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环状RNA
论做好心理建设的必要性
这种心理上的病态同时也影响了身体的健康,失眠、多梦、肠胃功能紊乱随之而来,此起彼伏、此消彼长,整个人似乎陷入了一种杂乱无章的循
环状
态。
aprilsunlove
·
2023-11-28 15:06
计算机组成原理——主存储器
存储器4.1概述一、存储器分类1.按存储介质分类半导体存储器TTL、MOS易失磁表面存储器磁头、载磁体非易失磁芯存储器硬磁材料、
环状
元件非易失光盘存储器激光、磁光材料非易失2.按存取方式分类存取时间与物理地址无关
梭梭子
·
2023-11-28 04:21
其他
RNA
-seq分析流程
1、质量控制:fastqc-o./-t1/public/home/zyhu/hfd/${i}_R1_001.fastq.gz/public/home/zyhu/hfd/${i}_R2_001.fastq.gz合并质控结果multiqc./Trimmomatic修剪去掉前端低质量碱基java-jar\$EBROOTTRIMMOMATIC/trimmomatic-0.32.jarPE-phred33$
chaos_z
·
2023-11-28 04:17
RNA
-Seq raw2fpkm pipeline (snakemake)
前几天,帮师妹分析转录组数据,由于她只需要FPKM,并且我刚好在学snakemake,就试着用snakemake写了一个简单的从rawdata到FPKM的流程。snakemake简介:snakemake是一款基于python3的软件snakemake的主要功能是快速搭建分析流程官方网址snakemake优势:支持并行运算支持断点运算支持流程控制支持内存控制支持CPU核心控制支持运行时间控制支持。。
李诚0921
·
2023-11-27 23:29
简单环(状压 dp,详细注释)
简单环参考博客:牛客网Wannafly挑战赛17C-简单
环状
压dp题目描述给定一张n个点m条边的无向图,求出图中所有简单环的数量。
幽影相随
·
2023-11-27 08:08
#
动态规划(DP)
Measurement of mRNA abundance using
RNA
-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples
WagnerGP,KinK,LynchVJ.MeasurementofmRNAabundanceusingRNA-seqdata:RPKMmeasureisinconsistentamongsamples[J].TheoryBiosci,2012,131(4):281-285.百度百科:RPKM,ReadsPerKilobaseperMillionmappedreads,代表每百万reads中来自
sunlight_yy
·
2023-11-27 02:38
单细胞seurat入门—— 从原始数据到表达矩阵
根据所使用的建库方法,单细胞的
RNA
序列(也称为读取(reads)或标签(tags))将从转录本的3'端(或5'端)(10XGenomics,CEL-seq2,Drop-seq,inDrops)或全长转录本
生信小博士
·
2023-11-27 02:06
矩阵
线性代数
通过转染双链siRNA 在哺乳动物细胞中进行
RNA
干扰
长链dsRNA不能用于多数哺乳动物细胞中,这是由于它能诱导干扰素反应而引发基因表达和细胞凋亡的变化。本方案介绍了一种向哺乳动物细胞中转入短的双链siRNA的方法,双链siRNA因其长度过短而不能引起与dsRNA相关的序列非特异性反应。本方案适用于24孔板中生长的细胞。如果使用了其他规格的多孔板、培养瓶或者培养皿,则需要根据培养孔的表面积换算细胞密度和试剂用量(表1)。试剂转染试剂Dulbecco’
实验小助手
·
2023-11-26 20:22
色彩的混合
这种色相的
环状
排列,叫做「色相环」,是学习配色时用到的非常方便的图形工具,利用它我们可以了解两色彩间有多少间隔。所谓“一生二、二生三、三生万物”,由不同色相两两之间调和而成的环形色块也就形成了色相环。
Solay13
·
2023-11-26 18:17
纯生物信息学SCI文章好发吗?不好意思,很难了
3-4年前,一套完整的
RNA
-seq,而且是很简单的那种套路可以发到3-4分文章,好的
医学程序研究
·
2023-11-26 10:34
MAC M1 安装ViennaRNA Python模块
MACM1安装ViennaRNAPython模块ViennaRNA安装包下载安装配置调用
RNA
包ViennaRNA安装包下载快速通道:https://www.tbi.univie.ac.at/
RNA
/index.html
赵仙儿
·
2023-11-26 07:39
macos
python
perl
