文献阅读第19页

文献阅读2.1 基因组结构预测微生物群落中的代谢物动力学

Genomicstructurepredictsmetabolitedynamicsinmicrobialcommunities基因组结构预测微生物群落中的代谢物动力学cell(66.850/Q1)HighlightsMetabolitefluxesinmicrobialcommunitiesarepredictablefromindividualgenotypes微生物群落中的代谢物通量可从个体

龙star180·2022-10-20 11:07

文献检索与论文写作书籍（一）

1、文献检索与科技论文写作入门-2018.112、文献检索与论文写作（第二版）-2017.103、文献信息检索与论文写作（第六版）-2017.114、会读才会写：导向论文写作的文献阅读技巧(2015.11

dllglvzhenfeng·2022-10-17 08:22

AGV小车导航控制研一《智能控制》课程文献阅读作业

摘要AGV（即自动导向小车）是一种集控制、定位、各种传感器技术于一体的设备。随着智能车技术的不断发展，智能车的应用范围和功能都将大为拓展，现已逐渐用于工业与民用领域。但是由于负载变化、使用环境条件恶劣等原因，在实际运用时AGV小车在定位及控制上依然有许多难点需要攻克。本文即针对上述难点，研究并设计了一种新型的驱动方式和控制系统，利用模糊控制与PID控制相结合的方法，在开机初期误差矫正快，后期平稳，

Evandworld·2022-10-15 19:46

文献阅读：Should You Mask 15% in Masked Language Modeling?

文献阅读：ShouldYouMask15%inMaskedLanguageModeling?

Espresso Macchiato·2022-10-15 07:40

综述论文要写英文摘要吗_如何开始研究生的论文工作？把握好这13个步骤

在我们得到一篇文献之后(请自行百度：研究生该如何选择文献阅读)，我们该关注什么部分呢？快来看看吧！1.论文

weixin_39615741·2022-10-13 07:41

基于图神经网络链路预测

【ICLR2020】基于图神经网络的归纳矩阵补全[图表示学习]1链路预测问题文献总结[图表示学习]2动态图(DynamicGraph)最新研究总结（2020）[图表示学习]动态网络上的图神经网络文献阅读总结

tiger00O·2022-10-09 15:03

文献阅读 - Example-Based Cosmetic Transfer

基于实例的妆容迁移（Example-BasedCosmeticTransfer）摘要妆容迁移所需条件：化妆前后对比图像（实例），AAA和A∗A^{\ast}A∗；输入：图像（目标）BBB输出：妆容迁移图像B∗B^{\ast}B∗参考文献：Tong,D.,Tang,C.K.,Brown,M.S.,Xu,Y.Q.(2007).Example-BasedCosmeticTransfer.IEEEComp

K5niper·2022-10-09 10:14

文献阅读笔记10——ECA注意力机制

0写在前面第一部分内容更针对于精度的提升，第二部分就需要找到一些方法针对速度的提升。1ECA注意力机制天津大学在2020CVPR发表的一篇文章1.1Abstract+Conclusion目的：提高深度卷积网络的性能，并克服性能和复杂性之间权衡矛盾。挑战：复杂的注意力机制增加了模型的复杂性。提出了一种高效的通道注意力机制（ECA）作用：涉及少量参数，同时带来明显的性能增益灵感来源：SENet原理：避

白日梦想家April_Liu·2022-10-09 10:12

文献阅读笔记8——Shallow-Water Image Enhancement Using Relative Global Histogram Stretching Based on Adaptiv

0Abstract分为两个部分对比度校正和颜色校正对比度校正①均衡G和B通道②使用与原始图像的强度分布和水下不同颜色的波长衰减相关的动态参数重新分布每个RGB通道颜色校正通过拉伸“L”分量来修正并修改ab分量1Introduction挑战1.水下环境和水体浊度影响2.光的吸收、散射和反射2Relatedwork水下模型和直方图拉伸两个方面论述3浅水图像增强模型对比度校正在对比度校正步骤中，我们对R

