Protein

Protein A与Protein G有何不同？如何选择一抗和二抗？

抗体的结构二抗的结合1.一抗选择指南一抗是能和非抗体性抗原（特异性抗原）特异性结合的蛋白。种类包括单克隆抗体和多克隆抗体。一抗可以特异性地结合底物，识别出我们想要检测的东西。检测任何靶蛋白都有多种抗体可供选择，那如何进行一抗的选择呢？1）确定实验样本的种属确定自己实验所用样本的种属，如human、rat、mouse、pig、goat等。应选择物种相同或有交叉反应的抗体，抗体可能与不同物种的同种靶蛋
小黑黑黑黑·2022-04-26 16:19

alphafold2 蛋白三级结构预测

我们服务器上已经安装了该软件，所以直接调用module,需要自己准备包含蛋白氨基酸序列的protein.fa#!
落寞的橙子·2022-03-22 04:20

小技巧6-某列重复项对应的所有行合并（不做删除）

proteinlist.xlsx（protein序列和genename为虚构）有时会遇到类似上图的情况，进行了一系列的筛选后，一条肽段对应着不同基因名，如下：高亮行是protein重复行此时希望可以以肽段为固定列
大李_1ba1·2022-03-01 10:36

每日单词

engine引擎suit套服equality等式，相等cooperation协作action动作menu菜单mere纯粹的，仅仅的principle原则protein蛋白质extention扩展
猿小军·2022-02-20 05:11

【文献解读】NATURE COMMUNICATIONS：An effector protein of the wheat stripe rust fungus targets chloropla...

背景：1.Pst-12806：条锈菌效应蛋白2.TaISP:Pst-12806筛选到的靶标(aputativecomponentofthecytochromeb6-fcomplex)结果：WorkingmodelofthefunctionofPst_12806duringPst–wheatinteractions.日积月累：Secretome:n.分泌蛋白质组Chloroplast:[ˈklɔːr
sensen·2022-02-17 03:31

基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）

一、数据准备首先，选取不同物种的Protein数据集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan.fa；Durio_zibethinus.fa
胡小兵plus·2022-02-12 06:40

读“Inhibition of TLR signaling by a bacterial protein containing immunoreceptor tyrosine-based inhibitory

注：读文献后感，麻烦有心人帮忙修改一下语法之类的。Translocatedintiminreceptor(Tir)proteinisoneofthepathogenicagentsforenteropathogenicEscherichiacoli.TheresearcherfoundthattheTirproteinnotonlyplaysimportantroleinpedestalforma
小懒猫猫不吃鱼·2022-02-11 07:30

真正富有的人不是不知如何和我们相处的人！纽约瑜伽导师Eddie教会我们很多！-Healthy&Happy 17

我们有可能活很多年，甚至长生（如果开发出来技术可以公示于大众的话），基于现代蛋白（Protein）、细胞（Cell）、基因（Gene）”，生物技术奇点突破的三个基础领域，三者互相影响，合称为“PCG”。
徐林Grace·2022-02-09 14:45

如何安全的减脂？

人本重要成分水(Bodywater)、蛋白质(Protein)、体脂肪(BodyFat)体脂肪：脂肪占总体重的比例，肌肉含量越高，说明代谢旺盛，运动能力越强。
灬52赫兹灬·2022-02-06 02:16

2021-01-16

蛋白质（protein）是生命的物质基础，是有机大分子，是构成细胞的基本有机物，是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。
喜气羊洋子·2021-06-27 14:41

每日单词

protein蛋白质mere仅仅地principle原则daring勇敢steep陡峭accidental非偶然的permissible允许的ballon气球menu菜单cooprational协作的
猿小军·2021-06-25 17:36

基因家族鉴定---Blastp

数据：研究物种的基因组文件：Protein.fasta近源种的基因家族蛋白序列:protein.fasta建库：makeblastdb-ininput_file-dbtypemolecule_type-parse_seqids-outdatabase_name-logfileFile_Nameinput_file
MLD_TRNA·2021-06-24 20:19

4.Autodock使用最后一步docking

1.首先Docking--Macromolecule--Setrigidfilename找到文件夹下面的protein.pdbqt文件--打开选定蛋白质分子2.再点击Docking--ligand--open
YX_Andrew·2021-06-21 17:58

