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reshape2
合并同类型文件
GSE48213_RAW目录里面生成tmp.txt文件awk'{printFILENAME"\t"$0}'*|grep-vEnsEMBL_Gene_ID>tmp.txt##然后把tmp.txt导入R语言里面用
reshape2
白云梦_7
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2020-07-09 10:28
R语言数据变形melt和dcast用法
reshape2
包中的dcast函数和acast函数,两个函数都可以将长格式数据转换成宽格式数据。
棒棒糖one
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2020-07-08 21:41
R
【算法 机器学习】R语言做朴素贝叶斯和决策树算法
#朴素贝叶斯#####################################目标:利用朴素贝叶斯预测苹果是好的坏的rm(list=ls())gc()library(plyr)library(
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开心果汁
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2020-07-08 10:38
数据科学--机器学习
R语言进阶路上||遇见apply函数家族
关于数据的转化(或者叫提取摘要)R也出现了很多针对数据转化的R包:
reshape2
,tidyverse,magrittr,等等。其用
周运来就是我
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2020-06-30 03:26
R语言常用包分类总结
常用包:——数据处理:lubridata,plyr,
reshape2
,stringr,formatR,mcmc;——机器学习:nnet,rpart,tree,party,lars,boost,e1071
王亨
·
2020-06-29 22:11
R语言
R语言
R语言中的画布分区 (ggplot2)丨数析学院
示例数据我们将使用
reshape2
包中的tips数据集来做示例。2829这是一个根据tip占totalbill比值大小绘制的散点图。3031网格分区数据可以按照一个或者多个变量分开,使其在水
Datartisan数据工匠
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2020-06-27 09:54
differential expression matrix
corrplot')#install.packages('gpairs')#install.packages('vioplot')library(CLL)library(ggplot2)library(
reshape2
砖头机的灵感
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2020-06-26 14:20
R语言生态学数据分析
越来越多的研究采用R语言做为数据分析的工具,在这里整理常用生态学数据分析代码,供参考.物种组成柱形图#载入相应的包#如果未安装,请按下行代码安装#install.package(c("ggplot2","
reshape2
lazy虎
·
2020-04-11 23:47
盘一盘 生信技能树R语言小作业(高级)
生信人的20个R语言习题1.安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
绘图包:ggplot2
Forest_Lee
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2020-03-29 02:03
R语言作业-20题
生信人的20个R语言习题1安装R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
绘图包:ggplot2options
小梦游仙境
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2020-03-27 23:57
R语言数据整形-
reshape2
melt(data,id.vars=c(),measure.vars=(),variable.name="",value.name="")melt(muying3,id.vars="采购员",measure.vars=c("北京在库库存","上海在库库存","广州在库库存","成都在库库存","武汉在库库存","沈阳在库库存","其它机构库存"),variable.name="仓库",value.
付德刚Q
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2020-03-25 14:08
生信人的20个R语言习题-2019-06-20
20个R语言习题生信技能树原文链接请先看:生信人的linux考试安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
天涯清水
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2020-03-24 22:55
R小tip(八)热图添加显著性标志
我们这次讨论下如何在热图上标记显著性标记#psych包用于计算相关性、p值等信息library(psych)#pheatmap包用于绘制相关性热图library(pheatmap)#
reshape2
包用于输出数据的整合处理
小潤澤
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2020-03-24 20:13
利用
reshape2
包进行数据逆透视和数据透视
我们在数据分析的过程中经常会碰到不适合分析的数据格式,有的时候我们需要要画图或者建立n重交叉分析表,需要将长数据透视成宽数据;而有的时候宽数据不利于我们进行后续的分析,需要将数据转换成长数据。那什么是宽数据,什么是长数据呢?下面我们举个栗子看看吧。宽数据每一列为一个变量,每一行为变量所对应的值>library(openxlsx)>data=read.xlsx("/Users/afei/Deskto
鸣人吃土豆
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2020-03-16 03:37
R语言20练习题
www.bio-info-trainee.com/3409.html1安装R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
刘小泽
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2020-03-12 01:41
图书馆QQ咨询群聊天数据分析
数据准备和整理基础分析和高级分析结论#首先,是数据准备和整理library(stringr)library(plyr)library(lubridate)library(ggplot2)library(
reshape2
文质彬彬彬
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2020-03-04 02:50
R语言20练习题【完整版】
