生物信息分析

全新加权基因功能与通路富集分析方法助您科研一臂之力

基因功能与通路富集分析（以下简称富集分析）是最常用到的生物信息分析之一，它可以帮助生物学家和医学家挖掘新知识、确定新靶点、提供新思路和新线索，是大多数实验室常规必备生物信息利器。
e78edeb2d306·2024-02-04 17:00

FigDraw 4. SCI 文章绘图之散点图 （Scatter）

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你72篇原创内容-->公众号前两期简单介绍了R语言基础
90066456ace6·2024-02-03 11:30

数据下载两三事

最近在忙于搭建一个小的服务器用作生物信息分析。其中些许问题做一个简单的笔记。1数据库放在了Dropbox。外国人真的很喜欢用Dropbox的样子。
yilunanxia·2024-01-30 00:42

生物信息工作到底在做什么？

最近很多人在问我，做生物信息分析，具体是在做哪方面的工作呢？难不难？每天的工作内容是什么？容易上手吗？先来告诉大家生物信息分析到底难不难。
gtt儿_生物信息学习·2024-01-27 23:45

序列比对之blast在线和本地使用

序列比对（SequenceAlignment）比较两个或两个以上序列的相似性blast（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一种序列相似性比对工具，是生物信息分析最常用的一款软件
Nemo_53e9·2024-01-26 19:10

WDL： 快速编写属于你的分析流程

前言  一般生物信息分析流程都包含很多的分析步骤，这些步骤之间的联系也有很多情况。
生信云笔记·2024-01-25 21:09

【科研集市】一文带你读懂Hi-C（附高分文献汇总）

High-throughchromosomeconformationcapture)技术源于染色体构象捕获（Chromosomeconformationcapture,3C）技术，以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法
d5c9c866171f·2024-01-22 22:29

零代码进行转录组数据分析实战（一）：质量控制

生信：生物信息分析阶段。数据质控、比对、定量，以及差异表达基因分析等。从本文开始，着眼于生信阶段，开始带领大家进行转录组实战。首先就是测序数据质控。
简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-22 08:49

FigDraw 2. SCI 文章绘图必备 R 语言基础

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90066456ace6·2024-01-15 07:04

这个工具让你５分钟搞定GSEA分析！还不来看看？

初步的生物信息分析可能已经给我们提供了它们之间的差异倍数，P值等等。接下来我们可以使用在线工具对基因表达的分布进行分析。这里提供一个最近更新的简单又快捷，不需要安装的在线分析工具。
科研小行星·2024-01-11 15:56

解读！测序中的常用名词（转载）

转自欧易生物微信号：利用生物信息分析大数据在论文发表中占据了举足轻重的地位，尤其是在高通量测序越来越便宜的今天，但是测序分析中各种名词仍令很多小菜或非生物信息专业的人抓狂。
M78_a·2023-12-26 02:36

FASTA和FASTQ 介绍

参考:从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第2节FASTA和FASTQ作者：碱基矿工前言在生物信息分析过程中，各种组学（基因、转录、蛋白等）各种数据库，不同类型的数据可能都有其特有的数据文件与特殊的存储格式
Peng_001·2023-12-19 12:29

在线作图|2分钟绘制一张精美的火山图（Volcano Plot）

在生物信息分析中，火山图常用于转录组、基因组，蛋白质组，代谢组等统计数据。im
维凡生物·2023-12-17 22:49

生信小白Linux入门——安装Linux子系统

因为很多生物信息分析软件都是基于Linux，并且系统开源免费，不需要图形界面，有效的节约资源，可以方便高效的处理大批量数据。这是windows做不到的。
张小张__·2023-12-15 10:21

Topic 16. 临床预测模型之接收者操作特征曲线 (ROC)

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90066456ace6·2023-12-15 05:11

IF：4+ 鉴定与股骨头坏死软骨氧化应激相关的Hub基因和通路

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90066456ace6·2023-11-30 00:53

DNA 11. 识别肿瘤蛋白质三维结构上突变热点(HotSpot3D)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你125篇原创内容-->公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程
90066456ace6·2023-11-28 14:46

