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DGL
GNN-第三方库:
DGL
【图神经网络框架,支持对异构图的处理,开源相关异构图神经网络的代码,在GCMC、RGCN等业内知名的模型实现上也取得了很好的效果】
一、
DGL
库的实现与性能实现GNN并不容易,因为它需要在不规则数据上实现较高的GPU吞吐量。1、
DGL
库简介
DGL
库的逻辑层使用了顶点域的处理方式,使代码更容易理解。
u013250861
·
2022-11-24 05:13
图神经网络/GNN
人工智能
使用
DGL
实现RGCN时报Assertion srcIndex < srcSelectDimSize failed.的解决办法
我之前没有用过
DGL
实现过RGCN,简单看了一下网上的例子,按照这里:
dgl
.nn.pytorch.conv.relgraphconv—
DGL
0.8.1documentation和GCN的区别就是forward
蛐蛐蛐
·
2022-11-24 05:10
深度学习
Python技巧
科研工具
pytorch
python
第四周.02.RGCN代码讲解
文章目录导入包套路步骤1套路步骤2加载数据套路步骤3本文内容整理自深度之眼《GNN核心能力培养计划》参考案例:https://docs.
dgl
.ai/tutorials/models/1_gnn/4_rgcn.htmlRGCN
oldmao_2000
·
2022-11-24 05:06
#
小班课笔记
pytorch
深度学习
机器学习
rgcn
跟着官方文档学
DGL
框架第十四天——大型图上的随机训练之链接预测
参考资料https://docs.
dgl
.ai/en/latest/guide/minibatch-link.html#guide-minibatch-link-classification-samplerhttp
cqu_shuai
·
2022-11-24 05:32
DGL
深度学习
pytorch
DGL
图神经网络
链接预测
跟着官方文档学
DGL
框架第十天——训练图神经网络之链接预测
参考链接https://docs.
dgl
.ai/en/latest/guide/training-link.html#guide-training-link-prediction概述什么是链接预测链接预测就是预测图中给定节点间是否存在边
cqu_shuai
·
2022-11-24 05:31
DGL
深度学习
pytorch
图神经网络
DGL
GCN
跟着官方文档学
DGL
框架第十三天——大型图上的随机训练之边分类
参考资料https://docs.
dgl
.ai/en/latest/guide/minibatch-edge.html#guide-minibatch-edge-classification-samplerhttps
cqu_shuai
·
2022-11-24 05:31
DGL
深度学习
神经网络
图神经网络
DGL
边分类
跟着官方文档学
DGL
框架第九天——训练图神经网络之边分类/回归
参考链接https://docs.
dgl
.ai/en/latest/guide/training-edge.html#guide-training-edge-classification回归问题与分类问题只是损失函数上的不同
cqu_shuai
·
2022-11-24 05:01
DGL
深度学习
pytorch
图神经网络
DGL
GNN
【深度学习】R-GCN的
dgl
官方代码解读(entity classification)
来源:r-gcn官方代码实现:4_rgcn.py以下主要是记录个人对官方代码的理解。注意这篇官方教程只写了entityclassification的代码。参考文章:这篇博客R-GCN:多层网络由多层R-GCNLayer组成,代码比较简单在此略过,重点看每一层是怎么实现的。RGCNLayer:单层卷积网络先全部摆出来,然后再着重看几个部分。classRGCNLayer(nn.Module):def_
逍遥de鱼
·
2022-11-24 05:55
深度学习
python
人工智能
如何利用
DGL
官方库中的rgcn链接预测代码跑自己的数据集(如何在
DGL
库的链接预测数据集模块定义自己的数据集类)
最近在忙我的省创,是有关于知识图谱的,其中有一个内容是使用rgcn的链接预测方法跑自己的数据集,我是用的
