Protein

减肥为什么这么难（六）入口的三大主要营养物简介

一，主要营养物是指身体大量需要的营养物，有三种主要营养物：碳水化合物（carbonhydrate），蛋白质（protein）和脂肪（fat）。每种主要营养物提供给身体主要的膳食摄取热量。

精气神806·2024-09-03 08:39

Day 16 Protein mania: the rich world’s new diet obsession

卫报文章蛋白质狂潮：富人世界新近的饮食执念Protein蛋白质Mania.n.狂热/'meɪnɪə/obsession/əb'seʃ(ə)n/n.困扰Areyougettingenoughprotein

达斯维达利亚·2024-02-02 01:26

PPI 分析

蛋白质-蛋白质相互作用（protein-proteininteraction,PPI）是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体（proteincomplex）的过程。

斗战胜佛oh·2024-01-31 08:54

fa文件中基因序列多行转成单行

print"\n":chomp'protein.fa|tail-n+2>protein_new.fa

pomela·2024-01-29 21:35

Learning the protein language: Evolution, structure, and function(翻译)（上篇）

翻译文章：Learningtheproteinlanguage:Evolution,structure,andfunction*注：加粗地方为个人研究所需，翻译提供阅读指导帮助，具体细节请查看原文BeplerT,BergerB.Learningtheproteinlanguage:Evolution,structure,andfunction[J].Cellsystems,2021,12(6):6

sunlight_yy·2024-01-26 00:25

蛋白质基础分析

NCBI数据库常用四个子库:PubMed、BLAST、Nucleotide、Protein.对于一个蛋白质的基础分析:1.获得蛋白质序列：NCBI2.预测信号肽:SignalP4.1Server3.等电点和分子量

BioLearner·2024-01-18 04:53

身心灵成长【日精进】第10天

P即protein(蛋白质）F即fat（脂肪）C即carbohydrate(碳水化合物）PFC均衡饮食每餐用量：一拳（碳水化合物）一掌（蛋白质）一指（脂肪）以上是女性的量，男性加倍。

亲爱的玉格格·2024-01-16 12:53

RNA binding protein PCBP1 is an intracellular immune checkpoint for shaping T cell responses i...

本文选自sciadv，喜欢的朋友可以自行下载摘要：不同的T细胞谱系可以对各种环境信号作出反应，以驱动或限制免疫介导的病理。在这里，我们发现RNA结合蛋白，聚(C)结合蛋白1(PCBP1)是一个细胞内免疫检查点，通过限制Teff细胞固有的Treg承诺程序的表达，在激活的T细胞中上调，以防止效应T(Teff)细胞转变为调节性T(Treg)细胞。这对于稳定Teff细胞功能和颠覆免疫抑制信号至关重要。T细

一个没有感情的文献阅读机·2024-01-14 11:11

ENZO LIFE SCIENCE：MEGACD40L®蛋白

产品信息产品名称：MEGACD40L®Protein(soluble)(hu

Neobioscience·2024-01-08 15:06

癌症基因组重测序第一讲

一、基本组学结构A,T,C,G所构成的人类基因组信息可经过修饰，由一套DNA遗传基因组延伸至带有甲基化、乙酰化等修饰的表观遗传组，同时基因组也可以按照中心法则衍生出RNA和protein，即分别为转录组和蛋白组

不想透明的小透明·2023-12-31 08:25

额外的MSA序列的最近邻序列采样MSA序列

分别计算每个额外的MSA序列（protein['extra_msa']）和采样MSA（protein['msa']）序列的相似性（msa中相同的氨基酸越多，序列越相似），从而找到和每条额外MSA序列最相似的抽样序列

qq_27390023·2023-12-24 09:03

创建并连接mas特征

通过make_msa_feat函数创建protein['msa_feat']以及protein['target_feat']特征。

qq_27390023·2023-12-24 09:03

构建掩码多序列比对（masked msa）特征

设计替换概率张量categorical_probs，含有为mask位点以及随机/正确的氨基酸（+gap+X)，从protein['msa']中随机选择替换的位点，生成protein['bert_mask

qq_27390023·2023-12-24 09:32

构建每个聚类的profile和deletion_mean特征

通过summarize_clusters函数构建每个聚类的protein['cluster_profile']和protein['cluster_deletion_mean']特征。

qq_27390023·2023-12-24 09:02

知识分享 | 转录组个性化分析(4)——蛋白互作分析

蛋白质-蛋白质相互作用（protein-proteininteraction,PPI）是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体（proteincomplex）的过程。

