富集

2021-01-24

玖富悟空理财房山区金融办自成立了玖富风险化解专班以来，出借人数以万次通过电话、信函、现场咨询等方式向玖富所属房山区金融办及专班、房山区政府、北京市地方金融管理局反映玖富集团存在高利贷、私设资金池、挪用保障金
安逸_7da0·2023-12-18 08:03

你挨过“板砖”吗？用了大半辈子的红砖，其实你不了解

这并不是个例，经研究表明，富集砖厂的地方
西域绕天山·2023-12-18 02:55

2021-07-01 GO、kegg富集分析

What：什么是GO和KEGG？GO全称是GeneOntology，它分为：细胞组分（cellularcomponent,CC）、分子功能（molecularfunction,MF）、生物过程（biologicalprocess,BP），那这三者有什么关系呢？，大概就是母鸡A被养在鸡笼里，它能够下鸡蛋，但是前提是我往笼子里再放一只公鸡后才能下蛋，在这个比喻里，鸡笼就是CC，下蛋这个动作是BP，而放
学习生信的小兔子·2023-12-17 16:02

R语言学习之GO富集分析结果可视化（柱状图、网络图）

读取genesymbollibrary(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)input<-read.table("gene.csv",sep=",",header=T)把symbol转换为ENTREZIDgenetransform<-bitr(input$target,fromType="SYMBOL",toType=c("ENSEMBL","ENTREZID
佐博伊森·2023-12-17 07:19

2022-9-21晨间日记

纪念日：1、1909年9月21日--我国飞机设计师冯如第一次试飞成功；2、1926年9月21日--荷兰物理学家昂内斯首次发现物理超导性；3、1985年9月21日--胜利油田发现富集高产含油区；4、1989
王增祥·2023-12-16 04:12

纯生信发文的新技能，同一份GEO数据可以发两篇SCI

例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI，具体操作如下：第一篇纯生信SCI可以这样做：第一步，数据下载处理、合并、矫正、差异分析第二步，进行WGCNA分析第三步，进行取交集的基因第四步，进行GO、KEGG富集分析
SCI狂人团队·2023-12-16 03:18

基因富集分析 / KEGG / GO / MsigDB和GSEA

1为何做富集分析？在进行差异基因分析时会获得大量基因，但海量的基因不好系统分析、找到相似规律，则需要我们进行注释并基因不分析与哪些与疾病相关的通路相关，以便进一步挖掘有用信息。
期待未来·2023-12-06 13:49

GO注释（生信学习）

参考：GO分析学习笔记(qq.com)1.富集分析前景基因：要重点研究的基因集背景基因：所有的基因集例：前景基因为对照组与处理组的差异基因背景基因为对照组与处理组的所有基因2、GO的构成GOterms，
筱贺学生信·2023-12-03 18:59

BED文件与bedtools简介

、start开始3、end结束4、name名称5、score存一个数6、strand+or-2、bed格式的使用1、储存基因区2、储存基因组的某些位点信息3、储存CHIP-seq、ATAC-seq等的富集的
筱贺学生信·2023-12-03 18:28

神经影像和人类基因组关联分析的实践过程

选择代表性探针1.4步骤4:将组织样本分配到分块状的大脑区域1.5步骤5:规范表达测量1.6步骤6:选择在供体大脑中具有一致表达模式的基因2.第二阶段:相关表达和神经影像学测量3.阶段3:评估基因特异性和富集程度
sta@ma@brain·2023-12-03 17:26

转录组测序3-序列基因组比对

RNAseq涉及到原始数据，数据质控，基因组比对，差异基因鉴定，差异基因功能富集分析，重要基因如转录因子激酶的靶基因预测等，我们用10讲的时间，全面讲解转录组测序报告，及在上百个项目中遇到的近百个常见问题
纪伟讲测序·2023-12-03 11:32

熵增之源

但事实上白洞与黑洞的距离无限远，造成了白洞射出物质到黑洞吸收的过程中，受空间中微型黑洞和白洞影响，形成了局部区域的富集与真空。于是正反量子的空间分布不均匀导致了局部区域内的数量比不对称。
林秉清·2023-12-03 07:16

博大而神奇的土地！到此，你才知道造物主能有多偏心...

