HLA

2022-04-11

Naturegenetics|HLA自免疫风险等位基因限制T细胞受体高可变区原创苏安图灵基因2022-04-1117:39收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：苏安IF：38.33推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：

图灵基因·2024-02-14 03:48

HLA--基础

人类的MHC也叫做HLA(humanleukocyteantigen,HLA)复合体。小鼠的MHC则被称为H-2基因。由于MHC的多基因特性，依据其

晓佥·2024-02-05 10:53

linux下tomcat怎么部署,如何在Linux下使用Tomcat部署Web应用(图文)

MAC上安装HLA(HighLevelAssembly)1.安装HLA最新版的hla汇编器可在这里下载,支持MacOs,Linux,Windows平台2.安装步骤将下载好的hla程序包放在Mac

weixin_39938269·2024-01-19 18:48

其实还深爱—（好消息）

就是在配型者左手臂抽14ml静脉血，抽患者静脉血4ml，送到可以做DNA检查的实验室，提取两者中白细胞的DNA，进行扩增电泳，比较两者DNA有多少是相同的，想同的越多配型越合，目前只检测6个基因，分别是HLA

诗羽桐·2024-01-11 04:45

HLA分型工具--OptiType

OptiType只能分型HLA-A,HLA-B,HLA-C三种类型文章2014年发表：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4441069/截止2022

11的雾·2023-12-31 09:08

HLA--polysolver

Comprehensiveanalysisofcancer-associatedsomaticmutationsinclassIHLAgeneshttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4747795/使用全外显子组测序（WES）检测HLA

晓佥·2023-12-27 01:41

OpenRTI的编译与ha-hla例程的实现

首先是OpenRTI的编译安装从GitHub上cloneOpenRTI到本地文件夹，项目为了平台通用性，使用cmake来搭建工程，源码cmake之后，打开visualstudio进行编译，提示中有两个主要错误：一个是提示没有python的debug库文件，python310_d。于是modify一下python安装，安装debug模块，解决一个报错。然后报错提示有两个项目的输入文件匹配输出文件，发

lxlchick·2023-12-01 10:18

2_Linux基础知识及命令――――Linux的命令语法格式

lsoptions：定义命令的执行特性，可以有长短两种选项：长选项：用--引导，后面跟完整的单词，如--help短选项：用-引导，后面跟单个的字符，如-a多个短选项可以组合使用，例如：-h-l-a==-hla

小伙有点菜·2023-11-30 11:04

多组学纯生信分析套路多组学鉴定肾癌新药靶

整合-组学和HLA-配体组学分析识别ccRCC免疫治疗的新药物靶点一．研究背景透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是肾癌中最常见的亚型，有分析意向（http://gaptechsxr.mikecrm.com/

概普生信·2023-11-29 17:19

[用藥] 阿巴卡韦（ABC：Abacavir ）

药品简介目前阿巴卡韦不属于国家成人免费提供的药品，只免费提供给儿童抗病毒治疗；有条件时应在使用前查HLA

8chi·2023-10-28 21:51

主要组织相容性复合体MHC

人类的MHC被称为HLA（humanleukocyteantigen，HLA），即人白细胞抗原;小鼠MHC则被称为H-2。HLA位于人的6号染色体短臂上，H-2位于小鼠的17号染色体上。

Seurat_Satija·2023-10-22 09:15

HLA 分布式仿真

走在成长的道路上·2023-10-15 13:09

SNP2HLA HAN.MHC参考的使用

一段时间以来，一直困惑于这个HLA填充参考怎么使用，直到看到了这篇论文课题组的博士论文《中国汉族人白癜风MHC区域精细定位研究》。

zd200572·2023-09-20 15:33

sed将多行fasta变为一行

fasta文件：>sp|P30443|1A01_HUMANHLAclassIhistocompatibilityantigen,A-1alphachainOS=HomosapiensOX=9606GN=HLA-APE

气旋_c8b6·2023-07-22 09:12

人单核细胞白血病(THP-1)细胞培养攻略

其表面抗原HLA型为：A2，A9，B5，DRw1，DRw2。|细胞复苏1.预热水浴锅至37℃2.准备一个15mL离心

cas9x细胞基因敲除·2023-06-18 03:07

Linux语法格式是什么,linux命令语法格式

option：定义命令的执行特性，可以有长短两种选项：长选项：用--引导，后面跟完整的单词，如--help短选项：用-引导，后面跟单个的字符，如-a(1)多个短选项可以组合使用，例如：-h-l-a==-hla

百越闲人·2023-06-07 13:04

生病给我的启事

与HLA-B27呈强关联。某些微生物（如克雷白杆菌）与易感者自身组织具有共同抗原，可引发异常免疫应答。是四肢大关节，以及椎间盘纤维环及其附近结缔组织纤维化和骨化，以及关节强直为病变特点的慢性炎性疾病。

