共线性

MCScanX ‖ 安装、报错解决方法及简单使用

1.简介：（1）介绍：MCScanX采用改进了的MCScan算法，分析基因组内或者基因组间的共线性区块。
溪溪溪溪溪川·2021-06-11 23:05

从零开始学Circos绘制圈图（一）

一般基因组文章都会有下面这种酷炫图，用来描述基因组的基因密度分布，转座子的密度分布，和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系，以及其他各种你只要测序就能加上的信息，比如说你要是测了ATAC-seq
xuzhougeng·2021-06-11 00:13

关于多重共线性与SPSS岭回归解决方案-终极版（Ultimate）

在网上经常看到有人问关于使用SPSS岭回归方法处理多重共线性的问题，以前不断地有人问，我想将来肯定还会有人问这方面的问题。
GaussAnalytica·2021-06-08 11:33

岭回归

岭回归岭回归和lasso解决回归中重大疑难问题：排除多重共线性，进行变量的选择最小二乘估计在给定经典线性回归的假设下，最小二乘估计量是具有最小方差的线性无偏估计量（Gauss-Markov定理）线性回归模型可以写成
判笔·2021-06-06 15:15

多重共线性(multicollinearity)问题

建立多元线性回归的前提之一是:不存在多重共线性(Multicollinearity)。检验变量之间是否存在共线性问题可以使用方差膨胀因子(Varianceinflationfactor,VIF)。
北欧森林·2021-05-29 05:33

偏最小二乘回归及其SAS实现

偏最小二乘回归可用于解决多重共线性问题，其用途比主成分回归更为广泛。最初由经济计量学家HermanWold于20世纪70年代提出比较系统的算法体系，被许多统计学家称为“第二代多元统计分析方法”。
StatsHuo·2021-05-20 04:17

抽空学学R语言

其中，VIF测试共线性，＞10的有问题。
Edward76Lee·2021-05-10 09:32

基因组共线性分析-基于MCscanX

一.简介MCScanX是由福建农林大学唐海宝老师参与开发的基因组共线性分析软件，发表至今引用数200以上，相关概念和算法参考文献如下：TangH,BowersJE,WangX,etal.SyntenyandCollinearityinPlantGenomes
小飞虎·2021-05-07 00:20

回归分析

产生拟合方程，从而（对未知数据）迚行预测用途：预测，判别合理性例子：利用身高预测体重；利用广告费用预测商品销售额，等等.线性回归分析：一元线性；多元线性；广义线性非线性回归分析困难：选定变量（多元），避免多重共线性
Always_6778·2021-05-06 22:40

多重共线性检验之方差膨胀因子VIF

过程1、构造每一个自变量与其余自变量的线性回归模型，例如，数据集中含有p个自变量，则第一个自变量与其余自变量的线性组合可以表示为2、根据如上线性回归模型得到相应的判决系数R2R^2R2，进而计算第一个自变量的方差膨胀因子VIF：importpandasaspdimportnumpyasnpfromsklearnimportmodel_selectionimportstatsmodels.apias
小瓶盖的猪猪侠·2021-05-03 22:56

多重共线性问题相关

多元回归分析中的共线性问题原创2015-11-13ccccfysspss统计分析多重共线性：回归模型中，两个或者两个以上的自变量彼此相关时，称回归模型中存在多重共线性。
fun游乐场·2021-04-29 02:17

sas 变量降维、变量聚类、变量去除共线性

银行卡流水啊，信用卡流水等等，那么这些数据做衍生变量有个经常会碰到的问题，就是像这种“最近一天的通话次数”有可能跟“最近三天的通话次数”这种相关性很强，但是在拟合的之后，这种相关性强的只能进一个，不然共线性就来找你啦
_瑾_瑜_·2021-04-24 16:25