它驴友眼中的“湖北香格里拉”CNN眼中的“中国最美仙境”被列入《世界遗产名录》的世界文化遗产被《中国国家地理》选为“中国最美的地方”不仅如此它还是“世界硒都”全球硒资源最富集的地方它就是湖北恩施当你踏上这片土地你便会沉醉在那片绝美的峡谷风光中钟情于这里的一方山水或者迷于古老而神秘的土司文化抑或是被美食征服了味蕾
饭姐日报·2023-12-01 09:10

临界胶束浓度

这两种倾向平衡的结果使表面活性剂在水表富集，亲水基伸向水中，憎水基伸向空气，其结果是水表面好像被一层非极性的碳氢链所覆盖，从
Seurat_Satija·2023-11-29 05:14

r语言 相关性作图_R绘图：相关性分析与作图

公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程：生物信息学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能，单基因的批量相关性分析，可以用于做单基因的GO，KEGG富集分析和GSEA分析，也有多基因之间的相关性分析
知乎剧综·2023-11-29 03:32

2021-05-16 scRNA基础分析：差异基因富集分析

此前的分析我们按转录特征把细胞分成了很多类别，例如seurat聚类分析得到的按cluster分类，singleR分析得到的按细胞类型分类，monocle分析得到的按拟时状态（state）分类。不同的细胞类型之间，有哪些表达差异基因呢，这些差异基因有特别的意义吗？基因差异表达分析#基因差异表达分析library(Seurat)library(tidyverse)library(patchwork)l
学习生信的小兔子·2023-11-28 18:03

网易区块链打造可信数字身份认证应用新场景，赋能科技峰会

目前，“未来通行证”已经富集NFT门票、AI歌曲、区块链像素画、会议日程等丰富的会务服务内容，并将在会议期间提供覆盖衣食住行购的专属权益。
CECBC·2023-11-28 08:41

2021-07-24 神奇的单链DNA合成技术(4)——外切酶富集

PCR扩增是获得一段DNA的最有效也是最快速的方法，但是PCR的产物一般是双链DNA。如果只想要其中一条链，我们除了采用不对称PCR和生物素标记纯化的策略外，可能最容易想到的是能不能通过酶降解倒那条不需要的。答案是肯定的，使用Lambda和ExoIII核酸外切酶就可以实现。Lambda核酸外切酶作用于双链DNA，沿5´→3´方向逐步切去5´单核苷酸。最适底物是5´磷酸化的双链DNA，也能缓慢降解单
NAome·2023-11-27 14:50

2020-02-15

富集分析制作气泡图###自定义作气泡图x<-read.csv(file.choose(),stringsAsFactors=F)#筛选p<0.05x<-x[x$PValue<0.05,]x_go=x[,
爱看电影的橘猫·2023-11-27 08:27

鄢利老师 私人财富管理专家

鄢利老师私人财富管理专家场景化营销实战训练师CHFP理财规划师专业委员会特聘讲师RFP国际财务策划师协会特聘讲师鞍山邮政特聘“理财业务导师”吉林光大银行特聘“个金顾问”高晟财富集团特聘“家族法税顾问”曾获全国理财师大赛冠军带领团队两次获得全国十佳理财团队称号理财规划师专业委员会授予
陈送妹·2023-11-26 21:25

GeNets：发表在nature上的基因组分析网站平台工具

2018年6月NatureMethods上发表了一篇关于机器学习分析特定基因集内部关系工具的文章，简单来说就是，通常我们做了差异基因分析得到一个基因集合，然后会用GO/KEGG富集进行进一步分析，但是该工具给我们提供了另一种可能
斗战胜佛oh·2023-11-26 00:46

Perl 超几何分布计算

1.超几何分布公式超几何分布检验在生信中使用是比较多的，典型的就是GO和KEGGPathway的富集分析。
正踪大米饭儿·2023-11-25 18:23

基因工程实验Ⅱ大肠杆菌质粒DNA的抽提及检测『Protocol』

①染色体DNA的去除：在富集培养目标菌种后，首先应裂解细菌细胞，采用含有SDS的NaOH溶液裂解菌体释放质粒，同时氢氧化钠的强碱性，可使DNA氢键断裂，双螺旋结构破
生菜小科狗·2023-11-25 00:37

