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r语言逻辑回归
文献笔记八十四:Rsubread
R语言
里转录组表达定量工具
论文链接https://academic.oup.com/nar/article/47/8/e47/5345150本地文件gkz114.pdf
小明的数据分析笔记本
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2023-11-21 13:42
R语言
cox森林图绘制
杀杀cox森林图绘制cox的结果多为数据,绘制成表格较为不便,因此可以用森林图进行美化展示
R语言
中森林图的实现代码较为简单:library(forestplot)library(survival)library
不会生信哟
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2023-11-21 13:16
LLVM5.0环境搭建以及对C程序编译运行
LLVM有两个特点:(1)LLVM有一个特定指令格式的I
R语言
,我们可以通过书写Pass来对其IR进行优化。(2)可以作为多种语言的后端,提供与编程语言无关的优化和针对多种CPU的代码生成功能。
静水流深ylyang
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2023-11-21 12:01
R语言
的排列组合函数:排列函数(permutations)和组合函数(combinations)
R语言
的排列组合函数:排列函数(permutations)和组合函数(combinations)排列函数(permutations)和组合函数(combinations)是
R语言
中用于处理排列和组合问题的常用函数
幻想世界中的绚丽色彩
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2023-11-21 10:14
r语言
开发语言
R语言
R语言
绘图——数据可视化ggplot2 介绍和主要的参数
R有几种用于制作图形的系统,但ggplot2是最优雅和最通用的系统之一。与大多数其他图形包不同,ggplot2具有基于图形语法的底层语法,它允许您通过组合独立组件来组合图形。如果想要更加了解ggplot2,请阅读ggplot2:ElegantGraphicsforDataAnalysis,可以从https://ggplot2-book.org/getting-started.html学习本书介绍所
我是一只科研狗
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2023-11-21 08:37
R语言
如何合并2个单boxplot为1个多组boxplot(boxplot-multiple-group)
1.jpeg某一天,我生成了2个箱图boxplot,突然间老师要求合并成1个箱图,唉~~~于是我各种查资料,学着做这种分组plot,结果如上图所示,主要想用多组boxplot展示同组数据不同分类之间的区别,以及不同组之间的区别。以上是闲聊以下是代码定义个性化boxplot函数这个函数模块是生成多组boxplot的核心模块,功能是生成没有坐标轴的箱图,有它才能顺利生成想要的箱图。#定义boxplot
明天吃什么饭
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2023-11-21 08:12
(四)控制流、函数与apply家族
控制流
R语言
的循环和控制流包括:if、else、next、while、for等语句。
井底蛙蛙呱呱呱
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2023-11-21 04:16
使用
R语言
的clusterProfiler对葡萄做GO富集分析
葡萄的参考基因组下载自NCBI,下载链接是https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/003/745/GCF_000003745.3_12X/基本流程是Hiast2比对samtoolssam转bamstringtie组装转录本gffcompare将stringtie输出的gtf文件与参考基因组的注释文件做比较得到一-个merged.combin
小明的数据分析笔记本
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2023-11-21 04:20
二元分类问题搭建
逻辑回归
模型
1.读取数据——pandas#利用pandas读取数据importpandasaspddata=pd.read_csv(r"H:\Python\data\adult.data")cols=['age','education_num','capital_gain','capital_loss','hours_per_week','label']data=data[cols]data.head(8)运