MCScanX ‖ 安装、报错解决方法及简单使用

1.简介：（1）介绍：MCScanX采用改进了的MCScan算法，分析基因组内或者基因组间的共线性区块。
溪溪溪溪溪川·2021-04-23 00:20

R语言 检验多重共线性的操作

函数kappa()df1000κ>1000，存在严重的多重共线性。
·2021-04-17 15:11

什么是多重共线性问题？如何判别多重共线性问题？怎么避免多重共线性对模型和学习的干扰？

Multicolliearity多重共线性而所谓的多重共线性，是指predictorvariable之间的关系，当预测变量间有很高的相关度时，会造成信息冗余，影响回归模型的结果。
Data+Science+Insight·2021-04-16 22:42

python logistic回归

岭回归--要求自变量之间具有多重共线性，是一种改进最小二乘法的方法。主
柳叶刀与小鼠标·2021-03-10 15:11

线性回归的多重共线性问题及其解决

Content线性回归的多重共线性1.前提2.由损失函数推导ω(基于最小二乘法OLS)3.上述计算结果不成立3.1多重共线性的机器学习解释3.2多重共线性的解决4.Ridge&Lasso4.1Ridge4.2Lasso
SIHENG HUANG·2021-03-02 11:27

使用WGD鉴定全基因组复制

转载自链接：https://www.jianshu.com/p/3cfeb49c821a古老WGD检测有两种方法，一种是共线性分析，另一种则是根据Ks分布图。
wo_monic·2021-02-23 13:15

多重共线性检验-方差膨胀系数（VIF）-相关系数（机器学习）sklearn

文章目录多重共线性检验-方差膨胀系数（VIF）1、原理：2、多重共线性：3、检验方法：方差膨胀系数（VIF）：相关性检验：4、代码测试4.1导入相关库4.2准备数据4.3计算膨胀因子4.4计算相关系数4.5
魏宝航·2021-02-11 07:42

如何用WGDI进行共线性分析(上)

如果一个物种在演化过程中发生过多倍化，那么在基因组上就会存在一些共线性区域（即两个区域之间的基因是旁系同源基因，其基因的排布顺序基本一致）。
xuzhougeng·2021-02-01 14:37

多元线性模型分类变量方差_第三十一讲 R多元线性回归中的多重共线性和方差膨胀因子...

今天学习的主要内容是多元线性回归中的多重共线性和方差膨胀因子。1.共线性的概念1共线性在多元回归中，两个或多个预测变量可能彼此相关，这种情况称为共线性(multicollinearity)。
Jason.Gump·2021-01-31 23:00

灰色关联分析

回归分析（标准化回归）、方差分析（使用较少）、主成分分析（用于降维），但总有不足：1.需要有大量数据；数据个数大于条件个数2.样本需要服从典型概率分布3.可能出现量化结果与定性分析结果不服的现象（多重共线性
yokumeii·2021-01-30 17:05

[比较基因组] 共线性分析（jcvi）

jcvi软件的使用官网软件下载apt-getinstall-ytexlivetexlive-latex-extratexlive-latex-recommendeddvipngpipinstallgit+git://github.com/tanghaibao/jcvi.git3测试数据下载（下载前去Phytozome官网注册账号）python-mjcvi.apps.fetchVvinifera,P
17号小行星·2021-01-09 12:49

【机器学习笔记】：大话线性回归（三）多重共线性和强影响点分析

接着前两篇继续介绍本篇，前两篇链接如下：【机器学习笔记】：大话线性回归（一）【机器学习笔记】：大话线性回归（二）本篇介绍线性回归诊断的余下部分：多重共线性分析强影响点分析一、多重共线性检验1.多重共线性产生的问题当回归模型中两个或两个以上的自变量彼此相关时
Python数据科学·2021-01-07 11:43

python 多重线性回归_线性回归中的多重共线性与岭回归

模型评估指标等内容，其中在推导多元线性回归使用最小二乘法的求解原理时，对损失函数求导得到参数向量的方程式上式中有解，即能够得到最后一步的前提条件是存在逆矩阵，而逆矩阵存在的充分必要条件是特征矩阵不存在多重共线性
邵云卿·2021-01-06 03:35

python检验多重共线性_python从机器学习角度处理共线性

然而，在面对一堆数据集存在多重共线性时，OLS就变得对样本点的误差极为敏感，最终回归后的权重参数方差变大。
笨呆薪火·2020-12-29 05:19

手把手教你使用R语言做LASSO 回归

LASSO回归也叫套索回归，是通过生成一个惩罚函数是回归模型中的变量系数进行压缩，达到防止过度拟合，解决严重共线性的问题，LASSO回归最先由英国人RobertTibshirani提出，目前在预测模型中应用非常广泛
天桥下的卖艺者·2020-12-25 17:28

