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Binning
宏基因组CAG、MGS、MLG、MAG傻傻分不清?
在之前的
Binning
文章中(文章链接:《如何打破瓶颈,提升宏基因组研究level》、《宏基因组高分文章里的小技巧》),主要针对Contig进行聚类,旨在得到潜在的单菌基因组信息。
斗战胜佛oh
·
2024-01-25 11:54
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPI SDK获取每张图像的微秒时间和FrameID功能(C#)
Baumer工业相机通过NEOAPISDK获取每张图像的微秒时间和FrameID功能功能1.引用合适的类文件2.通过NEOAPISDK使用
Binning
功能Baumer工业相机使用微
格林威
·
2024-01-22 16:24
工业相机
数码相机
c#
开发语言
计算机视觉
opencv
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPI SDK使用
Binning
像素合并功能(C++)
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPISDK使用
Binning
像素合并功能(C++)Baumer工业相机Baumer工业相机NEOAPISDK和短曝光功能的技术背景Baumer工业相机通过
格林威
·
2024-01-20 14:33
工业相机
数码相机
c++
开发语言
计算机视觉
人工智能
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPI SDK使用ForceIP强制修改网口IP功能(C#)
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPISDK使用
Binning
像素合并功能(C#)Baumer工业相机Baumer工业相机NEOAPISDK和ForceIP功能的技术背景Baumer工业相机通过
格林威
·
2024-01-20 14:33
工业相机
数码相机
tcp/ip
c#
计算机视觉
opencv
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPI SDK使用
Binning
像素合并功能(C#)
Baumer工业相机堡盟工业相机如何通过NEOAPISDK使用
Binning
像素合并功能(C#)Baumer工业相机Baumer工业相机NEOAPISDK和短曝光功能的技术背景Baumer工业相机通过CameraExplorer
格林威
·
2024-01-20 14:00
工业相机
数码相机
c#
开发语言
视觉检测
计算机视觉
十一.图像处理与光学之图像缩放方式
模式/SOCresize)文章目录十一.图像处理与光学之图像缩放方式(sensorbinning模式/skipping模式/SOCresize)11.1sensorbinning模式11.1.12:2
Binning
悟空胆好小
·
2023-12-14 13:06
图像与光学相关
图像处理
人工智能
metawrap宏基因组数据处理流程(亲测有用)
1.metaWRAP简介MetaWRAP旨在成为一个易于使用的宏基因组数据分析软件包,从头到尾完成宏基因组分析的核心任务:序列质量控制、组装、可视化、分类分析、提取基因组草图(又称分箱
binning
)和功能注释
不锈铁
·
2023-11-27 21:44
生信
python
数据分析
信息可视化
数据分析
python
【置信度校准】几种经典概率校准方法(Platt scaling、 histogram
binning
、 isotonic regression、 temperature scaling)
1.PlattscalingPlattscaling本质上是对模型sigmoid输出的分数做概率变化。在此基础上引入了两个参数a,b,假设输入样本为,模型输出分数为,则最终输出概率计算公式变为a,b参数优化通过最大化似然函数(最小化对数损失函数)的方法可以求得2.histogrambinning对于所有输出未校准预测概率,将其划分成个bin,对于每个bin设置一个校准分数,如果预测概率若如区间,这
蘑菇桑巴
·
2023-11-18 20:21
机器学习
置信度校准
概率论
机器学习
EukCC2评估真核生物MGAs质量
可以评估
binning
后的单个bin或者bins目录。其原理是基于动态变化的单拷贝标记基因集(SCMGs),包括基础真核生物、真菌、原生动物及植物的SCMGs。SCMGs的原理在于
Neptuneyut
·
2023-11-10 03:24
eukcc
Nature子刊|
Binning
宏基因组+单菌验证
题目:ISME|宏基因组
binning
研究揭示土壤微生物群协同互作二甲基砷脱甲基机制期刊:TheISMEJournal影响
SHANGHAILINGEN
·
2023-09-26 18:28
测序
组学
测序
组学
一文带你了解”数据分箱“技术
01.数据分箱数据分箱(
Binning
)作为数据预处理的一部分,也被称为离散分箱或数据分段。其实分箱的概念其实很好理解,它的本质上就是把数据进行分组。
Jay__007
·
2023-09-24 05:47
Python
python
pandas
numpy
Camera Tunning ISP 模块面试总结
需要出多大的分辨率去调效果;因为有些芯片有最大分辨率支持的限制,可能需要调整sensor输出的分辨率大小;而且要注意下减小分辨率后,输出图像的fov及像素的长宽比,减小分辨率的话,一般会损失fov(前提不是
binning
青春~飞鸟
·
2023-09-21 07:50
图像处理
金融风控建模常用指标介绍(WOE, IV, KS, PSI)
WOE(WeightofEvidence,用于特征变换,衡量变量某个取值的预测能力)WOE算法已在我的另一篇文章数据预处理-分箱(
Binning
)和WOE编码介绍过,这里不再赘述。
隔壁偷菜的谁
·
2023-09-20 18:49
金融风控
机器学习
数据挖掘
评分卡模型
数据预处理-分箱(
Binning
)和 WOE编码
数据预处理-分箱(
Binning
)和WOE编码1.分箱1.1理论1.1.1定义分箱就是将连续的特征离散化,以某种方式将特征值映射到几个箱(bin)中。1.1.2为什么要进行分箱?