weiyi99999
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2023-11-21 00:01
数据科学
Python
数据科学
逻辑回归模型
二元分类
基于sklearn的分类模型评估方法
与线性回归问题不同,分类问题,或者说
逻辑回归
问题输出的是离散值,即判断某件事物属于哪个类别。事实上,
逻辑回归
模型输出的是一个概率值,通过将这个概率预测值与设定
lymboy
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2023-11-21 00:29
机器学习
机器学习
逻辑回归
ROC
r语言
与多维统计_Kaukatcr:多维空间语言设计的实验
r语言
与多维统计与ProjectXanadu™[1]相关的各种项目之一是ZigZag™,ZigZag™是一种组织器系统或思维导图工具,围绕着称为ZZStructures的扭曲多维空间构建。
dfsgwe1231
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2023-11-21 00:18
python
java
编程语言
linux
操作系统
复杂数据统计与
R语言
程序设计实验二
1、创建一个对象,并进行数据类型的转换、判别等操作,步骤如下。①使用命令清空工作空间,创建一个对象x,内含元素为序列:1,3,5,6,8。②判断对象x是否为数值型数据。③将对象转换为逻辑型数据,记为x1。④判断x1是否为逻辑型数据。2、创建多种数据结构,并进行数据结构的各种操作,步骤如下。①使用命令清空工作空间,设置工作空间。②创建一个向量x,内含元素为序列:11,23,25,46,38,30,5
星星失眠️
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2023-11-21 00:47
复杂统计与R语言程序设计
r语言
python
开发语言
机器学习初探:(八)神经网络 - 1
(八)神经网络-1图片出处文章目录(八)神经网络-1神经网络(Neuralnetworks)神经元模型
逻辑回归
vs感知机多层网络多层网络的表示多层前馈神经网络几种激活函数Sigmoid函数tanh函数ReLU
黑洞拿铁
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2023-11-21 00:40
机器学习入门
神经网络
机器学习
深度学习
LINUX学习-预习
早上学习了一上午GEO数据的
R语言
处理,能听懂50%,感觉还要跑一个芯片看看结果。
米粥的味道
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2023-11-20 21:08
R语言
绘制配对样品箱线图
配对箱线图,常见于配对样本的数据分析中。例如下图示例,为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同,在取样时,往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织,两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中,往往需要调查很多的患者,因此会获得大量的配对样本。随后,通过qPCR或RNA-seq等方法定量基因表达后,以箱线图呈现特定基因在肿瘤组织和正常组织中的整体表达水平,并在箱线图中以
纪伟讲测序
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2023-11-20 20:40
如何利用
R语言
进行meta分析—详细教程(2)
如何利用
R语言
进行meta分析—详细教程(2)---(如何在meta分析中进行离群值检测与meta回归)小伙伴们大家好,在我上一篇的推文里详细讲解了如何利用
R语言
的meta包并以OR值和95%CI作为效应尺度进行合并作
吃一口小肉丸
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2023-11-20 18:27
【学习笔记】吴恩达机器学习 | 第五章 |
逻辑回归
简要声明课程学习相关网址Bilibili网易云课堂学习讲义由于课程学习内容为英文,文本会采用英文进行内容记录,采用中文进行简要解释。本学习笔记单纯是为了能对学到的内容有更深入的理解,如果有错误的地方,恳请包容和指正。非常感谢AndrewNg吴恩达教授的无私奉献!!!文章目录简要声明专有名词ClassificationClassificationHypothesisRepresentationLog
Benjamin Chen.
