文献阅读GNN 第17页

GIN：图同构网络

论文链接：https://arxiv.org/abs/1810.00826论文来源：ICLR2019一、概述目前的GNN框架大多遵循递归邻域聚合（或者消息传递）框架，并且已经出现各种GNN变种。

酷酷的群·2023-03-23 06:03

GNN模型介绍

图模型这两年有点火呀，稍微记录一下，有时间了再来补充。一般有这两类：基于空间，代表模型GAT基于频谱，代表模型GCN以上两个模型都是为了在非欧空间中模拟卷积过程，基于空间的模型类比cnn做法将相邻的节点做处理获得下一层隐层GCN的做法是现将输入图使用傅里叶变换转换到频域上，在频域上进行和cnn一致的卷积操作，再将结果进行逆傅里叶转成时域上（在这里是每个节点上）

needle_princess·2023-03-22 03:04

文献阅读——原发性和转移性肿瘤中克隆扩增的EOMES+Tr1样细胞与疾病进展相关

——by不是杀杀Natureimmunology2021May20IF:20.477PMID:34017124该文章基于原发性非小细胞肺癌和结直肠癌单细胞转录组测序数据的分析，发现CDS4+T细胞中有两类细胞亚群在这两种癌症中具有高度相似的特征基因，之后进一步通过流式细胞技术对scRNA-seq的分析结果进行蛋白质层面上的验证，并在多种不同肿瘤、癌症不同阶段以及转移性肿瘤中对这类细胞亚群进行观察，

不会生信哟·2023-03-22 00:26

学习是一个过程

现在想来，感觉痛苦，往往也伴随着给文献阅读的时间不足。想用平常读一篇中文阅读理解的方式和速度，去读完一篇文献，尤其是英文文献，是十分不可取的。这是在认知上首先需要明确的。

阿拉萝卜·2023-03-20 09:43

心理学考研或者读研期间扩展阅读期刊清单

心理学一级学科硕士研究生文献阅读主要书目和期刊目录序号著作或期刊的名称作者或出版单位备注（必读或选读）1心理学报科学出版社必读2心理科学进展中国科学院心理学所必读3心理科学华东师范大学必读4心理学探新江西师范大学必读

葉梓穆·2023-03-20 02:12

文献阅读笔记：CUT&Tag

之前学习了CUT&RUN的一篇综述，在CUT&RUN的基础上，最近的一项更新的技术CUT&Tag也被发表出来了。这篇文献是2019年发表在NatureCommunication上的一篇综述，介绍了这个新的技术。除了这篇综述，我还查询了其他文献，在本篇笔记的末尾放了一张ChIP-seq，CUT&RUN和CUT&Tag三种技术的样品制备比较示意图，非常直观的可以看到3种方法的差异。也易于理解。题目：C

生信start_site·2023-03-19 13:56

文献阅读——肿瘤干细胞与转移

每天一篇文章今天这个还是蛮有趣image.pngTGLI1转录因子介导乳腺癌的脑转移通过激活转移起始肿瘤干细胞和肿瘤微环境当中的星形胶质细胞摘要乳腺癌转移的机制依旧不清楚。截断的胶质瘤相关的致癌基因的同源基因（TGLI1），一个转录因子被认为促进肿瘤发生、迁徙和侵袭，是否在任何肿瘤的转移过程中扮演什么角色仍旧没有被研究。在这一研究中，两个乳腺癌转移小鼠模型的结果显示TGLI1的异位表达，而不是GL

谢京合·2023-03-18 14:35

文献阅读-渗透压决定被子植物精细胞几何形状和完整性

大家好，本次阅读的两篇文章第一篇《K+TransporterAtCHX17withItsHydrophilicCTailLocalizestoMembranesoftheSecretory/EndocyticSystem:RoleinReproductionandSeedSet》，通讯作者是美国马里兰大学帕克分校细胞生物学和分子遗传学系HevenSzea教授。观察表达模式，发现在CHX17在根、茎