QIIME2进阶二_元数据及数据导入QIIME2

本节主要讲解如何将元数据与数据导入生物信息分析软件QIIME2，实现数据导入与检查。
环微分析·2023-11-26 18:54

QIIME2进阶五_QIIME2扩增子基因序列多样性分析

本节主要介绍了如何使用生物信息分析分析软件QIIME2对扩增子基因序列进行Alpha和Beta多样性分析，以及Alpha稀疏和深度选择。
环微分析·2023-11-26 18:54

1130转录组分析（三）--王通老师讲解

1130RNAseq生物信息分析（王通老师）01课程介绍[if!supportLists]1.[endif]RNAseq测序定义[if!supportLists]2.
不如好好学生信吧·2023-11-22 01:36

关于精准医疗的再思考

各国定义有一些差别，但核心意思相差不大，我们看一下中国精准医疗专家组詹启敏院士的定义:应用现代遗传技术、分子影像技术、生物信息分析技术，结合患者生活环境和临床数据，实现精准的疾病分类和诊断，制定具有个性化的预防治疗方案
基因百晓生·2023-11-21 11:32

第三代基因测序技术革新 云计算的应用

而今天，随着基因测序技术的发展，我们可以通过无创DNA检测的方式，利用DNA测序对母体外周血浆中的游离DNA片段进行测序，并将测序结果进行生物信息分析，可以从中得到胎儿的遗传信息，从而实现对唐氏儿的精准筛查
weixin_34336526·2023-11-14 13:59

生信人的最终梦想

注意我说的是数据分析，不仅仅是生物信息分析。
简佐义的博客·2023-11-12 22:52

如何下载生物数据（一）：生物数据检索

其实，一个完整的生物信息分析，约80%-90%的时间和工作量都是在做前期准备上，所以，正确下载合适的数据是非常重要的功能，那么从本次开始，我们将通过一系列的文
基因学苑·2023-10-31 13:04

可视化生信分析利器 Galaxy 之 Docker 部署

GalaxyProject（https://galaxyproject.org/）是很多年前在云计算背景下诞生的一个生物信息学可视化分析开源项目,是目前生物医学研究领域最受欢迎的在线生物信息分析工具之一
BioIT爱好者·2023-10-31 10:09

生信入门：序列比对之blast在线和本地使用

blast作为一种序列相似性比对工具，是生物信息分析最常用的一款软件，必须掌握。不管是做两序列相似性的简单比对，还是引物特异性、序列的来源等个性化分析，都会用到blast比对。
基因的生物信息学分析·2023-10-31 09:50

IF: 4+ 通过共表达网络鉴定急性心肌梗死患者血小板转录组关键基因模块和通路

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90066456ace6·2023-10-31 09:55

生物信息学——文件格式 pileup详解

从某种意义上来说，生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。一、pileup文件格式概述：pileup格式是一种常见的文本文件格式，用于描述基因组测序数据中每个碱基的信息。它通常
福旺旺·2023-10-18 18:09

Linux系统中如何安装生信软件?保姆式全攻略

Linux生信软件安装攻略生物信息分析软件在Linux系统下的安装通常有多种途径，其中包括使用包管理工具（如conda）进行安装和通过源代码进行编译安装。
生信分析笔记·2023-10-18 11:22

IF：5+ 7种癌症免疫治疗证明DNA损伤反应通路突变可作为免疫检查点阻断疗效的潜在生物标志物

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桓峰基因·2023-10-15 09:40

IF：4+ 膀胱癌RNA结合蛋白相关预后模型

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你71篇原创内容-->公众号最近分享了很多转录组的高级别分析
90066456ace6·2023-10-15 04:17

生物信息学——常见的四种文件格式(fasta,fastq,sam,vcf)

从某种意义上来说，生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。例如当前很多分析都可以概括为从fastq到bam，从ba
福旺旺·2023-10-11 04:30

RNA 21. SCI 文章中单基因富集分析

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你88篇原创内容公众号今天就来剖析一下单基因到底怎么做
桓峰基因·2023-09-28 23:10

SCS【1】今天开启单细胞之旅，述说单细胞测序的前世今生

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你123篇原创内容-->公众号今天开启单细胞之旅，单细胞其实我也算接触较早的项目
90066456ace6·2023-09-28 20:33

4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...

