文献阅读GNN 第14页

文献阅读笔记（bone marrow hematopoietic stem cell niche）

一、Thebonemarrownicheforhaematopoieticstemcells1、（P4）ThesestudiessuggestedthatendothelialcellsareonecomponentoftheHSCniche,butdidnotaddresswhethertheydirectlyorindirectlyregulateHSCmaintenanceinvivo.2、

NANAXI_67da·2023-06-11 06:29

图神经网络：(化学领域)再次认识图神经网络

文章目录Mutagenicity数据集搭建模型训练模型文献阅读重新回来Mutagenicity数据集Mutagenicity数据集是用于图分类的数据集。判断该化合物是否具有致突变性。具体信息见代码吧。

Q天马A行空Q·2023-06-11 06:09

图神经网络：(节点分类)在KarateClub数据集上动手实现图神经网络

文章目录文献阅读：代码实操：文献阅读：参考文献：SEMI-SUPERVISEDCLASSIFICATIONWITHGRAPHCONVOLUTIONALNETWORKS中文翻译：用图神经网络进行半监督的分类我在百度网盘上传这篇文献

Q天马A行空Q·2023-06-11 06:38

面向动态图的极低时延 GNN 推理采样服务

阿里云云栖号·2023-06-10 23:48

[图神经网络]ViG(Vision GNN)网络代码实现

论文解读：[图神经网络]视觉图神经网络ViG(VisionGNN)--论文阅读https://blog.csdn.net/weixin_37878740/article/details/130124772?spm=1001.2014.3001.5501代码地址：ViGhttps://github.com/huawei-noah/Efficient-AI-Backbones/tree/master/

ViperL1·2023-06-10 22:15

文献阅读--植物精卵融合过程粘附因子GEX2的发现

本次精读的是一篇老文章，2016年发表在《currentbiology》上的《GameteAttachmentRequiresGEX2forSuccessfulFertilizationinArabidopsis》，通讯作者是新加坡国立大学生物科学系的FredericBerger教授（我猜是图片中间那个）。研究兴趣翻译如下：保守的蛋白质组蛋白不仅仅是DNA的简单支架，还参与基因组活动的调节。我们探

每天都想睡觉的阿源·2023-06-09 22:30

用keras搭建LSTM神经网络的经验

尤其神经网络，其实大部分文章都是这几种常见的网络结构，例如CNN，GNN,GCN,LSTM，RNN等。所以

臭小子222·2023-06-09 09:00

论文阅读：Syn2Real Transfer Learning for Image Deraining using Gaussian Processes

首次写文献阅读，文笔功夫很差，如有不足之处，恳请海涵。

倘若我问心无愧呢丶·2023-06-09 01:16

2023.05.21 学习周报

文章目录摘要文献阅读1.题目2.背景3.现存问题和解决方法4.方法4.1Variationalmodedecomposition(VMD)4.2BidirectionalLSTM5.实验5.1数据标准化

MoxiMoses·2023-06-08 12:48

2023.05.28 学习周报

文章目录摘要文献阅读1.题目2.现有方法存在的局限性3.SR-GNN模型4.模型的组成部分4.1构图4.2item向量表示4.3session向量表示4.4预测模块5.实验与分析5.1数据集5.2比较方法

MoxiMoses·2023-06-08 12:48

2023.04.30 学习周报

文章目录摘要文献阅读1.题目2.摘要3.介绍4.本文贡献5.数据处理6.模型6.1look-up操作6.2LSTM6.3周期模拟及额外因素7.实验7.1数据集7.2基线7.3实验表现8.结论ISOMAP1

MoxiMoses·2023-06-08 12:17

2023.05.14 学习周报

文章目录摘要文献阅读1.题目2.现存问题和解决方法3.RUM4.本文贡献5.模型框架5.1Memoryenhanceduserembedding5.2Predictionfunction5.3Item-levelRUM5.4feature-levelRUM6

MoxiMoses·2023-06-08 12:17

2023.06.04 学习周报

文章目录摘要文献阅读1.题目2.背景3.方案4.本文贡献5.模型5.1图注意力形式5.2superGAT6.实验7.结论有限元数学建模深度学习1.高斯扩散2.原理总结摘要Thisweek,IreadacomputerscienceaboutGNN.Atpresent

MoxiMoses·2023-06-08 12:38

文献阅读·59-OSBP

简介 Opensetdomainadaptationbybackpropagation.ECCV-2018,Cited-46. official,pytorch,star-22.关键字 openset，domainadaptation正文1.场景域内样本的类别集合之间的关系如下图所示的第3种，在这种情况下完成域适应任务：域关系.png2.基本思路和解决方案方式：解决分离unknow和

jiangweijie1981·2023-06-08 09:25

3.用图神经网络进行图分类

在本教程中，我们将更深入地了解如何将图神经网络（GNN）应用于图分类任务。图分类是指在给定图的数据集的情况下，基于一些结构图的属性对整个图（与节点相反）进行分类的问题。

