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文献阅读GNN
面对挑战,这个是最大的敌人
科研小白之家这次6月共读,由我来主持外科组的
文献阅读
授课。形式和以往不同了,小白之家的戴老师要求用平时阅读文献的思路来讲解,pdf的形式。这对于我来说真的很挑战,我从来没有以这种形式来讲解过。
科研女神经
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2023-10-09 00:34
阅读文献小技巧
对于汇报论文的
文献阅读
,更是需要有一定的技巧。下面列出一些阅读汇报论文文献的技巧。1.明确阅读目的和任务。
蔬菜院院长
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2023-10-09 00:41
文献技巧
学习方法
QA-
GNN
: Reasoning with Language Models and Knowledge Graphsfor Question Answering
题目:QA-
GNN
:使用语言模型和知识图进行问答推理作者:MichihiroYasunaga、HongyuRen、AntoineBosselut、PercyLiang、JureLeskovec发布地方:
SU_ZCS
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2023-10-08 19:24
nlp
自然语言处理
知识图谱
【
文献阅读
】【NMI 2022】LocalTransform :基于广义模板的有机反应性准确预测图神经网络
预测有机反应产物是有机化学的一个基本问题。基于成熟有机化学知识,化学家现在能够设计实验来制造用于不同目的的新分子。但是,它需要经验丰富的专业化学家来准确预测化学反应的结果。为了进一步帮助有机化学家并在数字化学时代实现全自动发现,机器智能可以准确预测有机反应的产物,大大加快新分子的设计过程。最近,已经提出了几种基于机器学习的方法来预测有机反应产物,但仍然需要改进反应预测模型才能达到足够的准确性,与普
HealthScience
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2023-10-08 16:46
有机反应预测
人工智能
深度学习
分享我的markdown笔记工作流
从大一开始接触各式各样的效率工具,到现在也试用了上百种,也初步形成了一些自己workflow,覆盖文件管理,markdown笔记,
文献阅读
等等,所以想与大家分享交流一下。
Nash_e381
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2023-10-07 10:13
UHPC
文献阅读
笔记
文章目录0.背景1.202303012.20230306001.UHPC基底材料的设计原理是什么?002.如何选择UHPC用纤维?003.为何不建议UHPC使用大尺寸骨料?004.UHPC适用于哪些场合?005.如何保证UHPC的基本品质?006.UHPC的抗磨和耐火性能也能高出C80很多吗?007.UHPC的弹模为何不容易达到55GPa以上?008.什么样的UHPC性价比较高?009.UHPC最
George1415926
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2023-10-06 20:06
混凝土结构
塔架
其他
文献阅读
——《唐长安城的利益空间-以皇帝礼仪的舞台为中心》
妹尾达彦《唐长安城的礼仪空间-以皇帝礼仪的舞台为中心》隋唐初的礼仪空间:探究隋唐长安城的城市规划中体现的古典性唐长安城城市规划特征——各种传统思想有机的深入城市规划各处1.《周礼》模式周礼中将国都的位置认为是天所制定的地上的中心点,是依天命而君临诸侯的天子的居住地。“前朝后市,左祖右社,中央宫阙,左右民廛”上述城市框架在中亚印度西亚地中海等广大地域都能看到,但隋唐长安城的特点是:市设在了宫殿的前方
黄小米吖
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2023-10-06 10:40
文献
GNN
-频域-2014:Spectral Networks and Locally Connected Networks on Graphs(频谱图卷积神经网络)【第一篇从频域角度分析】
《原始论文:SpectralNetworksandLocallyConnectedNetworksonGraphs》空域卷积非常直观地借鉴了图像里的卷积操作,但缺乏一定的理论基础。而频域卷积则不同,相比于空域卷积而言,它主要利用的是**图傅里叶变换(GraphFourierTransform)**实现卷积。简单来讲,它利用图的**拉普拉斯矩阵(Laplacianmatrix)**导出其频域上的的拉
u013250861
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2023-10-05 23:37
图神经网络/GNN
人工智能
考北京语言大学古代文学,专业课120、143,学姐告诉你是什么样的体验
19北语古代文学,初试391,政治67,英语61,古代文史
文献阅读
120,中国古代文学史143,初试排名第九,复试英语45,面试91,笔试75综合排名第十,18个人进复试,录取13人,一路跌跌撞撞已上岸
一往文学
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2023-10-05 13:29
黄丽红日精进656/660
.…5.