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2023-11-20 18:22
学习笔记
【学习笔记】吴恩达机器学习
机器学习
学习
人工智能
逻辑回归
人工智能基础_机器学习044_
逻辑回归
代码实现与手动计算概率---人工智能工作笔记0084
上面我们已经把
逻辑回归
的公式,以及,公式对应的图形都画画出来了,然后我们再来看看如何用代码实现可以看到上面是代码,咱们自己去写一下importnumpyasnpfromsklearn.linear_modelimportLogistieRegressionfromsklearnimportdatasets
脑瓜凉
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2023-11-20 18:20
人工智能
逻辑回归
逻辑斯蒂回归概率计算
gRPC入门------protocol buffers指南(一)
注:内容来自官网资料LanguageGuide(proto3).这份指南描述如何使用protocolbuffe
r语言
来构建你的protocolbuffer数据,包括.proto文件语法和如何从.proto
Sirius_lwq
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2023-11-20 18:46
天池-机器学习算法(一):基于
逻辑回归
的分类预测
sklearnhttps://scikit-learn.org/stable/index.htmlhttps://sklearn.apachecn.org/sklearn(scikit-learn)是基于Python语言的机器学习工具简单高效的数据挖掘和数据分析工具可供大家在各种环境中重复使用建立在NumPy,SciPy和matplotlib上开源,可商业使用-BSD许可证seabornhttps
luckyme_
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2023-11-20 12:40
深度学习
机器学习
python
R语言
实现多变量孟德尔随机化分析(1)
多变量孟德尔随机化分析调整了潜在混杂因素的影响。1、调整哪些因素?参考以往文献。可以分别调整,也可以一起调整。2、解决了什么问题?某个暴露相关的SNP,往往与某个或者某几个混杂因素相关。可以控制混杂偏倚。3、如何解释结果?若该暴露的P值小于0.05,则可以说明该暴露独立于其他暴露对结局产生影响。否则是通过其他因素对结局产生影响。#多变量孟德尔随机化(MVMR)library(TwoSampleMR
weixin_49320263
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2023-11-20 08:08
GWAS
r语言
R语言
的入门学习
目录准备工作导入csv数据集选择前200行作为数据集展示数据集的前/后几N行宏观分析删除缺失值构建直方图导出为图片
R语言
常见图像类型例1:散点图例2:散点矩阵图准备工作安装教程:
R语言
和RStudio的下载安装
一只天蝎
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2023-11-20 08:37
R语言数据分析
r语言
学习
开发语言
基于
R语言
平台Biomod2模型的物种分布建模与可视化分析
!](https://img-blog.csdnimg.cn/84e1cc8c7f9b4b6ab60903ffa17d82f0.jpeg#pic_center)
生信小窝
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2023-11-20 08:07
biomod2
R语言
:利用biomod2进行生态位建模
在这里主要是分享一个不错的代码,喜欢的可以慢慢研究。我看了一遍,觉得里面有很多有意思的东西,供大家学习和参考。 利用PCA轴总结的70个环境变量,利用biomod2进行生态位建模:#----------------------------------------------------------##NICHEMODELLINGWITHBIOMOD2USING########70ENVIRO
Amyniez
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2023-11-20 08:32
R语言
r语言
开发语言
gis
物种分布模型
biomod2
学习方法
经验分享
R语言
和RStudio的下载安装(非常简便舒适)
目录
R语言
和RStudio的关系
R语言
和Tableau下载
R语言
进入官网选择清华镜像源DownloadRforWindows选择base版本开始下载进行安装配置环境变量检查是否安装成功下载RStudio
一只天蝎
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2023-11-20 08:31
R语言数据分析
r语言
开发语言
R语言
绘制精美图形 | 火山图 | 学习笔记
一边学习,一边总结,一边分享!教程图形前言最近的事情较多,教程更新实在是跟不上,主要原因是自己没有太多时间来学习和整理相关的内容。一般在下半年基本都是非常忙,所有一个人的精力和时间有限,只能顾一方面。所以,长时间不更新是很正常的,若在看本教程的你,若有愿意分享的教程,可以投稿,我们也欢迎投稿。今天,来分享一下近两天自己的学习笔记。火山图,此图也是实用性很强,80%的同学应该可以用得到,今天分享的只
小杜的生信筆記
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2023-11-20 05:06
R语言精美图形绘制教程
学习
数据挖掘
r语言
数据库
信息可视化
笔记
开发语言
Day5-郭妞-数据结构
(6)表格在
R语言
中改名叫数据框_(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,
郭妞儿
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2023-11-20 01:27
我与
R语言
的相识与相知
作者:张宜峤,刚入职场的小白,自学
R语言
两年1相识第一次听说
R语言
,来自我的大学老师,她说她的学生都用
R语言
,她劝编程零基础的我试试,只要踏实,一步一个脚印,不管多么简单的代码都要亲手实践,那么入门一点儿也不难
R语言中文社区
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2023-11-19 19:07
Coding and Paper Letter(三十二)
rastertodf4.
