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小麦-基因组
小麦
基因组
测序研究进展
3/15本期作者:大胖丫最近几年,麦类作物
基因组
学发展迅速,物理图谱的相继完成将大大加速麦类作物遗传学、比较
基因组
学以及进化等方面的研究,同时也将大大加速重要农艺性状基因的分离和鉴定。
Neal_Bio
·
2024-02-04 20:11
探秘海洋生物,来看看海洋生物公开
基因组
数据集吧!
近日,由青岛华大基因研究院规划的海洋生物公开
基因组
数据集(PublicMarineGenomeResources,PMGR)系列在国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)正式上线。
尐尐呅
·
2024-02-04 18:57
Jellyfish进行Kmer评估
基因组
大小
我们对一个新物种进行
基因组
denovo测序时,一般需要先对该物种进行
基因组
survey,估计
基因组
大小、杂合率、重复序列比例、GC含量和倍性等信息,这些结果会直接影响我们后续测序的数据量及估计组装难度。
吕强强学生信
·
2024-02-04 18:45
问题在苹果还是印第安人——《枪炮病菌与钢铁》笔记九
会开花的野生植物20万种,几千种可供人类食用,几百种得到了驯化,十几种作物的产量占全世界作物产量的80%以上,谷类的
小麦
、玉米、稻米、大麦、高粱,豆类中的大豆,根茎类的马铃薯、木薯、甘薯,糖料中的甘蔗和甜菜
蹉跎笑我
·
2024-02-04 17:27
使用3D-DNA流程,结果不升反降怎么破?
之前我写过一篇利用3D-DNA流程基于Hi-C提升
基因组
组装,那个时候我做的项目并不多,也没有遇到坑,直到最近我用3D-DNA流程进行
基因组
组装,发现结果出乎意料Fig1在上图中,蓝色框表示组装出来的scaffold
xuzhougeng
·
2024-02-04 12:26
GWAS:网页版的基因型填充(genotype imputation)
在全
基因组
关联分析中,处理芯片数据时,必须走的一个流程就是基因型数据填充(imputation)。当然,如果你拿到的是全测序的数据,请忽略这一步。下面直奔主题,怎么在网页版进行基因型填充。
橙子牛奶糖
·
2024-02-04 10:33
2019-12-15
雨不急不慢的下了一整天,
小麦
终于喝到了水,庄家是离不开水的,孩子也一样,离不开老师和家长的鼓励,加油
29a725cba7b1
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2024-02-03 23:56
BioTech - 小分子药物设计与优化 概述
小分子药物设计与优化的过程包括以下步骤:靶点识别和验证:通过分子生物学、结构生物学、
基因组
学等方
SpikeKing
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2024-02-03 22:12
AI
for
Biotech
BioTech
药物设计
药物优化
亲和力
分子对接
虚拟筛选
药效团
如何用
基因组
绘制代谢通路?
只有
基因组
,想画一个代谢图,折腾了好几天,最后发现仔细看官网文档是最快的,网页搜到的很少有详细讲解的,大多都是只讲一个部分,所以老老实实看官网是最快的。
python明
·
2024-02-03 22:50
求风调雨顺
过麦时下了几天雨,没有及时收
小麦
的人家,只能等待地里能够进去大型机械再割麦子,结果,麦子在穗上就发霉了;
徐步而行
·
2024-02-03 22:08
【又是一年端午时】6月18日
这时很自然的想起北方老家端午节的场景,在北方老家端午前后
小麦
还没有长麦穗。
静起风云
·
2024-02-03 20:49
奶牛,为什么,能不停地产奶
比如鸡、牛、猪、羊,比如
小麦
。但尤瓦尔·赫拉利以《革命的受害者》为题,讲述了这些看似是“成功的演化”。
梁言相劝
·
2024-02-03 16:54
200826 Circ之旅3-构建人类
基因组
索引
注:后面可能还会构建鼠源的x参考:RNA-seq(5):序列比对:Hisat2人类
基因组
hg19、hg38构建bwa索引生物信息学习——bowtie2使用手册bwabowtie2salmonsubreadhisat2
dicklim
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2024-02-03 15:13
细胞器
基因组
(叶绿体、线粒体)组装神器GetOrganelle介绍
GetOrganelle是中国科学院昆明植物研究所金建军和郁文彬两位老师共同开发的质体组装软件,论文发表在GenomeBiology,十分简单易用,对没有计算机基础的使用者十分友好。1、安装软件可以直接使用conda进行安装condacreate-nchloroplast#创建一个虚拟环境condainstall-nchloroplastgetorganelle#将getorganelle安装在虚
惊鸿影
·
2024-02-03 12:12
米饭和面条谁的热量高,更容易发胖?