dgl
库中给出的在pytorch环境下实现rgcn的链接预测的代码,相关链接贴在这里:
dgl
库中关于
自信的小螺丝钉
·
2022-11-24 04:51
科研
人工智能
深度学习
知识图谱
图神经网络框架
DGL
学习 104——图分类模型(Graph Classification Tutorial)
学习利用
DGL
进行批次化训练图分类模型。这是一个图层面的任务。图形分类是生物信息学,化学信息学,社会网络分析,城市计算和网络安全等许多领域应用的重要问题。将图神经网络应用于此问题是最近流行的方法。
wufeil
·
2022-11-24 04:17
图神经网络
python
神经网络
深度学习
机器学习
可视化
图神经网络17-
DGL
实战:节点分类/回归
对于图神经网络来说,最常见和被广泛使用的任务之一就是节点分类。图数据中的训练、验证和测试集中的每个节点都具有从一组预定义的类别中分配的一个类别,即正确的标注。节点回归任务也类似,训练、验证和测试集中的每个节点都被标注了一个正确的数字。概述为了对节点进行分类,图神经网络执行了guide_cn-message-passing中介绍的消息传递机制,利用节点自身的特征和其邻节点及边的特征来计算节点的隐藏表
致Great
·
2022-11-24 04:17
图神经网络
mxnet以及
dgl
的配套安装(linux服务器、GPU版)
mxnet以及
dgl
的配套安装(linux服务器、GPU版)1、在确定CUDA正常能够使用的情况下,先查看CUDA的版本,linux服务器上使用nvcc--version命令查看,我的是10.1版本的。
不知名亮仔!
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2022-11-24 04:46
python
linux
mxnet
图神经网络之
DGL
安装
使用简单的pip直接安装
dgl
是可以成功的,但训练使用cuda的话则会报错,注意,如果使用torch框架,则必须在
dgl
安装之前安装torch…
DGL
安装:condainstall-cdglteamdgl-cuda10.1
码匀
·
2022-11-24 04:16
笔记
DGL
图神经网络实践之图节点分类(一)
本文主要以DeepGraphLibrary(
DGL
)为基础,利用图神经网络来进行图节点分类任务。本篇针对的图为同构图。
nrcc
·
2022-11-24 04:14
深度学习
神经网络
人工智能
跟着官方文档学
DGL
框架第十一天——训练图神经网络之整图分类(Graph Classification)
参考链接https://docs.
dgl
.ai/en/latest/guide/training-graph.html#guide-training-graph-classificationhttps:
cqu_shuai
·
2022-11-24 04:42
DGL
pytorch
图神经网络
DGL
图分类
GCN
【图神经网络】使用
DGL
框架实现简单图分类任务
使用
DGL
框架实现简单图分类任务简单图分类任务实现过程打包一个图的小批量定义图分类器图卷积读出和分类准备和训练核心代码参考资料图分类(预测图的标签)是图结构数据里一类重要的问题。
镰刀韭菜
·
2022-11-24 04:41
深度学习
复杂网络与图学习
深度学习
图神经网络
DGL
图分类任务
图卷积
DGL
学习笔记——第一章 图
提示:
DGL
用户指南学习中文章目录一、关于图的基本概念?
斯外戈的小白
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2022-11-24 00:58
学习
python
人工智能
知识图谱嵌入模型代码梳理
1、下山方法2、详解3、代价函数part1:线性回归part2:最小二乘法(LeastSquareMethod)二、
DGL
1、引入库2、
dgl
.DGLGraph(g_nx)3、
dgl
.DGLGraph(
spark plug
·
2022-11-22 12:17
#
人工智能导论
知识图谱经典算法合集
#
深度学习
知识图谱
人工智能
关于深度学习的一些总结
关于深度学习的一些总结一、
DGL
1、DeepGraphLibrary(
DGL
)是一个Python软件包,用于在现有DL框架(例如PyTorch,MXNet,Gluon等)之上实现图神经网络模型。
是馨呀!
