E-COM-NET
首页
在线工具
Layui镜像站
SUI文档
联系我们
推荐频道
Java
PHP
C++
C
C#
Python
Ruby
go语言
Scala
Servlet
Vue
MySQL
NoSQL
Redis
CSS
Oracle
SQL Server
DB2
HBase
Http
HTML5
Spring
Ajax
Jquery
JavaScript
Json
XML
NodeJs
mybatis
Hibernate
算法
设计模式
shell
数据结构
大数据
JS
消息中间件
正则表达式
Tomcat
SQL
Nginx
Shiro
Maven
Linux
生物信息
谈谈数次生信线下活动的收获和体会
http://blog.genesino.com/2018/03/ampliconseqsumamry/从2017年11月份到2018年3月份,共进行了5次培训研讨活动,内容依次为转录组高级分析、
生物信息
作图系列
生信宝典
·
2024-02-06 08:48
生物信息
常用30个Linux命令(二)
学习
生物信息
,Linux是必须掌握的内容,其实常用的Linux命令也就30个左右,而且这些命令都是单词的简写,记忆起来并不困难。从这次内容开始,我们将详细介绍这30个左右的命令。
基因学苑
·
2024-02-05 16:40
支持向量机
支持向量机在许多领域都有广泛的应用,如文本分类、图像识别、
生物信息
学、金融预测等。支持向量机的应用:(1)文本分类:支持向量机可以用于文本分类任务,如垃圾邮件过滤、情感分析、主题分类等。
小森( ﹡ˆoˆ﹡ )
·
2024-02-05 10:24
机器学习算法
支持向量机
算法
机器学习
基迪奥的新书(基因表达调控-新组学技术介绍与应用)是否值得买?
--谈谈你入门
生物信息
学时遇到的那些坑先说答案,不值得买。相信很多朋友在新学一门技术时,会通过购入书籍、购买课程等手段来迅速地提高自己的知识储备,笔者也不例外。
浪子刀客
·
2024-02-05 08:41
2022-05-26
生物信息
文献胃癌一篇(浙医二院)疑问:究竟是基因驱动的进展,还是伴随进展的基因表达变化?谁是始作俑者?尽管医疗技术日益成熟,但晚期胃癌患者的预后仍不能客观确定。
朗月斋主
·
2024-02-05 05:36
全新加权基因功能与通路富集分析方法助您科研一臂之力
基因功能与通路富集分析(以下简称富集分析)是最常用到的
生物信息
分析之一,它可以帮助生物学家和医学家挖掘新知识、确定新靶点、提供新思路和新线索,是大多数实验室常规必备
生物信息
利器。
e78edeb2d306
·
2024-02-04 17:00
【年度盛会征稿】第二届全国精准营养与生命健康创新大会(PNHIC 2024)
“精准营养”研究借助多组学、可穿戴、影像学、
生物信息
学、人工智能等多种新技术和新理论对不同个体营养状况和需求开展系统研究,提供量身定制的膳食和生活方式干预和指导,从而更有效地促进健康和防控重大疾病。
搞科研的小刘选手
·
2024-02-04 14:41
学术会议
人工智能
大数据
web安全
智慧城市
安全
物联网
文件格式——FASTA
FASTA文件的格式在
生物信息
学中,FASTA格式(又称为Pearson格式)是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。
oddxix
·
2024-02-04 03:57
scRNA-seq | Windows下的R、RStudio下载和安装
2020/5/25,下定决心用R语言了,Python虽然顺手但是
生物信息
学尤其是单细胞测序领域主要还是R的天下。(发现一篇Naturecommunication居然用R调用了Tensorflow!