文献阅读
5.课题报告6.日精进
做自己小太阳
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2023-10-05 06:41
Tangram Tutorial 2:配合 squidy 使用 Tangram
推荐先按顺序阅读往期内容:文献篇:1.
文献阅读
:使用Tangram进行空间解析单细胞转录组的深度学习和比对教程篇:1.TangramTutorial1:映射小鼠皮层MOp的snRNAseq数据到Slide-seq2
Tiger Z
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2023-10-05 01:46
程序人生
文献阅读
Orchestrating single-cell analysis with Bioconductor
文献题目:Orchestratingsingle-cellanalysiswithBioconductor发表时间:2020Feb发表杂志:NatureMethods长文慎入,可以收藏之后慢慢阅读。最近的技术发展已经能够在单个细胞中分析大量的基因组特征。然而,单细胞数据存在独特的挑战,需要开发专门的方法和软件,以成功获得生物学发现。Bioconductor项目迅速发展满足这些需求,使用开源软件,并
生信start_site
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2023-10-04 15:15
PyG (PyTorch Geometric)
GNN
笔记
https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/index.htmlINTRODUCTIONBYEXAMPLEhttps://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/notes/introduction.htmlAgraphisusedtomodelpairwiserelations(edges)b
光子乘羽
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2023-10-02 21:41
深度学习
pytorch
深度学习
机器学习
GNN
Code Tips
目录1.重置label取值范围2.根据多个labelstensor从整体label数据中提取特定数据。3.构建GeometricGATConv和GCNConv的edge_index4.为GCNConv从全部edgeindex抽取指定的batchedgeindex4.1extractbatchedgeindexforfullnodes4.2extractbatchedgeindexforbatchn
天狼啸月1990
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2023-10-02 21:41
GNN
algorithms
深度学习
人工智能
GNN
advanced knowledge
1.BP时注意lossvalue避免构建的GNNmodel在BP时陷入梯度消失或梯度爆炸,这都会导致modelperformance很差。修正方法:Batchnormalizationtorch.nn.BatchNorm1d()激活函数torch.nn.ELU();torch.nn.ReLU();torch.nn.Sigmoid()目标时将BPlossvalue限定在20-40之间Notethat
天狼啸月1990
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2023-10-02 21:41
GNN
algorithms
深度学习
人工智能
GNN
PyG~torch_geometric 学习理解
目录1.PyGIntroduction2.PyGInstallation2.1PyG安装常见错误及原因2.2PyG具体安装步骤3.torch_geometricpackagestorch_geometric.data.DataDataset与DataLoaderDropout、BatchNorm3.torch_geometric:理解edge_index3.1理解mini-batchedgeind
天狼啸月1990
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2023-10-02 21:10
学习
图神经网络
GNN
(一)GraphEmbedding
DeepWalk使用随机游走采样得到每个结点x的上下文信息,记作Context(x)。SkipGram优化的目标函数:P(Context(x)|x;θ)θ=argmaxP(Context(x)|x;θ)DeepWalk这种GraphEmbedding方法是一种无监督方法,个人理解有点类似生成模型的Encoder过程,下面的代码中,node_proj是一个简单的线性映射函数,加上elu激活函数,可以
天津泰达康师傅
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2023-10-02 16:04
图神经网络
神经网络
人工智能
深度学习
文献阅读
:RLAIF: Scaling Reinforcement Learning from Human Feedback with AI Feedback
文献阅读
:RLAIF:ScalingReinforcementLearningfromHumanFeedbackwithAIFeedback1.文章简介2.方法介绍1.整体方法说明3.实验结果1.RLHFvsRLAIF2
Espresso Macchiato
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2023-10-01 18:07
文献阅读
RLAIF
LLM
RLHF
强化学习
大模型
Task 01 简单图论与环境配置
参考链接:https://github.com/datawhalechina/team-learning-nlp/blob/master/
GNN
/Markdown%E7%89%88%E6%9C%AC/2
沫2021
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2023-10-01 10:36
【
文献阅读
】Pocket2Mol : 基于3D蛋白质口袋的高效分子采样 + CrossDocked数据集说明
Pocket2Mol:EfficientMolecularSamplingBasedon3DProteinPocketscode:GitHub-pengxingang/Pocket2Mol:Pocket2Mol:EfficientMolecularSamplingBasedon3DProteinPockets所用数据集与“A3DGenerativeModelforStructure-BasedDr
HealthScience
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2023-09-30 15:17
SBDD
人工智能
python
单目相机空间定位
文献阅读
关键词单目相机:Monocularcamera单目相机空间定位:Monocularcamerageolocation大范围单目PTZ相机空间定位:Large-rangeMonocularPTZ-camerageolocation大范围(Large-range)、全方位(omnidirectional)、低配准点(lessworld-imagepairs)、高适应性(Highadaptability
WindOfMayGIS
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2023-09-30 12:37
科研
音视频
3d
目标检测
优化|深度学习或强化学习在组合优化方面有哪些应用?
