E-COM-NET
首页
在线工具
Layui镜像站
SUI文档
联系我们
推荐频道
Java
PHP
C++
C
C#
Python
Ruby
go语言
Scala
Servlet
Vue
MySQL
NoSQL
Redis
CSS
Oracle
SQL Server
DB2
HBase
Http
HTML5
Spring
Ajax
Jquery
JavaScript
Json
XML
NodeJs
mybatis
Hibernate
算法
设计模式
shell
数据结构
大数据
JS
消息中间件
正则表达式
Tomcat
SQL
Nginx
Shiro
Maven
Linux
blas
20230417 -- 处理 多个VHH sanger测序序列
#20230417#序列来源生工测序:sanger序列#目的:整理成fasta,并且将上下游序列拼接组成contigs,然后ig
blas
t#有些.seq文件没有配对文件,有些.seq文件是多行输出结果,
All_Will_Be_Fine噻
·
2023-04-18 13:26
bioinfo
VHH
NGS
linux
NGS
本地
Blas
t的安装与使用
Blas
t的安装说明:
BLAS
T工具是由NCBI所提供。
中午打个盹
·
2023-04-17 19:27
linux下载
blas
t软件
linux下载
blas
t软件/pub/software/里面下载下载ncbi-
blas
t-2.13.0+-x64-linux.tar.gz(rpm结尾,红帽操作系统,src文件为源代码,需要准换为二进制格式
μμ豆奶
·
2023-04-17 07:27
linux
linux
ubuntu
运维
RuntimeError: CUDA error: CU
BLAS
_STATUS_INTERNAL_ERROR when calling `cu
blas
Create(handle)`
##RuntimeError:CUDAerror:CU
BLAS
_STATUS_INTERNAL_ERRORwhencallingcu
blas
Create(handle)最近在使用pytorch训练神经网络时出现了标题所示的错误
汉德萨姆ys
·
2023-04-17 00:30
神经网络和深度学习
深度学习
python
机器学习
人工智能
cuda
Install metawrap-env
metaWRAPcondainstall-ymambamambacreate-y--namemetawrap-env2--channelurskymetawrap-mg=1.3.2速度特别快condaactivatemetawrap-env2condainstall-y
blas
小白菜学生信
·
2023-04-16 19:30
教授专栏52 | 王吉光团队: 整合数据科学与生物技术, 揭秘肿瘤抗药异质性, 助力精准医疗...
杂志发表了一篇题为《PharmacogenomicprofilingrevealsmolecularfeaturesofchemotherapyresistanceinIDHwild-typeprimaryglio
blas
toma
香港科大商学院内地办事处
·
2023-04-16 12:02
人工智能
2022-12-06加油!!!!L3局部对齐
https://www.jianshu.com/p/e20994e5e33chttps://zhuanlan.zhihu.com/p/388359186
blas
talgorithm----in
八段锦1134
·
2023-04-16 11:04
回顾UCL经验 Recapping my UCL experience!
I’mattheendofmyleghereinLondon,ithasbeensucha
blas
tgettingtolearnallthedifferentfacetsofeducationtechnologytodaywithmylovelyfolksatt
NicholasTan尼克
·
2023-04-16 11:41
python中tensorflow_python – 如何解释TensorFlow输出?