01馒头和面条均为
小麦
粉制作而成,100g
小麦
粉的热量为345千卡,而100g大米的热量也相差不多。但是这些都是生重的热量,如果制作成米饭和
橙杏健康
·
2024-02-03 08:58
轻课60天
我真的佩服
小麦
老师,跟他学英语,连续60天打卡返还学费298元做奖学金。坦白说,这是促使我达成目标的一个重要原因!但不是唯一原因。开始这项任务,我就要考验自己的持续行动!
能量心
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2024-02-03 07:39
scATAC文献:人类大脑皮质单细胞水平染色质和基因调控的动态发育图谱---方法
Chromatinandgene-regulatorydynamicsofthedevelopinghumancerebralcortexatsingle-cellresolutionsingularvalue:一scATACprocessing使用“cellrangeratacmkfastq”(10x
基因组
学
科研菜鸟
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2024-02-03 05:20
那熟悉的布谷鸟叫
农人说,布谷鸟开始叫的时候,
小麦
就快要熟了。每天在布谷鸟的叫声中起床,吃完早已下地干活的母亲准备好的早饭,迎着清晨的阳光,穿过麦田,在淡淡麦香中走到邻村的小学。一切都是那么恬静美好,一切都是那么朝气勃
自由的阿涛
·
2024-02-03 04:40
2022-06-20
又到了该收
小麦
的时候了,金黄的麦浪在热风中一起一伏。热空气中都是
小麦
秸秆混合着尘土的味道,一台台的收割机、播种机在田地里来回穿行,马路边的地头上聚集着收
小麦
和播种玉米的人们。
叛逆的怜悯
·
2024-02-03 04:37
五一劳动节,你劳动了吗?
农民的孩子既然不知道麦子,
小麦
和大麦他就更分不清楚了,再想想他平时吃饭不好好吃,饭粒掉的满地都是,于是当机立断回家跟亲戚割麦子去,让他
刷脸的时代
·
2024-02-03 03:38
一、二、三、四代测序技术原理详解
测序技术是
基因组
学的核心技术,上期的推送【LAI:
基因组
组装质量评估新标准】简单介绍了测序技术的发展进程。其实,测序技术的发展主要基于两个非常具有里程碑意义的理念:“生命是序列的”和“生命是数据的”。
生信空间
·
2024-02-02 22:24
【R语言】如何利用SNP的rs号提取坐标信息
前面给大家介绍了【R语言】获取
基因组
上某个区域内的SNP信息我们经常会从一些文献或者数据库里得到一些与疾病相关的SNP信息。
生信交流平台
·
2024-02-02 21:26
迩行论坛学习感悟
令我感触最深的是梁老师的《
小麦
收获季》,梁老师先从种植大调查开始,调查小朋友有没有想种植的东西,小朋友七嘴八舌说自己想种的东西,经过讨论投票之后,投出来种植
小麦
。
孙毓高实幼
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2024-02-02 16:35
ATAC-seq发篇测序文章就结束了吗?看如何利用ATAC-seq数据为后续关键基因的转录调控研究提供重要依据
转座酶可及染色质测序分析(ATAC-seq)是常见的研究染色质可及性的方法,ATAC-seq联合RNA-seq是一种新的研究思路,为阐述
基因组
和特定生物过程中的基因差异表达提供见解。
爱基百客
·
2024-02-02 15:16
学习
ATAC
转录调控
国自然热点:如何从表观遗传学方向入手进行炎症机制研究
表观遗传学则是研究
基因组
中不涉及DNA序列改变的遗传变化,包括DNA甲基化、组蛋白修饰以及非编码RNA等。近年来,越来越多的研究表明炎症与表观遗传之间存在密切的关联。
爱基百客
·
2024-02-02 15:16
国自然热点
学习
国自然
表观遗传学
炎症
今日春分
春分后,气候温和,雨水充沛,辽阔的大地上,岸柳青青,莺飞草长,
小麦
拔节。农谚有云:春分麦起身,一刻值千金。
庄梓
·
2024-02-02 13:44
传统大曲新知识疑难解答
大曲是中国白酒使用的糖化发酵剂,是一种以生料
小麦
(或配伍大麦、豌豆)为原料,自然网罗制曲环境中的微生物接种发酵,微生物在曲坯中彼消此长,自然积温转化并风干而成的一种多酶多菌多物质的微生物生态制品,具有糖化发酵生香的作用
转角遇见酒
·
2024-02-02 11:08
FeatureExtract--extracts sequences and feature annotation from genbank format file
最近一直在看和植物叶绿体
基因组
有关的知识,其中有一项内容是分析叶绿体
基因组
的密码子偏向性,这就要求我们首先要拿到基因的CDS序列,在NCBI的organellegenome数据库中我们通常可以下载到叶绿体全
基因组
的
小明的数据分析笔记本
·
2024-02-02 11:45
文献精读丨GWAS+TRN多组学方法揭示
小麦
穗发育调控过程
文献精读笔记英文题目:Systematicminingandgeneticcharacteriza;tionofregulatoryfactorsforwheatspikedevelopment中文题目:
小麦
穗发育调控因子的系统挖掘及遗传特性研究通讯作者
生信分析笔记
·
2024-02-02 08:03
两大一小打算去恩施旅游3、4天适合穿短袖还是长袖?