,是由于其结合了强化学习(Reinforcementlearning)强大的决策(decision-making)能力和深度学习(deeplearning)的各种模型(RNN、Transformer、
GNN
人工智能学家
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2023-09-30 05:44
算法
大数据
编程语言
python
神经网络
2019-05-11
文献阅读
记录
今日阅读记录:题目:Urbanization在中国——从都市化到新型城镇化(2019-2)期刊:城市规划CityPlanningReview作者:许皓;李百浩摘要:中国语境下的Urbanization,因都市化、城市化、城镇化不同译名,呈现多元的表述方式。新型城镇化等衍生词,则进一步丰富其表达。本文引入概念历史的分析视角,运用文献计量法,以波动频次与文本语境分析作为切入,追溯以上概念的起源与阶段性
一行白鹭上青天
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2023-09-29 21:47
为zotero同步服务搭建个人webdav应用
前言后面要进入博士阶段的研究生活了,在硕士期间,文献和笔记的管理极其混乱,因此打算打造一套新的好用的
文献阅读
,管理,写作体系。
Pz_mstr
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2023-09-28 12:25
【每日学习】
zotero
webdav
经典
文献阅读
之--EGO-Planner(无ESDF的四旋翼局部规划器)
0.简介作为局部规划器而言,当机器人或无人机想要避开动态障碍物时。局部规划器就显得尤为重要了。其中基于梯度的规划器被广泛用于四旋翼无人机的局部规划,其中欧几里得符号距离场(ESDF)对于评估梯度幅度和方向至关重要。然而,由于轨迹优化过程仅覆盖了ESDF更新范围的一个非常有限的子空间,因此计算这样一个场具有很大的冗余性。《EGO-Planner:AnESDF-freeGradient-basedLo
敢敢のwings
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2023-09-26 20:55
经典文献
人工智能
算法
2022-10-20晨间日记
今天是什么日子起床:8:20就寝:23:30天气:晴心情:平和纪念日:无任务清单昨日完成的任务,最重要的三件事:听力、
文献阅读
、英语作业、生物信息学作业改进:习惯养成:周目标·完成进度学习·信息·阅读健康
Wendy_0122
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2023-09-26 11:46
微习惯复盘与感恩日记2022-7-20
1、科研:听了一点点学术志的深度阅读营,今天的内容比较无趣,是一个用知网研学进行
文献阅读
的实操演示,我觉得对我来说用处不大,毕竟我看的论文不是社会学的,也真的不打算用知网研学这个很贵的工具,完全没有必要好吗
小木山庄的溜溜
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2023-09-26 04:59
2022-11-27
文献阅读
方面,是否已经掌握了该领域的研究进展?实验技能方面,有哪些方法能够解决目前瓶颈问题?精力投入方面,真的是把80%以上的精力用在了思考课题上?感觉自己还是思考的不多,用的精力不够,趁着
何毛毛
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2023-09-25 17:05
文献阅读
:LIMA: Less Is More for Alignment
文献阅读
:LIMA:LessIsMoreforAlignment1.内容简介2.实验设计1.整体实验设计2.数据准备3.模型准备4.metrics设计3.实验结果1.基础实验2.消解实验3.多轮对话4.
