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环状RNA
中科院脑智卓越中心新型
RNA
编辑工具
id=1698817729106080048&wfr=spider&for=pc【嵌牛导读】:Nature子刊发表中科院脑智卓越中心关于新型
RNA
编辑工具开发及其优化的研究成果【嵌牛鼻子】:新型
RNA
编辑工具
wangcheng
·
2023-12-25 07:53
sc-
RNA
-seq数据分析|| UMAP与t-NSE的区别
UMAP将会与tsne一样作为高纬数据可视化的利器,并且优于tsne.UMAP与t-SNE均是非线性降维,多用于数据可视化UMAP结构与t-SNE一致UMAP计算更快UMAP能更好地反映高纬结构,比t-SNE有着更好的连续性这种连续性反映到单细胞分析中就是能更好滴可视化细胞的分化状态(UMAPbetterrepresentsthemulti-branchedcontinuoustrajectory
周运来就是我
·
2023-12-25 07:59
中国药科大学齐炼文团队报道:治疗II型糖尿病的新策略
该研究采用了
RNA
体内转染试剂(EntransterTM-invivo,Engreen)注射小鼠尾静脉的新方法,快速高效获得p
实验小助手
·
2023-12-25 02:49
临床开展
RNA
-seq送测序前你应当考虑到几个因素
DNA层面的测序问题已经不能完全满足临床的需要,当下,美国一些医院在临床已经开展DNA测序+
RNA
测序联合分析,更好的为临床服务。
伍鸿荣
·
2023-12-25 01:59
chatgpt告诉你如何设计
RNA
引物?
RNA
引物设计原理是什么?答:
RNA
引物设计是指设计一段短的
RNA
序列,用于在反转录过程中特异性地与目标
RNA
分子结合,并在此基础上进行扩增、检测等操作。
伍鸿荣
·
2023-12-24 19:48
Seurat 基础知识
Seuratobject的名称,我们可以得到类似如下内容:AnobjectofclassSeurat13425featuresacross39233sampleswithin1assayActiveassay:
RNA
c海明威
·
2023-12-24 18:05
研究论文 2022-Oncoimmunology:AI+癌
RNA
-seq数据 识别细胞景观
Wang,Xin,etal."DeeplearningusingbulkRNA-seqdataexpandscelllandscapeidentificationintumormicroenvironment."Oncoimmunology11.1(2022):2043662.https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/2162402X.2022.20
素材积累
·
2023-12-24 07:11
笔记
AI
bulk
RNA-seq
RNA
-seq数据库(ChatGPT)
截至我最后更新知识的时间(2022年1月),存在许多
RNA
测序(
RNA
-seq)数据库,这些数据库提供了大量的基因表达和转录组学数据。
素材积累
·
2023-12-24 07:11
笔记
数据库
RNA-seq
一种具有翻译功能的circRNA在肌细胞生成中的作用
Circ-ZNF609isacircularRNAthatcanbetranslatedandfunctionsinmyogenesis期刊:MolecularCell影响因子:14.248主要技术:
RNA
-Seq
d5c9c866171f
·
2023-12-24 04:04
ImmuCellAI | 免疫浸润计算工具 R包学习
ImmuCellAIImmuCellAI(ImmuneCellAbundanceIdentifier)是一个从基因表达数据集(包括
RNA
-Seq和芯片数据)中估计24种免疫细胞丰度的工具,其中24种免疫细胞由
Aech
·
2023-12-24 03:52
r语言
免疫浸润
ssGSEA
ImmCellAI
小鼠
189. 旋转数组(环形替换)
因此讨论两种常见的思路:1.
