孟德尔第2页

讲一讲孟德尔随机化分析中的敏感性分析（sensitivity analyses）

很多人问过我敏感性分析的问题，说明大家对敏感性分析普遍是有疑问的，我之前的推文中也没有详细的讲过，因此决定写这一篇补充一下敏感性分析的工作。什么是敏感性分析敏感性分析定义：敏感度分析是研究数学模型或系统(数值或其他)输出中的不确定性如何在其输入中被分配到不同的不确定性来源——摘自维基百科。我知道这段拗口的定义让人看了，感觉跟没看一样。所有的文字都认识，但是连起来就读不懂是什么意思了。所以我直白的翻

橙子牛奶糖·2023-09-05 01:05

本周最新文献速递20211226

Findinggenetically-supporteddrugtargetsforParkinson’sdiseaseusingMendelianrandomizationofthedruggablegenome不想看英文题目：孟德尔随机化鉴定帕金森病的药物靶点杂志和影响因子

橙子牛奶糖·2023-08-26 08:05

改良版自编小程序上线啦---助力孟德尔随机化(Mendelian Randomization)数据挖掘

孟德尔随机化步骤相对简单固定，一共就是3步，但是如果我们一个一个的对研究变量和结果数据进行筛选，也是挺费时间的，在上篇文章《自编R语言小程序助力孟德尔随机化(MendelianRandomization

天桥下的卖艺者·2023-08-25 10:10

孟德尔随机化招学员啦

中山医博士孟德尔随机化全流程感兴趣的话私聊～授课老师（2人）情况：均为中山医博士，目前共发表孟德尔随机化文章7篇，涵盖杂志包括ebiomedicine，JTRM，Addiction，Europeanpsychiatry

菜菜子孟德尔·2023-08-16 01:22

现代遗传学之父——孟德尔

孟德尔，1822年7月出生于奥地利摩拉维亚的海钦夫（现属捷克的海恩西斯）。父亲是一个爱好园艺的农民。孟德尔的快乐童年大多是在父亲的花园里度过的。他常跟随父亲栽培植物，并对种植花木产生了浓厚的兴趣。

生活对我下了手·2023-08-12 13:13

课间小憩话题：饮酒数据与教育程度相关？

近日，美国国立卫生研究院FalkW.Lohoff教授团队发表在《MOLECULARPSYCHIATRY》上发表重磅大样本人群队列研究，两样本孟德尔随机化对78万人数据的研究证实，教育程度影响饮酒行为和酒精依赖风险

概普生信·2023-08-11 03:09

保护孩子的求知欲

纵观人类历史的发展,莱特兄弟因为向往鹰的翅膀能飞翔于高空,瓦特因咕嘟嘟的水蒸气顶起了水壶的盖子而好奇,孟德尔因为热爱农业中的嫁接而在成年后延续自己的童年兴趣,才有了一项又一项改变世界的发明。

Liya丫丫姐姐·2023-08-09 09:16

R数据分析：孟德尔随机化分析文献解析和实例操练

最近抽空研读了一篇探讨高血压和肾功能关系的文献，记录下来分享给大家，主要也是想看看孟德尔随机化的统计分析结果在论文中是如何呈现的，之后我会给大家写写孟德尔随机化的统计分析在R语言中的做法，希望可以帮助到大家

Codewar·2023-08-06 04:44

孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系

1.孟德尔随机化方法传统观察性流行病学研究在发现疾病病因以及因果推断中存在诸多挑战，比如反向因果关联、潜在混杂因素、微效暴露因素以及多重检验等，当研究者诉诸于随机对照试验研究(randomcontroltrial

Hayley笔记·2023-08-05 15:43

孟德尔遗传的拓展

等位基因间的相互作用完全显性（completedominance）显性等位基因能完全遮盖隐性等位基因的作用，杂合子的表型与显性等位基因的纯合子相同。不完全显性（incompletedominance）显性等位基因不能完全遮盖隐性等位基因的作用，杂合子中显性性状不能完全遮盖隐性性状。（茉莉红花白花杂交出紫花）共显性（codominance）显性等位基因和隐性等位基因的作用互不干扰，杂合子中显性和隐性

没有眼镜·2023-08-04 11:34

孟德尔随机化，其实MR自带循环

关注微信公众号CodeMed在进行孟德尔随机化研究中，尤其是目前组学当道，大家都纷纷加入，看已发表的文章，想把其他人的研究结局，替换成自己的的研究方向，进行探索（发SCI）...但是，不可避免的出现一个问题