www.bio-info-trainee.com/3409.html再次基础上进行加工、重构,加入了自己的理解1安装R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
刘小泽
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2020-03-01 17:56
ggplot2 GCA SCA Recidual variances
Dlm_wk/8801growth_para/data")library(ggplot2)df.comp<-read.csv("var_h2_compare.csv")str(df.comp)library(
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董八七
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2020-02-29 17:13
Basics-安装和使用R包
install.packages("
reshape2
")#reshap2为包名在一个新R线程中使用该包之前,你必须先导入它。library(resha
王诗翔
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2020-02-27 16:36
【r<-格式|方案】长宽格式互相转换
这是
reshape2
包的一个新接口。
reshape2
包的melt()与dcast()函数。
王诗翔
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2020-02-27 07:45
【r<-方案】TCGA表达矩阵长宽格式变换
长宽格式互相转换一文中介绍了如何对数据的两种规整形式——长格式和宽格式进行相互转换,主要的两大利器tidyr(tidyverse)与
reshape2
。
王诗翔
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2020-02-16 03:30
Day9-生信人的20个R语言习题-2019-06-18-未完
生信人的20个R语言习题请先看:生信人的linux考试安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
天涯清水
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2020-02-14 20:35
生信技能树R语言作业-高级
为达到更好的浏览效果及查看全部图片,可转至RPubs1安装一些R包数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
Y大宽
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2020-02-14 19:54
【r<-包】R-数据操作(三):高效的data.table
接【r#>载入程辑包:'data.table'#>Thefollowingobjectsaremaskedfrom'package:
reshape2
':#>#>dcast,melt注意,data.table
王诗翔
·
2020-02-14 18:06
R package——dplyr(一)
首先我们先了解一下它的作者,著名的HadleyWickham,其作品包含强大的EDA工具包ggplot2,重命名工具包
reshape2
等……OS:一个“等”字,多少辛苦,多少汗水……通过数据从根本上了解世界真的是一件非常
iShareOne
·
2020-02-09 07:50
高效数据整理工具——dplyr(一)
在前面的数据处理笔记中提到了多个简单的数据处理函数(包括R内置的transform、aggregate、by、summary其他操作)以及工具包(主要为reshape、
reshape2
),这些工具虽然用起来比较方便
井底蛙蛙呱呱呱
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2020-02-09 01:44
PCA主成分分析实战和可视化 | 附R代码和测试数据
一、PCA应用#加载需要用到的R包library(psych)library(
reshape2
)library(ggplot2)library(factoextra)1.数据初始化#基因表达数据exprData
生信宝典
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2020-02-06 08:34
【r<-修整数据】使用
reshape2
包
分析之前,准备数据很多R用户都搞不太清楚用于修整数据的内置函数(比如stack、unstack与reshape),庆幸的是我们还有其他选择,HadleyWickham(ggplot2的作者)开发了一个
reshape2
王诗翔
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2020-01-23 18:57
R: Bubble matrix
觉得图好漂亮,这次又来当了次代码搬运工了Bubblematrix我们先创建一个数据data<-read.csv('E:/Rfile/data.csv',header=T)数据表格#加载包library(
reshape2
小潤澤
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2020-01-08 22:28
【生信技能树】R语言练习题 - 高级
www.bio-info-trainee.com/3409.html安装一些R包:数据包:ALL,CLL,pasilla,airway软件包:limma,DESeq2,clusterProfiler工具包:
reshape2
猫叽先森
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2020-01-08 14:08
在热图中画的相关基因趋势线
这里教你一招:step1:假设我们使用DESeq标准化后的数据,对标准化后的矩阵进行聚类(我取了log2(data+1))library(ggplot2)library(pheatmap)library(
reshape2
小潤澤
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2019-12-26 11:20
R中的柱形图
]..共同探讨进步有偿求助请出门左转door,合作愉快在日常作图中,柱形图就像白开水,没有特异之处,却处处责任担当今天我们就尝试通过R来展示各种柱形图数据准备>xsqwjknf(dt1library(
reshape2
飘舞的鼻涕
·
2019-11-06 07:02
长数据与宽数据的转换丨数析学院
指南:接下来,我们会对下列两套方法进行演示:tidyr包的gather()函数和spread()函数,这也是
reshape2
包的一个新接口。
reshape2
包的melt()和dcast()函数。
Datartisan数据工匠
·
2019-11-06 02:37
R中热力图的两种绘制方法-ggplot和pheatmap
数据格式如下:image.png基于ggplot的热力图绘制library(ggplot2)library(
reshape2
)setwd("D:/example/")#设定数据的存放路径data1<-read.csv
画长空_yin
·
2019-10-18 18:53
