环状RNA

RNA 3. SCI 文章中基于T CGA 差异表达基因之 DESeq2

在比较高通量测序分析中，一项基本任务是分析计数数据，如RNA-seq中每个基因的Readcount，以获得跨实验条件的系统性变化的证据。离
90066456ace6·2024-01-29 12:48

STL容器结构与分类

容器的结构与分类容器-结构与分类序列式容器sequencearray,c++11不可扩容vector向后扩容dequedouble-endqueue双端队列，前后均可扩充list双向环状链表forwardlist
Zard 泉水·2024-01-28 17:22

RNA-seq阅读2016年【HISAT, StringTie and Ballgown】笔记

2016StevenLSalzbergNatureProtocolRNAseq总体分析流程分为四步：1）alignmentofthereadstothegenome2)assemblyofthealignmentsintofull-lengthtranscripts3)quantificationoftheexpressionlevelsofeachgeneandtranscript4)calcu
小红楼上的树影·2024-01-28 13:08

【现学现卖】实时荧光定量PCR——qPCR

应用很广泛，凡是涉及一条RNA链逆转录为cDNA，再以此为模板通过PCR进行DNA扩增都可以叫做RT-PCR，可能应用于定性PCR或者定量PC
乔伊nikkie·2024-01-27 15:38

circRNA研究知多少

circRNAs（CircularRNAs，环状RNA分子）是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成闭合环形结构的非编码RNA分子，在真核生物中广泛存在。
ee00dc6faab7·2024-01-27 04:41

CSS动画特效

分享几款实用的CSS动画效果前言1、一起来看流星雨效果2、光影效果4、磨砂玻璃效果5、发光渐变效果6、泡沫环状效果7、定制表单效果总结：前言css动画特效1、一起来看流星雨效果2、光影效果###3、霓虹灯效果
前端早间课·2024-01-26 16:35

R包VennDiagram的韦恩图绘制及交集元素的提取

例如做RNA-seq的最直接目的，大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到多分组情况时，常需要展示多组间共享的差异基因数量，这个时候就要使用到韦恩Venn图。
纪伟讲测序·2024-01-26 15:28

一文掌握R包DESeq2的差异基因分析过程

例如，肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调，这些失调分子是否是引发或加速肿瘤进程的潜在因素？
纪伟讲测序·2024-01-26 12:20

NOC CCN NIC CCI总线

1.前言在ARM当前所有的总线产品里，根据拓扑的不同可以分为三类产品：NIC/CCI系列是交叉矩阵的（Crossbar），CCN系列是基于环状总线的(Ring)，NoC系列是网状总线(Mesh)。
biaobiao_hust·2024-01-26 09:49

RNA-Seq：差异表达分析案例

白利合子酵母菌在乙酸或铜胁迫下早期反应的转录谱分析摘要：醋酸在食品工业和生物技术中是非常重要的微生物抑制化合物，而非传统酵母种白利合子酵母菌对醋酸有显著的耐受性。Zbhaa1是酿酒酵母haa1基因的功能同源物，是一种能调节白利合子酵母菌对醋酸和铜胁迫的适应性反应的双功能转录因子。在2018年5月发表的一篇文章TranscriptionalprofilingofZygosaccharomycesba
DumplingLucky·2024-01-25 22:35

2022-06-23

单细胞RNA测序的研究表明，总mRNA含量与肿瘤表型息息相关。然而，目前为止，还未出现能够对总mRNA进行大规模泛癌检查的技术。近期，美国安德森癌症中心
图灵基因·2024-01-25 21:45

文献阅读-2022-11-23-RNA结构-5'UTR的review

题目：2018_Functional5′UTRmRNAstructuresineukaryotictranslationregulationandhowtofindthem摘要:RNA分子能折叠成复杂的形状
不学无术吗·2024-01-25 13:53

地球和吞噬者

在长久的历史长河中，一艘波江人的飞船打破了平静，由于波江星球被巨大的环状吞噬者所吞噬，携带着大量的关于吞噬者的资料，来到地球。
哒哒的秘密·2024-01-25 05:51

2022-11-22

题目：DeterminationofinvivoRNAstructureinlow-abundancetranscripts摘要：RNA二级结构在多种生物过程中扮演重要的角色，但是，目前，大部分体内的RNA
不学无术吗·2024-01-25 04:06

Nat.Biotechnol|能靶向冠状病毒RNA的新型CRISPR工具问世

图片下载：右键此处另存为可保存此图片Cas13酶沿着RNA行走的景象。
PaperRSS·2024-01-25 01:09

奇妙的带环链表

正如其名，带环链表就是在普通链表的基础上自身形成了环状结构，如下图所示：其中（-4）中存储的是（2）的地址，自然形成了环状结构，且
唔·西·迪·西·2024-01-24 17:02