每天都想睡觉的阿源·2023-03-18 00:30

2018-09-24 wes文献阅读4

Title：胃癌患者调节DNA重组修复的PALB2，BRCA1和RAD51C基因的种系突变Journal:GastroenterologyIF:20.773Articlehistory:accepted2017April摘要：10%胃癌有家族遗传倾向，目前只发现CDH1与胃癌风险相关，为了鉴别与胃癌风险相关的基因，我们收集28个患者，遗传性弥漫性胃癌但不伴有CDH1突变，进行全外显子测序分析。结论

凤凰_0949·2023-03-17 00:58

李宏毅 GNN 课堂笔记

rusty1s/pytorch_geometrichttps://zhuanlan.zhihu.com/p/54505069https://zhuanlan.zhihu.com/p/1129380371.GNN

音符纸飞机·2023-03-16 08:06

SCI论文文献阅读方法--Editideas（辑思编译）

读文献有不同的读法，不同阶段不同目的下，阅读的侧重点和方法有所不同，下面介绍的是几种不同目的的文献读法中最为经典的一种阅读方式，从文章各部分的阅读顺序和重点角度的一种阅读方式。一篇健全的文章大多为IMRAD结构，什么是IMRAD？简言之，它就是：Introduction：Whatproblemwasstudied?MethodsandMaterial：Howwastheproblemstudied

Editideas辑思编译·2023-03-16 03:04

2020-12-02微信推文学习

今日工作完成文献阅读整理心中有数新闻稿done推文整理获取快递论文写作从简单做起1.推文整理source（ppt）一个浏览器googlechrome两个网站xiumi.us微信公众平台文案审核：摘要中文题目指定的封面图个人介绍个人生活照致谢

锅炉工的自我修养·2023-03-15 23:57

算法文献阅读：POSTAR2：破译转录后调控逻辑

期刊：NucleicAcidsResearch（19.160/Q1）POSTAR2:decipheringthepost-transcriptionalregulatorylogicsPOSTAR2：破译转录后调控逻辑ABSTRACTPost-transcriptionalregulationofRNAsiscriticaltothediverserangeofcellularprocesses.

龙star180·2023-03-15 21:19

阅读文献心历路程

记录且分享一下我这几年的转变1.阅读文献思维模式的转变原因以前文献汇报的状态：极其痛苦，硬翻译，啥也没看懂现在文献汇报的状态：抓重点，抓逻辑，思路清晰转变原因：写SCI论文给我带来的巨大痛苦，让我深刻意识到文献阅读的缺乏

乔伊乔一·2023-03-15 20:40

文献阅读 ——肿瘤干细胞的异质性

嗯！！读这个文献前半部分的时候差一点把它撕碎~到底想说什么？？？不过后面的内容还是提供了一些新的视角。所以还是值得略读一下滴。文章标题.png这个文章有新意的部分和最核心的思想就是下面这两张图。首先第一张图，是想说明EMT和CSC的异质性的关系。即细胞处于混合状态EMT的时候和CSC的各种功能之间的相关性。image.png然后，接着就说功能不同的CSC亚群之间的关系和能够用来区分这些CSC的ma

谢京合·2023-03-15 14:31

命令行更新node版本

第一步：清除npm缓存，执行命令：npmcacheclean-f第二步：安装n模块：npminstall-gnn模块是专门用来管理nodejs版本d第三步：升级node.js到最新稳定版：nstable

一瓣山河·2023-03-13 22:11

一键显示影响因子与分区

今天小编给大家介绍一款可以自动加载期刊影响因子和分区的插件（Scholarscope），该插件还具有文献管理功能，让你的文献阅读更加便捷。Scholarscope的简介支持哪些浏览器？