小麦
:13085442236(长按复制、添加导游薇信、免费咨询)七月,夏日的气息充盈着恩施大地,繁花似锦,碧水连天。恩施,这个被誉为“神秘花园”的地方,总是让人心驰神往。而七月的恩施,
旅游博主嘉尔
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2024-02-02 08:12
全身治疗后转移性透明细胞肾细胞癌的
基因组
图谱(IF7+)
Thegenomiclandscapeofmetastaticclearcellrenalcellcarcinomaaftersystemictherapy系统治疗后转移性透明细胞肾细胞癌的
基因组
图谱发表期刊
生信学霸
·
2024-02-02 08:18
阴天的傍晚
小麦
都已完全出齐穗了,春性麦正扬花期,半冬性
小麦
刚刚出齐穗。
小麦
扬花期遇到连阴雨会发生赤霉病,天气预报明天无雨,赶紧喷施农药预防。
未名之初
·
2024-02-02 05:20
儿时味道
那个糖我不记得是怎么做的,好像就是
小麦
发芽的慢慢熬的,熬好以后再使劲的拉,越拉越白,现在还有卖,叫做麦芽糖。我们这里做的还不
笑化万物
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2024-02-02 02:20
全
基因组
关联分析流程 ( 二 )
最佳线性无偏预测(BLUP)BLUP(BestLinearUnbiasedPrediction),在线性混合模型中可以用来评估随机效应。随机效应的最佳线性无偏预测(BLUP)等同于固定效应的最佳线性无偏估计(bestlinearunbiasedestimates,BLUE).BLUP法具有估计值无偏、估计值方差最小、可消除因选择和淘汰等原因造成的偏差等特性,获得的个体育种值具有最佳线性无偏性,是当
正踪大米饭儿
·
2024-02-02 01:25
我的爷爷
他很瘦,只剩一层
小麦
色的皮肤和骨架,有时我看着他怪心疼的。我爷爷从我上五、六年级时起,他的病就发了,他肺不好,导致呼吸不畅,要经常住院,平时都要用制氧器制氧来帮助呼吸,所以他也不能再
江门广雅新月十班
·
2024-02-02 00:27
从表观遗传分析入手,揭示癌症免疫景观
Identificationofepigeneticdysregulationgenemarkersandimmunelandscapeinkidneyrenalclearcellcarcinomabycomprehensivegenomicanalysis通过综合
基因组
分析识别肾脏透明细胞癌的表观遗传失调基因标志物和免疫景观发表期刊
生信学霸
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2024-02-02 00:06
【国家营养师培训】第二课作业 蛋白质
2、蛋白的分类1)完全蛋白:奶类中的酪蛋白、乳白蛋白;蛋黄中的卵黄蛋白、卵白蛋白;肉类中的白蛋白、肌蛋白;大豆中的大豆蛋白;
小麦
中的麦谷蛋白;玉米中的谷蛋白等2)半完全蛋白:
小麦
中的麦胶蛋白等3)不完全蛋白
罗二小姐
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2024-02-01 22:16
如果白日梦是酒,那,请不要贪杯哦
我想我要去最远的山看最远的海看悬崖上长满青苔看礁石被阳光暴晒看远海与天连成一线过远山见有一方
小麦
趟河流见有几缕炊烟走走停停郁郁苍苍星星点点在最深的森林里阳光斑驳陆离在最清的河流里小鱼不知流年似水这山河有多绮丽这森林川谷多旖旎想要在白日里迷离仿佛穿过尼罗河到达埃及陷入狮身人面像的迷思是谁的风潜入我做的梦染红了墨色的海棠沾湿了竹绿的衣裳让我对谁空断肠看窗外杨絮纷纷扬扬
泡雪碧
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2024-02-01 22:55
怀念一碗手擀面
每当
小麦
收割后,村里上交给国家后多余的
小麦
就会按人头分给村民。我家分到
小麦
后,母亲仿佛吃了蜜糖似的脸上有了笑容,她
临湖风
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2024-02-01 21:31
2022-07-08
ageloc的由来及其背后的尖端科技:2003年,科学家们终于能够建立人类
基因组
图谱,这项发现为曾润海博士提供深入探究人体老化过程的基础。
基因组
图谱:提供了那篇关键的拼图让科学家们得以了解
雅静种小草
