基因组信息学

GenVisR 基因组数据可视化实战(三)

3.genCov画每个突变位点附件的coverage，跟igv有点相似。这个操作起来很复杂，但是图还是挺有用的。可以考虑。由于我的referencegenomebuild是hg38BiocManager::install(c("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene","BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38"))library(TxDb.Hsapien

11的雾·2024-09-16 05:47

保研日记--哈工大威海计算机学院

传送门保研日记--中国海洋大学计算机系保研日记--中国人民大学信息学院（人大信院）保研日记--北京交通大学计算机学院保研材料模板（自我介绍，个人简历，个人陈述，推荐信）哈工大威海计算机学院这次夏令营给我的感觉非常的朴素

faaarii·2024-09-16 00:11

佛山信息学真题桂城-2021-五年级3.4

最近学业太忙啦，就停更了一小会儿......三.挡住视线(GC4093)GC4093GC.2021.五年级.03.挡住视线http://43.139.152.26/d/DH_Trial/p/GC4093题目描述午饭时间在饭堂排队打饭。一行队伍中有N个人，小明站在队伍中第k个位置，身高高于小明的同学就会挡住小明的视线。请找出队伍中离小明最近且挡住小明视线的人。输入格式第一行有一个正整数N,表示队伍中

#Y清墨·2024-09-14 19:32

高通量测序的数据处理与分析指北(二)--宏基因组篇

博客原文宏基因组篇前言之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理，这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前，我们先来认识一下什么是宏基因组。

lantary·2024-09-14 12:52

保研日记--中国人民大学信息学院（人大信院）

传送门：保研日记--中国海洋大学计算机系保研日记--北京交通大学计算机学院保研日记--哈工大威海计算机学院保研材料模板（自我介绍，个人简历，个人陈述，推荐信）转眼就到九月份了本来想实时记录，忙起来就给忘了，眼看保研就要进入收尾阶段，回忆一下暑假的夏令营经历人大的面试内容没实时更新还有一个原因是，在面试开始做了口头的保密协议的，最后没有优营，不能成为人大人了（人大只有夏令营一次机会）所以还是打算记录

faaarii·2024-09-13 04:21

【笔记与idea】——ACL2017论文报告会

这篇是2017年我有幸参加了中文信息学会组织的ACL2017论文报告会记的笔记，当时还是研一新生，对NLP感兴趣，偶然通过老师知晓了这次报告会，所以想去现场听听大牛们的idea、和大牛们交流（然而由于当时没有入门

胖胖的飞象·2024-09-12 17:10

生信人应该这样来装软件(未完待续)

P1优先选择二进制可执行软件来安装不同组学任务模块比对重要全基因组测序/外显子测序找差异和变异转录组相关计数软件安装规律：二进制，下载解压，全路径调用#C语言查看在还是不在whichmakewhichcmakewhichjavawhichperlwhichpython

dandanwu90·2024-09-12 15:50

潜心教研，求真求实（960字）

去年我这边也搞了两节微课和一节课例，结果是石沉大海，惊不起一点涟漪，今年有所不同，有信息学科带头人蒋老师的专业引领，赣教云的在线活动了解得更多了一些，但仍然有许多盲点和不足，对这项工作的学习还是处于比较被动的局面

fcb12615e0bc·2024-09-12 00:09

逆转录病毒载体简介

随着现代医学的发展，研究者发现有越来越多的疾病与人类基因组的突变或缺失有关。几十年来，人们一直在探索一些疾病在分子水平的治疗，试图通过对患者基因的调控达到治疗某种疾病的目的。

生物GO·2024-09-11 13:37

基于深度学习的基因组数据分析

基于深度学习的基因组数据分析利用深度学习技术来处理和分析基因组数据，帮助解决基因组学领域中一些复杂且具有挑战性的问题。

SEU-WYL·2024-09-11 11:16

生物信息名词汇总|生物信息基础知识

生物信息名词汇总|生物信息基础知识GWAS-Genome-wideassociationstudies，全基因组关联研究：用于识别遗传区域（基因组）和性状/疾病之间关联的方法。

Red Red·2024-09-11 09:31

倒计时5天！“SMP-智谱AI大模型交叉学科基金”第二期持续申报中！数百万元现金或等额赞助支持...