因变量 方差膨胀系数_SPSS技术：多重线性回归模型；极端值与多重共线性

原标题：SPSS技术：多重线性回归模型；极端值与多重共线性欢迎关注天善智能微信公众号，我们是专注于商业智能BI，大数据，数据分析领域的垂直社区。
雨沐森林·2020-12-23 04:00

聊聊“基因组共线性”

最近看了几篇关于共线性分析的微信/推送，发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。
Mr_我爱读文献·2020-12-18 10:37

基因家族分析5 || 共线性分析及可视化

共线性分析（Syntenyanalysis）及可视化基因家族流程：基因家族分析（一）基因家族流程：基因家族分析（二）基因家族流程：基因家族分析（三）基因家族流程：基因家族分析（四）===========
溪溪溪溪溪川·2020-12-03 17:54

机器学习小白入门1——线性回归

文章目录机器学习入门1——线性回归基本假设Part1.基本原理1.1基本形式推导1.2评价指标1.3显著性检验1.4多重共线性Part2.代码实现2.1算法实现2.2sklear
dancingmind·2020-11-29 22:35

【计量经济学导论】05. 异方差

文章目录异方差异方差的含义异方差的产生原因异方差的后果异方差的检验方法异方差的修正措施异方差在上一节的讨论中，完全共线性问题违背了基本假定MLR.3，而多重共线性没有违背任何一个基本假定，因此OLS估计量仍然具有
lixddddd·2020-10-31 15:41

基因家族分析理论

基因家族分析以及基因层次分析一.物种层次一般在物种层次，我们重点关注的是物种间的演化关系，以及物种间的分化时间，并且构建系统发生树二.基因组层次在全基因组范围内，我们就可以构建两个物种染色体间，或者全基因组内的共线性关系比方说
小潤澤·2020-10-14 13:10

VIF 多重共线性膨胀因子

方差膨胀系数(varianceinflationfactor，VIF)是衡量多元线性回归模型中复(多重)共线性严重程度的一种度量。它表示回归系数估计量的方差与假设自变量间不线性相关时方差相比的比值。
Sunstar0708·2020-10-09 15:42

DALS016-Linear Models线性模型05共线性

title:DALS016-LinearModels线性模型05共线性date:2019-08-2012:0:00type:"tags"tags:矩阵计算线性模型categories:生物统计前言这一部分是
backup备份·2020-10-09 12:24

浅谈共线性的产生以及解决方法(上篇——前世)

标题：浅谈共线性的产生以及解决方法(上篇——前世)1.多元线性回归模型在线性相关条件下，两个或两个以上解释变量对一个被解释变量的数量变化关系，称之为多元线性回归分析，由多元线性回归分析得到的数学表达式称为多元线性回归模型
一风007·2020-10-07 19:59

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

多元线性回归是我们在数据分析中经常用到的一个方法，很多人在遇到多维数据时基本上无脑使用该方法，而在用多元线性回归之后所得到的结果又并不总是完美的，其问题实际上并不出在方法上，而是出在数据上。当数据涉及的维度过多时，我们就很难保证维度之间互不相关，而这些维度又都对结果产生一定影响，当一组维度或者变量之间有较强的相关性时，就认为是一种违背多元线性回归模型基本假设的情形。今天我们就讲解一下如何用VIF方
Python中文社区·2020-09-29 21:31

【数学建模】灰色关联分析

步骤步骤一：画统计图、进行一些简单的分析用回归分析的多重共线性问题？
Anadem·2020-09-17 21:09

多元共线性检测 -- 方差膨胀因子(Python 实现)