·
2022-11-21 03:28
深度学习
神经网络
深度学习
python
【
dgl
学习】
dgl
实现GAT(图注意力网络)
1GAT的实现步骤参考文献[1]UnderstandGraphAttentionNetwork
一穷二白到年薪百万
·
2022-11-20 10:47
#
dgl
学习
图神经网络
dgl
教程
importdglimporttorchimporttorch.nnasnnimporttorch.nn.functionalasF一、实现GCN节点分类1.1加载cora数据集importdgl.data#networkxdataset=
dgl
.data.CoraGraphDataset
qq_45812502
·
2022-11-19 19:52
图学习
深度学习
机器学习
人工智能
OSError: libcudart.so.10.2: cannot open shared object file: No such file or directory
https://blog.csdn.net/kangyahui900/article/details/104662849我的就不是了,我装的是
dgl
-cu102(0.4.3),在自己的
qq_40819945
·
2022-11-19 10:03
NLP学习之路
python
分布式GNN系统环境配置
分布式GNN系统环境配置DL环境Anacondascp命令安装anacondaconda虚拟环境命名创建虚拟环境安装pytorch1.9.安装
DGL
库conda环境迁移配置VScode远程调试!!!
77summer77
·
2022-11-19 08:32
dgl
工具
分布式
pytorch
人工智能
【节点分类】python实现:4种(GNN,GAN,SAGE,APPNP)图神经网络(-
dgl
库-pytorch-cuda-)
信息系统建模作业,要求是使用四种不同的节点表征方法两个3k+数据集环境:pytorchcuda11.1
dgl
-0.6.1(cuda环境配置指路:我发的第一篇文章)
dgl
库各种网络功能介绍:https:/
shjvdfygeknpdchaoyi
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2022-11-14 11:29
作业
pytorch
python
神经网络
GNN教程:
DGL
框架实现GCN算法!
↑↑↑关注后"星标"Datawhale每日干货&每月组队学习,不错过Datawhale干货作者:秦州,算法工程师,Datawhale成员引言本文为GNN教程的第七篇文章【使用
DGL
框架实现GCN算法】。
Datawhale
·
2022-11-14 11:54
神经网络
算法
python
深度学习
机器学习
PyTorch Geometric(PYG)入门指南
PyTorchGeometric入门指南pytorchgeometric是基于pytorch框架封装的图神经网络库,相比于
DGL
库更加便利,符合pytorch开发规范,拥有pytorch基础,更易于使用
GIS_11
·
2022-11-13 11:36
深度学习
pytorch
深度学习
GNN
【PyG 教程】PyTorch Geometric 安装与入门
文章作者:梦家个人站点:dreamhomes.top原文地址:https://dreamhomes.github.io/posts/202005182019.html公众号ID:DreamHub早期基于
DGL
梦家
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2022-11-13 11:57
graph
neural
network
PyTorch
PyG
GNN
图神经网络库
DGL
使用指南
目录第1章:图本章路线图1.1关于图的基本概念1.2图、节点和边1.3节点和边的特征1.4从外部源创建图从外部库创建图从磁盘加载图逗号分隔值(CSV)JSON/GML格式
DGL
二进制格式1.5异构图创建异构图使用多种类型从磁盘加载异构图逗号分隔值
sinat_38007523
·
2022-11-12 17:38
python
深度学习
图论
python
PPI数据集分析
PPI数据集下载地址:https://data.
dgl
.ai/dataset/ppi.zip1.数据集介绍蛋白质-蛋白质相互作用网络,包含位置基因集,基序基因集和免疫特征作为特征(共50个)和基因本体集作为标签
杰克船长有烦恼
·
2022-10-28 07:18
论文从零开始
python
深度学习
人工智能
基于图神经网络 链路预测
基于图神经网络的归纳矩阵补全[图表示学习]1链路预测问题文献总结[图表示学习]2动态图(DynamicGraph)最新研究总结(2020)[图表示学习]动态网络上的图神经网络文献阅读总结:网络表示学习跟着官方文档学
DGL
tiger00O
·
2022-10-09 15:03
神经网络
深度学习
Anacoda + pytorch 环境下安装
DGL
_GPU
首先假设您已安装了pytorch虚拟环境在cmd中输入命令查看cuda版本nvcc--version打开https://www.