减肥纯干货之二

我们把摄入体内的食物分为：蛋白质（protein）、脂肪（fat）和碳水化合物（carb)。
小jiang片·2021-06-11 17:22

Phylogenetic tree——系统发育树的生成

在分子水平，亲缘关系的远近通常用DNA（或protein）序列的差异来表示。构建发育树的算法非常多，具体参考参考文献中的文章。
咸鱼426·2021-06-11 00:35

《半年前的食物塑造了今天的你》［日本］村山彩

P,F,C的失衡是指（protein蛋白质，fat脂肪，carbohydrate碳水化合物）。减少热量并不意味着一定会瘦，瘦身真正的关键在于pfc的平衡，在于营养物质的吸收。
涂_774a·2021-05-08 00:07

Pfam-[The Pfam protein families database in 2019]

今年Pfam数据库发文称：过去几年，Pfam数据库发生了重大变化！细看了一下，果真变化重大！吓得我赶紧过来把笔记更新了~~*32.0版的Pfam更新了些什么？（31.0版，2017年，才1年多）1.数据量增加：蛋白家族数量增加到17,929；2.蛋白家族宗族分类和功能注释的优化：将重新定义的蛋白家族与已有的家族进行整合；3.与RepeatsDB协同优化Pfam中的串联重复蛋白结构定义：Repeat
ZXia413·2021-05-05 03:28

牛肉乌冬炒面

克魔芋乌冬面180克盐料酒胡椒少许做法：1.牛柳用料酒盐胡椒腌一晚2.热锅加入黄油，融化后加圆葱，炒半熟3.加入腌好的牛柳炒熟4.加入洗过的魔芋乌冬面炒三分钟即可热量：272卡脂肪：13.1克蛋白质：28.6克Protein
哎审判长饿了吗·2021-04-27 11:02

2021-03-01-文献阅读笔记—肝癌血管侵袭的基因组和蛋白质景观的全面分析

RevealsMolecularDriversandPredictiveBiomarkers--Hepatology--14.679思路从肝癌伴血管浸润的转录组血分析、蛋白组学分析→找到差异mRNA、差异microRNA、差异protein
FFwizard·2021-03-03 19:49

论文笔记：EGAT: Edge Aggregated Graph Attention Networks and Transfer Learning Improve Protein-Protein In

文章目录一、摘要二、方法（一）、蛋白质图的表示（二）、节点级特征表示（三）、边级特征表示（四）、EGAT结构的主要特点（五）、边缘聚合图关注层（六）、在计算注意力分数时使用边缘特征三、结果（一）、数据集（二）、基准数据集上的结果（三）使用基于ProtBERT的特性进行迁移学习的影响四、总结一、摘要图神经网络(GNN)已成为结构信息编码的一种有效工具，尽管基于GNN的体系结构已被应用于配对结合位点预
wangpan007·2021-01-20 19:15

梦断代码--一个程序员的自白 (一）

本文以此献给Protein。看过一本同样叫做《梦断代码》的书，英文名叫《dreamincode》我总觉得翻译得不准确。在那本书中，讲述了一个软件项目Chandler失败的前后经历，让人读来扼腕叹息。
wingfiring·2020-09-17 07:20

梦断代码--一个程序员的自白（九 完）

当时Protein的新经理M也刚来不久，我们都有点担心资源不够。这时，美国的架构师也忙于新的项目，也没时间给出Protein的新设计，中国这边就只好
wingfiring·2020-09-17 07:20

梦断代码--一个程序员的自白（七）

最终，目标锁定到Protein，让Protein通过ADP来存储材质包。对于Protein项目，我至今也不知道最初的立项缘由。
wingfiring·2020-09-17 07:20

PPI | protein-protein interaction | 蛋白互作分析 | gene interaction | 基因互作

前言做RNA-seq基因表达数据分析挖掘，我们感兴趣的其实是“基因互作”，哪些基因影响了我们这个基因G，我们的基因G又会去影响哪些基因，从而得到基因调控的机制。直觉确实是很明确的，但是细节处却有很多问题。我们讨论的到底是基因表达的互作，还是基因产物的互作？------------对于蛋白编码基因，它翻译产生蛋白，如果此蛋白不参与转录过程，理论上不可能会影响另一个基因的表达，那也就不存在基因表达的互
weixin_30723433·2020-09-15 12:00