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2024-02-01 20:04
《
基因组
学》课程-学习笔记之一
写在前面分子生物学相关知识的学习,可能一直停留在大三阶段。那会看完了几本书,自我认为目前为止,可以满足与多数人的日常交流。然而,一方面当时是囫囵吞枣,不甚了解;另一方面,时间过去太久,年龄也不小了,一直用不上的部分,早已忘却(多数知识点,在讨论学术问题时,完全用不上)。约莫是那个时候,我发现了很多优质的网络公开课,上研究生之后,就也基本没看。往往是时间问题,所以我对高铁这个过程,又爱又恨。漫长的车
生信石头
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2024-02-01 18:27
使用MAKER进行基因注释(高级篇之GeneMark-ET模型训练)
真核生物
基因组
预测主要会用到GeneMark-ES/ET,其中GeneMark-ES可用于无监督自训练,也就是只要提供一个
基因组
序列即可,而GeneMark-ET则是在GeneMark-ES的基础上整合了高通量的
xuzhougeng
·
2024-02-01 17:40
2020-02-25 Day30 利用生物信息学分析鉴定乳腺癌的潜在关键基因和关键通路
方法:使用来自基因表达综合(GEO)和癌症
基因组
图谱(TCGA)的四个数据集(GSE21422,GSE29431,GSE42568和GSE61304)进行生物信
卅衣
·
2024-02-01 15:13
BWT比对算法
序列比对对于两个序列进行比对,即pairwisealignment,我们可以按比对方式分为全局比对(NW算法)和局部比对(SW算法):当然对于两条短序列,可采用上述算法进行比较,但是如果其中一条序列换成了较长的参考
基因组
序列
小潤澤
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2024-02-01 10:11
单细胞转录组测序技术及各类数据分析方法总结
在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全
基因组
范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展细胞间的表达异质性研究、鉴定新的细胞亚型、解析早期胚胎的发育等。
AIPuFu
·
2024-02-01 09:22
单细胞测序
生物学
医学
生物信息学
单细胞测序
生物学
医学
有什么300-500元左右的白酒比较好喝,适合送人?
这款白酒名为“明月清风”,是一款以优质
小麦
为原料制作而成的浓香型白酒。它以其独特的口感和高性价比赢得了广大消费者的喜爱。1.独特的酿造工艺“明月清风
林哥超酷
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2024-02-01 09:32
发现拖延症的性别差异基因
拖延症普遍存在于人群中,从前对拖延症的分析主要基于心理层面,但现在有研究团队终于不再忍受各种陈词滥调,试图到人类的
基因组
的汪yang大海中去寻找到拖延症的线索,结果他们还可能真找到了一点东西,一个基因,
Oliver_G
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2024-02-01 09:00
国庆节快到了,推荐10道家宴菜,色香味俱全老少皆宜,上桌秒光
煎茄子材料:茄子500克,植物油100克,
小麦
面粉50克,鸡蛋120克,胡椒粉2克,盐3克,牛奶10克做法:1.把茄子洗净,削去皮,切
锦绣v山东
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2024-02-01 08:04
美国南方无糖玉米面包:如果你有好的玉米,就没有理由加糖
也不含
小麦
粉。一个人可能会用加了糖的
小麦
粉和玉米粉做一些很好吃的东西,但
羊反
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2024-02-01 03:25
2021-09-19
2、本研究利用巨噬细胞中的全
基因组
反筛选,发现G蛋白偶联受体GPR84介导APMAP缺陷癌细胞的增强的吞噬作用。3、这项工作
图灵基因
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2024-02-01 03:49
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