隔壁偷菜的谁
·
2023-09-16 06:53
算法
python
数据预处理
分箱
WOE
KNIME 模块( Transformation 类型模块之一 列处理模块集合 之
Binning
)
欢迎关注公众号数据分析指北数据分析指北-KNIME模块(Transformation类型模块之一列处理模块集合之
Binning
)历史回看:模块基础基础(DataAccess类型模块之二Database模块集合
havef
·
2023-09-09 17:44
量化交易-单因子分析-alphalens
1.数据准备1.1计算因子IC重要函数defget_clean_factor_and_forward_returns(factor,prices,groupby=None,
binning
_by_group
大虾飞哥哥
·
2023-09-01 23:53
量化交易
pandas
python
大数据
处理contig合并后有序列名相同的问题
做
binning
的时候遇到这个问题:Exceptionoccuredwhenparsingfiletemp/contig/all_contigs.faTraceback(mostrecentcalllast
江有枫xx
·
2023-08-25 07:27
服务器
宏基因组CAG、MGS、MLG以及Bin、MAG、Draft genome
宏基因组的
Binning
主要针对Contig进行聚类,旨在得到潜在的单菌基因组信息。除了Contig,宏基因组中还有一类序列信息,即Gene。
笺牒九州的怪咖
·
2023-08-21 22:03
2022《Molecular Plant》同源四倍体马铃薯单倍型分型和四倍体遗传
利用最先进的测序技术和多倍型图形
binning
,此研究完成了一种马铃薯栽培品种Cooperative-88(C88)的染色体规模的单倍型分型基因组组装。
生信师姐
·
2023-08-16 09:06
机器学习中的特征工程(四)---- 特征离散化处理方法
离散化过程也被表述成分箱(
Binning
)的过程。特征离散化常应用于逻辑回归和金融领域的评分卡中,同时在规则提取,特征分类中也有对应的应用价值。
HaloZhang
·
2023-08-11 01:33
宏基因组分析笔记之
binning
一、宏基因组简介:reads→(根据overlap组装)→contig重叠群→(构建454paired-end库或illuminameta-paired库,组装)→scaffold→(
binning
)→
小王的学习杂记
·
2023-08-07 06:21
宏基因组分箱软件metaWRAP报错记录与解决方法
最近学习微生物宏基因组分箱(
binning
),按官方文档安装metaWRAP,踩了一堆坑,记录一下报错及解决方法:1.metaWRAP安装安装教程及下载地址:GitHub-bxlab/metaWRAP:
ygyxl
·
2023-06-21 04:21
移动端TB(D)R架构基础
目录1各类电子设备功耗对比2名词解释3立即渲染4TBDR渲染流程5
Binning
过程(第一个Defer)6不同GPU的Early-Depth-Test(第二个Defer)7优化建议8参考目录1各类电子设备功耗对比桌面级主流性能平台
果冻喜之郎
·
2023-06-11 21:09
TA
unity
小驰私房菜_03_了解Remosaic
【Camera基础系列】【4合1sensor】【remosaic】【
Binning
】这篇文章分下面几点展开:一、什么是remosaic二、为什么需要remosaic三、remosaic是如何实现的四、疑问点五
小驰编程
·
2023-03-29 14:22
Android
android
camera
android
studio
android
java
凌恩客户文献|宏基因组
binning
解析中国浓味白酒窖泥微生物群落MAGs和代谢潜力
通过宏基因组
binning
解析了中国
SHANGHAILINGEN
·
2023-03-14 22:24
微生物
三代测序
PacBio
其他
科技
宏基因组分析-基于
binning
二、分析流程介绍宏基因组分箱(
Binning
)是将
微基生物
·
2023-02-07 11:22
宏基因组
宏基因组测序
宏基因组检测
宏基因组分析
宏基因组二代测序
数据挖掘——第三章 数据预处理
datacleaning)数据集成(dataintegration)数据归约(datareduction)数据变换(datatransformation)3.2数据清理缺失值处理方法噪声数据处理方法分箱(