CodeMed·2023-08-02 14:57

自编R语言小程序助力孟德尔随机化(Mendelian Randomization)数据挖掘

咱们再前两期已经对孟德尔随机化进行了一个初步的介绍，孟德尔随机化步骤相对简单固定，一共就是3步，但是如果我们一个一个的对研究变量和结果数据进行筛选，也是挺费时间的，我随手写了一个R的小程序可以帮助咱们进行数据挖掘

天桥下的卖艺者·2023-08-02 14:21

【R包安装】TwoSampleMR 两样本孟德尔随机化

在Linux中安装R包TwoSampleMR用devtools直接安装报错解决办法用devtools直接安装报错library(devtools)devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")#configure:error:Headerfilegmp.hnotfound;maybeuse--with-gmp-include=INCLUDE_PATH#

.SHEER·2023-08-02 14:21

R语言复现一篇6分的孟德尔随机化文章

上一期我们对孟德尔随机化做了一个简单的介绍，今天我们来复现一篇6分左右的使用了孟德尔随机化方法的文章，文章的题目是：Mendelianrandomizationanalysisdoesnotrevealacausalinfluenceofmentaldiseasesonosteoporosis

天桥下的卖艺者·2023-08-02 14:47

精选核心资料“高中生物”核心资料——必修二知识点归纳

第一章遗传因子的发现第1、2节孟德尔的豌豆杂交实验一、相对性状性状：生物体所表现出来的的形态特征、生理生化特征或行为方式等。相对性状：同一种生物的同一种性状的不同表现类型。

橙老师学堂·2023-07-26 16:46

解析基因影响：孟德尔随机化的创新思维

本文的目的是探讨使用孟德尔随机化的创新思维来解析基因影响的重要性。孟德尔随机化是一种基于自然突变和基因重新组合的实验设计，通过利用随机分配的基因组合，帮助我们确定基因与个体差异之间的因果

笑不语·2023-07-21 21:31

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

在既往文章中，我们对孟德尔随机化研究做了一个简单的介绍。我们可以发现，使用TwoSampleMR包做出来的森林图并不是很美观。

天桥下的卖艺者·2023-07-16 12:23

大地母亲

“无法想象，没有您的英语启蒙，在一片闭塞中，我怎么能够阅读世界上最先进的科学文献，用超越那个时代的视野，去寻访遗传学大师孟德尔和摩尔根？

王文彦·2023-06-20 09:54

遗传算法[GA]

遗传算法借鉴了达尔文的进化论和孟德尔的遗传学说。其本质是一种并行、高效、全局搜索的方法，它能在搜索过程中自动获取和积累有关搜索空间的知识，并自适应地控制搜索过程以求得最优解。

发呆的比目鱼·2023-06-17 16:36

如何在 Python 中实现遗传算法

遗传算法的主要思想来源于达尔文生物进化论和孟德尔的群体遗传学说，通过数学的方式，将优化问题转换为类似生物进化中的染色体基因的交叉和变异等过程，因此具有坚实的生物学基础和鲜

之一Yo·2023-06-14 23:00

双向孟德尔随机化

关注微信公众号CodeMed在孟德尔随机化研究，进行验证是否存在反向因果关系，需要进行双向孟德尔随机化（BidirectionalMendelianrandomization）。

CodeMed·2023-06-12 02:28

孟德尔随机化——踩一个大家都没踩过的坑

孟德尔随机化——踩一个大家都没踩过的坑此次研究，我用的前人研究的数据，为Excel。

珏世佳人·2023-06-12 02:57

使用TwoSampleMR进行两样本的孟德尔随机化研究

欢迎关注”生信修炼手册”!TwoSampleMR是MR-Base数据库开发团队提供的R包，可以调用MR-Base数据库中已有的gwas结果，来进行2SMR分析，官方文档链接如下https://mrcieu.github.io/TwoSampleMR/2SMR分析需要两个输入文件，第一个文件为遗传变异与暴露因素的gwas结果，第二个文件为遗传变异与结局变量的gwas结果。对于暴露因素相关的gwas结

生信修炼手册·2023-06-12 02:56

R数据分析：工具变量回归与孟德尔随机化，实例解析

，今天给大家写工具变量和孟德尔随机化，文章略微有些长，请大家准备好清醒的头脑，和半个小时的阅读时间哈。

公众号Codewar原创作者·2023-06-12 02:26

TwoSampleMR-R教程两样本孟德尔随机化（原来真的就是这么简单……）

1.工具变量install.packages("remotes")remotes::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")##Toupdatethepackagejustrunthecommandagaininstall.packages("readxl")读取本地文件方法1：先改变量名，然后format_data()读取自己整理好的工具变量文件，命名如下图。注意