环状
替代;2.三次翻转。环
鸟剩鱼汤
·
2023-12-23 22:43
如何快速了解接触的质粒(三)
---启动子启动子(promoter)顾名思义就是用来启动目的基因表达的一段DNA序列,位于目的基因前端,本身不被转录,是
RNA
聚合酶识别,结合和开始转录的一段序列。
小乔爱科研
·
2023-12-23 04:42
单细胞从理论到实践-这一本书就够了
前面给大家介绍过一些单细胞相关的理论和实践知识BD单细胞测序平台Rhapsody(视频)10X单细胞
RNA
-seq技术(视频)10X单细胞混样技术(视频)单细胞ATAC-seq技术介绍免疫组库10XGenomicsVDJ
生信交流平台
·
2023-12-23 03:13
RNA
-seq下游分析之PCA画图
RNA
-seq下游分析之PCA图_欧阳火火的博客-CSDN博客rm(list=ls())mydata1,]head(dds2)rld1<-rlog(dds2)plotPCA(rld1,intgroup=
ECHO1216
·
2023-12-22 20:28
NGS Mapping 软件 Bowtie 算法介绍
简介Bowtie是目前流行的一款DNA、
RNA
序列比对软件,开源免费。Bowtie的技术路线基于BWT-FM。BWT-FM法对内存的消耗很小,被很多工具采用。
茄子_0937
·
2023-12-22 18:49
从
RNA
定向互作看基因组组织
我们最近开始了解非编码
RNA
(ncRNA)在此类过程中的原始作用,现在已知几种类型的
RNA
对调节基因表达至关重要:在细胞核中,长非编码RNAs(lncRNAs)、增强子RNAs(eRNAs)、稳定的内含子序列
Ss_y
·
2023-12-22 13:06
【circRNA】circRNA简介(1)
cirRNA是非编码
RNA
中的一大类,它由一种非经典剪接方式——反向剪接(backsplicing)产生;当反向剪接发生时,下游剪接位点与上游剪接位点共价连接闭合。
jjjscuedu
·
2023-12-22 05:54
Cell:脑肿瘤免疫微环境图谱 | 癌症研究数据资源
通过整合多参数FCM分析、
RNA
序列数据、TME细胞培养分析、蛋白质阵列和空间组织特征,揭示了来自不同
尐尐呅
·
2023-12-22 00:31
多切片联合构建3D生物空间图谱
通过对多个切片进行联合建模,将其与单细胞
RNA
测序数据进行整合,STitch3D同时识别出具有一致基因表达水平的3D空间区域,并
tzc_fly
·
2023-12-21 07:47
单细胞多组学分析
3d
2021-10-15
单细胞
RNA
测序显示微生物群的缺失使TME倾向于促肿瘤巨噬细胞。2.从机制上讲,本文发现微生物群衍生的干扰素基因刺激因子(STI
图灵基因
·
2023-12-21 06:47
四价流感疫苗(鼻喷雾)
流感病毒为
RNA
病毒,根据核蛋白和基质蛋白分为甲、乙、丙、丁四型,目前感染人的主要是甲型流感病毒中的H1N1、H3N2亚型及乙型流感病毒中的Victoria和Yamagata系。
Tree_Ye
·
2023-12-21 01:23
Seurat用自定义的 cell type 做差异表达
Rcodemarkers%dplyr::glimpse()Formalclass‘Seurat’[package“SeuratObject”]with13slots…@assays:Listof1……$
RNA
Janine_1991
·
2023-12-21 01:19
R
生物信息
r语言
盘式过滤器的基本原理与特点介绍 叠片过滤器简介选型流量参数表
1:盘式过滤器(叠片过滤器)介绍叠片过滤器又称为盘式过滤器或叠片式过滤器,它是由过滤单元并列组合而成,其过滤单元主要是由一组带沟槽或棱的
环状
增强塑料滤盘构成,上下两层盘片中间沟槽起到过滤拦截的作用。
新乡市宇工环保设备有限公司
·
2023-12-20 23:43
盘式过滤器
笔记
拭子(痰液)核酸提取中如何高效地分离核酸
3.样本处理:a)拭子:向无
RNA
酶
清风拂面vv
·
2023-12-20 19:29
生物学上描述DNA/
RNA
的长度常用的kb\nt\bp是指什么?
