋白质结构预测5、蛋白质表达分析6、比较基因组学7、导致癌症的突变分析8、在药物研发方面的应用前者偏理论,后者偏向证明第一类研究方向:第一类的
生物信息
学应用关注于中心法则中任一阶段的信息传递
conch0329
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2023-10-16 10:02
生物信息学
生物
生物信息
云主机构建生信服务器(一)——腾讯云的注册及使用
之前在自己的电脑上折腾过一段时间
生物信息
学,被各种软件的安装、数据的下载折腾到吐血。虽然现在网上的教程很多,但总还是会卡在一些地方无法顺利进行下去。
青椒窝窝头
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2023-10-15 13:55
IF:5+ 7种癌症免疫治疗证明DNA损伤反应通路突变可作为免疫检查点阻断疗效的潜在生物标志物
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你105篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因
·
2023-10-15 09:40
文章思路推荐
生信分析
数据分析
算法
随机森林
决策树
IF:4+ 膀胱癌RNA结合蛋白相关预后模型
关注公众号,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你71篇原创内容-->公众号最近分享了很多转录组的高级别分析
90066456ace6
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2023-10-15 04:17
2018-01-06
2.做了一天的
生物信息
学实验。进展缓慢,数据可以读到了,但是要转化成标准格式。我现在在下载数据格式的模板,下载了一下午也没成功。不论用什么方法都超级慢,不知道是网速的原因,还是因为这个网站的原因。
王小沫的日记
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2023-10-15 01:54
9月客户文章盘点——累计IF 103.2
客户文章一览凌恩生物以打造国内一流生物公司为目标,在科研测序领域深耕不辍,吸纳多名在
生物信息
高级技术人员的加盟,参与并完成多个高科技项目。
SHANGHAILINGEN
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2023-10-14 23:37
测序
组学
生信学习笔记:
生物信息
学测序分析基本流程入门笔记
基因差异表达计算变异检测物种组成与丰富度计算kmer估计基因组大小序列拼接Pregraph常用序列拼接软件基因组污染分析RNA-seq与meta序列拼接基因功能注释非编码RNA小RNA共线性分析在线序列分析序列比对数据下载前言根据B站视频教程
生物信息
快速入门边自学边随手记的笔记
twocanis
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2023-10-13 20:54
生物信息
生物信息学
miRNA
生物信息
数据分析流程初探(一)
snakemake-qiaseq-mirna流程在github的snakemake-qiaseq-mirna[1]流程中,MiRNA的分析步骤如下:Step1:ReadtrimmingandUMIdetectioncutadapt[2]umi_tools[3]Step2:ReadalignmentStep3:DeduplicationStep4:Readcounting第一步:cloneGithu
生信小木屋
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2023-10-13 20:18
生物信息学
生物学
python
数据分析
富集分析天花板之ClusterProfiler4
说在前面在国内做生信的小伙伴或多或少都听过一个大名鼎鼎的名字---Y叔,想当初小编初入生信大门时还专门百度查了一下,他就是南方医科大学
生物信息
学系主任余光创教授。
生信宝库
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2023-10-13 15:35
Java工程项目打包成一个安装包从而在电脑上部署
我们都知道
生物信息
其实包含方方面面非实验工作,只是应用在生物中,解决生物学问题。一句话总结:生信是个框,不做实验都往里面装。
沧浪之水v
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2023-10-13 13:56
甲状腺健康也很重要
甲状腺是内分泌系统的一个重要器官,它和人体其它系统(如呼吸系统等)有着明显的区别,但和神经系统紧密联系,相互作用,相互配合,被称为两大
生物信息
系统,没有它们的密切配合,机体的内环境就不能维持相对稳定。
骐琳
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2023-10-13 04:14
corrplot包画相关性图详解
主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、
生物信息
学等。
医学和生信笔记