白日梦想家April_Liu·2022-10-09 10:12

文献阅读笔记7——CBAM: Convolutional Block Attention Module

1摘要卷积块注意力模块是一种简单有效的前馈卷积神经网络。给定其中间一个映射，模块沿两个独立维度（通道和空间）顺序推断注意映射，然后讲注意映射乘以输入特征映射以进行自适应特征细化。2Introductioncontribution①简单有效的注意模块，用于提高CNN表征能力②通过广泛消融实验证明我的注意力机制有效性③插入CBAM在多个基准上有很大的提高3Relatedwork从网络工程和注意力机制两

白日梦想家April_Liu·2022-10-09 10:42

【笔记】文献阅读[ByteTrack]- Multi-Object Tracking by Associating Every Detection Box

Multi-ObjectTrackingbyAssociatingEveryDetectionBox引言1介绍2相关工作2.1多目标跟踪（MOT）中的目标检测2.2数据关联3BYTE4实验4.1实验设置4.2BYTE消融实验4.3基准评价5结论引言文献阅读笔记

摇曳的树·2022-10-08 18:59

Python单细胞复现2022||01-文献阅读：致命COVID-19分子单细胞肺图谱

这篇文献提供的代码是R与python版本，是个极好的学习单细胞与python的资源今天先来看看文献背景文献情况：标题：Amolecularsingle-celllungatlasoflethalCOVID-19Doi：https://doi.org/10.1038/s41586-021-03569-1通讯作者：BenjaminIzarJianwenQue哥伦比亚大学欧文医学中心血液学/肿瘤科医学系

_十三·2022-10-08 00:21

文献阅读【RNA-seq数据归一化】

最近一直在做lncRNA的分析，其中的lncRNA的差异表达分析中，需要对readscount进行归一化，之前没有考虑很多，就用的通常的流程：hisat2→stringtie→prepDE.py/featureCount→DESeq2其中的DESeq2的归一化部分，也是我们通常称的标准化，是我们关注的重点，DESeq2主要原理：通过计算一个归一化因子，并进行变换，进而提高中等表达基因的地位。归一化

·2022-10-07 22:31

算法文献阅读：dbCAN2：一个用于自动化碳水化合物活性酶注释的宏服务器

期刊NucleicAcidsResearch（19.160/Q1）dbCAN2:ametaserverforautomatedcarbohydrate-activeenzymeannotationdbCAN2：一个用于自动化碳水化合物活性酶注释的宏服务器ABSTRACTComplexcarbohydratesofplantsarethemainfoodsourcesofanimalsandmicr

龙star180·2022-10-07 20:18

Informer模型与基础学习

文章目录摘要文献阅读一.Informer:一个基于Transformer改进的高效的长时间序列预测模型1.1论文摘要1.2研究内容1.3Informer模型架构1.3.1预备知识1.3.1.1LSTF问题定义

HSR CatcousCherishes·2022-09-28 07:45

文献阅读：Linformer: Self-Attention with Linear Complexity

文献阅读：Linformer:Self-AttentionwithLinearComplexity1.问题描述2.核心方法1.vanillaattentionlayer2.attention优化3.分析

Espresso Macchiato·2022-09-26 09:46

文献阅读：SNCSE: Contrastive Learning for Unsupervised Sentence Embedding with Soft Negative Samples

文献阅读：SNCSE:ContrastiveLearningforUnsupervisedSentenceEmbeddingwithSoftNegativeSamples1.内容简介2.方法实现1.embedding

Espresso Macchiato·2022-09-26 09:45

文献阅读:Fast, Accurate, and Lightweight Super-Resolution with Cascading Residual Network

