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Chip
基因表达趋势分析-1:TCseq
TCseq包可以应用于转录组,单细胞转录组,ATAC-seq,
Chip
-seq等的表观基因组时序型数据分析。该包主要用于不同时间点的差异分析,时间趋势分析及可视化作图。
Hayley笔记
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2022-07-01 10:27
NoC(Network on
Chip
)学习笔记(2)
NoC(NetworkonChip)学习笔记(2)NoC的路由与交换NoC的路由确定性XY路由算法odd_even路由算法DyAD路由算法DyXY路由算法NoC的交换电路交换包交换存储转发交换技术虚直通交换技术虫孔交换技术NoC的路由与交换NoC的路由在NoC的交换信息时,需要确定从源节点到目标节点所经过的路径,这时就需要路由算法来确定该路径。路由算法分为静态路由算法和动态路由算法两种。静态路由算
Tommyll
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2022-06-29 10:05
片上网络
NoC(Network on
Chip
)学习笔记(1)
NoC(NetworkonChip)学习笔记(1)NoC结构与性能NoC层次NoC基本属性NoC常见的拓扑结构2DMesh2DTorus3DMeshOctagon/Spidergon结构ClusterMesh结构树状结构蝶状结构各种结构之间的比较参考文献NoC结构与性能NoC技术是在SoC(SystemonChip)基础上发展演变来的。SoC通常是指在单一芯片上实现的数字计算机系统,通过总线完成其
Tommyll
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2022-06-29 10:05
片上网络
Nat.Rev.Genet丨十二位分子遗传学家万字长文,烛照遗传学和基因组学的未来
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2022-06-22 12:46
weex
base64
hierarchy
dbcp
微软
Android开发手册
Chip
监听及ChipGroup监听
目录
Chip
监听ChipGroup监听实例效果展示
Chip
监听选中状态的监听:setOnCheckedChangeListener,该监听只有设置了checkable属性为true或者使用了【filter
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2022-06-10 17:28
前置camera没有搭配闪光灯,如何关闭闪光灯图标
1.1如果89
chip
,请确认:alps\mediatek\config[project]\projectconfig.mk中是否有配置:MTK_SUB_STROBE_SUPPORT=yes如果有请修改为
bestwu0666
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2022-06-05 11:08
mtk
camera
day18
ChIP
-seq数据和质控软件
一、要组织数据比如建立一个
ChIP
-seqtest文件。在下面建立一系列过程文件夹mkdirrawdataqccleanalignpeak等,相当于一下子建立这么多文件夹。
meraner
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2022-05-31 13:33
2022-05-19 Peak注释学习总结
三个讲的很好的参考教程链接学习一遍ChIPseeker的使用https://www.jianshu.com/p/c76e83e6fa572021-05-23
ChIP
-seq数据从头到尾比对及分析汇总(个人分析记录贴
AsuraPrince
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2022-05-19 14:16
在Windows下完成
ChIP
-Seq分析
纯粹就是记录下如何在Window下完成
ChIP
-Seq,并没有详细讲解
ChIP
-Seq的原理和每一步背后的含义。想深入了解可以翻生信技能树,生信宝典,组学大讲堂等等公众号。
Nuvolar
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2022-05-17 07:53
windows
生物信息学
share memory的bank conflict分析
硬件从事计算机行业的同学肯定见过这个东西,没错这个玩意就是内存条,上面的小黑块就是内存颗粒,每一片称之为
chip
.有兴趣的可以拆开自己的电脑看一下,这个
chip
大约有1
s.feng
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2022-04-23 21:03
CUDA编程
c++
从零开始实现
Chip
8 模拟器
Chip
8是一个游戏软件。就像红白机NES,掌机GBA,PSP等机器一样。实现
Chip
8模拟器,就可以在电脑平台运行
chip
8的游戏rom。只不过相对于其他游戏模拟器,
Chip
8足够简单。
人世间
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2022-04-22 10:47
放弃Venn-Upset-花瓣图,拥抱二分网络
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2022-04-17 07:48
python
大数据
数据可视化
数据分析
人工智能
放弃Venn-Upset-花瓣图,在线拥抱二分网络
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2022-04-17 07:48
python
大数据
数据可视化
数据分析
人工智能
一篇所有研究生都该读的好文:阳光温热 科研静好
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2022-04-09 07:41
j2ee
xhtml
bitcoin
ai
办公软件
一文看懂:
ChIP
实验和qPCR定量分析怎么做|易基因技术
染色质免疫共沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,
ChIP
),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。
深圳市易基因科技
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2022-03-30 11:00
cubemx STM32的FLASH内存读写