本文已在公众号“数据分析与商业实践”首发，关注一下~，更多商业数据分析案例等你来撩注：相关数据源和超详细的代码（python，JupyterNotebook版本+详细注释）已经整理好，在“数据分析与商业实践”公众号后台回复“vif”即可获取。探索性数据分析、数据清洗与预处理和多元线性回归模型构建完毕后，为提升模型精度及其稳健性，还需进行许多操作。方差膨胀因子便是非常经典的一步，原理简单，实现优雅，
萝 卜·2020-09-17 04:21

mummer基因组共线性分析详解

在生物信息中，基因组共线性分析dotplot图几乎全部是用MUMmer或者LAST做的。
awk_bioinfo·2020-09-16 15:57

回归分析

1、回归分析分类包括线性回归、非线性回归、逻辑回归（0和1）、岭回归、主成分分析，最后两个参与建模的自变量之间具有多重共线性，但是岭回归的X非常多2、一元线性回归建模比如：淘宝某商品的总销量和收藏数的一元线性回归第一步
weixin_43630413·2020-09-16 04:17

主成分分析PCA

降维的必要性1.多重共线性--预测变量之间相互关联。多重共线性会导致解空间的不稳定，从而可能导致结果的不连贯。2.高维空间本身具有稀疏性。
wwj55166·2020-09-16 04:49

R语言学习_数据降维

没用的变量）变量相关（相关的变量）解决办法剔除无用变量逐步回归向前引入法向后剔除法逐步筛选法Step函数AIC越小越好AIC=nln(SSE)+2p主成分分析快速降维技术降维过程中不影响解的精度消除多重共线性数学工具原变量线性组合得到新变量
MongoVIP·2020-09-15 09:08

SVM支持向量机系列理论（九） 核岭回归

当碰到数据有多重共线性时（自变良量存在高相关性），我们就会用到岭回归。
promisejia·2020-09-14 19:18

线性回归原理及实践

1.建立线性模型想要一个成功的回归分析，在建立线性模型之前，确认以下信息很重要：线性：特征值与和预测值是线性相关不含多重共线性：数据有极少或没有多重共线性，当特征不是相互独立时，会引发多重共线性。多
xufabing1993·2020-09-14 14:19

线性回归模型中的多重共线性--Multicollinearity

1.Predictorvariable预测变量，即为自变量（independentvariable）或者回归子（regressor）,即它的值不受其他变量的影响。2.Correlationcoefficients相关系数是指两个变量之间的关系，而皮尔森系数（pearson’scorrelation）就是在线性回归中常用的一种相关系数，通常就是指Pearson’sRvalue。皮尔森系数用来计算两个
yuanmengxinglong·2020-09-14 08:18

多元线性回归中多重共线性_多重共线性如何在线性回归中成为问题。

多元线性回归中多重共线性LinearRegressionisoneofthesimplestandmostwidelyusedalgorithmsforSupervisedmachinelearningproblemswheretheoutputisanumericalquantitativevariableandtheinputisabunchofindependentvariablesorsi
weixin_26752765·2020-09-14 07:12

多元线性回归模型中多重共线性问题处理方法

p=46多重共线性指自变量问存在线性相关关系，即一个自变量可以用其他一个或几个自变量的线性表达式进行表示。若存在多重共线性，计算自变量的偏回归系数β时，矩阵不可逆，导致β存在无穷多个解或无解。
公众号：数海星辰·2020-09-14 07:12

多元线性回归中多重共线性_多重共线性如何在线性回归中成为问题

多元线性回归中多重共线性LinearRegressionisoneofthesimplestandmostwidelyusedalgorithmsforSupervisedmachinelearningproblemswheretheoutputisanumericalquantitativevariableandtheinputisabunchofindependentvariablesorsi
weixin_26750481·2020-09-14 05:40

平面的投影变换(1)——什么是投影变换？

例如，一条直线成像后仍为直线（共线性），而原本平行的两条直线在成像后通常变为不平行了
许三少·2020-09-14 01:11
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