利用AI绘制精美的基因代谢通路图（基础知识）

年中总结接近尾声，我们学一学基础知识，利于我们文章的发表通过KEGG富集分析得到通路图非常模糊，无法直接用于文章发表。
单细胞空间交响乐·2023-11-24 23:10

转录调控 | 基因集富集分析（GSEA）介绍

很多人会好奇为什么当KEGG、GO等常规差异富集结果中没有富集到我关注的通路时，大家会推荐进行GSEA分析呢？GSEA分析到底是什么？为什么KEGG、GO都可以进行该分析?
诺禾致源·2023-11-24 23:01

中国饮食之殇

没有健康的基础，所谓转基因之战不过是笑话，再大的风险都不如重金属富集来的快来的猛烈。土地污染的源头：一，城市化进程中的污染企业污染了地下水但是治理工作无人知晓具体情况。
韦仕鸿Angela·2023-11-23 20:17

入坑数字货币的，敢不敢来晒晒你的收益？

而币圈也成为暴富集散地！这些年，通过币圈暴富的人不知凡几，而数字货币成为通往暴富的最佳捷径！无数百倍币千倍币成就了无数拥有暴富梦想的人！那句名言“梦想一定要有，万一实现了呢！”也成为币圈最佳座右铭。
飞扬跋扈的小白兔·2023-11-22 11:10

CMap数据库筛选化学药物

数据库clue.io文献链接：连接图谱：使用基因表达特征连接小分子、基因和疾病|科学(science.org)基本模式：利用CMap将差异基因列表与数据库参考数据集比对；根据差异表达基因在参考基因表达谱富集情况得到一个相关性分数
hx2024·2023-11-21 23:20

RabbitMq 的理论及应用示例（一）

语言进行开发作为底层语言实现：Erlang有着和原生Socket一样的延迟，所以性能非常高开源、性能优秀，稳定性保障提供可靠性消息投递模式（confirm）、返回模式（return）与SpringAMQP完美整合，API丰富集群模式比较丰富
江湖致富888·2023-11-21 16:54

使用R语言的clusterProfiler对葡萄做GO富集分析

葡萄的参考基因组下载自NCBI，下载链接是https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/003/745/GCF_000003745.3_12X/基本流程是Hiast2比对samtoolssam转bamstringtie组装转录本gffcompare将stringtie输出的gtf文件与参考基因组的注释文件做比较得到一-个merged.combin
小明的数据分析笔记本·2023-11-21 04:20

读塔木德有感

世界上三分之二的财富集中在犹太人手中。世界首富罗斯查尔德是犹太血统。犹太人也是世界上最聪明最成功的商人。塔木德内容介绍了犹太人做生意的很多经验。犹太人商人遍布世界各地。犹太人喜欢做有钱人的生意。
寒冰不语·2023-11-20 14:34

这个不用版面费的期刊牛呀，这么简单的纯生信也敢接收

今天看到一个不用版面费的期刊竟然出版了一篇非常简单的纯生信数据挖掘的文章，这篇文章就做了GEO数据的差异分析、GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析，连生存分析都没有做的。
SCI狂人团队·2023-11-20 00:40

如何利用clusterProfiler进行基因集的KEGG富集分析？

KEGG富集分析就是一种非常流行的对基因集进行分组的方法。安装BiocManager::install("clusterProfiler")BiocManager::install("org.Hs.
简说基因-专业生信合作伙伴·2023-11-19 15:52

Q&A | 如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析

Q&A|如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析QuestionMSigDB富集分析富集分析思考参考往期Question有朋友在后台提问：在使用clusterProfiler
木舟笔记·2023-11-19 15:21

富集分析原理和clusterProfiler包进行GO、KEGG富集分析详细说明

概念：基因富集分析是指对于给定一组基因根据基因组注释信息（GO、KEGG）对基因进行聚类分析，即给定的基因是不是GO中的一个功能（或KEGG中的一个通路）。
Tian問·2023-11-19 15:49

【R-clusterProfiler包安装经验】

前言这几天打算开始学习一下富集分析，发现这个R中的包：clusterProfiler，遂打算下载安装，开始学习。关于安装的经验也记录一下，以后可能用得上，也可以给需要的人提供下参考。
小柴犬冲冲冲·2023-11-19 15:47