组学大讲堂·2023-03-12 18:25

古色古香设计风格与现代建筑完美演绎的晋中图书馆

共有六层，地上五层，地下一层，在功能区域划分上，负一层为公共服务区，一层为少儿、老年与视障阅读区，二层为综合服务区、社会科学阅读区，三层为自然科学与地方文献阅读区，四层为晋中市美术馆和数字阅读区，五层为典藏古籍阅读区

博物馆学文化·2023-03-12 09:52

【环境搭建】MacOS系统M1芯片从零开始安装torch torch-geometric(PyG) torch-sparse torch-scatter步骤详解、配置图神经网络(GNN)训练环境教程

前言：实际上只装PyTorch或者torch不会遇到什么问题，但是torch-geometric、torch-scatter、torch-sparse在M1chip的Mac上非常难安装（PyGDocumentation>Installation里注明了“CondapackagesarecurrentlynotavailableforM1/M2/M3macs”）。博主试错过程中遇到了很多无解的bug

FR1SKY·2023-03-10 15:46

文献阅读-Myosin XI-B 对于花粉管的囊泡和器官运输是必要的

大家好，本次阅读的文献是近期发表在《PlantJournal》上的《MyosinXI-BisinvolvedinthetransportofvesiclesandorganellesinpollentubesofArabidopsisthaliana》一文，通讯作者是中国农业大学的李岩教授，该实验室聚焦花粉管顶端生长分子机制研究。该实验室于去年发表一篇类似文章《Organellemovementa

每天都想睡觉的阿源·2023-03-10 14:02

第14次周报

第14次周报摘要文献阅读研究背景TextSmoothing实验研究贡献总结摘要ThisweekIreadanarticlethatproposedanefficientdataaugmentationmethod

三倍速的红色魔女·2023-03-09 22:46

文献阅读（48）—— 长序列time-series预测【Informer】

文献阅读（48）——长序列time-series预测【Informer】文章目录文献阅读（48）——长序列time-series预测【Informer】先验知识/知识拓展文章结构文章方法1.文章核心网络结构

柚子味的羊·2023-03-09 21:39

给深度学习研究生的入门建议（未完待续ing）

我的背景是浙江大学人工智能专业在读硕士，研究方向是GNN、NLP、司法智能。

诸神缄默不语·2023-03-09 16:29

什么是图神经网络？

GNN将深度学习的预测能力应用于丰富的数据结构，这些数据结构将对象及其关系描述为图中由线连接的点。当两种技术融合时，它们可以创造出新奇而美妙的东西——比如手机和浏览器融合在一起打造智能手机。

扫地的小何尚·2023-03-09 13:07

文献阅读：单细胞转录组学分析在人类个体发生过程中识别出红系前体中的免疫易感人群

搬运自公众号：BioArt题目：Single-celltranscriptomicanalysisidentifiesanimmune-pronepopulationinerythroidprecursorsduringhumanontogenesis作者：中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）石莉红研究员、周家喜研究员与解放军总医院第五医学中心刘兵研究员、暨南大学兰雨研究员合作期

生信小白花·2023-03-02 09:34

基于图数据库 NebulaGraph 实现的欺诈检测方案及代码示例

本文是一个基于NebulaGraph图算法、图数据库、机器学习、GNN的FraudDetection方法综述。

·2023-02-21 15:20

GCN入门资料

由于科研需要自学GCN中，近期在B站、知乎上看了很多资料，在这里总结一下我个人觉得讲的很清晰的资料，方便自己之后的回顾，也方便大家找资料：1、什么是GCN/GNN?