生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览(第一版)系统梳理了常用功能数据库。
生信宝典·2023-09-20 11:46

肝细胞癌中关键生物标志物的筛选和鉴定:来自生物信息分析的证据

摘要肝细胞癌是世界上最常见的癌症之一。人们对其病因进行了大量的研究，但对其分子机制尚不清楚。从基因表达综合数据库(GeneExpressionOmnibus,GEO)下载芯片数据集GSE19665、GSE33006和GSE41804，以确定肝癌发生和进展中的候选基因。鉴定差异表达基因(DEGs)，并进行功能富集分析。构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)，并使用STRING和Cytoscape进行模
亦是旅人呐·2023-09-11 11:30

4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...

生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览(第一版)系统梳理了常用功能数据库。
生信宝典·2023-08-20 07:45

Cytoscape + STRING + cytoHubba 联合使用寻找hub基因

Cytoscape的安装和使用Cytoscape是一款非常优秀的生物信息分析软件，该软件可以在分析生物数据的时候提供图形化的操作方式，支持多种多种分析方式，可以选择分析网络，帮助用户对
米妮爱分享·2023-08-19 13:14

Nextflow 快速搭建生信分析流程（一）

生物信息分析中流程搭建是所有组学分析过程中必不可少的环节，目前市面上一些主流的生信类的公司（包括贝瑞、华大、诺禾等）在流程搭建过程中还主要依靠perl和python以及shell等命令进行流程的开发。
翌然小白·2023-08-19 13:23

生物信息分析常用文件格式和软件

生物信息分析常用文件格式和软件文件格式数据格式fastqfasta注释gtfgffbedbcf比对格式sambam工具类数据质控类cutadaptfastptrimmomaticfastx-toolkit
超人立志做国王·2023-08-14 07:00

【工具】Galaxy（training）生信平台资源

Galaxy(https://galaxyproject.org/use/)生物信息分析平台是目前生物医学研究领域最受欢迎的在线生物信息分析工具之一，其后台封装了很多高端的计算工具，并且在网页的前端给这些工具以直观的使用界面而把计算和存储管理的细节隐藏起来
米源MY·2023-08-13 13:16

GEO数据挖掘（一）--简单快速下载GEO数据

这种通过对现有公共数据挖掘数据进行分析的研究方式目前正是生物信息分析的热门领域。
诺禾致源·2023-08-03 22:15

RNA 20. SCI 文章中单样本免疫浸润分析 （ssGSEA）

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你122篇原创内容公众号这期讲讲单样本基因富集分析，
桓峰基因·2023-08-02 14:18

植物基因组-基因组分析中的“地图”文件(gff3和gtf文件介绍)

常见的生物信息分析中，基因组的注释文件和参考基因组具有相同重要的功能，如果说参考基因组是一个蕴含着所有资源的宝岛，那么基因组的注释文件就是航海路线图。
blue_unique·2023-08-02 04:01

【文献速递】-cell-颠覆性技术：DBiT-seq空间高分辨率的多组学技术

空间转录组技术在一定程度上提供了基因表达空间异质性信息，但如何在大组织区域内进行高分辨率、多组学、无偏差的生物信息分析仍然是一个科学难题。
基因侦探·2023-07-28 15:53

4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...

生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览(第一版)系统梳理了常用功能数据库。
生信宝典·2023-07-27 10:38

生信基础-测序原理

生物信息分析的前提是获得了测序数据，关于测序原始数据也涉及非常多知识及细节，如果明白了测序原理及测序数据产生的过程，在理解关于原始数据的各个问题上也比较容易。
新欣enjoy·2023-07-27 05:54

DNA 3. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你81篇原创内容-->公众号前言随着癌症基因组学的进步
桓峰基因·2023-07-21 00:56

IF: 6+ m6A信号与肿瘤免疫微环境在胶质瘤中的预后分析及验证

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你84篇原创内容-->公众号这期分享一篇贼简单的6+
桓峰基因·2023-07-19 02:25

DNA 7. 基因组拷贝数变异分析及可视化 (GISTIC2.0)

桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你119篇原创内容公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程
桓峰基因·2023-06-17 08:44
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