文章地址：https://arxiv.org/abs/1803.08664作者的项目地址：CARN-Pytorch1简单介绍作者说目前的主流的方法都是奔着性能表现去的，并没有考虑实际应用的情况。所以作者在本篇文章中提出一种快速，精确并且轻量级的网络。2网络介绍提供了一个轻量级的网络，作者称之为CARN（CascadingResidualNetwork，级联残差网络）。它具有以下三个特征：全局和局部

alxe_made·2022-09-15 07:15

【笔记】文献阅读[YOLOV2]-YOLO9000: Better, Faster, Stronger

YOLOv2:YOLO9000:Better,Faster,Stronger引言1介绍2更准确3更快4类别更多5总结引言论文精度可以看B站大佬的视频：【精读AI论文】YOLOV2目标检测算法有不准确的地方，评论区欢迎指出哦！相互学习！我们向大家介绍YOLO9000，一种先进、实时的目标检测系统，可以检测超过9000个目标类别。首先，我们对YOLO检测方法提出了多种改进，既有新颖的，也有借鉴前人

摇曳的树·2022-09-12 07:13

文献阅读-CSC-中文错别字-有关论文搜集-+CGED

CSC-中文拼写错误检测ChineseSpellingCheckerCSC的问题主要是：模型和数据CSC-2020Spellingerrorcorrectionwithsoft-maskedbertACL-2020-字节SpellGCN:IncorporatingPhonologicalandVisualSimilaritiesintoLanguageModelsforChineseSpellin

Flying Warrior·2022-09-09 08:11

文献阅读:CrossNet: An End-to-end Reference-based Super Resolution Network using Cross-scale Warping

文章地址：https://arxiv.org/abs/1807.10547视频地址：https://www.youtube.com/watch?v=7htEaaNkxG8作者的项目地址：ECCV2018_CrossNet_RefSR1.1简单介绍目前除了SISR(Singleimagesuperresolution)进行图像超分辨重建之外,现在还出现RefSR(Reference-basedsup

alxe_made·2022-09-04 07:01

文献阅读1

基于多级注意力密集残差网络的单幅图像超分辨率重建-中国知网(cnki.net)问题方案效果未能充分利用图像全局信息和局部信息，导致重构结果缺失源图像部分关键信息的问题网络以密集残差为基础，融合了图像的多尺度特征信息，保证了网络在深度上不损失特征信息的同时，获得更多不同感受野下的特征信息，避免源图像关键信息的过度丢失。此外，为从具有低频冗余信息的低分辨率图像中恢复包含足够高频信息的高分辨率图像，网络

Mick..·2022-09-01 13:51

Zotero安装配置插件小Tips: 多端同步、自动翻译、抓取题录信息、参考文献等

大家都可以贡献优秀的插件，提高文献阅读和管理的效率。另外，Zotero非常轻量级，打开特别快。然而，开源软件都有个弊端，需要折腾一下才能变得好用，即需要安装一些插件扩展。（非

Gisleung·2022-08-26 07:38

可解释性机器学习( Explainable Artificial Intelligence (XAI) )文献阅读记录(1.1)

文章目录论文标题：ExplainableArtificialIntelligence(XAI):Concepts,taxonomies,opportunitiesandchallengestowardresponsibleAI1.Introduction引言2.可解释性：what,why,whatforandhow?2.1TerminologyClarification术语澄清2.2What？（是

Lucy@IshtarXu·2022-08-21 17:11

文献阅读（03）Computing Graph Neural Networks: A Survey from Algorithms to Accelerators

作者：SERGIABADAL,AKSHAYJAIN,ROBERTGUIRADO,JORGELÓPEZ-ALONSO,andEDUARDALARCÓN目录文章脉络：缩写&&引用：1INTRODUCTION：(1)本质：(2)难点：(3)目前所作的尝试：（4）关于gnns算法及其应用的文献：2.GNNs符号以及一般结构2.1Notation2.2GeneralStructure2.3Computing

道枝jing·2022-07-31 07:56

学习记录：正负样本分配策略之YoloX | SimOTA-简单易懂版

学习记录：正负样本分配策略之YoloX|SimOTA-简单易懂版文献阅读和分享目标检测领域趋势正负样本分配策略——SimOTA网络训练（恋爱历程）SimOTA具体流程（中介分配对象流程）一、初步筛选（外貌协会