binning
Yi_cAt
·
2023-02-05 08:12
数据挖掘
数据挖掘
机器学习
python
基因BIN来源分析(一)cd-hit去冗余,salmon计算基因TPM
所以基因BIN来源分析很适合
Binning
下游分析。
胡童远
·
2022-05-18 16:31
宏基因组标准流程--metaWRAP
github.com/bxlab/metaWRAP"MetaWRAP")旨在成为一个易于使用的宏基因组数据分析软件包,从头到尾完成宏基因组分析的核心任务:序列质量控制、组装、可视化、分类分析、提取基因组草图(又称分箱
binning
哈皮大爱
·
2021-08-30 22:27
数据挖掘, 概念与技术 Chapter 3. 数据预处理
keyword:数据质量,datacleaning,dataintegration,datareduction,ETL,
binning
,outlieranalysis,实体识别问题,[图片上传失败...
Wallace_QIAN
·
2021-06-20 22:31
从CONCOCT入手理解宏基因组
binning
文章会同步发表于本人github和githubhomepage目录宏基因组
binning
简介
binning
原理2.1.可用于
binning
的特征2.2.从哪些序列下手进行
binning
?
UnderStorm
·
2021-05-02 14:11
宏基因组shotgun入门笔记
根据分析对象的分类1.2.三个基本数据处理问题1.3.一般分析流程1.4.比较宏基因组学的应用1.5.目前存在的技术问题实验设计2.1.几点指导意见2.2.测序平台的选择Metagenomeassembly宏基因组
binning
4.1
UnderStorm
·
2021-04-19 21:04
机器学习-直方图和核密度估计(Kernel Density Estimates)
1、直方图的问题①直方图装箱(
binning
)的过程会导致信息丢失。②直方图不是唯一的。对比起来比较困难。③直方图不是平滑的④直方图不能很好的处理极值核密度估计(KDE)完全没有上述的问题。
旺旺丫丫
·
2020-09-14 20:14
机器学习
直方图
核密度估计
CMOS 摄像头的Skipping 和
Binning
模式
CMOS摄像头的Skipping和
Binning
模式在通常的摄像头中,不同的resolution对应不同的帧率。想要提高帧率就要考虑是否需要缩小视野(FOV)。
大熊背
·
2020-09-12 19:14
图像基础知识
理解 Pix
Binning
理解PixBinning在CMOS摄像头的Skipping和
Binning
模式博文中,我们提到过PixBinning可以提高sensor的信噪比。
大熊背
·
2020-09-12 19:14
图像基础知识
【数据处理】python变量分箱常见手法:分类型、数值型、卡方、自定义
"""分箱逻辑:1.类别型特征:1)类别数在5个以下,可以直接根据类别来分箱(
binning
_cate)2)类别数在5个以上,建议做降基处理,再根据降基后的类别做分箱2.数值型特征:1)离散型数值特征(
CS正阳
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2020-09-11 10:27
项目实战:数据处理
数据分箱技术
Binning
数据分箱技术
Binning
数据分箱就是按照某种规则将数据进行分类。就像可以将水果按照大小进行分类,售卖不同的价格一样。
徐念安
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2020-09-11 08:59
数据科学
Camera
Binning
Mode
CameraBinningMode:像素合并模式,将相邻的像素单元电荷通过物理的方法叠加在一起作为一个像素输出信号;
Binning
是一种图像读出模式,将相邻的像元中感应的电荷被加在一起,以一个像素的模式读出
laviolette
·
2020-08-25 16:20
Camera
Binning
Mode
CameraBinningMode:像素合并模式,将相邻的像素单元电荷通过物理的方法叠加在一起作为一个像素输出信号;水平方向
Binning
:同列相邻行的电荷叠加垂直方向
Binning
:同行相邻列的电荷叠加采用这种方式
leo_wdls