野柚子__·2023-06-12 02:55

R数据分析：孟德尔随机化中介的原理和实操二

delta方法上面的流程跑通之后，对于中介分析，我们需要报告间接效应的估计值和置信区间，还有中介比例的估计值和置信区间，类似下面的这样：但是其实我们是光跑孟德尔是得不到上面的需要的值的（比如间接效应的标准误

公众号Codewar原创作者·2023-06-12 02:55

R数据分析：孟德尔随机化实操

好多同学询问孟德尔随机化的问题，我再来尝试着梳理一遍，希望对大家有所帮助，首先看下图1分钟，盯着看将下图印在脑海中：上图是工具变量（不知道工具变量请翻之前的文章）的模式图，明确一个点：我们做孟德尔的时候感兴趣的是

公众号Codewar原创作者·2023-06-12 02:55

《辛普森一家》制作人患癌症去世，预防癌症的方法一定要告诉你

美国当地时间9月22日，《辛普森一家》制作人J·迈克尔·孟德尔因患结肠癌病逝，享年54岁，前段时间《蜡笔小新》、《名侦探柯南》、《火影忍者》配音老师蒋笃慧患宫颈癌病逝，享年49岁。

伊凯健康·2023-04-18 13:05

我们最应该追的星：DK出品—科学家的故事

生物学家生物学是对生命的研究，捷克遗传学家孟德尔从农场里的豌豆实验为我们揭开了遗传

晓珺笔迹·2023-04-18 13:11

教授专栏55 | 唐少军: 定期使用氨基葡萄糖与痴呆发病的关系:来自纵向队列和孟德尔随机化研究的证据...

文/唐少军教授、郑嘉臻痴呆症以认知和日常生活能力的不可逆进行性损害为特征，是一种异质性综合征，对患者、他们的亲属以及国家医疗保健系统都构成了重大负担。在英国，超过850,000人患有痴呆症。全球范围内，大约有5,000万人患有痴呆症，预计到2050年这个数字将上升到1.52亿。鉴于目前尚无有效的药物治疗痴呆症，近年来对可能可调节的保护因素进行识别和详细调查变得越来越重要。以往的研究高度支持葡萄糖胺

香港科大商学院内地办事处·2023-04-16 12:03

TwoSampleMR：两样本孟德尔随机化

孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系主要步骤：1.读取暴露因素GWAS数据选取合适的工具变量（如有必要，需要进行clumping）2.读取结局GWAS数据，提取上述的工具变量的SNPs3.对暴露因素与结局的

Hayley笔记·2023-04-16 07:18

人工智能作业之遗传算法

它是模仿自然界生物进化机制发展起来的随机全局搜索和优化方法，借鉴了达尔文的进化论和孟德尔的遗传学说。其本质是一种高效、并行、全局搜索的方法，能在搜索过程中自动获取和积累有关搜索空间的知识，并自适应地

呆狐仙·2023-04-16 00:00

本周最新文献速递20220116

Mendelianrandomizationanalysessupportcausalrelationshipsbetweenbloodmetabolitesandthegutmicrobiome不想看英文题目：孟德尔随机化分析支持血液代谢物与肠道微生物组之间的因果关系杂志和影响因子

橙子牛奶糖·2023-04-14 19:36

第十一章人类复杂疾病与计算系统生物学

vii.常见复杂疾病viii.先天性畸形ix.遗传变异是复杂疾病的决定因素x.人类遗传病分类b.染色体异常遗传病c.基因病i.概念ii.研究基因与疾病关系的主要目的iii.狭义基因病的分类a)单基因病(孟德尔遗传疾病

布兰迪乔·2023-04-14 02:44

精选知识点精华版“高中生物”核心资料——高考微生物知识大全

一、病毒类病毒指的是一类不具由细胞结构的生物，它们的变异剂本上是基因突变，都不遵循孟德尔的遗传规律。

橙老师学堂·2023-04-13 05:16

亲本分析杂谈（一）——分子标记系统发展

如果违背孟德尔定律，那么两个个体就不是亲子关系（当然，现实远没有那么简单，但我在之前的读书笔记中也提到，刚开始认识一个事物的时候，尽量保持幼稚、简单，别想着刚

HaoranWu·2023-04-04 12:32

水产养殖中的选择育种笔记1

此外，这些实验使他发现了两个定律：孟德尔的第一定律：分离定律。一对等位基因在杂合状态下，Aa，互不干预保持独立，在形成配子时分配到不同的配子中去。孟德尔的第二定律：自由组合定律。在配子形成过程中，两