R语言
包bigvis,大型数据集的探索性数据分析。big
G小调的Qing歌
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2023-11-19 19:57
【R】基础语法
matrix列表数据框因子factor缺失数据字符串日期和时间获取数据读入文件写入文件读写Excel文件读写R格式文件数据转换数据转换-reshape2包数据转换-tidyr包数据转换-dplyr包【参考课程】
R语言
入门与数据分析
Cqw、
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2023-11-19 16:20
r语言
逻辑回归
与混淆矩阵代码
##基础函数库importnumpyasnpimportpandasaspd##绘图函数库importmatplotlib.pyplotaspltimportseabornassnsfromsklearn.datasetsimportload_irisdata=load_iris()#得到数据特征iris_target=data.target#得到数据对应的标签iris_features=pd.D
灼清回梦
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2023-11-19 16:01
逻辑回归
矩阵
算法
机器学习之
逻辑回归
( Logistic Regression,LR)
机器学习之
逻辑回归
(LogisticRegression,LR)机器学习方法之
逻辑回归
(LR)原理介绍应用案例之鸢尾花分类
逻辑回归
优缺点机器学习方法之
逻辑回归
(LR)本文主要用简单的语言讲述一下
逻辑回归
方法的原理
在迷失中寻找自己
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2023-11-19 16:57
机器学习
人工智能
逻辑回归
python
机器学习
人工智能
逻辑回归
逻辑回归
算法--阿里云天池
Task01
逻辑回归
算法学习内容概括具体学习内容学习重点记录1学习重点记录2学习总结学习内容概括了解
逻辑回归
的理论,掌握
逻辑回归
的sklearn函数调用使用并将其运用到鸢尾花数据集预测。
碉堡的
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2023-11-19 16:26
python
机器学习
可视化
逻辑回归
logistic
regression
Regularized Logistic Regression(吴恩达机器学习:正则化
逻辑回归
)
文章目录RegularizedLogisticRegression题目:微晶体质检处理Trainingset数据可视化Feature_mappingsigmod函数损失函数求解梯度下降算法可视化预测RegularizedLogisticRegression题目:微晶体质检(吴恩达机器学习课后题链接放在最后)输入:两次测试的结果输出:微晶体质检结果(通过/驳回)Trainingset第一列为第一次测
Algorithm-
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2023-11-19 16:55
算法
机器学习
人工智能
逻辑回归
R语言
安装BiocManager包
if(!require("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install(version="3.16")library(BiocManager)#测试BiocManager::install('enrichplot')BiocManager::install('clusterProfile
Python_GNN-DL
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2023-11-19 15:48
r语言
学习
R语言
基础知识-学习笔记汇总
B站课程:生信必备技巧之
R语言
基础教程全集的代码笔记1.
R语言
包安装rm(list=ls())#设置镜像:options()$reposoptions()$BioC_mirror#options(BioC_mirror
生信研究猿
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2023-11-19 15:48
R语言课程笔记
学习
r语言
开发语言
PyTorch|
逻辑回归
的简单实现
01|什么是
逻辑回归
?经过前面的学习,我们介绍了张量Tensor的基本操作,也知晓了PyTorch的AutoGrad系统。有了上述基础,便可以试着训练简单的机器学习模型了。
木千之
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2023-11-19 14:24
AI+Security
逻辑回归
pytorch
pytorch学习:
逻辑回归
代码
#-*-coding:utf-8-*-"""CreatedonSunSep209:50:012018@author:www"""importtorchfromtorch.autogradimportVariableimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotasplt#设定随机种子torch.manual_seed(250)#读入数据withopen(r'E:\da
xckkcxxck
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2023-11-19 14:24
pytorch
MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作
融合
R语言
的MaxEnt模型的优势?