Double-Zh·2022-07-24 07:34

文献阅读：LVI-SAM: Tightly-coupled Lidar-Visual-Inertial Odometryvia Smoothing and Mapping

LVI-SAM:Tightly-coupledLidar-Visual-InertialOdometryviaSmoothingandMapping该两个子系统以紧耦合的方式设计。对于VIS初始化，LIS提供初始参数（系统状态x和IMU零偏b且假设b不变）。VIS进行视觉特征跟踪时，引入激光雷达帧可提供特征深度。LIS在进行扫描匹配时的初始猜测是来自优化视觉重投影和IMU测量误差，此作为因子图的一

湖田岛·2022-07-18 14:23

自动泊车-停车位（泊车位）检测文献阅读综述（笔记）

简介本文主要简单梳理从2000年以来比较具有代表性的基于视觉停车位检测方法的文献（主要分为传统方法和最近两年火起来的深度学习的方法），作为入自动驾驶领域的第一篇博客啦！（多图预警！！！）文献目录：2000-Vision-GuidedAutomaticParkingforSmartCar这篇文章应该是比较早基于视觉方法来检测停车位的文章，但整篇文章不仅仅包括检测停车位，而是自动泊车的整个过程（检测停

jaycain·2022-07-18 11:20

文献阅读 | MOCHI:识别基因调控网路中的互作模块

原文链接:TianD,ZhangR,ZhangY,ZhuX,MaJ.MOCHIenablesdiscoveryofheterogeneousinteractomemodulesin3Dnucleome.GenomeRes.2020Feb;30(2):227-238.doi:10.1101/gr.250316.119.Epub2020Jan6.PMID:31907193;PMCID:PMC70505

阿狸的窝·2022-07-07 14:11

文献阅读笔记

文献1：AsystemsgeneticsapproachrevealsPbrNSCasaregulatorofligninandcellulosebiosynthesisinstonecellsofpearfruit期刊：GenomeBiology思路整理：1.构建自然群体转录组，寻找与石细胞相关性状的相关的模块（图1a），并将模块内石细胞合成结构基因回贴到通路中（图2a，b）。构建以结构基因为基

AsuraPrince·2022-06-30 13:35

文献学习008--[sc]两篇PBMC单细胞文献阅读

1.Asingle-cellmapforthetranscriptomicsignaturesofperipheralbloodmononuclearcellsinendstagerenaldisease这是今年刚发的一篇文章，影响因子5.991。因为是做PBMC的，来学习一下分析思路和亚群注释的方法。背景：终末期肾衰存在systemicinflammation和immunedeficiency，

Hayley笔记·2022-06-30 09:26

文献阅读 | 膨胀卷积在遥感图像小目标分割中的有效应用

EffectiveUseofDilatedConvolutionsforSegmentingSmallObjectInstancesinRemoteSensingImagery本文主要目的是在学习红外小目标检测时看到的有关的文章和算法实现，并对其进行了翻译，作者开源了相关的代码，github地址：作者官方github实现膨胀卷积在遥感图像小目标分割中的有效应用文章翻译摘要：近年来，由于CNN的研究

北屿白·2022-06-24 07:26

文献阅读（SG滤波器—（LSTM）编码器与解码器模型，预测水质）—OrdinaryKriging模型

文章目录摘要一.Large-scalewaterqualitypredictionwithintegrateddeepneuralnetwork（基于集成深度神经网络的大规模水质预测）1.1论文摘要1.2问题描述1.3模型设计1.3.1SGfilter1.3.2SE-LSTM1.4评估标准1.5实验特点1.6思考点补充点（SG滤波器的原理）二.深度学习方面三.工程项目四.本科毕设摘要本周一是阅读了

HSR CatcousCherishes·2022-06-20 09:52

【文献阅读】MEG和EEG的多变量模式分析对比

原文：MultivariatepatternanalysisofMEGandEEG:AcomparisonofrepresentationalstructureintimeandspaceMEG和EEG的多变量模式分析：表征性结构在时间和空间的比较亮点：系统比较了MEG和EEG在采用SVM的RSA分析时的结果差异，其比较思路和技术细节值得参考，例如给出了采用方法的详尽理由，包括优点辨析和成功条件。