切瓜少年
·
2024-02-03 20:37
【C++动态规划学习总结】
1.动态规划:初识动态规划(英语:Dynamicprogramming,简称DP),是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
生物信息
学中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法
PP mod
·
2024-02-03 17:30
C++学习记录
c++
动态规划
学习
软件系统架构黄金法则17:图形数据存储架构法则
图形数据在社交网络、推荐系统、
生物信息
学等领域具有广泛的应用。为了更好地存储和处理这些数据,图形数据存储架构应运而生。
禅与计算机程序设计艺术
·
2024-02-03 15:47
AI大模型应用开发实战案例详解
大数据
人工智能
语言模型
AI
LLM
Java
Python
架构设计
Agent
RPA
200826 Circ之旅3-构建人类基因组索引
注:后面可能还会构建鼠源的x参考:RNA-seq(5):序列比对:Hisat2人类基因组hg19、hg38构建bwa索引
生物信息
学习——bowtie2使用手册bwabowtie2salmonsubreadhisat2
dicklim
·
2024-02-03 15:13
FigDraw 4. SCI 文章绘图之散点图 (Scatter)
关注公众号,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你72篇原创内容-->公众号前两期简单介绍了R语言基础
90066456ace6
·
2024-02-03 11:30
卡梅 计算机生物专业怎么样,美国卡梅
生物信息
学专业录取案例
Carnegiemellonuniversity卡耐基梅隆大学computationalbiology计算机生物学Universityofmichigan,annarbor密歇根大学安娜堡分校bioinformatics
生物信息
学
weixin_39683863
·
2024-02-02 04:14
卡梅
计算机生物专业怎么样
2020-02-25 Day30 利用
生物信息
学分析鉴定乳腺癌的潜在关键基因和关键通路
在本研究中,我们旨在通过公共数据集的
生物信息
学分析来鉴定乳腺癌中潜在的病原性和预后差异表达基因(DEG)。
卅衣
·
2024-02-01 15:13
《
生物信息
学:导论与方法》--新一代测序NGS:转录组分析RNA-Seq--听课笔记(十四)
第八章新一代测序NGS:转录组分析RNA-Seq8.1转录组介绍Atranscriptomeisacollectionofallthetranscriptspresentinagivencell.所谓转录组(transcriptome),是指特定细胞中全体转录本(transcript)的集合。也可以说是细胞特定时刻基因表达谱的一个快照(snapshotofexpressionprofile)在转录
盲人骑瞎马5555
·
2024-02-01 12:52
生物信息学
RNA-Seq
Cufflinks
TopHat
《
生物信息
学:导论与方法》----变异的功能预测----听课笔记(十一)
第六章变异的功能预测6.1问题概述Wheredidyourgeneticvariationscomefrom?inheritedfromparentsdenovomutations(70~100个新发突变)somaticmutations(体细胞突变,如癌症)有很多的先天的小儿疾病,就是这个孩子有一个Denovomutation,刚好落在了一个重要的基因上,它有可能有这种严重的疾病。肿瘤细胞一般都
盲人骑瞎马5555
·
2024-02-01 12:21
生物信息学
遗传变异
SIFT
PolyPhen
生信学习笔记1:学习如何用OPLS-DA分析代谢组数据(从入门到掌握)
它们广泛应用于化学计量学、
生物信息
学、经济预测等领域。偏最小二乘法(PLS)偏最小二乘法是一种多变量分析方法,主要用于找到两组数据(通常是预测变量集和响应变量集)之间的线性关系。
盲人骑瞎马5555
·
2024-02-01 12:18
生物信息学
学习
人工智能
算法
OPLS-DA
隐马尔可夫模型系列——(二)模型参数
隐马尔可夫模型在自然语言处理、语音识别、
生物信息
学和金融领域等方面有着广泛的应用。本文将从模型参数的角度详细介绍隐马尔可夫模型中的三个关键要素:隐藏状态、观测状态和状态转移
飞影铠甲
·
2024-02-01 02:35
机器学习
人工智能
机器学习
数学建模
2021-12-27
NatRev丨癌症基因组测序数据的计算分析原创珍奇图灵基因2021-12-2707:03收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:珍奇IF:60.716推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:本文描述了癌症基因组
生物信息
学分析中涉及的主要步骤
图灵基因
·
2024-01-31 23:49
特征选择综述论文阅读笔记
一特征选择(featureselection)的简介 我们现在正处在大数据的时代,大量的高维数据在各种领域中无处不在,如社交媒体、医疗保健、
生物信息
学和在线教育。
wyn20001128
·
2024-01-31 01:23
数据挖掘
数据挖掘
机器学习
算法
LINUX的练习题
LINUX的练习题:最低要求是完成我的linux20题http://www.bio-info-trainee.com/2900.html其次完成
生物信息
学数据格式的习题(blast/blat/fa-fq
七七师姐
·
2024-01-31 00:14
生物信息
网站集合
1.常用门户:美国国家生物技术信息中心(NCBI):https://www.ncbi.nlm.nih.gov欧洲
生物信息
学研究所(EMBL-EBI):https://www.ebi.ac.ukUCSCGenome
庐山星晖
·
2024-01-30 16:27
ChatGPT如何为初学者进入
生物信息
学领域赋能?