简疋·2023-02-20 23:52

推荐场景太大太复杂搞不动？快来试试 PGLBox！

图神经网络（GraphNeuralNetwork，GNN）是近年来出现的一种利用深度学习直接对图结构数据进行学习的方法，通过在图中的节点和边上制定聚合的策略，GNN能够学习到图结构数据中节点以及边内在规律和更加深层次的语义特征

·2023-02-20 16:13

2019.2.23

文献阅读完成兼职应聘预约完成新实验方案未设计完成ppt设计练字未完成托福单词书到货，明天开始背单词今天的事情完成了一半左右，阅读了新东方的单词记忆法，受益颇多，明天开始背单词计划。加油！再接再厉！

DniWeR·2023-02-19 05:00

算法文献阅读7：MCScanX (MCscan的改良升级版)

MCScanX:atoolkitfordetectionandevolutionaryanalysisofgenesyntenyandcollinearityMCScanX：一个用于基因同线性和共线性检测和进化分析的工具包2021年影响因子/JCR分区：16.971/Q1NucleicAcidsResearch(这个期刊影响因子特别高，时而为一区，有的时候又被中科院划为二区，ncst为B档)(图1

龙star180·2023-02-18 20:03

七日一周开业大吉（7.30-8.5）

明日工作：1、配方细化，准备下发；2、文献阅读整理；3、相关事宜处理。7月31日早已习惯了早出晚归，每天都在todolist,todolist……。

白云路·2023-02-18 15:26

二月week4文献阅读：Lineage-Determining Transcription Factor TCF-1 Initiates the Epigenetic Identity of T...

Lineage-DeterminingTranscriptionFactorTCF-1InitiatestheEpigeneticIdentityofTCells初期学习者，跟着别人的学习脚步学习了科学文献的搜索，观看和构思。一、介绍Introduction文章使用染色质开放检测技术（ATAC-seq）研究T细胞成熟过程中开放染色质的变化，发现成熟早、中、晚期启动的开放染色质都富集转录因子TCF-

米妮爱分享·2023-02-18 13:10

[论文泛读]2021多篇GNN论文阅读

DiffusionImprovesGraphLearning-NIPS2019假设T是原始的转移矩阵（或者说图卷积矩阵、信息传递矩阵），那么图扩散矩阵定义为：为了保证收敛性，加上约束，。这个转移矩阵可以自行定义：如果我们令，，那么就得到了personalizedpageRank图扩散矩阵。如果我们令，，那么就得到了文献《Theheatkernelasthepagerankofagraph》提出的时

fry3251·2023-02-18 10:35

图神经网络解释性问题综述

图神经网络的可解释性是目前比较值得探索的方向，这篇综述论文针对近期提出的GNN解释技术进行了系统的总结和分析，归纳对比了该问题的解决思路。

熠熠晨曦_·2023-02-17 18:10

Datawhale 6月学习——图神经网络：图预测任务实践

前情回顾图神经网络：图数据表示及应用图神经网络：消息传递图神经网络图神经网络：基于GNN的节点表征学习图神经网络：基于GNN的节点预测任务及边预测任务图神经网络：超大图上的节点表征学习图神经网络：基于图神经网络的图表征学习

SheltonXiao·2023-02-17 17:31

单细胞文献阅读：The adult human testis transcriptional cell atlas

分享一下去年看过的一篇关于人SSC的文章：直译就是“成人睾丸转录细胞图谱”，这篇文章主要是进行的单细胞转录组分析，虽然是18年发的一篇文章，但是也可以为我们的单细胞分析提供一点思路。文章：Theadulthumantestistranscriptionalcellatlas来源：CellResearch(2018)28:1141–1157;https://doi.org/10.1038/s4142

ApriL_Taurus·2023-02-17 11:06

又是两天没动笔

这个目标是2020年初定下的，到现在正好20个月，期间参加过几个申请项目的培训班和讲座，在文献阅读和写作技巧方面有一丁点收获，但总体进展不大。

蒲公英的小伞兵·2023-02-17 10:06

文献阅读（63）NIPS2012-ImageNet Classification with Deep Convolutional Neural Networks

学徒刘猛·2023-02-17 07:48

(1)论文 WWW2019 《Knowledge Graph Convolutional Networks for Recommender Systems》

id=3313417论文介绍1.论文所做工作这篇论文将图神经网络GNN中的图卷积网络GCN模型应用到了知识图谱KG中，并运用到推荐系统中。本篇论文的创新点：1.