Espresso Macchiato
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2023-09-25 14:13
文献阅读
LIMA
LLM
Finetune
数据质量
NLP
【Graph Net学习】
GNN
/GCN代码实战
一、简介
GNN
(GraphNeuralNetwork)和GCN(GraphConvolutionalNetwork)都是基于图结构的神经网络模型。
BoostingIsm
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2023-09-25 10:02
Graph
DL
学习
python
人工智能
2023.07.16 学习周报
文章目录摘要
文献阅读
1.题目2.问题3.介绍4.Problemdefinition5.Method5.1FeatureExtractor5.2SyntheticNodeGeneration5.3EdgeGenerator5.4GNNClassifier5.5OptimizationObjective5.6
MoxiMoses
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2023-09-25 02:17
深度学习
2023.9.10 学习周报
目录摘要ABSTRACT一、
文献阅读
1、题目2、ABSTRACT3、网络结构1、传统LSTM神经元的内部结构2、BiLSTM单元的内部结构3、VMD-BiLSTM实验流程图4、文章解读1、Introduction2
Nyctophiliaa
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2023-09-25 02:45
学习
Epigenetics
文献阅读
:The molecular hallmarks of epigenetic control
这篇文献是表观领域“大牛”C.DavidAllis和Thomas在2016年发表的一篇综述。文章里讲述了表观遗传学的发展历程,以及一些研究进展。这篇文献我没有自己翻译,因为找到了一篇翻译的很好的文章了:NatRevGenet|20年来表观遗传领域核心进展之全景解读我只是把阅读过程中个人认为比较重要的知识点摘抄下来。“大佬”的文章,建议直接看英文原版更有感觉~文献题目:Themolecularhal
生信start_site
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2023-09-24 17:13
如何使用 Humata.ai:快速理解和总结文献
链接:Humata简介Humata.ai是一个人工智能驱动的
文献阅读
助手,可以帮助用户快速理解和总结文献。它可以提取文献的关键信息,并以简洁易懂的语言生成摘要。
winfredzhang
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2023-09-24 13:36
人工智能
humata.ai
pdf
总结
图神经网络(
GNN
)最新顶会论文汇总【附源码】
得益于强大的建模和分析能力,图神经网络(
GNN
)在社交网络分析、推荐系统、知识图谱、文本分析、等诸多领域得到了广泛的应用,目前已成为了人工智能领域的热门研究方向。
深度之眼
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2023-09-23 07:20
深度学习干货
人工智能干货
图神经网络
GNN
软件设计模式期末大作业——可乐商城管理系统
文章目录设计模式大作业软件设计模式任务书设计要求:学生应完成的工作:1.应用场景描述2.设计模式选择3.实现语言与工具参考
文献阅读
:工作计划:一、系统目标1.设计目的2.需求描述二、系统模式选择1.需求分析
zeng_jun_yv
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2023-09-22 13:37
软件设计模式
java
开发语言
后端
Pytorch学习记录-TextMatching几个经典模型
0.深度文本匹配发展总结本文基于知乎《深度文本匹配发展总结》,希望作为对之后
文献阅读
的一个路径。0.1常用数据集SNLI:5
我的昵称违规了
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2023-09-21 13:29
第八课.TPAMI2021年多篇
GNN
相关工作
目录Topology-AwareGraphPoolingNetworksGraphNeuralNetworkswithConvolutionalARMAFiltersLearningGraphConvolutionalNetworksforMulti-LabelRecognitionandApplications补充内容DeepWalk(KDD2014)GraphSAGE(nips2017)本次内
tzc_fly
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2023-09-21 12:31
图神经网络
深度学习
机器学习
人工智能
第六课.