外泌体多组学21-通过大小排斥色谱分离的细胞外囊泡适用于血浆中的RNomics分析
由于血浆的生物组成复杂,血浆
RNA
组学分析(RNomics)很容易实现,因此有必要根据性能从现有方法中选择最优策略进行预期的应用在这项研究中,我们进行了四种不同的ev分离策略并进行了比较(即超离心(UC
_十三
·
2023-11-25 20:58
echarts实现颜色渐变的
环状
图(包括自定义各种配置项的属性)
实现效果:实现代码:option={color:[newecharts.graphic.LinearGradient(1,1,0,0,[{offset:0,color:'#F2A635'},{offset:0.9,color:'#ffffff'}]),newecharts.graphic.LinearGradient(1,1,0,0,[{offset:0,color:'#26DCCE'},{off
MrZhouGx
·
2023-11-25 18:27
Smart-seq total 2021
然而,在分析细胞
RNA
时,大多数研究仍然只关注与蛋白质编码转录物相对应的3%。单个细胞中剩
韧_7e6f
·
2023-11-25 15:36
Python 的垃圾回收(简单总结)
大体分为4类:(根据自己的理解写的)1.引用计数器2.标记清除(对1补充)3.分代回收(对1补充)4.缓存机制几种回收机制的内部联系:在Python中维护了一个refchain的双向
环状
链表,这个链表中存储程序创建的所有对象
python小学生---
·
2023-11-25 15:27
python
开发语言
后端
科研“出圈”必备——空间组学技术
空间转录组学/
RNA
成像技术
尐尐呅
·
2023-11-25 09:50
基因工程实验Ⅱ大肠杆菌质粒DNA的抽提及检测『Protocol』
一、实验原理:质粒的抽提与纯化实质上是将质粒DNA与细菌的基因组染色体DNA、
RNA
、蛋白质、细胞膜等细胞器及其他大分子物质分离的过程,因此质粒的抽提大致可分为:细菌的培养、收集与裂解;质粒DNA的分离与纯化
生菜小科狗
·
2023-11-25 00:37
53.《Bioinformatics Data Skills》之实战:统计落在外显子区域dbSNP数目
寻找区域间的overlap算得上是基因组最常见的操作,貌似简单的寻找overlap追究细节之后也会变得非常复杂,比如为了解决
RNA
-seq表达定量的问题就衍生出一系列专业的工具或者R包(例如RSEM,TopHat
DataScience
·
2023-11-24 08:34
空间转录组技术在肿瘤免疫治疗中的应用潜力
原位杂交原位杂交(ISH)是一种使细胞或组织中特定DNA或
RNA
分子
尐尐呅
·
2023-11-24 07:08
PTA-病毒感染检测
(注意,人的DNA序列是线性的,而病毒的DNA序列是
环状
的)输入格式:输入第一行中给出1个整数i(1≤i≤11),
jmu-pfm
·
2023-11-23 14:07
算法
数据结构
图论
Kallisto原理及应用
Kallisto简介首先,这款软件是2016年发表在NBT上的一款
RNA
-seq的计数软件,文章标题为《Near-optimalprobabilisticRNA-seqquantification》(http
小潤澤
·
2023-11-23 09:44
学习:StatQuest-
RNA
-seq
RNA
-seq的建库过程image.png上图是
RNA
建库的步骤
RNA
测序过程image.pngimage.pngimage.png采取边合成边测序的原则,不同碱基,带有不同荧光,测序仪测出不同荧光image.pngRNA-seq
小潤澤
·
2023-11-23 06:32
单细胞36计之18擒贼擒王---单细胞与空间转录组整合
与scRNA-seq参考整合为了促进Slide-seq数据集的细胞类型注释,我们利用了由Saunders*,Macosko*等人制作的现有小鼠单细胞
RNA
-seq海马数据集。2018。
Seurat_Satija
·
2023-11-23 05:41
论文阅读“ZINB-based Graph Embedding Autoencoder for Single-cell
RNA
-seq Interpretations”
,WangY,etal.ZINB-basedGraphEmbeddingAutoencoderforSingle-cellRNA-seqInterpretations.AAAI2022.摘要导读单细胞
RNA
掉了西红柿皮_Kee
·
2023-11-22 03:22
1130转录组分析(三)--王通老师讲解
[endif]为什么要进行
RNA
测序机体DNA是一个相对静态的过程,
RNA
是一个动态变化的过程,其在生理病理或者外在条件下,会发生相应变化,影响调控疾病发生。
不如好好学生信吧
·
2023-11-22 01:36