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2023-10-13 02:05
数据可视化
r语言
python
数据分析
相关性网络图
全流程分析代码|代码一WGCNA分析|全流程分析代码|代码二WGCNA分析|全流程代码分享|代码三4.精美图形绘制教程精美图形绘制教程5.转录组分析教程转录组上游分析教程[零基础]小杜的生信筆記,主要发表或收录
生物信息
小杜的生信筆記
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2023-10-12 15:52
R语言精美图形绘制教程
信息可视化
r语言
人工智能
开发语言
学习
python笔记——python
生物信息
学数据管理-数据读写
#第二部分#文件neuron_data.txt16.38139.90441.4629.0340.93202.70142.30346.00300.00>>>data=[]>>>forlineinopen('neuron_data.txt'):#for循环逐行读取文件...length=float(line.strip())#去掉空格和换行符,转换为浮点数...data.append(length)#
懒猫古德
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2023-10-11 22:09
生物信息
学——常见的四种文件格式(fasta,fastq,sam,vcf)
生物信息
学
生物信息
学——常见的四种文件格式(fasta,fastq,sam,vcf)文章目录
生物信息
学概述一、fasta文件格式二、fastq文件格式三、sam(/bam)文件格式四、vcf文件格式概述每一种生物软件都有固定的文件格式要求
福旺旺
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2023-10-11 04:30
生物信息学
生物信息
测序技术
识别 lncRNA相关的生物标志物以提高LUAD预后的准确性(IF5+)
CCT6AandSPOCK1forLungAdenocarcinomaBasedonBioinformaticAnalysisoflncRNA-MediatedceRNANetworkandSampleValidation基于lncRNA介导的ceRNA网络的
生物信息
学分析和样本验证
生信学霸
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2023-10-10 11:19
序列回帖与multi-mapped reads的处理
通常的解决方法是使用后缀树,在之前的文章中写过方法:后缀树练习实例:从目标串S中查找串T重复次数在
生物信息
中,根据有无已知的基因组信息可以将mapping分成两类。这里只谈m
YangRiriri
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2023-10-09 04:05
生物信息
RDKit安装和使用
因为做
生物信息
工作需要这个包去计算化学结构的相似性,所以就安装了这个工具包。安装过程中有一点小坑,在这里写出来供大家参考。
一穷二白到年薪百万
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2023-10-08 02:00
软件安装
python
anaconda
《Bioinformatics Programming Using Python》
《BioinformaticsProgrammingUsingPython》高清电子书微科享想生活本书通过许多例子和练习题,帮助读者简化使用Python的
生物信息
学编程。
高锰酸钾配甲醛_ab83
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2023-10-07 19:42
使用metaCCA进行单/多个SNP与多表型的典型相关性分析
欢迎来到"bio
生物信息
"的世界新年的第一篇更文。祝大家新春快乐!身体健康!18号回家以后,经历了如下过程。
橙子牛奶糖
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2023-10-07 12:35
一张思维导图帮你看懂
生物信息
数据来源及产生途径
最近系统的从头到尾学习了一下樊龙江老师出版的
生物信息
学这本书,学习
生物信息
有1年多了,从事医学数据分析6年多了,唯一的感觉就是基础很重要真的很重要,参加了很多的培训班,自己也看过很多的视频,也办过几期的线下培训
菜鸟青盐
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2023-10-07 07:38
遇到了一次colorspace的测序数据
目前已经是我接触
生物信息
学的第四年了,这里的内容由于学业压力也很久没有更新,现在可以趁着寒假的空闲时间写一写最近遇到的东西。
果蝇饲养员的生信笔记
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2023-10-06 02:57
计算机算法在
生物信息
学中的应用,
生物信息
学在系统发育分析中的应用(自己原创) - 生物科学 - 小木虫 - 学术 科研 互动社区...
