生物信息分析

7.24

生物信息学之前在座谈会上也已经被诸多老师提及，而今天由来自微分基因数据中心的孙勇老师为我们关于生物信息分析做了简单介绍。
寒林_4c5c·2023-04-14 13:08

如何使用conda安装R和R包

如何使用conda安装R和R包生物信息分析常遇到R和R包使用和安装问题，最新版的R包特别难安装，而conda可以很好的解决这个问题。conda的安装相对简单此处不再赘述。
心如止水-WTF·2023-04-11 21:07

生信小工具：Plink之下载安装与其基本格式（1）

谈起Plink相信熟悉的人更定都会知道，这是一个全面的基因组分析工具集，具有很多的小功能，在SNP数据统计，过滤，GWAS分析中都可以用得上，而且速度非常的快，堪称是生物信息分析软件中神器之一。
lakeseafly·2023-04-11 05:19

R语言基础教程 | 文件的输入与输出

做生物信息分析，少不了的就是数据，比如转录组的数据，无论是下载的还是测序的，用R进行分析，就必须将这些数据读入，分析的结果，比如一些图，就少不了输出，因此，文件的读写在数据分析中是比较常用的。
生信师姐·2023-04-08 15:28

MachineLearning 1. 主成分分析（PCA）

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你67篇原创内容-->公众号前言生信分析就是数据挖掘
桓峰基因·2023-04-06 02:05

DNA 2. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你80篇原创内容-->公众号前言随着癌症基因组学的进步
桓峰基因·2023-04-06 01:56

Topic 16. 临床预测模型之接收者操作特征曲线 (ROC)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你67篇原创内容公众号全网总结最全的ROC绘制方法，
桓峰基因·2023-04-01 18:01

linux下安装conda并使用

linux下安装conda并使用linux下安装conda并使用conda是生物信息分析必备的环境，集成了很多优秀的软件，关键是解决了依赖包的问题，很好用。记录一下我安装conda的心得。
爱打篮球的小猿·2023-03-30 16:27

性价比最高的黑苹果体验-NUC8I5BEH

本人身处生物信息分析行业，曾经也是广大Windows中的一员，对于MacOS不屑一顾，直到我用上了2K的大屏显示器，我的所有代码和Rstudio都模糊一片(高分屏自动修正),特别是用Rstudio做图的时候
小光amateur·2023-03-28 02:14

2019年“生物信息分析”暑期班培训报名通知

中关村华康基因研究院为了满足高校学生深入学习生物信息分析知识、掌握最新的生物信息分析技术及积累更多实战经验的需求，由浙江省生物信息学学会、中关村华康基因研究院主办的2019“生物信息分析”暑期班将在2019
华康基因·2023-03-23 02:04

根据barcode拆分测序数据

在后续的生物信息分析中，根据Barcode序列即可将不同样品的序列拆分开来。接下来介绍两个序列拆分工具seqtk_demultiplex和fastq-multx。seqtk_demulti
赵会成·2023-03-22 18:28

NIPT（无创产前DNA检测）技术的解说及运用（五）

NIPT检测技术仅需采取孕妇静脉血，利用二代DNA测序技术对母体外周血浆中纯化后的游离胎儿DNA片段（cffDNA）进行测序，并将测序结果进行数据化处理、生物信息分析，可以从中解读出胎儿的遗传信
生物菌君·2023-03-18 19:19

三维基因组（Hi-C）的原理以及应用

Hi-C技术源于染色体构象捕获（ChromosomeConformationCapture,3C）技术，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质三维结构信息
生信编程日常·2023-03-15 12:45

4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...

生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览(第一版)系统梳理了常用功能数据库。
生信宝典·2023-03-10 04:23

全国计算机信息高新技术考试生物信息分析（中级）考试大纲

全国计算机信息高新技术考试生物信息分析（中级）考试大纲第一单元基因组学相关基础知识（8分）1、人类基因组组成与遗传规律：DNA的分子结构、DNA复制方式、人类基因组DNA序列特征（2分）；2、基因及其表达与调控
天明豆豆·2023-02-18 03:31

IF：13+ Nomogram预测免疫检查点抑制剂治疗MSI-H型转移性结直肠癌患者的预后

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你80篇原创内容-->这期分享一篇临床预测模型的文章
桓峰基因·2023-02-17 09:17

R包clusterProfiler如何安装成功(新手必看!)