GNN
的可解释性
目录CNN的可解释性深度学习中的可解释性CNN可解释性的研究模仿人类视觉:ThisLooksLikeThat:DeepLearningforInterpretableImageRecognition从参数角度研究:HowFunctionsEvolveinDeepConvolutionalNeuralNetworkImage到Graph的过渡:InterpretingCNNKnowledgeviaA
tzc_fly
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2023-09-21 12:30
图神经网络
算法
机器学习
新的
文献阅读
生态
zotero迎来6.0正式版的更新,内置PDF阅读器与笔记编辑器极大重构了我的
文献阅读
生态,本文记载了基于6.0版本的zotero配置过程。
骆苏
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2023-09-21 03:42
工作流
macos
开源
图神经网络
GNN
GCN AlphaFold2 虚拟药物筛选和新药设计
文章目录图神经网络1.GeometricDeepLearningRepresentationlearning表征学习机器学习的数据类型:序列、网格、图引出
GNN
2.GraphNeuralNetworksMachineLearningLifecyclelearninggraphishardFeatureLearninginGraphsWaystoAnalyzeNetworksANaiveApproa
丸丸丸子w
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2023-09-21 01:36
深度学习
生物信息
人工智能
GNN
图神经网络
AlphaFlod2
计算机辅助药物设计
文献阅读
2022-12-15
1.title:Frommolecularbasicstoagronomicsbenefits:insightsintononcodingRNA-mediatedgeneregulationinplantsAbstract:1.现象:thedevelopmentofplantsislargelydependentontheirgrowthenvironment.Toadapttoaparticul
Kernel_real
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2023-09-20 11:38
文献阅读
EMM:癌症中的单细胞转录组学-计算的挑战与机遇
学习一篇综述文献:Single-celltranscriptomicsincancer:computationalchallengesandopportunities,2020年发表于Experimental&MolecularMedicine,DOI号:https://doi.org/10.1038/s12276-020-0422-0。(第一作者JeanFan是Harvard大名鼎鼎的BIG生信
林枫bioinfo
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2023-09-20 11:01
Distill学习计划-
GNN
的通俗解释
AGentleIntroductiontoGraphNeuralNetworks译自非常好的一篇博客,原文链接本文旨在探索如何利用图的结构和特性构建出图神经网络(graphneuralnetwork,
GNN
RWLinno
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2023-09-20 09:42
学习
神经网络
笔记
机器学习
人工智能
python
算法
【
GNN
03】PyG
工具包安装:不要pip安装https://github.com/pyg-team/pytorch_geometrichttps://github.com/pyg-team/pytorch_geometricimporttorchimportnetworkxasnximportmatplotlib.pyplotaspltdefvisualize_graph(G,color):plt.figure(f
不菜不菜
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2023-09-19 10:51
神经网络
人工智能
深度学习
Google 基于
GNN
开发气味识别 AI,工作量相当于人类评价员连续工作 70 年
关键词:气味分析
GNN
气味谱图作者|雪菜编辑|三羊本文首发于HyperAI超神经微信公众平台~神经科
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2023-09-18 15:46
机器学习神经网络人工智能
Pre-trained models for natural language processing: A survey(NLP领域预训练模型研究综述)
一、前言首先列出了常用的神经网络模型:CNN、RNN、
GNN
以及注意力机制,它们的优点是能够缓解特征工程
敷衍zgf
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2023-09-18 12:28
文本挖掘
论文笔记
自然语言处理
人工智能
这才是
文献阅读
和管理的正确打开方式
看文献的步骤:1.先看中文再看英文。只要是个中国人,一般最擅长的还是中文而非英文,所以看中文文章最节省时间,对某一科研领域的入门也最快。如果有人牛哄哄的告诉你:“现在谁还看中文文章啊?你OUT啦!”那他的唯一目的一定是在你面前装B而不是真的为你着想。不得不承认,中文文献一般都没啥创新,但是在项目的最初阶段你只需要对该方向有个大致的掌握,而中国人别的不行,在跟踪和重复外国人工作方面是很在行的。所以,
百思方成Helen
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2023-09-18 08:27
研究生科研路上的六大关口
来源:信忠保科学网博客1、
文献阅读
关研究生入学经过一个学期理论文化课学习后,在导师指导下进入研究课题,同时也大致有了研究方向,由此便进入了
文献阅读
阶段。
文献阅读
是做学问的基础,似乎难倒了大部分学生。
易美编校
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2023-09-17 19:42
文献阅读
-TBK1在发育和衰老过程中抑制RIPK1驱动的细胞凋亡和炎症
杀杀还是神经退行性疾病的文献总结~TBK1SuppressesRIPK1-DrivenApoptosisandInflammationduringDevelopmentandinAgingTBK1在发育和衰老过程中抑制RIPK1驱动的细胞凋亡和炎症衰老是遗传性和偶发性神经退行性疾病的主要危险因素。但是,尚不清楚衰老如何与遗传易感性相互作用以促进神经退行性变。文章研究了TBK1的部分功能丧失,这是肌
不会生信哟
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2023-09-17 08:14
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