中国中文信息学会社会媒体处理专委会（http://www.cips-smp.org）联合北京智谱华章科技有限公司（以下简称“智谱AI”），共同推出“SMP-智谱AI大模型交叉学科基金”第二期。

AITIME论道·2024-09-10 03:35

refgenie：参考基因组下载商店

HereweprovideawebinterfaceandaRESTfulAPItoaccessgenomeassetsforpopularreferencegenomeassemblies.refgenie提供了人、鼠等常见物种的参考基因组以及注释文件等信息

小贝学生信·2024-09-09 10:14

【机器学习】朴素贝叶斯方法的概率图表示以及贝叶斯统计中的共轭先验方法

朴素贝叶斯方法的概率图表示1.1节点表示1.2边表示1.3无其他连接1.4总结二、朴素贝叶斯的应用场景2.1文本分类2.2推荐系统2.3医疗诊断2.4欺诈检测2.5情感分析2.6邮件过滤2.7信息检索2.8生物信息学三

Lossya·2024-09-07 19:33

零基础入门生信数据分析——导读

零基础入门生信数据分析——导读生信数据分析，即生物信息学数据分析，是一个涵盖了生物学、计算机科学、数学和统计学等多个领域的交叉学科。

呆猪儿·2024-09-06 02:32

分子生物学-3

1.共线性（synteny）：一个物种的基因组中相互连锁的基因，在另一物种的基因组中也是连锁关系，而且在两个物种的遗传图上的位置也是相似的。例如，人与小鼠之间就有一百多个共线区。

ss的专属赫兹·2024-09-04 16:06

Signac::EnhanceCoveragePlot 参考实现流程

Signac中的CoveragePlot是一种用于展示基因组覆盖度的图形工具，常用于ATAC-seq（AssayforTransposase-AccessibleChromatinusingsequencing

倪桦·2024-09-04 12:23

【健康】《健康管理师》第三章—健康管理其他相关知识—第一节（健康信息学）

一、健康信息学1、信息的概念：信息是经过加工过的数据，它对接收者有用，对决策或行为有显示、潜在的价值。2、信息的主要特征物质属性：客观性、普遍性、有用性。

dear心理咨询师黄倩雯·2024-09-04 02:26

血液DNA提取产量高吗？

本试剂盒采用独特的裂解液配方，可直接从新鲜、冷冻或陈旧的全血中提取高质量的基因组DNA，也可以直接提取得到血液中感染的细菌或转移的肿瘤细胞

清风拂面vv·2024-09-03 15:54

3410：练70.2 判断字符串是否为回文

3410：练70.2判断字符串是否为回文信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统练70.2判断字符串是否为回文信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统判断字符串是否构成回文判断字符串是否构成回文

dllglvzhenfeng·2024-09-03 13:21

细菌/真菌DNA提取注意事项

产品介绍BIOGDNAFungi&BacteriaKit是专门用于从各种细菌和真菌样本中提取基因组DNA的试剂盒。BIOGDNAFungi&BacteriaKit采用特别配制的菌体裂解酶裂解真菌和

清风拂面vv·2024-09-03 01:37

NCBI BLAST+：分析生物内在编码的工具

在生物信息学的广阔领域中，NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国国立生物技术信息中心）开发的BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool

belldeep·2024-09-02 23:52

【图论简介】

图论在计算机科学、网络理论、优化问题、生物信息学等多个领域都有广泛的应用。本文将简要介绍图论的基本概念、常见算法及其在实际中的应用。

WA-自动机·2024-09-02 13:26

2022《Nature Plants》通过基因组组装揭示模式蕨类植物的动态基因组进化

Introduction大多数蕨类植物的大基因组和复杂度，阻碍了其通过基因组组装来阐明蕨类生物学和陆地植物的进化。

iBioinformatics·2024-09-02 07:21

1.5 编程基础之循环控制 45 金币方法二（python3实现）

OpenJudge-45:金币信息学奥赛一本通（C++版）在线评测系统[NOIP2015普及组]金币-洛谷1.5编程基础之循环控制_45金币https://blog.csdn.net/dllglvzhenfeng

dllglvzhenfeng·2024-08-31 16:21

1105：数组逆序重存放

题目信息：信息学奥赛一本通（C++版）在线评测系统https://ybt.ssoier.cn/problem_show.php?