VivaVida·2022-06-18 12:53

伪时序分析文献阅读——PAGA

PAGA:graphabstractionreconcilesclusteringwithtrajectoryinferencethroughatopologypreservingmapofsinglecellsPAGA：通过生成单细胞的拓扑结构并保存其映射来统一聚类和轨迹推断的图抽象F.AlexanderWolf1,FionaK.Hamey2,MireyaPlass3,JordiSolana3,

hyena_7·2022-06-12 19:03

算法文献阅读5：MCscan（作者指定引用的文献）

SyntenyandCollinearityinPlantGenomes（Science）植物基因组中的同线性和共线性Plantgenomescomplement,particularlyovermodest(intrafamilial)evolutionarydistances.Comparativedatawillalsofacilitateabroaderunderstandingofthe

龙star180·2022-06-09 12:02

2022-06-07 文献阅读

（一）ARID1ApreventssquamouscellcarcinomainitiationandchemoresistancebyantagonizingpRb/E2F1/c-Myc-mediatedcancerstemness主要结论：（1）MechanisticstudiesrevealedthatARID1Ablockedtheinteractionbetweencyclin-depe

仰望_c623·2022-06-07 16:24

文献阅读|Nomograms列线图在肿瘤中的应用

欢迎关注”生信修炼手册”!列线图，也叫诺莫图，在肿瘤研究的文章中随处可见，只要是涉及预后建模的文章，展示模型效果除了ROC曲线，也就是列线图了。那么列线图究竟是什么，列线图怎么得到，从图中我们可以得到哪些信息，带着这些问题，我们来阅读下面的这篇文献，地址如下>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4465353/1.列线图的定义列线图是肿瘤预后评

生信修炼手册·2022-06-07 08:36

深度强化文献阅读系列（一）：Courier routing and assignment for food delivery service using reinforcement learning

来源：文章于2022年发表于期刊COMPUTERS&INDUSTRIALENGINEERING，期刊基本信息及影响因子如下图所示：目录摘要1.研究贡献2.文献综述3.问题描述3.1问题描述3.2问题假设/前提条件3.3问题定义4.解决方法4.1强化学习基本框架4.2Q-learning4.3DDQN4.4RuleBasedalgorithm5.仿真评估6.实验结果6.1Q-learning单age

zhugby·2022-06-06 07:56

PSO算法文献阅读笔记

粒子群算法读书笔记精读2020《电子信息学报》基于非线性降维的自然计算方法孙小晴（2020-04-28）1针对问题高维大规模优化问题，陷入局部最优与收敛速度和时间复杂度的矛盾。2创新点非线性降维思想-NDR将初始化的N个D维个体，视为N行D列的矩阵；求该矩阵的阶梯矩阵，得到列的最大线性无关向量组。（其他列可由最大线性无关向量组表示）引入随机系数，解决降维个体属性参数减少问题3算法流程4实验分析ND

最佳第六六六人·2022-05-28 07:04

日更挑战1:要如何安排好自己的时间

第一：读文献第二：辅导小朋友做作业第三：做好手上的工作读文献需要完整的整块时间，碎片化的时间不适合做文献阅读，达不到深度思考，所以需要安排一整块的时间来做这件事，那么一整块的时间只能定义在晚上睡前1小时

魏小胖·2022-05-26 23:14

【文献阅读】自体基质血管成分细胞移植对促进诱导扩张皮肤再生的随机对照临床试验

此项RCT研究针对皮肤软组织扩张术的患者如何在尽可能短的时间里尽可能多的扩张皮肤为二期手术创造良好条件进行了探索。由于基质血管成分（SVF）可发挥容量支撑、免疫调节、神经再生、造血支持、血管生成、组织细胞再生等各种功能。如果将自体基质血管成分用于皮肤软组织扩张术，是否能够促进皮肤扩张值得进行研究。一、实验设计研究团队设计了平行组、单盲、随机、对照的临床试验，分别设置试验组和对照组，其中试验组给予S