xiao5kou4chang6kai4
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2023-11-19 12:06
农业
生态
生物
r语言
开发语言
R语言
tuneR包,extractWave手工截取音频
R语言
tuneR包,extractWave手工截取音频5015c6f1-4282-4445-9114-1892c4f68ff9.pngSnipaste_2020-12-01_01-52-42.png#TueDec0101
youmigo
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2023-11-19 11:18
代做Risk Management、R程序语言调试、R设计代写帮做Haskell程序|代做
R语言
程序
1.(30points)ConsideraTermLifeinsurancecontractwith:-Policyholderis45yearsoldatthestartofthecontract.-SinglepremiumP,sothepolicyholderonlypaysatthestartofthecontract(t=0).-Benefitof$100,000,whichispaid
qiongqiangbi
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2023-11-19 10:09
R语言
|广义相加模型(GAM)
转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记:R软件:广义相加模型(GAM)01解决何种问题前面一期和大家分享如何运用样条回归处理遇到的非线性问题,但这适合处理单个因变量Y对应一个自变量X的问题,而现实情况是,我们常常要处理多个自变量和一个因变量之间的关系,除此以外,虽然通过做散点图能发现非线性关系,但很难归属它的形式,广义线性模型中的多项式回归,由于其不好解释的系数,降低了模型实用性。因此本章分
小易学统计
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2023-11-19 10:19
吴恩达《机器学习》9-1:代价函数
二、代价函数的变化回顾
逻辑回归
问题中的代价函数,有:在神经网络中,输出变量和因变量都是向量,因此代价函数更为复杂:这个代
不吃花椒的兔酱
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2023-11-19 10:07
机器学习
机器学习
学习
笔记
学习小组Day5笔记--LBB
今天的学习内容是
R语言
的数据结构向量1.标量和向量的区别标量:一个元素组成的变量向量:多个元素组成的变量。
LBB
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2023-11-19 07:00
R语言
ggplot2气泡图叠加图片的简单小例子
image.png之前有人在公众号留言问这幅图的实现办法,这个是气泡图,用ggplot2很方便能够实现,但是这个图比较特殊的是横坐标还有对应的图片,当然出图以后用其他软件来编辑是可以实现的,但是对齐之类的可能会比较麻烦。如果能用代码实现就能节省一些时间,正好最近看到一个ggplot2的扩展包叫做ggimg对应的github的主页是https://github.com/statsmaths/ggim
小明的数据分析笔记本
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2023-11-19 07:01
r语言
plot函数
R语言
中的plot()函数是一个用于创建各种类型的图形的基本绘图函数。它可以用来绘制散点图、线图、直方图、箱线图、饼图等多种图形。
南抖北快东卫
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2023-11-19 05:27
r语言
开发语言
【数据预处理2】数据预处理——数据标准化
在以梯度和矩阵为核心的算法中,如
逻辑回归
,支持向量机和神经网络,数据标
DJ.马
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2023-11-19 05:17
#
数据预处理
机器学习
【机器学习算法】机器学习:支持向量机(SVM)
与
逻辑回归
和神经网络相比,支持向量机,在学习复杂的非线性方程时提供了一种更为清晰,更加强大的方式。具体来说就是在线性可分时,在原空间寻找两类样本的最优分类超平面
DJ.马
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2023-11-19 05:16
#
机器学习
机器学习
算法
支持向量机
PSM倾向得分匹配法【python实操篇】
对于PSM原理不太熟悉的同学可以看看前一篇文章:PSM倾向得分匹配法【上篇:理论篇】目前网上PSM实操的相关文章都是
R语言
、SPSS和STATA实现的,少数Python版本代码不全,可读性有限(有些甚至要钱
水满船头滑
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2023-11-19 01:21
python
算法理解
R语言
读取CSV文件出现错误可能的原因之一
R语言
读取CSV文件出现错误可能的原因之一在
R语言
中,读取CSV文件是一项常见的任务。然而,有时候在读取CSV文件时会遇到错误。以下是可能导致错误的几种常见原因以及相应的解决方法。
HackDashX
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2023-11-18 19:37
r语言
数据库
python
R语言
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