☆下山☆·2023-06-07 07:50

2023/6/4周报

目录摘要论文阅读1、标题和现存问题2、使用GNN进行文本分类3、INDUCT-GCN4、实验准备5、实验结果深度学习1、时空图的种类2、图在环境中的应用3、STGNN总结摘要本周在论文阅读上，阅读了一篇

白小李·2023-06-06 21:54

2023/5/21周报

目录摘要论文阅读1、标题和现存问题2、各个结构3、基于GNN-LSTM-CNN网络轨迹预测模型4、实验准备5、实验结果深度学习1、费舍尔判别2、步骤具体化3、GCN总结摘要本周在论文阅读上，阅读了一篇基于

白小李·2023-06-06 21:37

【图-注意力笔记，篇章1】Graph Transformer：包括Graph Transformer 的了解与回顾且其与GNN、Transformer的关联

一份PPT带你快速了解GraphTransformer：包括GraphTransformer的简要回顾且其与GNN、Transformer的关联GNN、Transformer与GraphTransformer

xiaobai_Ry·2023-04-21 15:47

文献阅读- REV 参与调控助细胞中 LRE 的表达

开题终于结束了，失踪人口回归，本次阅读的是发表在《bioRxiv》上的《TheSEELMotifandMembersoftheMYB-relatedREVEILLETranscriptionFactorFamilyareImportantfortheExpressionofLORELEIintheSynergidCellsoftheArabidopsisFemaleGametophyte》。LRE

每天都想睡觉的阿源·2023-04-21 04:13

经典文献阅读之--VGICP（体素化的ICP匹配）

0.简介之前我们在以前的文章中介绍了很多有关于点云匹配相关的知识，最近两年处理GICP这一大一统的ICP匹配方法以外，还有一个工作对体素化和ICP这两者打起了心思，《VoxelizedGICPforFastandAccurate3DPointCloudRegistration》提出了一种体素化的广义迭代最近点（VGICP）算法，用于快速、准确地进行三维点云配准。该方法扩展了广义迭代最近点（GICP

敢敢のwings·2023-04-21 03:27

2023.04.16 学习周报

文章目录摘要文献阅读1.题目2.摘要3.简介4.Dual-StageAttention-BasedRNN4.1问题定义4.2模型4.2.1Encoderwithinputattention4.2.2Decoderwithtemporalattention4.2.3Trainingprocedure5

MoxiMoses·2023-04-20 13:15

【论文阅读】HGT：Heterogeneous Graph Transformer

Cziun·2023-04-20 09:00

《Relational Attention: Generalizing Transformers for Graph-Structured Tasks》【ICLR2023-spotlight】

https://github.com/CameronDiao/relational-transformer动机标准的Transformer缺少relationalindectivebiases，而这在GNN

Iron_lyk·2023-04-20 09:29

2023.2.19 第四十一次周报

目录前言文献阅读-NGCU：用于时间序列数据预测的新RNN模型背景主要贡献思路模型：NGCU实验元胞自动机元胞自动机（CA）原理特点代码实战奇偶规则森林火灾总结前言ThisweekIreadanarticlethatproposedanewgatingunitthroughthestudyofRNN

孙源峰·2023-04-20 06:11

2023.2.12 第四十次周报

目录前言文献阅读-用于预测时间序列的网络自关注背景贡献主要思路预测模型可见性图随机游走过程进行预测总结与展望元胞自动机CellularAutomata概述元胞自动机的构成元胞自动机的基本特征分类总结前言

孙源峰·2023-04-20 06:11

2023.4.16 第四十九次周报-2

目录前言文献阅读:基于动态分类的长短期记忆网络模型，用于不同气候区日流量预报背景主要贡献思路动态分类（DC）方法DC-LSTM和DC-B-LSTM模型Box-Cox数据转换模型性能评估指标克里金插值源码总结第一部分第二部分第三部分总结前言

孙源峰·2023-04-20 06:40

12月week4文献阅读：Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression...