百易汇能生物·2023-12-23 07:57

磷酸化、泛素化

蛋白的磷酸化就是将磷酸基团加在加在蛋白质（protein）上的过程。给蛋白加上磷酸基团的酶，叫做激酶；去掉蛋白上的磷酸基团的酶，叫做磷酸酶。

谢京合·2023-12-04 11:09

ADNI-subject-Info

生物标记物β-淀粉样蛋白β-淀粉样蛋白（amyloidβ-protein，Aβ）分子量约4kDa，由β淀粉样前体蛋白(β-amyloidprecursorprotein,APP)水解而来，由细胞分泌，在细胞基质沉淀聚积后具有很强的神经毒性作用

爱学习的卡比兽·2023-12-01 17:02

CDS和ncRNA的分物种数据库

EnsemblFTP网站(ftp://ftp.ensembl.org/pub/current_fasta)收集了大多数物种的DNA,protein,CDS,ncRNA信息1.DNA不用说，就是基因组信息

bioinfo2011·2023-11-26 02:09

Protein Structure Representation Learning by Geometric Pretraining-通过几何预训练进行蛋白质结构表示学习

ProteinStructureRepresentationLearningbyGeometricPretraining-通过几何预训练进行蛋白质结构表示学习Abstract学习有效的蛋白质表示对于生物学的各种任务（例如预测蛋白质功能或结构）至关重要。现有方法通常在大量未标记的氨基酸序列上预训练蛋白质语言模型，然后在下游任务中使用一些标记数据对模型进行微调。尽管基于序列的方法很有效，尚未探索对少量

NoteLoopy·2023-11-19 23:30

数据分析实战 | K-means算法——蛋白质消费特征分析

目录一、数据及分析对象二、目的及分析任务三、方法及工具四、数据读入五、数据理解六、数据准备七、模型训练编辑八、模型评价九、模型调参与预测一、数据及分析对象txt文件——“protein.txt”，主要记录了

天下弈星~·2023-11-11 23:17

细胞穿膜肽5-FAM-HIV-1 tat Protein (47-57) ，1676104-81-6

编号:174448中文名称:细胞穿膜肽5-FAM-HIV-1tatProtein(47-57)英文名:5-FAM-HIV-1tatProtein(47-57)CAS号:1676104-81-6单字母:5FAM-YGRKKRRQRRR-OH三字母:5FAM-Tyr-Gly-Arg-Lys-Lys-Arg-Arg-Gln-Arg-Arg-Arg-COOH氨基酸个数:11分子式:C85H130O20N3

salepeptide·2023-11-09 23:06

Paper Reading : Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments us

0.简介摘要中说道目前大多数都是使用渐进式路线启发式算法计算，但是对于成千上万个序列数据集时，这些方法可能已经到达瓶颈。难以保证在很大数量级数据上保证质量。本文介绍的clustalomega的新程序，它可以快速地对齐几乎任何数量的蛋白质序列，并提供精确的对齐。测试效果：在较小的测试用例中，包的精度与高质量的对齐器的精度相似。在更大的数据集上，clustal-omega在执行时间和质量方面优于其他包

进一寸有一寸的欢喜077·2023-11-04 12:51

mega11进化树分析

如果你要做进化树分析，切记，右下角选择ANALYZE2.2选择Edit菜单下的InsertSequenceFromFile**2.3Creatanewalignment2.4根据实际情况选择DNA或者protein

R语言爱好者·2023-11-03 04:53

霏主食之10分钟--教会你做5种爆款高蛋白的健康西式早餐

PROTEIN蛋白质蛋白质是维持生命的要素，没有蛋白质就没有我们的生命。在细胞生命旅途中，蛋白质参与了所有活动，它是人体最基础的建筑材料，人体内各个器官都由蛋

羊村霏儿·2023-10-27 06:17

论文解析-moETM

cell-topicmixture可解释性组学翻译性能评估RNA转录本、表面蛋白、染色质可及域调控关系研究1.验证同一主题下，topgene可以映射到topprotein过程结果2.跨主题验证gene-protein

平平无奇科研小天才·2023-10-18 01:52

绿原酸酯与CALB Docking(3) - Covalent Docking

cmd命令与操作问题1.protein

ZOOEEER·2023-10-17 10:34

R下载合并ENCORI RBP（RNA binding protein）靶基因数据

前面给大家简单介绍了☞starbase（ENCORI）数据库介绍（一）☞RNA相互作用神器——ENCORI也给大家介绍了如何从ENCORI批量下载miRNA的靶基因，并且合并成表格。ENCORI数据库不提供整理好的结果一次性下载。☞R下载合并ENCORImiRNA靶基因数据得到所有miRNA和所有靶基因之间的所有调控关系之后，我们就可以在本地批量预测miRNA的靶基因了☞R批量预测miRNA和靶基