无大大无大大·2023-02-17 04:19

文献阅读：Language Models are Few-Shot Learners

文献阅读：LanguageModelsareFew-ShotLearners1.内容简介2.模型&实验1.模型&训练2.调用方法3.模型效果3.总结&思考文献链接：https://arxiv.org/abs

Espresso Macchiato·2023-02-16 23:53

Human Action Recognition Using a Modified Convolutional Neural Network(经典文献阅读)

Originalurl:http://blog.csdn.net/sheng_ai/article/details/40537969https://wenku.baidu.com/view/640545d6d0d233d4b14e69ea.html一.文献名字和作者HumanActionRecognitionUsingaModifiedConvolutionalNeuralNetwork，Ho-J

junmuzi·2023-02-16 22:15

GNN图神经网络原理解析

一、GNN基本概念1.图的基本组成图神经网络的核心就是进行图模型搭建，图是由点和边组成的。在计算机处理时，通常将数据以向量的形式进行存储。

Emiliano Martínez·2023-02-16 22:19

技术沙龙 | 图神经网络(GNN)最新研究进展分享

由于深度学习在可推理和可解释性方面的局限性，结合图计算与深度学习的图神经网络(GNN)成为近期学术界和工业界研究的热点新方向之一，并在社交网络、推荐系统等领域得到了广泛的应用。

开放知识图谱·2023-02-16 21:47

联邦GNN综述与经典算法介绍

作者：京东科技李杰联邦学习和GNN都是当前AI领域的研究热点。联邦学习的多个参与方可以在不泄露原始数据的情况下，安全合规地联合训练业务模型，目前已在诸多领域取得了较好的结果。

·2023-02-16 20:34

图神经网络入门：搭建GNN环境

图神经网络入门：搭建GNN环境本教程是在Windows10下安装Pytorch(GPU版本，CPU版本比较简单，不需要CUDA、cudnn),CUDA,cudnn,pyG许多初学者，开始以为直接安装好上述的软件或者包就直接能用了

想成为风筝·2023-02-07 11:47

【GNN报告】GNN-LOGS部分报告汇总

BastainRieck:Topology-BasedGraphRepresentationLearning基础拓扑学习基于拓扑学习的工作参考BastainRieck:Topology-BasedGraphRepresentationLearning_哔哩哔哩_bilibiliChaitanyaK.JoshiGraphNeuralNetworksforGeometricGraphs背景方法Geom

静静喜欢大白·2023-02-07 10:27

Point-GNN README批注

Point-GNNREADME批注1.Point-GNN1.1GettingStarted1.1.1Prerequisites1.1.2KITTIDataset1.1.3DownloadPoint-GNN1.2Inference1.2.1Runacheckpoint1.2.2Performance1.3Training1.4License1.5

Ly.Leo·2023-02-07 10:24

「图与推荐指南针」: 顶级学者/研究组有哪些？

，代表作node2vec，GraphSAGE，门下各个是高手）Google：BryanPerozzi（DeepWalk作者，一作成名）TUM：StephanGunnemann（GraphAttack，GNN

weixin_45519842·2023-02-07 09:08

北邮教授石川：图神经网络需要解决的几个关键问题

会上，四位国内学者对图表示学习和图神经网络的最新理论进展和应用探索进行了介绍，题目分别是：《图卷积神经网络》中国中文信息学会·社会媒体处理专委会副主任、中科院计算所研究员沈华伟《图神经网络(GNN)及认知推理

喜欢打酱油的老鸟·2023-02-07 09:37

GNN 2021(十三) An Effective Knowledge Distillation Framework，WWW

所提出的框架提取任意学习的GNN模型(教师模型)的知识，并将其注入到设计良好的学生模型中，学生模型采用标签传播和特征转换两种简单的预测机制，分别自然地保留了基于结构的先验知识和基于特征的先验知识。

五月的echo·2023-02-07 09:34

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