Single-cellRNA-seqhighlightsintra-tumoralheterogeneityandmalignantprogressioninpancreaticductaladenocarcinomaABSTRACTPancreaticductaladenocarcinoma(PDCA)isthemostcommontypeofpancreaticcancerfeaturedwi

米妮爱分享·2023-04-20 03:45

1.Introduction: Hands-on Graph Neural Networks

PyG（PyTorchGeometric）是一个基于PyTorch的库，用于轻松编写和训练图形神经网络（GNN），用于与结构化数据相关的广泛应用。

☆下山☆·2023-04-19 23:00

联邦GNN综述与经典算法介绍

作者：京东科技李杰联邦学习和GNN都是当前AI领域的研究热点。联邦学习的多个参与方可以在不泄露原始数据的情况下，安全合规地联合训练业务模型，目前已在诸多领域取得了较好的结果。

·2023-04-19 18:52

文献阅读：Identification of essential genes for cancer immunotherapy

写在前面：正在准备课程pre，为了帮助自己理清逻辑，所以顺手把这篇文献翻译了。但是只翻译了对自己有用的部分（引言和讨论没有翻），若有需要还是请看原文。某些专业术语的翻译比较生硬，如有纰漏，欢迎批评指正。文献：Patel,S.,Sanjana,N.,Kishton,R.etal.Identificationofessentialgenesforcancerimmunotherapy.Nature54

Chlmon·2023-04-19 17:55

2021秋季课程cs224w（图机器学习） colab5 异构图节点分类

代码详见github：https://github.com/whitehat32/cs224w-colab这里的主要思路就是先对每种类型的边使用gnn获得嵌入表示，之后把嵌入表示聚合(聚合方式可以是求均值或者

一只谜谜怪·2023-04-19 16:32

【RecBole-GNN/源码】RecBole-GNN中lightGCN源码解析

或者点击链接扫码关注【RecBole-GNN/源码】RecBole-GNN中lightGCN源码解析【RecBole-GNN/源码】RecBole-GNN中lightGCN源码解析原文：https://

码农的科研笔记·2023-04-19 11:59

第十周.02.LightGCN

First-orderPropagationhigh-orderconnectivityNGCFvsGNNLightGCN摘要3.1LightGCN3.2ModelAnalysis实验本文内容整理自深度之眼《GNN

oldmao_2000·2023-04-19 11:28

详解PyG中的ToSLIC变换

前言PyG是一个开源的Python库，用于深度学习任务中的图神经网络（GNN）建模和训练。该库包括多个GNN模型和与图相关的数据结构和算法。在本篇文章中，我将介绍PyG中的T

·2023-04-19 11:32

4/16学习周报

文章目录前言文献阅读摘要简介方法评估标准结果结论时间序列预测支持向量机SVM高斯过程GPRNNLSTMGRUtransformer总结前言本周阅读文献《Real-timeprobabilisticforecastingofriverwaterqualityunderdatamissingsituation

hehehe2022·2023-04-19 07:06

舆情&传染病时空分析文献阅读笔记

[1]朱炤瑗,秦昆,关庆锋,罗萍,姚博睿,漆林,周扬.COVID-19期间国家关系交互网络时空分析研究[J].地理与地理信息科学,2022,38(01):15-22.研究问题：COVID-19疫情不断蔓延为国际政治、外交关系等带来深刻影响。目前基于复杂网络方法的国际关系研究较少考虑节点的空间属性，难以探索国际关系的动态演化模式及其空间分布特征。该文提出一种结合时间序列聚类与空间统计的国家关系交互网

无知的研究生·2023-04-18 23:32

【研究型论文】EC-GCN: A encrypted traffic classification framework based on multi-scale GNN

文章目录EC-GCN:Aencryptedtrafficclassificationframeworkbasedonmulti-scalegraphconvolutionnetworks摘要存在的问题论文贡献1.分析和动机图结构分析图节点和边分析2.问题和模型问题定义模型框架3.工作流程4.模型评估总结论文内容数据集EC-GCN:Aencryptedtrafficclassificationfra

过动猿·2023-04-18 18:04

GNN笔记1-3——图信号处理

图和图移位算子图被定义为三元组集合：：节点：表示个不同label的集合；边：有序对表示可以影响；权重：是上的一个数字，表示影响的程度。有向图与无向图在无向图中，等价于，且，在有向图中是从指向的箭头，权重不一定等于。带权图与无权图对于无权图若边之间存在连接，通常认为的权重是单位“1”，即，而带权图上的权重可以根据需要定义为任意值。图的矩阵表示邻接矩阵：,forall，对于无向图，；节点的度：节点的度

Ice_spring·2023-04-18 14:36

文献阅读|单细胞+空间转录组-胰腺导管癌

文章信息title：Integratingmicroarray-basedspatialtranscriptomicsandsingle-cellRNA-seqrevealstissuearchitectureinpancreaticductaladenocarcinomas标题：结合基于微阵列的空间转录组和单细胞RNA-seq揭示胰腺导管腺癌的组织结构杂志：naturebiotechnology