dgl
.ai/pages/start.html选择本地CUDA对应的
DGL
_GPU
SevenBerry
·
2022-08-22 21:58
pytorch
python
机器学习
神经网络
使用
DGL
构建自己的GNN模型
说明:这个系列来自于
DGL
上面的ABlitzIntroductiontoDGL。如果看英文习惯的小伙伴还是建议直接看官网文档。
super_Racin
·
2022-07-31 07:08
DGL
神经网络
DGL
库中一些函数或者方法的介绍
文章目录前言AddReverse()update_all()apply_edges()apply_nodes()apply_each()HeteroLinear参考前言
DGL
库中有许多内置函数和方法,还是需要记录一下
Icy Hunter
·
2022-07-31 07:02
DGL
深度学习
人工智能
python
DGL
GraphSAGE的一些理解以及一些模块的
DGL
的代码实现
文章目录前言GraphSAGE传播公式邻居采样聚合函数minbatchDGL实现邻居采样同构图异构图总结参考前言因为参加天池比赛,要求最好使用纯inductive的模型,一脸懵逼,inductive是什么,后来搜了才知道,还有transductive模型,具体区别就是,transductive是只能够用于已知的图结构,而inductive可以用于未知的图结构,我们平时所用的模型一般都是induct
Icy Hunter
·
2022-07-31 07:45
DGL
机器学习
人工智能
DGL
GraphSAGE
邻居采样
PyG利用MessagePassing搭建GCN实现节点分类
数据处理2.MessagePassing3.GCN3.1message3.2aggregate3.3update3.4propagate4.GCN模型搭建4.1模型训练4.2模型测试5.完整代码前言PyG和
DGL
Cyril_KI
·
2022-07-29 07:55
PyG
GNN
PyG
MessagePassing
节点分类
使用StanfordCoreNLP的句法树以及NLTK的Tree建立
DGL
的图数据结构
文章目录前言构建思路前言因为其实Tree-LSTM的数据类型构造起来也是比较麻烦的,还是要记录一下,以防之后忘记构建思路因为前面一篇写的Tree-LSTM是用
DGL
实现的,那么图数据结构自然也要用
DGL
Icy Hunter
·
2022-07-17 07:26
DGL
数据结构
Tree-LSTM
DGL
句法树
DGL
分布式流程
DGL
分布式流程官网documentinteractingprocessesAPIinitializeDistGraphServerload_partitionDLpackDisGraphnum_nodes
77summer77
·
2022-07-11 07:45
dgl
分布式
分布式
图神经网络:
dgl
官方教程( 一 )
在图的一部分上进行消息传递2.4在消息传递中使用边的权重2.5在异构图上进行消息传递3.1DGLNN模块的构造函数3.2编写DGLNN模块的forward函数3.3异构图上的GraphConv模块4.1
DGL
cc太菜了怎么办
·
2022-07-11 07:15
GNN
性能提升19倍,
DGL
重大更新支持亿级规模图神经网络训练
我们在去年12月发布了DeepGraphLibrary(
DGL
)的首个公开版本。
喜欢打酱油的老鸟
·
2022-07-11 07:15
人工智能
图神经网络
亿级规模
DGL重大更新
GCN——
DGL
教程
官方教程中文版安装
DGL
内置函数和消息传递APIdgl.function查阅需要的函数,官方教程没有注释消息传递框架(MessagePassingParadigm):可以对“边”或者“节点”计算,(小白
卢容和
·
2022-07-11 07:07
GNN
pytorch
DGL
第一章(官方教程)个人笔记
DGL
库很友好出了汉语教程地址就在这个地方,这里基本从那边粘贴过来,算作个人笔记。第一章图
DGL
的核心数据结构DGLGraph提供了一个以图为中心的编程抽象。
名字填充中
·
2022-07-11 07:07
nlp
图神经网络
DGL教程
【Pytorch神经网络理论篇】 27 图神经网络
DGL
库:简介+安装+卸载+数据集+PYG库+NetWorkx库
DGL