生物学重复与技术重复
生物学重复与技术重复在利用基因芯片或者
RNA
-seq做基因表达分析的时候,经常听说生物学重复和技术重复,这篇文章我们就来简单介绍二者的含义。
wangchuang2017
·
2023-11-21 22:02
核酸的检测与性质
核酸分脱氧核糖核酸和核糖核酸,包括DNA和
RNA
,核酸的最小组成成分是核苷酸,包含脱氧核苷酸和不脱氧核糖核酸,基因是DNA的一部分,不同的人DNA不同,核苷酸的含氮碱基包括腺嘌呤,鸟嘌呤等等。
爱你的常青藤
·
2023-11-21 15:41
2021-02-17
RNA
-seq 流程
1前期准备1.1安装conda下载wget-chttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh安装bashMiniconda2-latest-Linux-x86_64.shsource~/.bashrc#激活conda添加镜像源condaconfig--addchann
diyidaoguang
·
2023-11-21 04:40
R语言绘制配对样品箱线图
随后,通过qPCR或
RNA
-seq等方法定量基因表达后,以箱线图呈现特定基因在肿瘤组织和正常组织中的整体表达水平,并在箱线图中以
纪伟讲测序
·
2023-11-20 20:40
基于 Letterize.js + Anime.js 实现炫酷文本特效
基于以上的截图效果可以分析出以下是本次要实现的主要几点:文案呈圆
环状
扩散开,扩散的同时文字变小文字之间的间距从中心逐个扩散开,间距变大文案呈圆
环状
扩散开,扩散的同时文字变大文字之间的间距从中心逐个聚拢,
南城FE
·
2023-11-20 15:05
前端动画合集
前端CSS那些事
javascript
前端
css
普通PCR、原位PCR、反向PCR和反转录PCR的 基本原理和操作步骤(四)
在RT-PCR中,一条
RNA
链被逆
天明豆豆
·
2023-11-20 06:08
单细胞分析最佳实践
单细胞
RNA
-seq数据分析最佳实践(上)单细胞
RNA
-seq数据分析最佳实践(中)单细胞
RNA
-s
FionaMoon
·
2023-11-20 03:02
出版级PCA美图,轻松拿捏(主成分分析利器,建议收藏备用)
工具位置UseGalaxy.cn>
RNA
-seq>PCAplotwithFactoMineR数据准备文件1:矩阵文件第1列:特征,如基因。第2-最后一列:样本的值,如表达量。
简说基因-专业生信合作伙伴
·
2023-11-19 20:51
Exosomal long noncoding
RNA
LNMAT2 promotes lymphatic metastasis in bladder 1 cancer
我们鉴定了外泌体长非编码
RNA
(lncRNA)
一个没有感情的文献阅读机
·
2023-11-19 13:17
用Seurat做
RNA
Velocity
介绍:https://www.jianshu.com/p/63071b368be5安装:注意:velocyto需要python版本>=3.6.0gitclonehttps://github.com/velocyto-team/velocyto.py.gitcdvelocyto.pypipinstall-e.#notethetrailingdot其他安装方式https://velocyto.org/
生信编程日常
·
2023-11-19 06:01
测序原理碎碎念
加接头的示意图如上图所示大致步骤如下:用酶或者激光或者超声波将GenomicDNA或者由
RNA
反转组得到的双链cDNA打断成小片段;打断是随机打断,有可能末端不平整,还需要用酶补平;补平之后,需要在3’
BINBINCC
·
2023-11-19 04:12
Web.xml中配置监听器Listener导致服务器启动不了
监听器调用该方法后一直处于循
环状
态一时半会挑不出就导致整个tomcat服务器卡在监听器环节了。发现问题后就简单了,直接在监听器里new个thread在调用该方
大海中的海洋
·
2023-11-18 18:10
web
tomcat
【vue2绘制echarts
环状
图】vue2使用echarts绘制
环状
图
效果图:鼠标悬浮的效果图:1:安装
[email protected]
或
[email protected]
.局部引入使用在vue页面引入import*asechartsfrom"echarts";exportdefault{name:"Home",data(){return{//总数countCharData:0,//存放echarts组装的数据echa
鱼干~
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2023-11-16 10:28
echarts
前端
javascript