R -- 关于clusterProfiler富集分析不能用了这事儿

对于读者的日常学习知识和习惯来说，gongzhonghao是更为高效的平台。scanningbelow,comeon!https://gitee.com/jaychouwong/gongzhonghao/blob/master/关注公众号请扫码.png大概是因为KEGG数据库更新了，因此clusterProfiler也要使用最新版本的（4.6.2）对于更新包呢，试了一些方法，未果，因此直接去Bio
生信摆渡·2023-11-19 15:16

GSVA，GSEA,KEGG,GO学习

目录GSVA1：获取注释基因集2：运行GSEA1,示例数据集2,运行GSEA_KEGG富集分析GSEA_GO富集分析DO数据库GSEAMSigDB数据库选取GSEAKEGG1：运行2：绘图bar图气泡图绘图美化
hx2024·2023-11-19 15:46

生信学习之通路富集二（通路打分）

生信学习之通路富集二（通路打分）：生信学习之通路富集一（GO分析）对富集通路打分：AUC打分代码。
coffeeii·2023-11-19 15:15

桃䄦

香格里拉位于横断山脉腹地，这是一片生物物种富集之地。读高中时，给我们教授生物学科的潘老师。他喜欢在教学之余对香格里拉
姑依滑雪·2023-11-19 12:08

RabbitMQ简单介绍

,并且MQ是基于AMQP协议的1特点RabbitMQ底层使用Erlang语言编写,传递效率高,延迟低开源,性能优秀,稳定性较高与springAMQP(spring高级消息队列协议)完美的整合,API丰富集群模式丰富
卷不动的打工仔·2023-11-11 09:13

《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 7

这一章来介绍NGS的下游分析富集分析简单的讲，富集分析就是一种统计分析的手段，用来筛选功能相类的一组基因是否富集中差异表达的基因中。
小潤澤·2023-11-06 01:26

9年结果发表|ADRCs在乳腺癌术后重建中的临床研究

近期，日本九州大学医学院的ShuheiIto教授团队发表了使用Celution系统分离的ADRCs富集的脂肪移植在乳腺癌术后病人乳房重建的临床研究结果，结果表明ADRC富集的自体脂肪移植技术在乳房重建中长期安全和有效
高远_3b59·2023-11-04 19:30

YY直播一天收入达到40Ｗ？原来做了这些事......

目前YY直播是一个包含音乐、科技、户外、体育、游戏等多个内容，是目前国最较大的娱乐平台，注册用户达到10亿人，月活跃用户达到1.22亿，其最早建立在一款强大的富集通讯工具——YY语音的平台基
禹叶同学·2023-11-03 20:55

【实战】circleplot展示GO富集分析结果—附R代码

上一期给大家简单介绍了☞circleplot展示GO富集分析结果今天我们用前面讲差异表达分析时，用到的TCGA数据库中的CHOL这套数据的差异表达分析结果来举例。
生信交流平台·2023-11-03 09:14

macs2的输出文件解读

区域长度peak的峰值位点（summitposition）peak峰值的高度（pileupheightatpeaksummit,-log10(pvalue)forthepeaksummit）peak的富集倍数
awk_bioinfo·2023-11-03 04:16

关于RNA-SEQ中GO分析的几个名词

问题一：GO和KEGG富集倍数（FoldEnrichment）如何计算见链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/264504322问题二：如何利用EXCEL计算Q值BH算法的公式为
ShanSly·2023-11-02 19:29

clusterprolifer go kegg msigdbr 富集分析应该使用哪个数据集，GO?KEGG?Hallmark？

关注微信：生信小博士5OverviewofenrichmentanalysisChapter5Overviewofenrichmentanalysis|BiomedicalKnowledgeMiningusingGOSemSimandclusterProfiler5.1.2GeneOntology(GO)GeneOntologydefinesconcepts/classesusedtodescri
生信小博士·2023-11-02 10:25

GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别

其中，基因集分析（GeneSetAnalysis）、基因集富集分析（GeneSetEnrichmentAnalysis）、单样本基因集富集分析（SingleSampleGeneSetEnrichmentAnalysis
生信小博士·2023-11-02 10:55

RNA-seq学习：No.5富集分析--ORF过表达

1、基础知识（1）基本概念富集分析(enrichmentanalysis)简单来说就是将成百上千个基因、蛋白或者其他分子分到不同的类中，以减少分析的复杂度。
小贝学生信·2023-11-01 20:45
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