kb=千碱基对kilobase(pair).是kbp的简写nt=核苷酸nucleotidebp=碱基对basepair1Mb=1000kb=1000000bp
大大的世界和小小的人儿
·
2023-12-20 15:08
基因表达差异分析R工具包DESeq2的详细使用方法和使用案例
DESeq2是一种常用的差异表达基因分析工具,可用于
RNA
-seq数据的差异表达分析。下面是DESeq2的详细使用步骤和全部脚本示例。
小果运维
·
2023-12-20 14:23
R
生信分析-bioinfo
信息可视化
数据分析
数据挖掘
DESeq2
R
案例
生信分析代谢通路可视化分析R工具包ggkegg的使用案例
assign_deseq2log2FoldChangecolumnnumeric_combinemean在这里,我们使用
RNA
-Seq数据
小果运维
·
2023-12-20 14:22
R
生信分析-bioinfo
python
算法
开发语言
ggkegg
ggplot
R
案例
视觉增强RTK论文(1)—— GNSS-Stereo-Inertial SLAM for Arable Farming
环状
闭合技术在农田中具有显著的挑战性,因为不同视野的局部视觉外观非常相似,并且很容易由于天气的影响而发生
点PY
·
2023-12-20 07:53
机器人导航定位
多传感器融合
2021-01-26基因ID+TMP
TumorProteinP53的简写,RNF180是RingFingerProtein180的简写ID号1.最常见的就是EntrezGene2.在gene数据库里面对于转录本和蛋白的编号是以NM和NP开头的3.非编码的
RNA
小森的生统笔记
·
2023-12-20 00:15
新版TCGA表达矩阵整理简单版
很多人因为网络原因不能使用TCGAbiolinks这个神包下载TCGA的
RNA
-seq数据,只能通过浏览器访问GDCTCGA的官网进行下载,而下载后得到的是一个个文件夹,对于如何整理成一个表达矩阵也是很麻烦的
医学和生信笔记
·
2023-12-19 20:16
数据结构与算法 19 链表 → 循环链表(约瑟夫环问题)
4.6链表→循环链表(约瑟夫环问题)循环链表,顾名思义,链表整休要形成一个圆
环状
。在单向链表中,最后一个节点的指针为null,不指向任何结点,因为没有下一个元素了。
牟泉禹[Dark Cat]
·
2023-12-19 20:58
学习笔记
链表
算法
数据结构
约瑟夫环问题
《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 1
前言最近在阅读欧剑虹老师《生物信息学生R入门教程》非常适合于刚入手NGS的初学者使用,这里我仅做我个人的读书笔记使用本书分为八个章节:1.R/Bioconductor简介2.基因芯片的数据分析3.
RNA
-seq
小潤澤
·
2023-12-19 19:08
细胞
RNA
提取的操作步骤
操作步骤(请自行准备无水乙醇、异丙醇、灭菌1.5mL离心管):1.取出洗涤液,按以下操作:a)洗涤液A:按终浓度30%比例加入无水乙醇,如7mL加入3mL无水乙醇;21mL加入9mL无水乙醇,充分混匀。b)洗涤液B:按终浓度70%比例加入无水乙醇,如3mL加入7mL无水乙醇;9mL加入21mL无水乙醇,充分混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。2.取1.5mL离心管,加入
清风拂面vv
·
2023-12-19 18:26
RNA
剪接机制
根据中心法则,DNA编码的遗传信息被转录成
RNA
,然后翻译成蛋白质。在将初级mRNA翻译成蛋白质之前,必须先对其进行修饰和编辑。
阿尔法约塔
·
2023-12-19 16:54
RNA
-seq数据如何做PCA
PCAworksbestwhentheinputdataisapproximatelynormallydistributedoneachdimension.Itwouldbeagoodideatodosomeinitialdataqualitycheckstoverifythatthisisthecase(andtransformthedataappropriatelyifnot),oratlea
OmicsAcademy
·
2023-12-19 08:49
体内内源基因调控之CRISPRi与CRISPRa
众所周知,CRISPR/Cas9系统可以用来操纵基因组:规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导
RNA
(gRNA)的指引下,靶向基因组中的特定区域并切割DNA,产生DNA双链断裂
辛晓红
·
2023-12-19 04:19
生信数据挖掘 单细胞测序
其收稿要求涵盖了癌基因的结构和功能的各个方面,尤其是:细胞癌基因及其激活机制,其编码蛋白的结构和功能,DNA和
RNA
的癌基因,肿瘤病毒,人类肿瘤的分子肿瘤学,肿瘤抑制基因,生长调控基因,细胞周期控制生长
概普生信
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2023-12-18 10:06
2022-03-18
NatComm|非编码
RNA
参与DNA修复调控机制原创图灵基因图灵基因收录于话题#前沿分子生物学机制瑞典Karolinska研究所的研究人员发表了一篇论文,展示了某些
RNA
分子如何控制癌细胞中受损DNA
图灵基因
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2023-12-17 21:52