17β-Estradiol high sensitivity ELISA kit

雌激素能促使细胞合成DNA、RNA和相应组织内各种不同的蛋白质。β-雌二醇(17β-Es
Neobioscience·2024-01-24 12:18

全反式维甲酸（ATAR）诱导白血细胞的染色质构象改变而影响分化进程

AlterationsofspecificchromatinconformationaffectATRA-inducedleukemiacelldifferentiation期刊：CellDeath&Disease影响因子：6.044主要技术：Hi-C、ATAC-seq、ChIP-seq、RNA-seq
d5c9c866171f·2024-01-24 11:45

每日反思：2月9日

那为何没有遵守时间规划，进入恶性循环状态？1、没
一白书白·2024-01-24 09:30

2021-11-26

丨非小细胞肺癌单细胞分析细化了肿瘤分类和患者分层原创珍奇图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：珍奇IF：31.743推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本研究通过多尺度单细胞分析对更大的患者队列进行分析，从而定义在肿瘤微环境中诱导的分子免疫状态；通过测序将免疫细胞的单细胞RNA
图灵基因·2024-01-23 22:41

翻译（4）siRNA

siRNAs在植物中，约90％的小RNA是来源于双链前体的siRNA。它们的长度可以进一步分为21-nt，22-nt和24-nt类。
Yancey_Yan·2024-01-23 19:50

TPM、RPKM与FPKM相互转换

RNA数据下机后，如果处理成readcountsmatrix的话，是一定要进行基于基因长度的标准化的（TMP，RPKM，TPKM等）。
Seurat_Satija·2024-01-23 18:39

石蜡包埋组织RNA提取步骤

产品特点◎裂解液、消化液经专门优化，无需过夜温育即可从福尔马林固定的、石蜡包埋组织中高效纯化基因组RNA；◎提取的RNA纯度高，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多
清风拂面vv·2024-01-23 17:03

StringTie在注释基因组时的注意事项

在利用RNA-seq注释基因组时，有一个问题就是，我将不同组织来源的转录组数据和参考基因组比对之后，那下一步是1）先将这三个比对结果进行合并，然后用StringTie进行预测，还是2）用StringTie
xuzhougeng·2024-01-23 14:16

高温季节，植物病毒病如何防治？？？

植物病毒在寄主细胞中进行核酸（RNA或DNA）和蛋白质外壳的复制，组成新的病毒粒体。植物病毒粒体或病
农事巴巴·2024-01-23 09:23

两个黑洞跳舞制造的引力透镜效应

因为背后的星体发出的光线会绕行，在地球上就会观察到一个环状影像，这就是所谓的爱
华笺流香·2024-01-23 05:34

生物信息学导论-北大-新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq 1

ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义+搜索内容。Real-TimeqRT-PCR基于互补杂交反应（complementaryhybridizationreaction），PCR技术的发展促进了本技术的发展，缺点是：1.低通量2.需要有转录本序列的先验知识。步骤：Real-TimeQuantita
陆沙·2024-01-23 00:50

Reads, Metagenomic assembly, and custom MAGs的区别与联系解读

研究者通常会涉及到以下三个数据类型，每个都有其独特的角色和应用：Reads（读数）:定义：Reads是从原始测序数据（例如Illumina测序的FASTQ文件）中获得的短序列片段，通常包含原始样本中的DNA或RNA
WDPLA·2024-01-22 15:18

转录组测序1-测序原始数据说明

样品制备到产出测序数据过程，是RNA提取建库和测序的试验环节。在使用Illumina
纪伟讲测序·2024-01-22 08:45

零代码进行转录组数据分析实战（一）：质量控制

RNA提取、片段化、逆转录以及上机测序。生信：生物信息分析阶段。数据质控、比对、定量，以及差异表达基因分析等。从本文开始，着眼于生信阶段，开始带领大家进行转录组实战。首先就是测序数据质控。
简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-22 08:49

累⊙﹏⊙

不过我可以做好我自己～《平凡的世界》里晓霞死了，虽然挽回了一个年幼的生命，但还是很令人揪心；《破冰行动》里马雯中弹了，不开心(;_;)说句不好听的，为什么不是陈珂…希望明天提RNA一切顺利！
阿喵同鞋·2024-01-21 23:47

两条命令就跑完RNA差异分析

它就是simpleRNA，居然只要两条命令就能跑完复杂的RNA差异分析，并生成结果矩阵和结果图！
基因组学研究生·2024-01-20 18:01

做一名错误先生，从今天开始

这让我自己陷入了一个反复的恶性循环状态。
木鱼的城堡·2024-01-20 16:04

【卡梅德生物】如何制备纳米抗体?