PPI(protein-protein interaction) realated database 与蛋白对相关的数据库简介合集

比较全面的蛋白对相关数据库简介及其网址。包括相关的network，complex，family，function等相关的pair，甚至还有non-interactionproteinpair。偶然看见，如获至宝。目前在寻找最新，最高效的蛋白交互对预测器，希望有读者告知。截取自文献Slater,O.,Miller,B.&Kontoyianni,M.DecodingProtein-proteinInt
Julse·2020-09-15 09:35

Exercism————Protein Translation

题目：最优解法：packagepractice;importjava.util.ArrayList;importjava.util.HashMap;importjava.util.List;classProteinTranslator{staticfinalStringSTOP="STOP";HashMapproteinMap=newHashMaptranslate(StringRNAChain)
陈小易·2020-09-13 02:11

A fast approach to global alignment of protein-protein interaction networks

摘要背景：全球网络比对已被认为是计算功能正畸的有效工具。常用的全局比对技术(如IsoRank)依赖于两步过程：第一步是基于迭代扩散的方法，用于将相似性分数分配给所有可能的节点对(匹配)；第二步将最大权重二部匹配算法应用于该相似性分数矩阵，以识别同源节点对。虽然在识别基于序列的正交法方面取得了明显的成功，但这个两步过程的计算代价很高。最近在计算节点对相似矩阵方面的工作表明，第一步的计算成本可以显著降
Toxic_皮·2020-09-12 11:08

Kaggle Human Protein Atlas 比赛总结—如何闯入Top1%拿到金牌

-竞赛交流群和求职招聘群里，正在寻找实习机会，欢迎进群与大佬交流～前言github链接：我们团队的solutionhttps://github.com/Gary-Deeplearning/Human_Protein
我爱计算机视觉·2020-08-26 13:33

GROMACS使用小计

参考网站：（1）国内网址，github网址目录MDP文件书写GROMACS简单处理命令MDP文件书写title=Protein-ligandcomplexMDsimulation;Runparameters
DS_HY·2020-08-17 06:57

DataFram行列显示不全解决办法

DataFram行列显示不全，比如：structureIdchainId...residueCountmacromoleculeType4101MA...154Protein7102LA...165Protein8102MA
Jennie_J·2020-08-17 03:13

R: clusterProfiler/enrichplot 富集分析与可视化神器

/bioc/html/clusterProfiler.htmlID转换功能函数：bitr;bitr_kegg功能：实现GeneSymbol,GeneID,Ensembl,UniprotID,ncbi-protein
下凡的生信人·2020-08-11 00:49

【论文整理】GNN论文持续追踪

GNN)progressManyimportantreal-worldapplicationsandquestionscomeintheformofgraphs,suchassocialnetwork,protein-proteininteractionnetwork
DrogoZhang·2020-08-02 12:20

Protein&Cell综述|解析宿主基因组和微生物的复杂互作(王军组作品，万字全文翻译)...

2018年5月，Protein&Cell杂志特别为中国肠道大会推出了主题为“MicrobiotaandHumanHealth”的专刊，邀请于君、傅静远、马永慧、王军、张发明、赵方庆、陈峰、王则能、聂勇战等
刘永鑫Adam·2020-07-30 05:46

JBrowse使用说明：参考基因组准备

通常，我们需要准备一个物种的基因组fasta文件，当然RNA和protein都是没有问题。
徐洲更hoptop·2020-07-29 14:17

Kaggle-人类蛋白质图谱图像分类(Human Protein Atlas)

转载于Garyhttps://zhuanlan.zhihu.com/p/54743461比赛介绍任务介绍本次比赛的问题是场景识别定位的是蛋白质所处位置的识别,例如在细胞液，细胞核里之类的依输出分所属多标签分类（Multi-lableClassification）难点及数据介绍首先一张示例图如下:一个样本由四个"通道图"组成(分成四张存储，每个"通道图"单通道)，2048*2048大小，官方提供了插
Star_ACE·2020-07-28 07:27

perl应用：DNA序列翻译（下）：从fasta格式中读取序列，然后输出蛋白质序列，以及fasta格式的介绍

usestrict;usewarnings;my$dna='';my$protein='';my@file_data=();my@filedata;@filedata=get_file_data();$
gaorongchao1990626·2020-07-14 10:15