生信交流平台·2023-10-17 07:10

Soy a proto-protein with a problem大豆和他的问题

又到了盛夏，在这个流火的季节，饮着啤酒，看着欧洲杯，再搭配一盘冰镇煮毛豆，快活似神仙。毛豆就是稚嫩时的黄豆，也叫大豆，是美味而又一种富含蛋白质来源的食品，中外都很喜欢他，今天看到Reader'sDigest（英文读者文摘）里有一篇文章，介绍了大豆和他的一个问题，拿了分享给大家。本文的作者是KateLowenstein和DanielGritzer前者是一位健康记者和Vice的主编，后者是Seriou

弥散的星尘·2023-10-16 18:22

生物信息学基础知识Day1

一、生物大分子生物信息学研究主要围绕脱氧核糖（Deoxyribonucleicacid，DNA）、核糖核酸（Ribonucleicacid，RNA）和蛋白质（Protein）三类生物大分子展开。1.

抱紧我自己·2023-10-16 10:09

RNA 14. SCI 文章中差异表达基因之蛋白互作网络 (PPI)

前言蛋白质互作网络（PPI,Protein-ProteinInteractionNetworks）是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成，来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节

90066456ace6·2023-10-04 16:13

GROMACS Tutorial 5: Protein-Ligand Complex 中文实战教程

GROMACSTutorial5:Protein-LigandComplex中文实战教程前言系统环境特别强调一、预处理阶段1.1蛋白质配体分离以及除水操作1.2选择力场识别JZ4配体1.2.1使用在线力场解析

菠菠萝宝·2023-10-03 23:44

2020-06-19

问题：之前一直处理fasta文件，最近用了一个现成的数据集（data来自PDB），发现：一个pdb文件中的序列既有protein序列、又有DNA序列；并且序列中每个残基不是由一个字母表示，而是一个氨基酸残基由三个字母表示

Seafairy·2023-09-28 06:18

非因解读| Reverse Phase Protein Array（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用

ReversePhaseProteinArray（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用外泌体（Exosome）是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡，也是细胞外囊泡（EV）的一种主要类型，直径大约40-160nm，具有脂质双层膜结构，能很好的保护其包被的物质，内含大量的核酸，包括DNA、RNA以及蛋白质和其它小分子代谢产物。在最近的癌症研究中，外泌体已被发现与肿瘤免疫中的抗原呈递、肿瘤细胞的生长

FynnBio·2023-09-25 06:06

简单了解蛋白质互作网络(PPI)

蛋白质互作网络（PPI）蛋白质互作网络（Protein-ProteinInteractionNetworks，PPI）是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成，来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节

果蝇饲养员的生信笔记·2023-09-19 16:08

MULTI-LEVEL PROTEIN STRUCTURE PRE-TRAINING WITH PROMPT LEARNING

通过提示学习进行多级蛋白质结构预训练期刊：ICLR2023作者：浙江大学团队背景蛋白质可以关注不同的结构水平来实现其功能。蛋白质结构有四个不同的层次，第一级是由氨基酸组成的蛋白质序列，第二级是指局部折叠结构，第三季描述自然折叠的三维结构，第四级是由多个氨基酸组成的蛋白质聚体。大多数现有的功能预测方法都采用一级或三级结构作为输入，无意中忽略了蛋白质结构的其他级别。相关工作ProteinReprese

唐小星小宇宙·2023-09-18 10:21

HPA数据库概要（Human Protein Atlas）

HPA数据库（HumanProteinAtlas）是基于蛋白组学,转录组学以及系统生物学数据，可以绘制组织、细胞、器官等图谱。不仅收录了肿瘤组织，也涵盖了正常组织的蛋白表达情况，而且还可以查阅肿瘤患者的生存曲线。接下来，我们进一步了解该数据库的细节。网址：https://www.proteinatlas.org整个界面还是比较清爽的，SEARCH栏中我们可以搜索想要查的基因或蛋白信息。在Field

翾格格·2023-09-17 02:52

GROMACS Tutorial 2 for Membrane Protein & Build Membrane Bilayer with CHARMM-GUI

KALP15inDPPCIntroduction1.Tutorial'sMethodpdb2gmxTopologyBuildingtheUnitCell1.Orienttheproteinandmembrane2.Packthelipidsaroundtheprotein3.SolvatewithwaterAddingIons2.BuildingwithCHARMM-GUIStep1ReadPro