有梦想的小林·2023-04-18 22:27

国家级生物医药公共服务平台发布HLA3D数据库，技术架构分享

近日，南京基因与细胞实验室合作团队取得阶段性成果，东南大学-生命科学与技术学院-李健教授团队在《BriefingsinBioinformatics》（影响因子IF=11.622）上发表题“HLA3D:anintegratedstructure-basedcomputationaltoolkitforimmunotherapy

思通数科x·2023-04-17 04:54

seasidezhb·2023-04-13 06:11

【HLA】初识HLA/RTI

本文主要对近期所翻阅的一些论文及资料进行的概要性整理，后续会有更多的关于HLA的研究细节发布，基于博客园的知识共享平台，以期共同进步！

SystemEngineeringLab·2023-04-08 09:18

DDS协议与OPCUA对比

一、DDS协议DDS协议(DataDistributionService)是OMG对象管理组织在HLA及CORBA等标准的基础上制定的新一代分布式实时通信中间件技术规范，DDS采用发布/订阅体系架构，强调以数据为中心

路边闲人2·2023-04-07 06:09

连锁不平衡（LD）分析。

由于HLA不同基因座某些基因经常连锁在一起遗传，而连锁的基因并非完全的随机的组成单体型，有些基因总是较多的在一起出现，

要快乐_更要经历山河·2023-04-04 14:17

ubuntu16.03

ctrl+-命令：ls当前目录下内容，不含隐藏内容ls-a显示所有内容，含隐藏内容ls-ld表示目录，-表示文件，不含隐藏内容ls-l-h-h将显示的内容大小变为相应单位如k，M等ls-h-l-a或ls-hla

weixin_30275415·2023-03-27 07:21

IMGT/HLA数据库简介

IMGT/HLA数据库收录了HLA不同Allel的序列信息，网址如下https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/最近更新日期为2018年7月11号，版本为3.33.0,数据库中收录的信息如下

生信修炼手册·2023-03-19 19:25

它被称为“不死的癌症”？

与HLA-B27呈强关联。某些微生物（如克雷白杆菌）与易感者自身组织具有共同抗原，可引发异常免疫应答。是四肢大关节，以及椎间盘纤维环及其附近结缔组织纤维

乐歌健康生活·2023-03-17 11:19

单细胞108篇文献解读之5---Acquired cancer resistance to combination immunotherapy from transcriptional loss...

AcquiredcancerresistancetocombinationimmunotherapyfromtranscriptionallossofclassIHLA，本文的重点在于单细胞数据的分析部分图片1背景知识HLA

Seurat_Satija·2023-03-14 04:55

第8章：主要组织相容性复合物MHC2021-04-18

在人类6号染色体上发现的人类MHC被称为人类白细胞抗原(HLA)。当具体提到HLA基因或HLA分子时(例如，HLA-A基因编码HLA-A分子)。

孟婆给咱来碗汤_cc67·2023-03-09 18:57

HIBAG——对SNP芯片数据进行HLA imputation

HIBAG是用于使用SNP数据估算HLA类型的软件包，该软件包配套根据现有数据库估算的参数，因此只需要输入自己的芯片数据，无需访问大型数据库，即可得到HLAimputation信息。

亚里亚的塔·2023-03-09 10:07

图示杂合SNP的R脚本

膜拜一下小伙伴的R脚本，杂合SNP在外显子和内含子区域的图示，以下截图来自于Gendx的HLA显示，以下脚本进行一个部分的实现image.png具体效果如下：image.pngoptions(stringsAsFactors

九月_1012·2023-02-03 07:48

The Immune Landscape of Cancer 方法汇总

等人开发，它允许对TCR和免疫球蛋白序列进行高度可定制的分析Opitype专门针对HLAI型基因进行分型的软件，可以提供精确的4位分型结果polysolver使用相对低覆盖率的WES数据，也可以实现高精度的HLA

JUpter_·2023-01-30 06:51

MATHLA：集成双向LSTM和多头部注意力机制的HLA-肽结合预测的强大框架

我们提出了一种整合了双向长短期记忆网络和多头注意力机制的泛等位基因HLA-肽结合预测框架——MATHLA。该模型在五倍交叉验证测试和独立测试数据集中都实现了更好的预测准确性。

逆袭lzw·2022-12-24 10:04

ECCV 2022 | RFLA：基于高斯感受野的微小目标检测标签分配

考虑到基于IoU阈值和中心采样策略对大对象的倾斜，作者进一步设计了基于RFD的分层标签分配（HLA）模块，以实现小对象的平衡学习。在四个数据集上的大量实验证明了所提方法的有效性。作者的方法在AI

CV技术指南(公众号)·2022-12-10 04:42

HLA-Face Joint High-Low Adaptation for Low Light Face Detection

文章目录HLA-Face:JointHigh-LowAdaptationforLowLightFaceDetection（HLA-Face联合高低自适应微光人脸检测）0Abstract1Contribution2JointAdaptationforDarkFaceDetection2.1Motivation2.2BidirectionalLow-LevelAdaptationBrightening