R包clusterProfiler是生物信息分析汇总，基因富集分析可视化经常用到的R包，但是安装时，新手经常会遇到一些问题，这里
·2023-02-16 21:13

2019年8.24-26“生物信息分析”暑期班（转录组）线下培训通知

为了满足高校学生深入学习生物信息分析知识、掌握最新的生物信息分析技术及积累更多实战经验的需求，浙江省生物信息学学会、中关村华康基因研究院主办的2019“生物信息学”暑期班（转录组）线下培训将在2019年
华康基因·2023-02-02 21:01

Clone 2. 肿瘤克隆进化之不同进化模式

点击关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你上期我们就肿瘤克隆进化的概念有了初步的认识，
桓峰基因·2023-01-30 08:11

Hi-C | 基础介绍

Hi-C技术源于染色体构象捕获（ChromosomeConformationCapture,3C）技术，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质三维结构信息
生信师姐·2023-01-27 20:16

RNA 22. SCI 文章中基于表达估计恶性肿瘤组织的基质细胞和免疫细胞（ESTIMATE）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你90篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2023-01-17 09:48

RNA 19. SCI 文章中无监督聚类法 （ConsensusClusterPlus）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你83篇原创内容公众号基于RNA数据做临床预测时，我们往往并不知道该对样本怎么分类
桓峰基因·2023-01-15 19:23

变异记录文件格式 vcf

主流的生物信息分析软件，在处理变异信息时，也基本上需要考虑支持解析或输出vcf格式的文件。本文在介绍vcf文件格式的基本格式的同时，对vcf文件记录的细节进行描述。
新爷话数据·2023-01-07 16:33

MachineLearning 5. 癌症诊断和分子分型方法之支持向量机（SVM）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你92篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2023-01-04 08:13

送书 | 令附生信专用简明 Python 文字和视频教程

本教程专注于帮助初学者，尤其是生物信息分析人员快速学会Python的常用功能和使用方式，因此只精选了部分Python的功能，请额外参考Python经典教程Abyteofpython和它的中文版来更好的理解
生信宝典·2023-01-01 07:53

RNA 20. SCI 文章中单样本免疫浸润分析 （ssGSEA）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你85篇原创内容公众号这期讲讲单样本基因富集分析，这个也蛮有意思的之前我已经介绍过基因集富集分析
桓峰基因·2022-12-26 17:05

手把手教你生信分析平台搭建（一）

很多读者想学习生物信息分析，而生物信息分析是一项实践性很强的工作，因此我们推出《生物信息分析平台搭建》系列，手把手教你搭建属于自己的生物信息分析系统，为了便于练习，我们将在虚拟机中进行练习，当熟练之后，
基因学苑·2022-12-25 23:40

甲基化系列 3. 甲基化芯片数据分析完整版（ChAMP）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你104篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2022-12-24 08:06

生物信息学笔记02 -- 研究的一般方法

阐明非编码区的信息特征，破译隐藏在DNA序列中的遗传语言规律生物信息学研究的内容与方法研究主要内容⚫生物学数据的收集、存储、管理与提供⚫基因组序列信息的提取和分析⚫功能基因组相关信息分析⚫生物大分子结构模拟和药物设计⚫生物信息分析的技术与方法研究
JamSlade·2022-12-02 02:51

IF：4+ 铁代谢和免疫相关基因标记预测三阴性乳腺癌的临床结局和分子特征

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你130篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2022-11-25 11:35

RNA 23. SCI文章中表达基因Cox模型的风险因子关联图（ggrisk）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你130篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2022-11-25 11:35

IF: 8+ m6A调控因子与m6A相关的lnc/mRNA作为结直肠癌预后因子的综合性分析

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你86篇原创内容公众号这期分享21年12月发表在MolecularTherapy
桓峰基因·2022-11-25 11:34