页(Page)<扇区(Sector)<块(Block)<芯片(
Chip
)页Flash存储器中一种区域划分的单
聪明的胜啊
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2022-03-18 18:08
单片机
嵌入式硬件
stm32
面阵相机以及相机选型公式
面阵相机以及相机选型公式#include#includeusingnamespacestd;intmain(){cout>
chip
;floatLong,Wide;cout>Long;cout>Wide;
ID1248
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2022-03-18 05:04
【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-
Chip
-2017年8月23日
用心陪伴每一天1音频0b轮播,汉语第一册下轮播2动画幼儿汉语第一册第七至十二单元,幼儿英语0a4-6单元3儿歌与游戏seesaw小伙子自己鼓捣乐高积木,妈妈,你看,跷跷板图片发自AppYes,youmadeaseesaw.宝宝指着大的说,Long.So,let'splaythegameofseesaw.Ok!Look,I'mmouse.Youareduck.Upanddown,upanddown,
水中的珊瑚雨
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2022-02-19 18:59
ChIP
-seq简介
在B站上找到一个介绍
ChIP
-seq的视频:AgentleintroductiontoChIP-Seq。
TOP生物信息
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2022-02-16 22:11
2019-12-24
2019-12-24W25Q128
CHIP
---65536page---4096sector---16Mbyte---256block(擦除单位)Page----256byte(pro)Sector--
13e6982014e1
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2022-02-14 20:00
ChIP
-Seq/ATAC-Seq/DNAse-Seq的一站式质量控制和分析流程
一个分析流程是针对
ChIP
-Seq的,包括转录因子和组蛋白修饰,链接在这里。另一个分析流程是针对ATAC-Seq或者DNAse-Seq的,链接在这里。
傅小潇
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2022-02-12 13:58
3月12日打卡
1、阅读牛津树3本(刚到货,3箱)Thesandcastle,Hookaduck,
Chip
'sRobot.新单词bucket、sandcastle2、早上听新东方Pop2第三课音频&歌曲theclock
ruiminlau
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2022-02-11 21:53
ChIP
-seq需知问题及展望
参考文章:看到公众号这篇推文解读的很深入https://mp.weixin.qq.com/s/7BqcpR1bMJaZHV408-sv6Q染色质免疫沉淀后测序(
ChIP
-seq)是一种针对DNA结合蛋白
caokai001
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2022-02-11 20:53
2018-11-18
然而,
ChIP
-
chip
技术的分辨率在200~800bp左右,远大于TFBS的长度,所以需要计算方法来确定TFBS的确切位置。与之相比,
ChIP
-seq技术的分辨率可以达到100bp,甚至更高。
是杰宝呀
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2022-02-10 05:48
第4篇:对ATAC-Seq/
ChIP
-seq的质量评估(一)——phantompeakqualtools
学习目标:探讨
ChIP
-seq数据质量低的来源理解链交叉相关性(strandcross-correlation)使用phantompeakqualtools计算交叉相关性和其他相关的质控度量值评估交叉相关图
六六_ryx
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2022-02-08 14:16
生信常用基础语法及技巧
-name"*.bam"-typef-execmv{}~/
ChIP
_seq/bam\;find.-name"*.bai"-typef-execmv{}~/
ChIP
_seq/bam\;find.
落寞的橙子
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2022-02-06 17:57
应届毕业生工资收入的微观影响因素——基于
CHIP
数据
应届毕业生工资收入的微观影响因素——基于
CHIP
数据一、引言应届毕业生指在应该毕业的年份即将毕业或者已经毕业学生。简单来说,学生在大学的最后一年毕业,就是应届毕业生。
TanKaiwen
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2022-02-06 17:37
探索Android Design Support Library v28的新控件
最近发布一系列新组件,目前还在alpha版本中,本文是在Kotlin下针对这些组件使用的示例,效果图如下:AndroidDesignSupportLibraryv28从上到下依次为:MaterialButton、
Chip
leo567
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2022-02-06 09:30
11-28 Goodbye, Mr. Chips 17 - 18
但没想到的是那天有位带着Brookfield帽子的小男孩来敲门,然后对老头说:你好,请问
Chip
先生在吗?老头从来没有见过这个孩子,于是问到,你找我有事?
素心s
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2022-02-06 00:20
什么是内存对齐,原理你真的了解吗?
前面我们说过内存是由
chip
构成。每个
chip
内部,是由8个bank组成的。其构造如下图:图2.内存颗粒物理结构在每个bank内部,就是电容的行列矩阵结构了。
yanfeizhang
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2022-02-05 12:33
哇!单细胞测序-配体受体互作分析原来可以这么简单又高大上!