本文综述了系统进化的各种研究方法以及
生物信息
学在其中的应用,并对
生物信息
学中所采用的研究生物进化关系的方法进行了比较,以及分析了
生物信息
学的发展趋势。关键词:系统发育分析;生物信
阿猴HOSEA
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2023-10-04 12:22
计算机算法在生物信息学中的应用
CCF发布2020-2021中国计算机科学技术发展报告
本《发展报告》包含体系结构、计算机视觉、理论计算机科学、信息系统、网络与数据通信等方向的报告,从碳中和体系结构、视觉-语言交互技术、
生物信息
学组合优化、新一代知识图谱信息系统、Ske
人工智能学家
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2023-10-03 14:23
大数据
编程语言
机器学习
人工智能
深度学习
【
生物信息
学】Notears Linear算法在线性结构方程模型中的因果关系估计
目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍3.IDE三、实验内容0.导入必要的工具1.set_random_seed2.notears_lineara.输入参数b.内部函数_adjc.内部函数_lossd.内部函数_he.内部函数_funcf.函数主体部分3.主程序数据部分展示绘制图n.代码整合一、实验介绍本实验完成了NotearsLinear算法在线性结构方程模型中的因果关系估计
QomolangmaH
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2023-10-03 06:14
#
生物信息学
python
numpy
开发语言
【
生物信息
学】使用皮尔逊相关系数进行相关性分析
目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍3.IDE三、实验内容0.导入必要的工具1.cal_pearson(计算皮尔逊相关系数)2.主程序a.实验1(较强的正相关关系):b.实验2(几乎没有线性相关关系):c.实验3(非常强的正相关关系):d.实验4(斯皮尔曼相关系数矩阵):3.代码整合一、实验介绍本实验主要实现了自定义皮尔逊相关系数进行相关性分析。相关性分析是一种常用的统计方法
QomolangmaH
·
2023-10-03 06:12
#
生物信息学
python
【
生物信息
学】计算图网络中节点的中心性指标:聚集系数、介数中心性、度中心性
目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍3.IDE三、实验内容0.导入必要的工具1.生成邻接矩阵simulate_G:2.计算节点的聚集系数CC(G):3.计算节点的介数中心性BC(G)4.计算节点的度中心性DC(G)5.综合centrality(G)6.代码整合一、实验介绍本实验实现了计算图网络中节点的中心性指标,包括聚集系数、介数中心性、度中心性等二、实验环境本系列实验使用了
QomolangmaH
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2023-10-02 16:12
生物信息学
人工智能
算法
【
生物信息
学】基因差异分析Deg(数据读取、数据处理、差异分析、结果可视化)
目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍3.IDE三、实验内容0.导入必要的工具包1.定义一些阈值和参数2.读取数据normal_data.csv部分展示tumor_data.csv部分展示3.绘制箱型图4.删除表达量低于阈值的基因5.计算差异显著的基因6.初始化结果数据表格7.进行秩和检验和差异倍数计算8.可视化分析9.代码整合一、实验介绍本实验完成了基因差异分析,包括数据读取
QomolangmaH
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2023-10-02 16:42
生物信息学
深度学习
人工智能
python
【
生物信息
学】使用HSIC LASSO方法进行特征选择
目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍3.IDE三、实验内容0.导入必要的工具1.读取数据2.划分训练集和测试集3.进行HSICLASSO特征选择4.特征提取5.使用随机森林进行分类(使用所有特征)6.使用随机森林进行分类(使用HSIC选择的特征):7.代码整合一、实验介绍本实验实现了HSICLASSO(Hilbert-SchmidtindependencecriterionL
QomolangmaH
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2023-10-02 16:42
生物信息学
深度学习
人工智能
python
特征选择
【
生物信息
学】使用谱聚类(Spectral Clustering)算法进行聚类分析
目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍3.IDE三、实验内容0.导入必要的工具1.生成测试数据2.绘制初始数据分布图3.循环尝试不同的参数组合并计算聚类效果4.输出最佳参数组合5.绘制最佳聚类结果图6.代码整合一、实验介绍本实验实现了使用谱聚类(SpectralClustering)算法进行聚类分析二、实验环境本系列实验使用了PyTorch深度学习框架,相关操作如下(基于深度学
QomolangmaH
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2023-10-02 16:10
生物信息学
算法
聚类
数据挖掘
支持向量机SVM:从数学原理到实际应用
LagrangeMultipliers)KKT条件核技巧(KernelTrick)双重问题和主问题(DualandPrimalProblems)四、代码实现数据预处理模型定义优化器选择训练模型评估模型五、实战应用文本分类图像识别
生物信息
学金融预测客户细分六
TechLead KrisChang
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2023-10-01 13:54
人工智能
支持向量机
算法
机器学习
人工智能
神经网络
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用计算python两点之间的距离math_自学生信Python(第二天)|计算出两点之间的距离...
计算出两点之间的距离日常旁白:本人是一枚生物学的学生,由于对
生物信息
学特别感兴趣,于是想自学
生物信息
学(新手莫怪)。
weixin_39828859
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2023-09-30 11:45
C#,生信软件实践(01)——DNA序列数据库FASTA文件合并工具的源代码
1
生物信息
学简介
生物信息
学(BioInformatics)是研究
生物信息
的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科
Trufferover
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2023-09-29 23:11
C#生信实践
BioInformatics
Recipes
生物信息学
生信
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