Itensorflow/stream_executor/dso_loader.cc:105]successfullyopenedCUDAlibrarylibcu
blas
.solocallyItensorflow
weixin_39759589
·
2023-04-16 08:21
GWIPS-viz + hORFeome
用bowtie2比对
blas
t匹配到lncRNA的序列到基因组上bowtie2-p24-x~/RNASEQ/index/bowtie2_index/GCA_000001405.15_GRCh38_no_alt_analysis_set.fna.bowtie_index
547可是贼帅的547
·
2023-04-16 06:53
BLAS
T -help
blas
tp-helpUSAGE
blas
tp[-h][-help][-import_search_strategyfilename][-export_search_strategyfilename][-
喜欢吃土豆的彭某人
·
2023-04-15 21:27
Tensorflow在Pycharm中报错 :找不到 libcu
blas
.so.8.0
ImportError:libcu
blas
.so.8.0:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory解决办法在Pycharm中添加环境变量进入菜单Edit
玖月初识
·
2023-04-15 10:09
Docker 基本操作
退出镜像后删除容器(container)#-it交互式进入容器#-v将某一文件夹下目录映射到docker/work工作目录#最后加上选择进入的镜像ID#-w加默认进入目录常见命令dockersearch
blas
t
奔跑的Forrest
·
2023-04-14 09:07
硬核原著 · 读圣经,学西语(第2期)
原文展示:Génesis1:2Ylatierraestabasinordenyvacía,ylastinie
blas
cubríanlasuperfi
胡老师的英语课
·
2023-04-13 13:02
多组学高分文献19-胶质母细胞瘤的整合药物蛋白质组学
Integratedpharmaco-proteogenomicsdefinestwosubgroupsinisocitratedehydrogenasewild-typeglio
blas
tomawithprognosticandtherapeuticopportunities
纪伟讲测序
·
2023-04-12 01:52
文献学习046--[st (FFPE)]肾细胞癌中三级淋巴结构是抗肿瘤浆细胞的生成和散播场所
HighlightsTertiarylymphoidstructuresaresitesofinsituBcellmaturationtowardplasmacellsIgG+andIgA+plasmacellsdisseminateintothetumortissuealongfibro
blas
tictracksTumorcellsarelabeledbylocallyproducedIgGPa
Hayley笔记
·
2023-04-12 00:26
宏基因组之物种注释(基于nr库)
软件需求:
blas
t,diamond,taxonkit(安装自行百度)构建细菌子库
blas
t方法可能会准确点,但是它的速度简直让我怀疑人生,俩种软件的方法我都说下吧,因为我比对的主要是细菌,我首先想到是干脆按照网上的方法构建一个细菌的子库可能速度会更快点
凯凯何_Boy
·
2023-04-11 21:02
blas
t 用法汇总
blas
t安装:先在网上找到最新版的
blas
t下载到本地;thisisthedownloadpadge:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/
blas
t/executables/LATEST/这里下载的是最近版本
11的雾
·
2023-04-11 14:08
单细胞scRNA-seq学习笔记3-示例文献理解
基础)课程分析的示例文章来自:2018年12月的NC文章:Spatiallyandfunctionallydistinctsubclassesofbreastcancer-associatedfibro
blas
tsrevealedbysinglecellRNAsequencing
天涯清水
·
2023-04-11 10:05
10X单细胞(10X空间转录组)整合分析之nature文献思路整理
关于多样本整合分析,之前我的公开课和宣讲课讲了很多,听过的都应该有一些整合的思路,今天我们来实地运用一下,看看高分文献是如何进行整合分析,文献在Cross-tissueorganizationofthefibro
blas
tlineage
Evil_Genius
·
2023-04-11 09:27
非模式生物基因GO富集分析:以水稻为例
模式生物做什么都简单,非模式生物则很多缺少注释,没有注释你就没法做,只能是借助于各种软件比如
blas
tgo,自己跑电子注释。
sober01
·
2023-04-11 03:22
儿童髓母细胞瘤单细胞转录组学-表观组学联合分析
Single-CellTranscriptomicsinMedullo
blas
tomaRevealsTumor-InitiatingProgenitorsandOncogenicCascadesduringTumorigenesisandRelapse.png
Insc
·
2023-04-11 01:44
新刊Nature Cancer: 单细胞分析揭示GBM肿瘤干细胞异质性
GradientofDevelopmentalandInjuryResponsetranscriptionalstatesdefinesfunctionalvulnerabilitiesunderpinningglio