虾里巴人·2023-04-03 04:45

使用Python实现的遗传算法附完整代码

遗传算法是模仿自然界生物进化机制发展起来的随机全局搜索和优化方法，它借鉴了达尔文的进化论和孟德尔的遗传学说。

琪琪%￥%·2023-03-31 04:25

每个物种基因组都是一个有趣的故事

《TheGene》《TheGene》是一部好剧，从贺建奎的基因编辑婴儿开始到Crispr基因编辑技术的发展历程结束，中间穿插了多个生命科学发展的重大事件，孟德尔的豌豆、摩尔根的果蝇、优生学、遗传物质的本质以及多个遗

我爱工作_工作使我快乐·2023-03-27 03:31

【国赛培训】遗传算法

1.遗传算法起源与发展遗传算法是模拟达尔文生物进化论的自然选择和孟德尔遗传学机理的生

地球上的新新人·2023-03-25 13:51

盘点2022年孟德尔随机化高分文章

都2022年了，竟然还有孟德尔随机化能发IF>10的文章！！！敲黑板，重点：所用数据全都是公共数据，完全可以复现！！！

rapunzel0103·2023-03-23 18:44

几个生态学名词辨析

欧文提出的同源性强调了结构和功能，而非达尔文和孟德尔时期强调的“共同祖先”。目前定义为，两个或多个性状、结构相似且具有共同祖先，那么它们同源的。

雪晗晗·2023-03-23 02:03

孟德尔随机化法（Mendelian randomization method）

这篇笔记的基础来自一篇中文文献，《孟德尔随机化法在因果推断中的应用》。英文来源：http://www.mend

又是一只小菜鸟·2023-03-23 02:05

遗传算法概念、步骤、应用解析(案例直白--黄含驰）

自然选择决定了群体中哪些个体能够存活并繁殖，有性生殖保证了后代基因的混合与重组②演化计算（EvolutionaryComputation,EC）是在达尔文（Darwin）的进化论和孟德尔（Mende

jubobolv369·2023-03-20 07:54

高中生物必修二

第一节孟德尔的豌豆杂交实验（一）1．孟德尔通过分析豌豆杂交实验的结果，发现了生物遗传的规律。2．孟德尔在做杂交实验时，先除去未成熟花的全部雄蕊，这叫做去雄。

小约翰_c789·2023-03-18 21:49

玩豌豆的孟德尔

德尔(1822.7.20-1884.1.6)，奥地利帝国生物学家。出生于奥地利帝国西里西亚海因策道夫村，在布隆(Brunn)(今捷克的布尔诺)的修道院担任神父，是遗传学的奠基人，被誉为现代遗传学之父。他通过豌豆实验，发现了遗传学三大基本规律中的两个，分别为分离规律及自由组合规律。(哎呀是截图)他的一生还是比较完美的，他小时候穷得响叮当，所以他没有受到过正规的教育。长大了以后，他又去了家乡里的修道院

一边上去·2023-03-13 20:39

有相关性就有因果关系吗，教你玩转孟德尔随机化分析（mendelian randomization ）

橙子牛奶糖·2023-03-12 13:09

七. 植物叶绿体基因组--组装，注释和比较作图（GetOrganelle，GeSeq，Chloroplot，IRscope）

叶绿体通过分裂方式增殖，通过细胞质遗传传递给后代（也叫母体遗传、单一亲本遗传、非孟德尔遗传等）。内共生起源学说认为叶绿体源于原始真核细胞内共生的蓝藻。

小飞虎·2023-02-18 18:32

基因组学发展历史-前奏

达尔文（1809-1882）格雷戈尔·孟德尔（GregorJohannMendel，1822年7月20日-1884年1月6日），奥地利帝国生物学家。出生于奥地利帝国西

花生学生信·2023-02-17 11:50

孟德尔随机化课程发表

中山医博士孟德尔随机化全流程感兴趣的话和我私聊吧～平均半年接受一篇，质量有保障现在是孟德尔的黄金时期，再等两年就不那么好发了，要发的抓紧吧～我之前自学，花费了大半年，才有了第一篇SCI（半个月接受，无需修回

行走在阡陌小道上·2023-02-05 18:10

推荐频道

孟德尔