使用MAKER进行注释: 如何避免多轮MAKER时的重复运算

如果参考组序列没有变化，那么有一些计算只需要做一次就行了，例如将EST,Repeat和Protein序列比对到参考基因组，得到它们对应的位置。
xuzhougeng·2020-07-07 23:51

WEEK 6 Live-cell Imaging for Single Cell Protein Dynamics

Lecture1-FluorescenceMicroscopy荧光显微法显微镜的结构和原理Lecture2-TypesofImaging不同种类的显微镜Lecture3-VisualizingMoleculesinLivingCells:FluorescentToolsSmallMoleculeDyesHoechst给DNA和核染色Mitotracker给线粒体染色Biosensors例如将荧光蛋
英天·2020-07-01 16:34

蛋白质（胃病的自我修复)

蛋白质(protein)是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。因此，它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。一般将蛋白质重要生理功能归纳为：1组成人体的重要成分之一。
李娥育儿说·2020-06-27 04:57

蛋白质的重要性:没有蛋白质就没有生命!

一、蛋白质蛋白质(protein)是生命存在的形式，没有蛋白质就没有生命。正常人体内含蛋白质16%-19%、大约占人体总重量的1/5、人体干物质重量的一半。
谈骨论髓·2020-06-25 06:51

m6A甲基化及预测方法工具总结

RNA根据编码性可分为编码RNA（protein-codingRNA）和非编码RNA（noncodingRNA）两大类，这些RNA转录后会发生各种修饰，包括N6-腺苷酸甲基化（N6-methyladenosi
dikuangzhong6068·2020-06-23 04:34

WEEK 5 Flow and Mass Cytometry for Single Cell Protein Levels and Cell Fate

Lecture1-FlowCytometry1流式细胞仪原理Lecture2-FlowCytometry2Lecture3-MassCytometry大量细胞计数法不用荧光、用TOF分析。比流式细胞仪计数更多CyTOF:CytometerwithaTimeofFlightMassSpectrometerLecture4-CytometryDataAnalysis在线免费分析工具：http://dv
英天·2020-06-22 05:01

脑血栓患者恢复期的饮食调养

1.2膳食结构中要增加蛋白质蛋白质(protein)是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。脑血栓病人的机体，需要大量的蛋白质与其他有机物质结合，完成身体所必须的能量活动。可以说，生命运动的每一个细胞
miss敏敏·2020-06-21 07:40

你想听什么曲子？新冠病毒、上帝粒子，还是宇宙？

想听原版的可以戳：https://soundcloud.com/user-275864738/viral-counterpoint-of-the-coronavirus-spike-protein-2019
果壳网·2020-06-02 00:00

基因组注释之从头预测

/uniprot-taxonomy_fungi+reviewed_yes.fasta-titleuniprot_protein-dbtypeprot-outuniprot_protein2.从头预测全基因组中的基因下载安装
javaLi·2020-04-09 17:34

in Biotechnology-Strong cation exchange (SCX) based analytical methods for the targeted analysis of protein

Here,wedescribehowinparticularSCXchromatographycanbeusedforthetargetedanalysisofimportantpost-translationalmodifications,suchasphosphorylationandN-terminalacetylation.Comparedtoothermethods,SCXislessl
英天·2020-04-07 03:28

#分子模拟#PLIP:蛋白配体联系分析工具

PILP（Protein-LigandInteractionProfiler）是一个在线的蛋白配体非共价联系的分析工具，其简单易用，同时提供Github版本利于学习其设计模式。
生信杂谈·2020-04-07 03:16

一只猫的营养需求

导读目录·蛋白质·脂肪·碳水化合物·牛磺酸·精氨酸·维生素A/B·总结←懒癌同学看这里·Protein蛋白质猫科食肉动物依靠动物组织中的营养来维持生存，满足身体各种需求；一只野猫的营养分析表明，它大概含有
子懿大人·2020-04-05 05:16

【王兴国营养特训班】第5期第3课7组刘倩

蛋白质的英文是protein”来自希腊文“proteios”(头
小倩的美好生活·2020-03-30 14:07

蛋白质（胃病的自我修复）

蛋白质(protein)是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。因此，它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。一般将蛋白质重要生理功能归纳为：1组成人体的重要成分之一。
黄晓莲营养育儿·2020-03-30 03:29
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