生信分析是个什么玩意儿？

生信小白：老板最近说，要搞搞高大上的全基因组测序，让我去做测序数据分析，可我都不懂哇...生信猿：这不就是生物信息分析嘛，搭建集群，搭建流程，跑跑数据...生信小白：听说你有一个朋友很厉害，可以让他教教我吗
wangchuang2017·2022-11-24 05:41

R 包 optparse 之命令行参数传递

对于经常与Linux打交道的生物信息分析童鞋们，我们今天分享一下怎么在命令行下通过传递参数（类似perl、python）的方式执行R脚本。
BioIT爱好者·2022-11-22 05:16

MachineLearning 4. 癌症诊断方法之 K-邻近算法（KNN）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你92篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2022-11-11 18:55

SCS【1】今天开启单细胞之旅，述说单细胞测序的前世今生

桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你123篇原创内容公众号今天开启单细胞之旅，单细胞其实我也算接触较早的项目
桓峰基因·2022-09-10 19:28

【51CTO学院三周年】编程成长感悟， 基于R，Python和JAVA

这是我自己编程技能提升途径的总结，主要有以下三点：业务驱动，修炼技能合作需求，扩展技能个人兴趣，不为金钱，只为快乐和创造最近刚入职两个月，同样从事的是生物信息分析，之所以从事当前这个行业，原因在于读大学时几乎大多数的专家
weixin_34419326·2022-09-01 07:48

基于barcode拆分二代序列

在后续的生物信息分析中，根据Barcode序列即可将不同样品的序列拆分开来。
曹草BioInfo·2022-08-28 16:46

RNA 24. SCI文章中基于TCGA的免疫浸润细胞分析的在线小工具——TIMER

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你135篇原创内容公众号今天来介绍一个使用非常方便的在线分析工具
桓峰基因·2022-07-19 22:45

FigDraw 15. SCI 文章绘图之多组学圈图(OmicCircos)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你132篇原创内容公众号桓峰基因公众号推出基于R语言绘图教程并配有视频在线教程
桓峰基因·2022-07-19 22:44

Topic 14. 临床预测模型之校准曲线 (Calibration curve)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你57篇原创内容公众号前言Calibrationcurve
桓峰基因·2022-07-19 22:44

DNA 12. SCI 文章绘图之全基因组关联分析可视化(GWAS)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你134篇原创内容公众号桓峰基因公众号推出基于基因组数据生信分析教程并配有视频在线教程
桓峰基因·2022-07-19 22:11

IF：12+ 不同癌症中TMB与ICI反应之间的免疫相关因素研究

桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你133篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用，还会定期分析一些相关的文章
桓峰基因·2022-07-18 11:50

FigDraw 7. SCI 文章绘图之折线图 (Lineplot)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你110篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因·2022-07-17 07:31

MachineLearning 10. 癌症诊断机器学习之神经网络（Neural Network)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你99篇原创内容公众号通过乳腺癌是数据我们利用不同的机器学习算法
桓峰基因·2022-05-15 07:58

DNA 1. Germline Mutation Vs. Somatic Mutation 傻傻分不清楚

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你76篇原创内容-->公众号B站直播课，肿瘤克隆进化生信分析培训课程
桓峰基因·2022-04-19 08:22

FigDraw 3. SCI 文章绘图必备 R 数据转换

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桓峰基因·2022-04-15 07:47

MachineLearning 1. 主成分分析（PCA）

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你67篇原创内容公众号前言生信分析就是数据挖掘，其过程中经常会遇到的情况是有很多特征可以用
桓峰基因·2022-04-09 07:55

HiPlot: bioinformatics analysis cloud platform

1.IntroductionofHiPlotHiplot(https://hiplot.com.cn)生物信息分析云平台免费为生物信息学、生物统计学、临床医学、地理信息学、数学统计学、机器学习等领域科研者提供在线生物信息数据分析的服务
benben_miao·2022-03-17 23:23

生物信息的Linux

生物信息分析的操作系统最流行莫过于Linux操作系统。原因有三点：长期运行的稳定性；很多软件只有Linux版本；强大的Bash命令简化重复性工作。
生信大猫·2022-03-09 16:32
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