李劭卓保护美好一切·2022-11-20 06:27

2021SC@SDUSC软件工程应用与实践----项目综述

目前在多肽结构的预测，蛋白质结构预测，多肽与HLA的结

见到我请过去学习·2022-11-20 03:40

HLA分型工具-HLA-HD

在2022年还在更新的一款软件https://www.genome.med.kyoto-u.ac.jp/HLA-HD/官方文档写的非常清楚，安装和使用的过程并没有遇到什么问题，所以这里只做一些记录。

11的雾·2022-11-18 09:36

HLA分型工具--HLAscan

HLAscan:genotypingoftheHLAregionusingnext-generationsequencingdata原文地址：https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-017-1671-3软件地址：https://github.com/SyntekabioTools/HLAscan/rel

11的雾·2022-11-18 09:23

2022-10-22 免疫检查点抑制剂生物标志物之HLA

免疫检查点抑制剂生物标志物之HLA-知乎(zhihu.com)HLA（HumanLeukocyteAntigen，人类白细胞抗原），HLA又称为MHC（MajorHistocompatibilityComplex

学习生信的小兔子·2022-10-22 07:54

HLA-DQ的刺激表达

HLA-DQ的表达和HLA-I类及其他HLA-II类表达的调控不太一样，它不像HLA-I类一样在人类组织细胞中组成型表达，非常多的细胞类型不表达HLA-II类，刺激表达的效果也不太一样，鉴于越来越多的HLA-DQ

文章收集器·2022-02-14 11:02

人脐带血CD34+造血干细胞/祖细胞及培养基 LONZA Human Cord Blood CD34+ Stem/Progenitor Cells

众所周知人脐带血CD34+细胞含有造血干细胞和祖细胞，相比其他人体组织来源的造血干细胞，脐带血CD34+造血干细胞更幼稚，可以避免供体和受体HLA（HumanLeukocyteAntigen，人白细胞抗原

泽平科技·2022-02-10 23:30

accustomed color scheme in Seurat FeaturePlot

FeaturePlot(seu.integrated,reduction="pca",features=c("AIF1","CD53","CD68","CD74","CSF1R","FCGR2A","HLA-DRA

为了梦走一遭·2021-11-11 06:54

HLAminer1.4 (HPRA, HPTASR) 在HLA分型中的使用方法

针对database中的fasta，报错时候重新bwaindex-aisHLA-I_II_CDS.fasta1.ReadAlignment(HPRA，fasterbutlessaccurate)查看HPRArnaseq_classI-II.sh，bwa方法比较繁琐:rd1=/liu/sample_rna_suc/clean_by_trimmomatic/SRR7094744_1_paired.fa

gong0037·2021-06-27 12:41

使用HLAscan进行HLA分型

HLAScan是由韩国的科研团队开发的一款HLA分型工具，可以处理WGS,WES和目标区域捕获测序的数据，将reads与IMGT/HLA数据库中的reads进行比对，然后确定HLA的基因型信息。

生信修炼手册·2021-06-14 11:56

【家庭伦理】龙凤砚（12）

让主治医生惊喜的是，捐献者的HLA即人类白细胞抗原与孩子的移植位点相合，相融性高，这样移植之后，

深山女巫一·2021-05-06 22:51

海澜集团

[1][2]中文名海澜集团外文名HEILAN(HLA)创立于1988年位于江苏省江阴市基础产业精毛纺面

邵启云·2021-04-20 09:54

参考基因组的选择

常常面临如何选择参考基因组的问题，我们以Ensembl上的参考基因组为例，我们以小鼠的参考基因组为例：我们看到第2行以alt结尾的参考基因组文件，这个文件的alt代表：Alternateloci，不同的单倍体型，里面有不同的HLA

小潤澤·2020-10-23 11:29

这场直播观众纷纷“打卡签到”，每个编号背后都有一个用生命重启生命的故事

抽取约8毫升血液，检测出的HLA（人类白细胞抗原）分型数据，就能为挽救一位血液病患者的生命提供些许可能。今年的9月19日是第六个世界骨髓捐献者日。

健康报·2020-09-19 00:00

麒麟KY-RTI分布仿真技术：第一章简介

原文：https://blog.csdn.net/sillysunny/article/details/84197424第一章简介高层体系结构（HighLevelArchitecture，HLA）是美国国防部为了解决美军在各个领域开发出来的多种模型和各类仿真系统的互联和互操作问题而提出的一种分布式仿真标准

每天进步一点点就好·2020-09-17 03:22

麒麟KY-RTI分布仿真技术：第三章 KY-OMT对象模型模板工具

3.1对象模型模板HLA1.3包含3个标准，第一个是描述整个联邦和联邦成员必须遵循的10条规则的标准；第二个是用于实现RTI的100多个服务的标准，这些服