Techie_Yang·2022-05-09 20:30

卵巢癌文献阅读总结

小白兔和小毛驴·2022-05-06 17:50

单细胞文献阅读002—COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas

文章题目：COVID-19immunefeaturesrevealedbyalarge-scalesinglecelltranscriptomeatlas发表时间及期刊：2021年2月发表在Cell期刊影响因子：2020/2021:38.637作者：张泽民&金荣华&陈捷凯&王晓群&瞿昆&张政&苏冰&王红阳&王福生&赵平森&李祥攀&程涛&刘新东&卞修武&魏来&贝锦新&黄志伟&蒋庆华&周鹏辉单位：北京

mumu不知·2022-05-03 22:39

【文献阅读】VQA的综述：方法和数据集（Q. Wu等人，Computer Vision and Image Understanding，2017）

一、文章背景文章题目：《Visualquestionanswering:Asurveyofmethodsanddatasets》这篇文章算是早期比较经典的VQA综述之一了。作者是来自沈春华老师团队。文章下载地址：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1077314217300772文章引用格式：Q.Wu,D.Teney,P.Wang,

全部梭哈迟早暴富·2022-05-03 07:22

文献阅读21期：Attention mechanisms and deep learning for machine vision: A survey

[综述阅读·机器视觉]Attentionmechanismsanddeeplearningformachinevision:Asurveyofthestateoftheart推荐理由：一篇较新的综述，主在介绍Attention和配套的深度学习机制在机器视觉领域的最新成果，作者把来龙去脉讲得较为明白，一篇好文1.摘要&简介最近几年，NLP领域较火的用于上下文预测识别的Attention机制获得了学界

RaZLeon·2022-05-03 07:26

文献阅读 NBT：通过整合bulk和single-cell测序数据识别表型相关亚群

介绍一篇文献：Identifyingphenotype-associatedsubpopulationsbyintegratingbulkandsingle-cellsequencingdata，2021年发表于NatureBiotechnology，DOI号：10.1038/s41587-021-01091-3。算法已经写成了R软件包，放在GitHub上供使用：https://github.co

林枫bioinfo·2022-04-30 20:50

基于深度学习的计算机视觉研究新进展_文献阅读

基于深度学习的计算机视觉研究新进展摘要：本文着眼于2016年以来典型网络和模型，对基于深度学习的计算机视觉研究进行综述，主要包括以下部分：总结了对凸显分类的主流深度神经网络模型（标准化模型和轻量化模型）总结了针对不同计算机视觉领域的主流方法和模型（目标检测、目标分割和图像超分辨率）总结了深度神经网络搜索方法本文收稿于2022-02-10引言时间节点深度学习早在1986年就被Dechter[2]引入

coding-day·2022-04-19 07:12

文献阅读——DDR1影响肝癌转移

2022-张必翔.png文章整体逻辑很简单，但胜在做的详细清晰。首先，DDR1这个基因在其他的肿瘤中高表达并且影响肿瘤细胞转移。但是，在肝癌中DDR1的功能不清楚。所以先用数据库数据、细胞系数据和临床样本分析其表达量。然后，做体外实验，划痕、侵袭、转移实验验证这个基因对转移的影响。然后质谱分析找到和DDR1互作的蛋白，找到之后验证他们之间的关系。其中因为涉及DDR1和ARF6-GTP，所以想进一步

谢京合·2022-04-13 17:59

过来人对研究生阶段的学习建议

点击上方“小白学视觉”，选择加"星标"或“置顶”重磅干货，第一时间送达本文转自|机器学习初学者一、研究生不同阶段大致任务1.研究生一年级：主要是学习一些基础知识、实验技能、文献阅读和检索，以及对自己研究领域有初步至中等程度的理解

小白学视觉·2022-04-13 07:14

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