ZMC48·2024-08-31 04:52

生信圆桌：专业生信服务器与平台服务的提供者

生信圆桌是一个专注于提供生物信息学（生信）服务器和平台服务的领先企业，致力于为全球科研机构、企业和独立研究者提供高性能的生信分析解决方案。

生信圆桌x生信云服务器·2024-08-31 03:45

7.0 践行打卡 D50

休息也要简单拉伸1.运动瑜伽冥想（休息日）2.阅读每日打卡论语每日一读3.三只青蛙工作～客户信息学习～读心术音频进阶断食三课时生活～收拾零碎物品，吃瘦晚间轻断关心朋友和家人不找借口反思：要把学来的东西运用到生活中

星月格格·2024-08-30 21:41

如何对利用GWAS关联到的SNP位点进行注释

GWAS（全基因组关联研究）关联到的SNP（单核苷酸多态性）位点注释是一个复杂的过程，涉及多个步骤，旨在理解这些位点在基因组中的生物学意义。

生信学习小达人·2024-08-30 02:03

使用pyGenomeTracks可视化hi-c数据

可视化是数据分析中非常重要的一个环节，对于NGS分析数据的可视化，最常用的就是各种基因组浏览器了，既有UCSC,GBrowse等基于web的基因组浏览器，也有igvtools等本地化的图形界面软件。

生信修炼手册·2024-08-29 16:16

线性基整理

概述线性基，是线性代数中的概念，在信息学竞赛中，前缀线性基是线性基的扩展，他们主要用于处理有关异或和的极值问题。

益达爱喝芬达·2024-08-29 02:51

信息学奥赛一本通2073：【例2.16 】三角形面积

【题目描述】传说古代的叙拉古国王海伦二世发现的公式，利用三角形的三条边长来求取三角形面积。已知△ABC中的三边长分别为a,b,c，求△ABC的面积。提示：海伦公式s=p(p−a)(p−b)(p−c)−−−−−−−−−−−−−−−−−√�=�(�−�)(�−�)(�−�),其中p=a+b+c2�=�+�+�2。【输入】三角形的三条边长。【输出】面积。（保留3位小数）【输入样例】2.13.14.1【输

2401_86878132·2024-08-28 12:17

用Python实现生信分析——基序（Motif）识别详解

在生物信息学中，基序（Motif）是指在生物序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）中具有特定功能或结构的短序列片段。基序通常在生物进化中得到保留，因为它们在生物学功能中起着重要作用。

写代码的M教授·2024-08-28 08:19

信息学奥赛c++ 初学保姆级教程

例1.1#includeusingnamespacestd;intmain(){cout叫做头文件c++里使用输出输入都要用这个头文件2.usingnamespacestd可以先理解为不可以省的东西3.intmain()名字叫主函数可以先理解为必须要写的东西函数里面会细讲4.{}里面的东西表示是这个函数里面的(现在是intmain()里面的）5.cout>里面的内容就是要输出的东西""里面是输出东

YANLIAM·2024-08-27 17:16

2022-04-20基因作图尝试

基因染色体分布情况可视化程序所在位置需要输入的内容1、基因组gff文件2、基因ID3、Chr列表：用fastastats生成excel文件，取第一列即可（如下图）https://www.jianshu.com

LiLiLi梦梦·2024-08-27 13:25

创业生态报告：中国崛起美国衰退

这就是已经成立8年的“创业公司基因组”组织的使命。这个组织吸引了一批研究员和创业者，他们每年会采访全球数千名创业者和投资人，从而更好地了解，创业的热门领域发生了什么变化，以及哪些情况是不变的。

飞猪share·2024-08-26 07:01

数据结构与算法——动态规划

LeetCode70题）2.斐波那契数列（LeetCode126题）3.最长公共子序列（LeetCode95题）引言动态规划（DynamicProgramming,简称DP）是一种在数学、计算机科学、经济学和生物信息学等领域广泛使用的算法设计技术

passion更好·2024-08-26 06:54

信息学奥赛初赛天天练-26-CSP-J2023基础题攻略，组合数学、高精度算法、计算机存储奥秘与操作系统实践

PDF文档公众号回复关键字:20240611单项选择题（共15题，每题2分，共计30分：每题有且仅有一个正确选项）6小明在某一天中依次有七个空闲时间段，他想要选出至少一个空闲时间段来练习唱歌，但他希望任意两个练习的时间段之间都有至少两个空闲的时间段让他休息，则小明一共有（）种选择时间段的方案。A31B18C21D337以下关于高精度运算的说法错误的是（）。A高精度计算主要是用来处理大整数或需要保留

ya888g·2024-08-26 03:31

信息学奥赛知识点(十三)----树和二叉树(上)