c4d-redshift红移渲染器Dome Light常见问题解析
用人话说其实它就是个
环状
得矩阵灯光,就是四周都是光源。四面八方发射光子,就能模拟一些GI得情况。但是对于比较狭窄得地方,会比较暗还是要开全局光。dome得方法会使渲染变得很快。
JadeKou
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2023-12-17 21:09
血液微生物
RNA
提取注意事项
操作步骤(请自行准备无水乙醇、异丙醇和1.5mL灭菌RNase-free离心管)1.取出洗涤液,按以下操作:a)洗涤液A:按终浓度30%比例加入无水乙醇,如7mL加入3mL无水乙醇;21mL加入9mL无水乙醇,充分混匀。b)洗涤液B:按终浓度70%比例加入无水乙醇,如3mL加入7mL无水乙醇;9mL加入21mL无水乙醇,充分混匀。2.取1.5mLRNase-free灭菌离心管,加入200μL血液样
清风拂面vv
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2023-12-17 19:58
Nat. Mach. Intell. | 通过深度神经网络联合建模多个切片来构建一个三维全生物体空间图谱
通过联合建模多个切片并将其与单细胞
RNA
测序数据整合,S
DrugAI
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2023-12-17 19:06
DrugAI
dnn
人工智能
神经网络
深度学习
机器学习
下船类似的问题(用链表实现)
找出最后留在圈子中的人原来的序号,要求用链表实现#include#defineNUM13structpeo{intnum;structpeo*next;};intmain(){structpeoarr[NUM]={0};//建立
环状
链表
幼儿园园霸柒柒
·
2023-12-17 18:41
每日一道C语言练习题
链表
c语言
石蜡包埋组织
RNA
提取步骤有哪些?
操作步骤:1.请自行准备:无水乙醇、异丙醇、灭菌双蒸水、二甲苯及1.5mL离心管。2.取出洗涤液,按以下操作:a)洗涤液A:按终浓度30%的比例加入无水乙醇,如7mL加入3mL无水乙醇,14mL加入6mL无水乙醇,充分混匀。b)洗涤液B:按终浓度70%的比例加入无水乙醇,如3mL加入7mL无水乙醇;6mL加入14mL无水乙醇,充分混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。3.
清风拂面vv
·
2023-12-17 18:00
第十九章 见所未见 (下)
环状
禁界发现了漏洞并已成功修复。外体屏蔽层没有发现新漏洞,且被已修复的旧漏洞没有发现异常。内体屏蔽层扫描后发现有非本星球生物侵入迹象,其中有二十四个存在威胁的对象,具体参数未知,需待进一步收集。”
几何星球
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2023-12-17 05:19
逆转录酶性质 – 六个关键注意事项
DNA聚合酶活性RNaseH活性热稳定性持续合成能力保真度末端核苷酸转移酶(TdT)活性逆转录酶是从
RNA
模板合成互补DNA(cDNA)链过程中的必需试剂。
evolisgreat
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2023-12-17 00:17
派森诺转录+代谢组联合分析,4.599分的项目文章
文章题目:MetabolomeandTranscriptomeAnalysisofLiverandOocytesofSchizothoraxo’connoriRaisedinCaptivity技术手段:
RNA
-seq
felix108
·
2023-12-16 23:08
2021-11-17
CanRes|抑制前列腺肿瘤的
RNA
分子原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制尽管许多前列腺癌患者接受了阻断促进肿瘤生长的激素的治疗,但大多数患者对这些治疗产生了耐药性。
图灵基因
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2023-12-16 16:34
CeRNA才是人生赢家,一篇著名的赤果果的文(tao)献(lu)
首先肯定要先搞清楚ceRNA是个啥,英文名competingendogenousRNAs,咱给翻译成——竞争性内源
RNA
。
医科研
·
2023-12-15 19:06
实验1:总
RNA
的提取——Trizol
实验一:细胞中总
RNA
的提取及鉴定一、目的:掌握Trizol提取总
RNA
的原理和步骤,学习电泳鉴定总
RNA
的方法。二、原理:
RNA
是核酸,具有较好的水溶性。
猪莎爱学习
·
2023-12-15 14:47
JupyterHub 如何切换 conda 小环境
然后安装conda,方法请见Q4,在conda中创建小环境(这里示例
rna
),并且安装ipykernel# conda 创建 小环境conda creat
生信小博士
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2023-12-15 04:40
服务器
linux
人工智能
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