_十三·2023-04-18 05:34

创造rap一首，关于毕业论文难写

今夜我静坐，思绪万千毕业论文压力，无从散思考未来之路，夜深人静心中的困惑，难以言明Chorus:毕业论文难写，思维难解期望重重，无从逃脱毕业论文难写，压力犹在深夜独处，愁苦满胸口Verse2:批判性思维，文献阅读数据库检索

懒笑翻·2023-04-17 15:35

文献阅读笔记：CUT&RUN

这篇文献阅读笔记比较长，属于CUT&RUN比较早的一篇综述了。是2017年发表在eLife上的。这篇文章通过把CUT&RUN与ChIP等方法从各个方面进行了比较，详细的说明了CUT&RUN的优点。

生信start_site·2023-04-17 04:34

视线追踪（Estimation of Gaze-Following）文献阅读：Believe It or Not, We Know What You Are Looking At

ReadPaper文章地址文章名称风格飘逸。这个是解决视线追踪任务的文章，第一次接触。因此做一下笔记。视线追踪任务很好理解，就是找出图中某个人物的视线焦点。文章所提出的双阶段解决方案：输入头部图像和头部坐标（可以认为是多模态输入），利用cnn和fc得到一个预测的视线方向，从而生成多尺度的视线方向场。将多尺度的视线方向场与原图concatenate，再次使用cnn（FPN结构）得到视线焦点的热图。一

cartes1us·2023-04-17 02:22

图神经网络也能用作CV骨干模型，华为诺亚ViG架构媲美CNN、Transformer

机器之心专栏机器之心编辑部华为诺亚实验室的研究员发现图神经网络（GNN）也能做视觉骨干网络。

人工智能与算法学习·2023-04-17 02:47

[图神经网络]视觉图神经网络ViG(Vision GNN)--论文阅读

2206.00272.pdfgit地址https://github.com/huawei-noah/Efficient-AI-Backbones/tree/master/vig_pytorch相较于之前将GNN

ViperL1·2023-04-17 02:12

2022-03-02 #文献阅读-个体多基因风险评分评估存在较大的不确定性，影响了基于PRS的风险分层

一级标题个体多基因风险评分评估存在较大的不确定性，影响了基于PRS的风险分层二级标题五级标题列表第一项列表第二项有序列表第一项有序列表第二项标题[图片上传失败...(image-e2f728-1646232750719)]斜体粗体引用段落代码块LargeuncertaintyinindividualpolygenicriskscoreestimationimpactsPRS-basedriskst

王尚一·2023-04-16 20:29

图像处理-边缘检测-文献阅读笔记

[1]李华琛.基于opencv图像边缘检测技术[J].数字技术与应用,2016(11):2.高斯滤波有效抑制噪声；原理：识别图像中亮度改变较为明显的点，本质是采用不同的算子进行边缘检测并进行修整。算子：Laplacian算子、Scharr算子、Canny算子基元：图像上比较有显著特点的基本单元canny实现流程：①平滑图像,抑制噪声;②计算梯度方向和幅值;③非极大值抑制;④滞后其阈值lapianc

Sun-wz·2023-04-16 14:57

pyg在大图上面进行GNN

今天想在reddit数据集上跑实验，发现pyg默认的sage_conv是不支持邻居采样、batch训练的，需要使用pyg提供的NeighborLoaderpyg中的NeighborLoader附上一个我自己实现的在reddit上面进行GraphSage的代码：GraphSage_batch.py:importtorchfromtorch_geometric.nnimportSAGEConvfrom

canaryW·2023-04-16 14:31

2022-02-28 #文献阅读-提高风险预测研究中多基因分数的报告标准

ImprovingreportingstandardsforpolygenicscoresinriskpredictionstudiesPolygenicscore(PGS)asinglevaluethatquantifiesanindividual’sgeneticpredispositiontoatrait.Typicallycalculatedbysummingthenumberoftrai

王尚一·2023-04-16 13:44

文献阅读 NC：单细胞多组学在免疫肿瘤学中的应用

简要介绍一篇最近发表在NatureCommunications上的COMMENT，Theuseofsingle-cellmulti-omicsinimmuno-oncology，DOI号：10.1038/s41467-022-30549-4。1.IntegrativeanalysesofscMulti-omicsinimmuno-oncologyIntra-modalityintegrationw

林枫bioinfo·2023-04-16 03:51

一些小情绪

我分析了一下原因：因为任务目标不明确，则容易有为难情绪和拖延因为自己感觉这个任务很难，自己做不好，所以就真的变得做不好了（想想自己的Transformer和GNN）所以，我觉得凡事(尤其是自己觉得困难的事情

wzhings·2023-04-16 02:29

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