桑基图(Sankey)的简单实现
首先,运行别人的例子他使用的是泰坦尼克的数据data<-
reshape2
::melt(Titanic)head(data)
果子学生信
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2019-06-18 15:36
5
reshape2
reshape2
包主要掌握melt和ca
陈宇乔
·
2019-05-10 07:28
reshape2
包
1.长/宽数据R语言中,90%的情况下都是使用长型数据,比如构建回归模型,或者利用ggplot2构图,因此当遇到宽型数据时,第一时间就是要把它们转变成长型数据。①宽型数据每一列为一个变量,每一行为变量所对应的值>library(openxlsx)>data=read.xlsx("/Users/afei/Desktop/test.xlsx")>head(data)组别1月份2月份3月份4月份5月份6
apricoter
·
2019-01-23 21:39
PCA主成分分析实战和可视化 | 附R代码和测试数据
一、PCA应用#加载需要用到的R包library(psych)library(
reshape2
)library(ggplot2)library(factoextra)1.数据初始化#基因表达数据exprData0
生信宝典
·
2019-01-18 21:15
生物信息
R
生物信息
R
PCA
R语言presentation——超市销售数据分析
我们需要用到的包有:arules、arulesViz、chron、dplyr、ggplot2、gplots、
reshape2
、wordcloud2、plyr。
EverestRs
·
2018-12-15 13:38
大数据概论
R语言presentation——超市销售数据分析
我们需要用到的包有:arules、arulesViz、chron、dplyr、ggplot2、gplots、
reshape2
、wordcloud2、plyr。
EverestRs
·
2018-12-15 13:38
大数据概论
R实战 第八篇:重塑数据(
reshape2
)
数据重塑通常使用
reshape2
包,
reshape2
包用于实现对宽数据及长数据之间的相互转换,由于
reshape2
包不在R的默认安装包列表中,在第一次使用之前,需要安装和引用:install.packages
悦光阴
·
2018-07-18 11:00
R 语言命令收集
记得增加如下命令:source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
reshape2
::melt(data,…,na.rm=FALSE,value.name=“value
Y-hit
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2018-05-29 22:49
R
R语言数据集行列互换技巧
这里给大家介绍4个函数,其中melt()、dcast()来自
reshape2
包,gather()、spread()来自tidyr包一、宽转长——melt()、gather()mydatamydata1mydata1addressnameYearSale1
数据蜂鸟
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2018-05-17 11:08
R语言-用户细分
案例:通过使用R语言的聚类算法将用户进行合理的划分,找出对超市贡献度,光临度最高的优质客户,对后期的推广有更深远的影响1.导入包library(dplyr)library(
reshape2
)library
月上贺兰
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2018-03-25 12:00
R语言中的 "Error in gzfile(file, "wb") :cannot open the connection" 异常处理总结
R语言中的"Erroringzfile(file,"wb"):cannotopentheconnection"异常处理总结最近学R语言做数据分析时,遇到到一个很让人头疼的问题,
reshape2
包下载好了
悠风号
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2018-03-04 23:53
R语言数据处理
第四章 排序:智能收件箱
library(tm)library(ggplot2)library(dplyr)library(
reshape2
)library(tidyr)library(lubridate)data.path]'
binggorun
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2017-11-26 23:02
优化算法
机器学习
R笔记(简单数据处理)
R语言笔记#设定R软件当前工作目录setwd("E:/Rwork")#显示R软件当前工作目录getwd()#R语言数据预处理常用包安装#plyr,
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,lubridate,stringrinstall.packages
妄念驱动
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2017-09-01 10:55
R
r语言
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包-官方文档学习
R语言
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包-官方文档学习简介核心函数长数据与宽数据宽数据长数据melt函数meltarraymeltdataframemeltdefaultmeltlistcast函数dcast其它函数recastmelt_checkparse_formulacolsplitadd_margins
QimaoRyan
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2017-07-25 13:52
数据科学
R语言
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包-官方文档学习
R语言
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包-官方文档学习简介核心函数长数据与宽数据宽数据长数据melt函数meltarraymeltdataframemeltdefaultmeltlistcast函数dcast其它函数recastmelt_checkparse_formulacolsplitadd_margins
QimaoRyan
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2017-07-25 13:52
数据科学
市场研究中的数据分析知识整理 (一)
1数据选取library(readr)library(dplyr)library(plyr)library(reshape)library(
reshape2
)#基于kaggle数据集https://www.kaggle.com
pauke
·
2017-07-23 11:32
anders
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