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
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2022-02-03 14:05
计算机系统要素(2)— 时序逻辑
所以由这些门构成的
chip
都叫组合
chip
。像CPU里面的ALU,这种提供了一些处理数据功能的芯片就是组合芯片的一种。
美航球馆
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2022-02-02 23:08
组学技术—— CUT&Tag
而在蛋白质与DNA之间的相互作用研究当中,
ChIP
-seq当属经典技术,可以说为后来一系列技术的发展开拓了很好的思路,但是传统的
ChIP
-seq也存在一些问题:信号比较杂,背景噪声很大,所以常常需要input
Bio_Infor
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2021-12-26 17:03
[R]bioconductor之ChIPseeker学习
ChIPseeker包南方医科大学Y叔大牛写的许多有名的生信R包之一,其最初设计用于
chip
-seq的macspeakcalling结果分析以及可视化,后来逐渐也适用于相关的peak分析。
小贝学生信
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2021-12-01 01:34
hi-c 文献导读-4 MACS
Model-basedAnalysisofChIP-Seq(MACS)发表时间:17September2008主要内容:addressanaccuratemethodofcallingpeakofChip一、背景知识1、
CHIP
小贝学生信
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2021-12-01 01:07
单细胞笔记9-scATAC-seq测序方法和数据分析
AssayforTransposase-AccessibleChromatinwithhigh-throughputsequencing,ATAC-Seq)技术能够一次性检测样本中染色质的开放性,无需像
ChIP
-Seq
江湾青年
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2021-11-03 16:19
表观组学:call peak概念和MACS2算法原理,最简明清晰的call peak一文通
在诸如:
ChIP
-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我们常常听到一个词CallPeak。CallPeak究竟是什么东西,得到的结果又有什么生物学意义呢?
xizzy
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2021-10-27 20:50
Chip
-seq
from生信技能树paper:Brookes,E.etal.Polycombassociatesgenome-widewithaspecificRNApolymeraseIIvariant,andregulatesmetabolicgenesinESCs.CellStemCell10,157–170(2012).GSEaccession:GSE34518,总共是9个样本,但是很多样本都分开在多个l
超级无敌大蜗牛
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2021-06-27 01:18
Seurat的单细胞免疫组库分析来了!
使用Seurat进行单细胞VDJ免疫分析NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2021-06-24 18:47
Motif scanning tool: FIMO(在线版分析笔记)
换言之,你需要提供你的序列(比如
ChIP
-seq峰,或者ATAC-seq峰,或任何你感兴趣的序列片段);并且,你还需要提供motif文件,目的就是要查看感兴趣的序列里有没有这些motif。
生信start_site
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2021-06-21 01:54
反思录2021-01-17
今日反思:昨天看剧的惯性还在,一早起来看剧,导致没准备好discussion,没东西可讲,再次让老板失望,晚上
ChIP
-seqguidelinesandpracticesoftheENCODEandmodENCODEconsortia
考拉王的桉树
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2021-06-20 20:20
ChIP
-seq和CUT&Tag技术
ChIP
-seq:利用染色质免疫共沉淀+高通量测序研究某种蛋白质结合的基因组区域染色质由DNA、组蛋白等组成:1.pngDNA将组蛋白“打包”,起到调控基因比如激活/沉默的作用:2.png1.甲醛交联:
Ann_0822
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2021-06-20 10:41
反思录2021-01-10
今日文献:DynamicmapsofUVdamageformationandrepairforthehumangenome今日反思:连续两天高强度运动,再加上今天工作强度较大,有些疲惫,实验间隙只想休息,
CHIP
-Seq
考拉王的桉树
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2021-06-20 10:39
讨厌又迷人的reads去重复
太长不看系列RNA-seq一般不去重复
ChIP
-seq一般去重复callS
鹿无为
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2021-06-14 15:20
我可能是最后一个知道IGV也可以overlap Track的
image因为我们做
ChIP
-Seq的时候,会有IP和Input。尽管我们可以在发文章的时候,在IGV上只放IP,但放上input会显得更加的严谨。
城管大队哈队长
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2021-06-12 22:39
关系抽取信息抽取知识图谱
关系抽取20210628https://www.cnblogs.com/robert-dlut/p/14343408.html中文电子病历命名实体识别(CNER)研究进展http://www.cips-
chip
.org.cn
weixin_ry5219775
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2021-06-10 22:25
知识图谱
自然语言处理
机器学习
Chip
-seq的原理2020-02-11
https://www.bilibili.com/video/av86858532?p=2212屏幕快照2020-02-11下午2.42.31.pngH3表示组蛋白K4组蛋白上的氨基酸,甲基化的位点H3K4me2H3K4me3AcetylationH2AZ对启动子起到激活作用H3K36me3H3K79me2对转录起激活作用H3K4me1H3K4me2H3K27ac对增强子激活CTCF绝缘子,抑制增
机器人会画画
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2021-06-04 04:09
NGS pipeline in Github
推荐:https://github.com/crazyhottommy/https://github.com/xuzhougeng/R-
ChIP
-data-analysishttps://github.com
小潤澤
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2021-06-02 20:07
DRAM学习笔记
image.pngimage.pngimage.pngimage.png整个DRAM的结构如上图所示,其中
Chip
、Bank以及Row/Column的概念比较重要。
CPinging
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2021-05-31 20:29
安卓模拟器性能比较
SFC一般来讲用Snes9x核心是比较安逸的,bsnes系列精确度极高,但不支持很多hack的ROM,兼容性也很不好说,另外performance版说是不支持增强
chip
?
realnabarl
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2021-05-20 02:16
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