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2020-08-23 19:51
image
sensor
BBNorm官方指导文档翻译
此外还有:基于深度的-
binning
,kmer频度直方图,错误矫正,错误标记,基因组大小估计BBNorm有
热爱大自然的小和尚
·
2020-08-20 17:17
连续属性离散化与sklearn.preprocessing.KBinsDiscretizer
1、连续属性离散化离散化(Discretization)(有些时候叫量化(quantization)或分箱(
binning
)),是将连续特征划分为离散特征值的方法。
望百川归海
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2020-08-18 11:16
机器学习
Ensemble Learning-模型融合-Python实现
文章目录1EnsembleLearning-模型融合1.1Voting1.2Averaging1.3Ranking1.4
Binning
1.5Bagging1.6Boosting1.7Stacking1.8Blending2
立刻有
·
2020-08-16 08:41
机器学习
数据挖掘竞赛
机器学习
模型融合
DAS Tool 介绍
DASToolDASTool是一种自动化的处理方法,集成了多个
binning
算法的结果,从而从单个assembly结果中获取优质的,非冗余的bins.与其他方法相比,其可以从土壤基因组中重建更多接近完整的基因组
weixin_44881875
·
2020-08-09 15:18
DAS工具: 利用去重、聚合和评分的策略从宏基因组中恢复基因组
推荐指数:★★★★★阅读时间:6分钟文本字数:2260字推荐理由:佳作推荐文章介绍了一种去重、聚合和评分策略——DAS工具,它灵活的结合了已建立的
binning
算法的优点。
刘永鑫Adam
·
2020-08-08 01:48
Chapter 2 Data Exploration
A.AboutDataQualityB.Preprocessing①Quality②Sampling③AttributeSelection④DimensionalityReduce⑤Discretization:
Binning
⑥Statistics⑦
Gaoithe
·
2020-08-04 18:21
Whisper
of
Data
Mining
camera 驱动 关于mipi的一些计算
2448,.line_length_pclk=1932,.frame_length_lines=2482,.vt_pixel_clk=144000000,.op_pixel_clk=254400000,.
binning
_fact
我在上海玩泥巴
·
2020-08-04 16:57
位图索引bitmap(二):现代位图索引技术
所以,从控制索引大小和减少查询响应时间这两个出发点,业内的优化策略一般从以下三个角度切入:分桶(
binning
)、编码(encoding)和压缩(compression)。
njpjsoftdev
·
2020-07-14 15:52
索引技术
olap
camera相关知识
模组硬件结构2工作原理2.1sensor2.2DSP/ISP2.3DVP/MIPI2.4摄像头模组引脚2.5snesor输出图像格式2.6pixelarray(像素阵列)3CMOS摄像头的Skipping和
Binning
ivychend
·
2020-07-14 12:15
硬件调试
python_等频分箱_等距分箱_特征无监督分桶
python_等频分箱_等距分箱data_temp=data#分箱:等距等频分箱#等距分箱#bins=10分箱数data_temp['deposit_cur_balance_bins']=
binning
御剑归一
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2020-07-12 15:26
Python
宏基因组分箱后续
3.1.1如何从NCBI批量下载genome数据3.2进化树构建3.2.1序列选择用16SrRNA构建:用保守基因串联构建:3.2.2建树3.2.3进化树美化4.基因草图可视化5.进化历程分析在获得了
binning
ruby912
·
2020-07-11 22:36
宏基因组
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