也引发了人们对它们在促进编程重数据分析方面的潜在用途的巨大兴趣,如
生物信息
学。凭借其卓越的会话和编程能力(例如rtour.ai网站),ChatGPT有望帮助学生克服编程障碍。
qq_37303241
·
2024-01-30 10:44
chatgpt
人工智能
使用 ChatGPT 为
生物信息
学初学者赋能
论文:EmpoweringBeginnersinBioinformaticswithChatGPT.2023对于生信初学者而言,最大的困难是身边没有经验丰富的人给予指导。而ChatGTP的出现可能改变这一现状,学生可以自己作为导师,指导ChatGPT完成数据分析工作。众所周知,与ChatGPT互动,给予的指令越精确,那么它给出的答案越精准。这篇论文提出一个与ChatGPT互动的模型:OPTICAL
简说基因-专业生信合作伙伴
·
2024-01-30 10:13
chatgpt
人工智能
2018.8.9
玉米粥土豆春卷大绿砖曲折的生物学学长结果是
生物信息
学纠结来纠结去很辣的辣子鸡美美的午觉破釜沉舟的决心吧桃子核桃打打气刚刚好的生活刚刚到的快递港澳通行证签证凉面烤奶微生物打卡保持明天开始独立实验了不需要人陪
珍惜眼前始为真
·
2024-01-30 09:14
生物信息
学 编程零基础学习 Python
我本科是农学,研究生专业是生物学,方向是植物基因组。编程方面真是零基础,仅仅在大一接触C语言。整个课题组基本都是用Python作为主要的编程语言。目前是研一下学期,我也想总结一下编程的学习之路。Python的入门第一本Python书.png这本书很薄,内容很简单,适合之前从没有学过编程的人阅读。通过这本书能简单了解Python语法,变量,函数等等进一步的深入学习Python编程.从入门到实践.pn
球果假水晶蓝
·
2024-01-30 09:14
数据下载两三事
最近在忙于搭建一个小的服务器用作
生物信息
分析。其中些许问题做一个简单的笔记。1数据库放在了Dropbox。外国人真的很喜欢用Dropbox的样子。
yilunanxia
·
2024-01-30 00:42
生物信息
工作到底在做什么?
最近很多人在问我,做
生物信息
分析,具体是在做哪方面的工作呢?难不难?每天的工作内容是什么?容易上手吗?先来告诉大家
生物信息
分析到底难不难。
gtt儿_生物信息学习
·
2024-01-27 23:45
序列比对之blast在线和本地使用
序列比对(SequenceAlignment)比较两个或两个以上序列的相似性blast(BasicLocalAlignmentSearchTool)是一种序列相似性比对工具,是
生物信息
分析最常用的一款软件
Nemo_53e9
·
2024-01-26 19:10
安装WGCNA的各种方法
相关网络在
生物信息
学应用中得到越来越多的应用。例如,加权基因共表达网络分析是一种用于描述芯片基因间表达相关模式系统生物学方法。加权相关网络分析(WGCNA)可用于寻找高度相关基因的聚类(模块)。
JeremyL
·
2024-01-26 11:16
2021-02-10
第三个问题埋藏在统计学甚至认识论的基石中,逐步会变得性命攸关并可能拆解掉
生物信息
这个行业,那就是如何解决相关性和因果率的巨大冲突,所有
生物信息
从业者都在联系收集到的数据和想解决的生物学问题时,都借用了大量的相关性来证明自己的数据是有用的
我们一起舔过铁栏杆
·
2024-01-26 10:58
WDL: 快速编写属于你的分析流程
前言 一般
生物信息
分析流程都包含很多的分析步骤,这些步骤之间的联系也有很多情况。
生信云笔记
·
2024-01-25 21:09
xshell用无线网远程连接linux失败_Linux基础入门 | 服务器集群使用指南
但是,在我们进行
生物信息
学分析时,往往需要在高性能服务器集群上投递任务。这就需要我们掌握基本的集群操作方法。
weixin_39781363
·
2024-01-25 18:58
业余爱好-
生物信息
学/生物化学/物理/统计学/政治/数学/概率论/AI/AGI/区块链
生物信息
学高等数学—元素和极限-实数的定义高等数学—元素和极限-实数的元素个数高等数学—元素和极限-自然数个数少于实数个数高等数学—元素和极限-无穷大之比较高等数学—元素和极限-级数的收敛高等数学—元素和极限
amingMM
·
2024-01-24 16:52
概率论
方便的 Bash 终端技巧大集合
几年前我从事
生物信息
学方面的研究工作。对那些简单的bash命令感到惊讶,他们比我的枯燥脚本快很多。通过学习命令行的快捷方式和脚本帮助我节省了很多时间。
summerbluet
·
2024-01-24 14:21
3‘aTWAS—3‘adapter-based transcriptome-wide association study
3'aTWAS是一个
生物信息
学技术,全称为3'adapter-basedtranscriptome-wideassociationstudy。
m1chiru
·
2024-01-23 09:23
人工智能
使用python处理
生物信息
数据(二)
Python学习的第二天。1.处理数据列处理ImageJ测量神经树突长度获得的数据。data=[]#读取neuron_data.txt文件,strip()函数去除文件中每行起始位置的空格和末尾的换行符。forlineinopen('neuron_data.txt'):length=float(line.strip())data.append(length)#data数据的长度n_items=len
你猜我菜不菜
·
2024-01-23 08:26
在Python环境中运行R语言的配环境实用教程
前情提要在做一些
生物信息
与医学统计的工作,本来偷懒希望只靠python完成的,结果还是需要用R语言,倒腾了一会儿,调成功了,就记录一下这个过程。
Metaphysicist.