blas
tomaheterogeneity
概普生信
·
2023-04-10 10:58
data2text-entity踩坑记录
Thefollowingvariablesareusedinthisproject,buttheyaresettoNOTFOUND.PleasesetthemormakesuretheyaresetandtestedcorrectlyintheCMakefiles:CUDA_cu
blas
_device_LIBRARY
简为2016
·
2023-04-09 19:15
Blas
t本地化快速上手教程
(*图片来自NCBI官网)https://
blas
t.ncbi.nlm.nih.gov/
Blas
t.cgi在线提交地址:https://
blas
t.ncbi.nlm.nih.gov/
Blas
t.cgi官方文档
爱上生物大数据
·
2023-04-09 02:46
AI学习杂记--tensorflow(1)
01GokulaKrishnanSanthanam认为,大部分深度学习框架都包含以下五个核心组件:张量(Tensor)基于张量的各种操作计算图(ComputationGraph)自动微分(AutomaticDifferentiation)工具
BLAS
「已注销」
·
2023-04-08 21:20
tensorflow
Blas
tBufferQueue 机制介绍
BBQ机制介绍:https://www.jianshu.com/p/50a30fa6952eBBQ原理解读:https://www.jianshu.com/p/cdc60627df90BBQ运用场景:https://www.jianshu.com/p/384a5cd2e304一、背景AndroidS版本之前,关于应用显示方面面临几个问题:应用程序在缓冲区的提交中灵活性不足,窗口与应用绘制之间无法做
大天使之剑
·
2023-04-08 20:17
「TBtools Plugin」使用open
BLAS
或Apple''s
BLAS
是你的R矩阵运算速度起飞
MacOS12.0以后的系统更改了
blas
的位置,具体去哪了现在不清楚,目前的办法是brew安装open
blas
,然后把open
blas
软连接过去问题与思考在写OneStepWGCNA插件的时候我就遇到过一个奇怪的现象
ShawnMagic
·
2023-04-08 12:23
安装 Tensorflow 遇到的坑
如果装完还是在importtensorflowastf时报ImportError:libcu
blas
.so.8.0:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfile
阿o醒
·
2023-04-08 11:54
如何从NCBI中获得16S rRNA序列
NCBI收集了16SribosomalRNAsequence,可以进行下载:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/
blas
t/dbimage.png解压后是已经建好索引的文件:image.png
scdzzdw
·
2023-04-07 06:45
3-【
blas
t】的安装和使用(2021.5.1)
安装时间:2021.2.31.简介
BLAS
T(BasicLocalAlignmentSearchTool),是一套在DNA数据库或蛋白质数据库中进行局部相似性比对分析的工具,其中包括
blas
tn(核酸比核酸
lkj666
·
2023-04-07 06:34
2019-03-13
1安装依赖包brewinstall-vdsnappyleveldbgflagsglogsziplmdbbrewinstallopen
blas
brewinstallhdf5opencv#boost需要在后续配置中注意
玉晨君
·
2023-04-06 03:54
单细胞108篇文献解读之12---Promotion of cholangiocarcinoma growth by diverse cancer-associated fibro
blas
t s...
利用单细胞转录组研究发现促进胆管癌生长的癌症相关成纤维细胞亚群图片研究背景在肝癌中,癌症相关成纤维细胞(CAF)的特性还有许多没有被研究明确。本文研究了CAF在肝内胆管癌(ICC)中的功能作用,通过遗传谱系追踪、单细胞RNA测序和配体-受体分析发现肝星状细胞(HSC)是CAF的主要来源,而HSC来源的CAF是与肿瘤细胞相互作用的主要亚群。单细胞RNA测序将CAF分为炎性和生长因子富集(iCAF)和
Seurat_Satija
·
2023-04-06 03:17
(Cont.) OpenPose OpenCV Caffe QT
Cont.condadeactivateRemembertodeactivatecondabeforecompilingcondadeactivatecaffecolas.hPath:openpose/3rdparty/caffe/include/c
blas
.hCase1
Cmy_CTO
·
2023-04-05 12:25
CV
#
opencv
#
OpenPose
caffe
opencv
qt
计算机视觉
基因家族共线性分析
共线性分析mcscan共线性分析12Jcvi教程最全的本地
blas
t教程安装jcvicondainstalljcvi准备文件gene.gff3cds.faprotein.facolineanalysis
wo_monic
·
2023-04-04 23:50
2021-04-24 分析Reads比对基因组后5和3端的序列情况
采用的斑马鱼线粒体基因组为标准序列将去掉接头的序列文件fq.gz变为fasta文件格式2.由于fasta文件过大,可以切割为多个文件下载