纳米抗体的制备通常涉及到从动物源（如骆驼、羊驼）提取RNA或cDNA，然后通过分子生物学技术将其克隆并表达。
卡梅德生物·2024-01-20 12:37

【学习笔记】mark一篇推荐系统的文章

在做一道RNA中Dropout事件填充的建模题，里面要用到低秩矩阵的填充，基于矩阵分解的填充方法参考了推荐系统的相关算法。mark一篇推荐系统的文章基于矩阵分解的推荐算法
Jweeeeee·2024-01-19 23:53

水秀

水秀演出开始，激光射出五颜六色的光柱，喷泉随着音乐舞动，有些是直射水柱，跟着音乐一起一伏，节奏轻重缓急，紧凑跳跃；有些喷泉摇动手臂，统一身形划出一个个S型的优美曲线来；有些喷泉围城一个环状，左右组合，形成一个水做的皇冠
无_穷·2024-01-19 18:05

【数据结构】循环队列（数组实现）

目录一、循环队列定义怎么使一个数组在逻辑上呈“环状”呢？
这题怎么做？！？·2024-01-19 12:54

ceRNA：一种全新的基因表达调控模式

竞争性内源RNA（ceRNA）是近几年来备受学术界关注的对象，它代表了一种全新的基因表达调控模式，相比miRNA调控网络，ceRNA调控网络更为精细和复杂，涉及更多的RNA分子，包括mRNA、编码基因的假基因
Seurat_Satija·2024-01-19 08:51

腰椎间盘突出是“睡”出来的？别慌，这有骨科医生的7个窍门帮你护腰！

这样会让腰椎、脊柱长时间处于旋转状态，会导致椎间盘内相邻的环状胶原纤维之间产生压力，椎间盘内压力增大导致髓核向一定方向突出，从而引发腰椎
潘氏中医向勇·2024-01-19 00:28

不做WB或免疫组化，也能轻松完成蛋白验证 | 蛋白组数据库推荐

其利用转录组学和蛋白质组学技术，从RNA和蛋白水平研究人类不同组织和器官中的蛋白表达
尐尐呅·2024-01-19 00:30

新型冠状病毒

1.遗传物质：RNA2.作用特点：传染性强、致死率低3.必须寄生生活，无法独立生存。4.防护建议：病毒会从口、眼睛、鼻子等体内与外界相通的地方进入体内，建议出门戴口罩，不用手触碰眼睛。
希望珍贵·2024-01-19 00:03

结构变异SV分析(WGS/WES)和融合基因检测（RNA）

69种工具检测SV对比https://www.jianshu.com/p/85ff211b4b4ehttps://zhuanlan.zhihu.com/p/87408242?utm_campaign=rss&utm_medium=rss&utm_source=rss&utm_content=title最终决定使用wham和Manta组合，其实最优组合应该是wham，inGAP-SV组合或者inGA
wo_monic·2024-01-18 16:31

唾液 RNA 提取试剂提取后的 RNA 可用于核酸检测使用？

产品特点◎提取RNA纯度高，无抑制剂，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多；◎可用于唾液样本中RNA的提取，提取后的RNA可用于核酸检测使用；◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂
清风拂面vv·2024-01-18 15:19

纯生信分析套路 甲基转移酶相关因子的预后分析

本文主要是基于TCGA数据和中国胶质瘤基因组图谱RNA测序数据集，通过一
音十千寻·2024-01-18 13:04

文献阅读：单细胞 RNA 测序揭示分子定义的肌间神经元类别的多样化

文献介绍「文献题目」Diversificationofmolecularlydefinedmyentericneuronclassesrevealedbysingle-cellRNAsequencing「研究团队」UlrikaMarklund（KarolinskaInstitutet）「发表时间」2020-12-07「发表期刊」NatureNeuroscience「影响因子」25.0「DOI」10
Tiger Z·2024-01-18 12:30

一文带你读懂单细胞测序

单细胞转录技术（scRNA-seq）非常适合研究样本中各个细胞基因表达的异质性，其经典流程：分离单细胞（核），将RNA转换为cDN
生信大碗·2024-01-18 00:53

2022-07-01

NatureCellBiology|活细胞动态RNA成像技术原创苏安图灵基因2022-07-0109:13发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：苏安IF：28.824推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文的作者带我们回顾了
图灵基因·2024-01-18 00:28

力扣每日一练（24-1-17）：轮转数组

defrotate(nums,k):n=len(nums)rotated=[0]*nforiinrange(n):rotated[(i+k)%n]=nums[i]nums[:]=rotated方法二：环状替换这个方法的思
CCSBRIDGE·2024-01-17 19:49

HCLA——3

学习目标：1.计算机网络是什么2.计算机网络的分类2.1局域网（LAN）2.2城域网（MAN）2.3广域网（WAN）3.拓扑结构3.1环状拓扑结构3.2星型拓扑结构3.3总线拓扑结构3.4、树型网络拓扑结构
。puppy·2024-01-17 07:47

2696. 删除子串后的字符串最小长度 --力扣 --JAVA

解题思路因为不确定需要循环遍历几次，所以选择使用while来进行循环；创建标志常量来表示循环状态是否结
xuxigifxfh·2024-01-16 22:44
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