树是一种非线性结构，栈和队列都是线性结构(线性一般是指每一个元素都通常只有一个前驱和一个后继)一、树的定义一棵树是由n(n>0)个元素组成的有限集合，其中：(1)每个元素称为结点(node)(2)有一个特定的结点，称为根结点或树根(root)(3)除根结点外，其余结点能分成m(m>=0)个互不相交的有限集合T0,T1,T2……Tm-1。其中的每个子集又都是一棵树，这些集合称为这颗树的子树。三、树的

黑色火種·2024-08-26 03:29

【现学现卖】CHEER中的概念解释——k-mer

HierarCHicaltaxonomicclassificationforviralmEtagEnomicdataviadeepleaRning对这篇文章中概念的理解：【现学现卖】CHEER与病毒宏基因组数据分析

番茄随笔·2024-08-26 02:53

要不要生二胎？先看我经历了什么

这倒不是说我俩有重男轻女的观念，而是因为我俩对基因组合的奇妙都有些好奇。大宝是女孩，样貌上遗传了老公的大部分基因。走到哪儿，都有人说，

宁汐漫语·2024-08-24 07:14

高性能计算（HPC）与超级计算

无论是在气象模拟、基因组研究、物理模拟，还是在金融分析和人工智能训练中，HPC和超级计算都发挥着至关重要的作用。

给生活加糖！·2024-08-23 13:05

基因组+转录组助力油菜种子油含量自然变异的遗传研究

派森诺与华中农业大学合作，在MolecularPlant上发表了题为《Genome-andtranscriptome-wideassociationstudiesprovideinsightsintothegeneticbasisofnaturalvariationofseedoilcontentinBrassicanapus》的研究结果。该研究为提高甘蓝型油菜和其他油料作物的有机碳提供了丰富的遗

felix108·2024-08-21 21:30

这是我在微信上看到的，信息学真好。（早知道我也学了）

时间过得真快，一晃就到了2017年年末，在这年的最后几天，让我们来一起看一看这一年的信息学牛孩们都去了哪里，为我们未来的信息学小选手们树立一些努力的目标（毕竟，榜样的力量还是很强的嘛）。

最靓的zai·2024-08-21 21:18

U411934 统计分数plus+

第三行，学生的语文、数学、英语听说、英语笔试、历史、生物、地理、政治、信息学奥林匹克竞赛成绩。输出格式第一行，name:学生的名

127wangruopu·2024-03-16 18:56

scATAC:人类基因组的染色质可及性图谱-Discussion

weixin订阅号同步更新：扒蒜小妹的日常scATAC:人类基因组的染色质可及性图谱scATAC:人类基因组的染色质可及性图谱-1scATAC:人类基因组的染色质可及性图谱-2scATAC:人类基因组的染色质可及性图谱

科研菜鸟·2024-03-15 20:37

24考研调剂 | 武汉纺织大学

教育部重点实验室招收24年调剂生，材料、化学、机械工程、计算机、力学等相关专业考研调剂招生信息学校:武汉纺织大学专业:工学->材料科学与工程年级:2024招生人数:100招生状态:正在招生中联系方式:*

小鹿学姐计算机考研·2024-03-14 12:08

高通量测序的数据处理与分析(二)-宏基因组2

博客原文宏基因组数据处理方法数据下载wget下载宏基因组的数据主要分布在两个数据库：1.NCBI的SRA数据库，2.ENA。

lantary·2024-03-08 09:58

gradle-4.1-all.zip蓝奏云免费下载

https://services.gradle.org/distributions/gradle-4.1-all.zip:点击下载如果是因为Androidstudio下载慢来到这里，建议看下面设置代理大连东软信息学院镜像服务器地址

薛定谔养猫·2024-03-03 12:02

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