blas
t软件,构建标准数据库4.对多个文件进行本地
blas
t(构建的标准数据库
zebra_mito
·
2023-04-04 09:20
儿童 ALL 细胞系的深入多组学分层分析(IF14+)
Integrativemulti-omicsanddrugresponseprofilingofchildhoodacutelympho
blas
ticleukemiacelllines儿童急性淋巴细胞白血病细胞系的综合多组学和药物反应谱分析发表期刊
生信学霸
·
2023-04-04 04:10
linux
BLAS
T序列比对
安装本地
blas
t序列比对软件,我们可以搜索一个查询序列定制数据库,例如想研究一个新测序的基因组,或者感兴趣的一组蛋白质序列。
夕颜00
·
2023-04-03 16:32
易基因:m6A mRNA甲基化修饰调控CTNNB1促进肝母细胞瘤增殖的机制研究|Mol Cancer
MolecularCancer》(IF:41.444/Q1)杂志上发表了题为“m6AmRNAmethylationregulatesCTNNB1topromotetheproliferationofhepato
blas
toma
易基因科技
·
2023-04-03 12:18
生物学
生物信息学
经验分享
数据挖掘
人工智能
动手学深度学习001
使用的数据集是许多形如((area,age),price)的样本对损失函数如下优化方式使用梯度下降首先我们需要注意要多使用矢量加法,python的for循环调用解释器进行操作效率较低,而矢量加法的底层使用了一些C++和
BLAS
狂蛆如龙
·
2023-04-02 14:08
cu
BLAS
Level-3 Function
cu
BLAS
Level-3FunctionLevel-3进行的是矩阵和矩阵之间的操作。
Junr_0926
·
2023-04-01 22:25
2021-03-04
blas
t+ 比对两个denovo RNAseq序列
因此我觉得用
BLAS
T应该可以达到他的要求。以下为解决步骤方便以后再遇到类似情况:1.安装
blas
t+sudoaptinstall
blas
t2
hopi_bai
·
2023-04-01 14:23
Biopython学习笔记(三)
Blas
t
使用
BLAS
T通常可以分成2个步。这两步都可以用上Biopython。第一步,提交你的查询序列,运行
BLAS
T,并得到输出数据。第二步,用Python解析
BLAS
T的输出,并作进一步分析。
生信start_site
·
2023-04-01 06:00
TensorFlow DLL文件缺失的解决方案:cudnn64_8.dll not found&cusolver64_10.dll not found
本文目的:解决cu
blas
64_11.dllnotfound,cu
blas
Lt64_11.dllnotfound,cufft64_10.dllnotfound,curand64_10.dllnotfound
ACMSunny
·
2023-03-31 16:06
python
解决方案
tensorflow
python
一文搞懂NCBI
Blas
t本地数据库(NT/NR等)构建
背景介绍
blas
t+:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/
blas
t/executables/LATEST
blas
tdb:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/
blas
t
简佐义的博客
·
2023-03-31 16:13
数据库
redis
python
less
软件测试
blas
t+
make
blas
tdbmake
blas
tdb-inar14.fa-dbtypeprot-parse_seqids-outar14
nitrostarch
·
2023-03-31 00:12
纤维化机制:Myofibro
blas
t的来源和功能
1.简介纤维化是由肌成纤维细胞在慢性炎症反应中过度沉积细胞外基质(ECM)蛋白引起的疤痕和组织硬化。多种有害刺激(包括毒素、传染性病原体、自身免疫反应和机械应激)能够诱导纤维化细胞反应。纤维化会影响身体的所有组织,如果不加以控制,会导致器官衰竭和死亡。目前对调节纤维化发生的关键信号转导通路的研究已经确定了潜在的治疗靶标,以阻止纤维化的进展并恢复细胞功能。MyocardialInterstitial
Hayley笔记
·
2023-03-30 21:15
《学习小组Day3-Linux环境下软件安装-周晓飞》
1.压缩软件bzip22.conda了解--linux的应用商店(Appstore)3.安装和配置miniconda(wget、
blas
h、source激活)minicoda成功安装:4.使用miniconda
小灰_6edc
·
2023-03-30 13:07
本地
blas
t
建立比对数据库make
blas
tdb-inMs.Unigene.fa-dbtypenucl-parse_seqids-outMsrna'##建立比对数据库-in数据来源fasta格式,-dbtype数据库类型
茶思饭
·
2023-03-30 13:36
关于cu
blas
的一些问题
1.新建一个cuda的项目2.项目-->属性-->输入-->附加依赖项,将cu
blas
.lib添加进去,否则会报一系列cu
blas
函数错误:...无法解析的外部命令,在_main函数中引用。
sunshiner2018
·
2023-03-30 04:36
上一页
5
6
7
8
9
10
11
12
下一页
按字母分类:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
其他