CocoCream·2023-09-13 20:59

2022-07-29

新推出的全流程蛋白质结构预测工具MEGA-Protein（MindSporeforEvolutionaryGeneration&AssessmentProtein），其中业界首创AIMSA引擎使得蛋白质结构预测突破

appleppear·2023-09-09 16:15

Briefings in Bioinformatics2021 | Bert-Protein+：基于Bert的抗菌肽识别

论文标题：AnovelantibacterialpeptiderecognitionalgorithmbasedonBERT论文地址：novelantibacterialpeptiderecognitionalgorithmbasedonBERT|BriefingsinBioinformatics|OxfordAcademic代码：https://github.com/BioSequenceAna

羊飘·2023-09-06 17:14

2019-01-18

protein/ˈproʊtiːn/n.蛋白质universal/ˌjuːnɪˈvɜːrsl/adj.普遍的；全体的e.g.auniversalvalueelixir/ɪˈlɪksər/n.灵丹妙药intensity

95小神经·2023-09-06 10:51

蛋白序列、功能快速查询及预测

蛋白质（protein）是生命的物质基础，是构成细胞的基本有机物。其结构多样，功能复杂，尤其是翻译后水平的多样化修饰更为其增添了神秘色彩，同时也增加了深入研究的难度。

Kevin_Hhui·2023-09-05 17:11

PHP实现每日蛋白质摄入量计算器

1.laravel路由//每日蛋白质摄入计算器Route::get('api/protein/intake','FormulaController@proteinIntakeCal');2.代码/***

历史老师-·2023-08-25 00:13

pymol安装使用；vscode蛋白质可视化插件 protein viewer；rcsb pdb，fasta蛋白wget下载

pdb文件字段说明学习：1、pymol安装使用参考：https://blog.csdn.net/eternalapple/article/details/110263296官网：https://pymol.org/安装：1、可以直接conda安装，一条命令condainstall-cschrodingerpymol-bundle安装成功后输入pymol即可调出窗口2、也可以直接下载安装包安装***

loong_XL·2023-08-16 04:23

溶剂可及性（二）protein-data-bank

原文链接：溶剂可及性（二）protein-data-bank一、ProteinDataBank蛋白质数据库（ProteinDataBank，简称PDB）是一个专门收录蛋白质及核酸的三维构资料的数据库。

麻衣带我去上学·2023-08-16 04:22

dplyr:Column must have a unique name-fix???

dataAssyout2%>%setNames(make.names(names(.),unique=TRUE))mRNA_exprSet%dplyr::filter(type=="gene",gene_biotype=="protein_coding

一路向前_莫问前程_前程似锦·2023-08-06 15:41

山东农业大学生命科学学院朱常香教授课题组在线发表《A nonspecific lipid transfer protein, StLTP10, mediates resistance to Ph...

作者简介：朱常香，博士，教授，博士生导师。现任生命科学学院副院长，学院教授委员会委员，入选学校“1512”工程第二层次。为中国植物病理学会、生物化学与分子生物学学会会员。主要研究方向：1.植物与病毒互作分子生物学：探讨植物与病毒间的防御与反防御机制，分析病毒-昆虫-寄主植物间的多重互作关系，为植物病害防控提供有效策略。2.植物抗逆基因工程：探讨植物抗病虫、抗盐抗旱的分子机理，分离克隆抗逆相关基因，

上官万尘·2023-07-31 20:41

南京农大熊爱生团队发表的研究论文《A novel plant protein-disulfide isomerase participates in resistance response ag...

Anovelplantprotein-disulfideisomeraseparticipatesinresistanceresponseagainsttheTYLCVintomatoPlanta(IF3.390)PubDate:2020-07-17,DOI:10.1007/s00425-020-03430-1TongLi,Ya-HuiWang,YingHuang,Jie-XiaLiu,Guo-M

上官万尘·2023-07-14 03:49

sqlserver------数据库的存储过程（练习）

对于数据库的存储过程之前的专题有讲过这里具体讲述存储过程的编写方法：例题：有heat表和eatables两张表，分别为：eatablesheat：protein（蛋白质），fat（脂肪），sugar（含糖量

dulu~dulu·2023-06-17 00:49

sqlserver数据库学习感悟（1）----关于group by

例题：有heat表和eatables两张表，分别为：eatablesheat：protein（蛋白质），fat（脂肪），sugar（含糖量），kj（热量）平均热量最高的食物是哪一类：当我们这样写时：selecttype

dulu~dulu·2023-06-16 18:41

study

PPI：protein-proteininteraction1.DIP(databaseofinteractingproteins)http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Main.cgi

山小溪·2023-06-13 20:09

推荐频道