·
2024-01-23 07:58
python
开发语言
r语言
生物信息
学导论-北大-新一代测序NGS:转录组分析RNA-Seq 1
ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义+搜索内容。Real-TimeqRT-PCR基于互补杂交反应(complementaryhybridizationreaction),PCR技术的发展促进了本技术的发展,缺点是:1.低通量2.需要有转录本序列的先验知识。步骤:Real-TimeQuantita
陆沙
·
2024-01-23 00:50
生物信息学
生物
生物信息
【科研集市】一文带你读懂Hi-C(附高分文献汇总)
High-throughchromosomeconformationcapture)技术源于染色体构象捕获(Chromosomeconformationcapture,3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合
生物信息
分析方法
d5c9c866171f
·
2024-01-22 22:29
推荐植物
生物信息
学参考书Plant Bioinformatics Methods and Protocols》third edition
找论文的时候偶然发现的这本参考书,个人感觉内容还挺丰富的,在这里推荐给大家书名是《PlantBioinformaticsMethodsandProtocols》thirdedition我看了下是2022年出的是最新的一版,全书总共28章第一章UsingGenBankandSRA介绍了genbank和sra数据库的一些内容第二章ScriptingAnalysesofGenomesinEnsemblP
小明的数据分析笔记本
·
2024-01-22 17:11
生物信息
学必知必会的Linux/Unix命令
我们之前分享过一篇文章:清华大学
生物信息
学课件资料分享,各位屯资料的小松鼠,有没有认真跟着学习呢?我翻了翻,立马就看到了干货。
简说基因-专业生信合作伙伴
·
2024-01-22 08:49
linux
运维
服务器
零代码进行转录组数据分析实战(一):质量控制
生信:
生物信息
分析阶段。数据质控、比对、定量,以及差异表达基因分析等。从本文开始,着眼于生信阶段,开始带领大家进行转录组实战。首先就是测序数据质控。
简说基因-专业生信合作伙伴
·
2024-01-22 08:49
数据分析
数据挖掘
生物信息
基础:pysam读写基因组文件
Pysam[1]是一个Python模块,它打包了高通量测序库htslib[2]的C-API,可用于读写基因组相关文件,如Fasta/Fastq,SAM/BAM/CRAM,VCF等。本文以Fasta/Fastq文件的读写为例,介绍Pysam的用法,详细教程请查看官网。Installpipinstallpysam或者condainstallpysamFastafiles对于Fasta文件,可以实现随机
简说基因-专业生信合作伙伴
·
2024-01-22 08:37
python
开发语言
北大公开课-2
生物信息
学历史
在分子水平研究演化L.pauling1965sangerDNAsequencing19771988人类基因组计划2001年人类基因组计划2005二代测序1991年Linux系统系统特点由目的单一的小程序组成,组合小程序完成各个任务一切皆文件避免人机交互,中间不需要输入任何内容能简写绝不写全称
番番番茄小姐
·
2024-01-21 18:24
生物信息
学导论-北大-变异的功能预测3(Comparative Modeling)
ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义。ComparativeModeling就是第一节提到的同源建模HomologyModeling,指利用序列的相似性去推测蛋白质结构。回放:同源建模HomologyModeling:SWISS-MODEL执行:先在数据库中搜索(i.e.BLAST)找到至少一个
陆沙
·
2024-01-21 17:34
生物信息学
生物
生物信息
生物信息
学导论-北大-变异的功能预测2(SAPRED)
ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义。生物学问题:如何区分致病变异和中性变异?如何预测一个变异是否致病?方法:Conservation-based:SIFTRule-based:PolyPhenClassifier-based:PolyPhen2,SAPREDSAPRED:SingleAmino
陆沙
·
2024-01-21 17:04
生物信息学
生物信息
生物
生物信息
学导论-北大-变异的功能预测1
ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义。基因突变的来源Germlinemutation(胚系突变)来自父母的遗传,是生殖细胞携带的突变,可以遗传在个体每个细胞中都存在Denovomutation(新发突变)父母本身没有突变,一般来自精卵结合或受精卵发育过程中的自发突变很常见,一般不会带来功能性的问
陆沙
·
2024-01-21 17:03
生物信息学
生物
生物信息
生信小工具之:并行解压神器pigz
做
生物信息
的同学会相信你们都会遇到这样的情况:你会遇到成白或者上千的sequencingdata,然后你需要解压它/或者将你一系列的结果进行压缩,然后你使用你熟悉的gunzip或者gzip,将你所需要解压或者压缩的文件一个一个压缩
lakeseafly
·
2024-01-21 11:24
上一页
1
2
3
4
5
6
7
8
下一页
按字母分类:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
其他