vue.js
ggThemeAssist|鼠标调整主题,并返回代码
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析(Nature重磅综述|关于
RNA
-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2023-11-14 22:57
可视化
人工智能
数据可视化
html
python
【学习笔记】生物信息学基础知识+序列比对初步了解(一)
文章目录DNA和
RNA
的组成基因蛋白质中心法则DNA的复制DNA到mRNA转录蛋白质的剪接蛋白质的折叠突变与多态性组学转录组蛋白质组代谢组组学数据简介表观遗传复杂生物网络影像组主要研究内容介绍多序列比对全局序列比对动态规划算法
Dumbledore‘s wand
·
2023-11-14 00:40
学习笔记
765. 情侣牵手(并查集代码)
012345三对情侣可以看成001122三对情侣,在这道题中,可以把012看作三个点,沙发看作三条边,可以理解成一个
环状
图,定下其点和边,开始思考。
cccc楚染rrrr
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2023-11-12 16:53
LeetCode
算法
leetcode
数据结构
生物信息学笔记03 -- 基因组序列分析 方法
排在外侧,碱基排列在内侧;两条链上的碱基通过氢键想结合,形成碱基对于腺膘呤(A)总是与胸腺嘧啶(T)配对、鸟膘呤(G)总是与胞嘧啶©配对,这说明两条链的碱基顺序是彼此互补的中心法则遗传信息从DNA传递给
RNA
JamSlade
·
2023-11-11 06:11
BioInfo
算法
人工智能
python
5+m6A+预后模型+WGCNA,简单又高效,学习下这篇思路吧
结果解读:在训练集中,基于3个与m6A相关的长非编码
RNA
建立了一个预后标志在基于276个m6A相关lncRNA的表达水平对EC
生信风暴
·
2023-11-10 19:12
论文阅读
RNA
-seq(1) :用conda安装
RNA
-seq所需要的工具-学习笔记
之前我用cufflink系列进行了一次
RNA
-seq分析,这一次是在学习了一种新的分析方法。在整个过程中,也参照了一些生信宝典公众号(这真的对于生信小白来说很nice,强烈推荐)的许多知识。
leo12354
·
2023-11-10 00:09
生信分析
python
基因工程-7-基因表达谱研究技术
基因表达谱研究技术胚胎原位杂交技术胚胎抗体染色技术基因芯片技术蛋白质组学技术.7.1.1胚胎原位杂交技术原位杂交(insituhybridization,ISH),是利用碱基互补配对的原理,用带有标记的目的DNA或
RNA
_玻璃晴朗_
·
2023-11-09 10:23
基因工程
学习
Unity 利用UGUI制作圆形进度条
1、首先准备好一张
环状
的PNG图,如下图。2、把该图导入Unity中并转换成精灵。
mr_five567
·
2023-11-08 07:47
unity
游戏引擎
Android 多语言对照表 \ 国际化语言
Android多语言对照表语言地区文件夹名称南非荷兰语南非values-af-
rNA
南非荷兰语纳米比亚values-af-rZA阿肯语加纳values-ak-rGH阿姆哈拉语埃塞俄比亚values-am-rET
Mars-xq
·
2023-11-08 01:16
android
Cell Reports | 表观组学和单细胞测序揭示在急性应激条件下FoxM1协调β细胞亚群的细胞分裂、蛋白质合成和线粒体活性
发表单位:瑞士分子健康科学研究所期刊:CellReports(IF:8.8)发表日期:2023年8月29日研究技术:ATAC-seq、ChIP-seq、
RNA
-seq、scRNA-seq(爱基百客均可以提供
爱基百客
·
2023-11-07 22:54
单细胞测序
ATAC
其他
羊驼免疫流程及技巧
单域抗体普遍通过免疫羊驼获得,羊驼体内免疫系统自身的抗体成熟后,分离B淋巴细胞,提取
RNA
,反转录获取cDNA,以cDNA为底物PCR扩增获取多样化纳米抗体基因片段,然后将多样化纳
卡梅德生物
·
2023-11-07 20:28
科技
R语言实操记录——导出高清图片(矢量图)
(矢量图)2.1、保存为EPS图片格式后转AI编辑2.2、保存为PDF格式(推荐)2.3、用ggplot2包的ggsave函数输出图片(非全部适用)三、矢量图与位图一、起因(废话,可跳过)最近需要用到
环状
图
福旺旺
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2023-11-06 23:30
R语言
r语言
开发语言
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