库是由纽约大学和亚马逊联手推出的图神经网络框架,支持对异构图的处理,开源相关异构图神经网络的代码,在GCMC、RGCN等业内知名的模型实现上也取得了很好的效果。
LiBiGo
·
2022-07-11 07:36
#
深度学习理论篇
python
深度学习
神经网络
人工智能
超分辨率重建
利用
DGL
中的消息传递API手搭GCN实现节点分类
目录1.前言2.数据3.GCN3.1消息函数3.2聚合函数3.3更新函数3.4模型训练/测试1.前言前面的两篇文章分别介绍了
DGL
中的数据格式和消息传递API:了解
DGL
中的数据格式详解
DGL
中的消息传递
Cyril_KI
·
2022-07-11 07:54
DGL
GNN
GNN
GCN
DGL
消息传递
详解
DGL
中的消息传递API
目录1.前言2.
DGL
消息传递范式2.1消息函数2.2聚合函数2.3更新函数2.4update_all()案例:GCN1.前言最近有用到
DGL
来手写GNN算子,因此需要简单理解一下消息传递范式。
Cyril_KI
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2022-07-11 07:54
DGL
dgl
GNN
图神经网络
了解
DGL
中的数据格式
目录前言1.
DGL
数据集1.1
dgl
.DGLGraph1.2
dgl
.graph()1.3
dgl
.heterograph()前言在PyG搭建GCN前的准备:了解PyG中的数据格式中讲解了PyG中的数据格式
Cyril_KI
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2022-07-11 07:50
DGL
dgl
pytorch
图神经网络框架
DGL
中的 消息函数、聚合函数及更新函数 的理解与说明
在
DGL
框架中,当我们明白了边、顶点、图以及边和顶点的属性后,接下来需要了解的概念就是三座大山了:消息函数聚合函数更新函数mailboxdgl的节点有一个概念是mailbox,用一暂存消息函数发送过来的数据
znsoft
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2022-07-06 07:06
图神经网络
图神经网络DGL
图神经网络(一)
DGL
框架搭建GCN图卷积神经网络模型
一、DGLDGL是基于pytorch开发的一个专门用于图神经网络模型搭建的框架,到现在为止,
DGL
已经高度封装了如GCN、GraphSage、GAT等常见的图神经网络模型,可以直接调用,比较方便,当然针对非常想挑战自己的编程能力又或者非常想从更底层的角度去学习图神经网络
Guapifang
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2022-07-06 07:31
图神经网络
深度学习
神经网络
cnn
pytorch
gcn
【
DGL
学习4】使用
DGL
构造异构图
使用
DGL
都早异构图参考:https://docs.
dgl
.ai/guide_cn/graph-heterogeneous.htmlimportdglimporttorchUsingbackend:pytorch
智慧的旋风
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2022-07-06 07:00
GNN实验
深度学习
python
DGL
GNN
pytorch
DGL
实现同构/异构图卷积模型
__init__()#gcnself.conv1=
dgl
.nn.Graph
cici_iii
·
2022-07-06 07:58
DGL
pytorch
python
深度学习
基于注意力机制的图神经网络且考虑关系的R-GAT的一些理解以及
DGL
代码实现
文章目录前言R-GAT传播公式
DGL
代码实现模型构建数据集构建测试模型参考前言因为R-GAT在
DGL
的官网上并没有给出实例教程,然后原文的代码实在是太长了,完全头大,只能在网上疯狂搜索野生代码,最后搜到一个通过
Icy Hunter
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2022-07-06 07:52
DGL
机器学习
深度学习
图神经网络
DGL
R-GAT
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