转录第22页

一文读懂基因富集分析：从小白到SCI

对于小编来讲，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，基因组可以算突变率、转录组可以算基因表达水平、表观组可以观察甲基化水平、蛋白质组/代谢组可以看蛋白/代谢物丰度，甚至是宏基因组也可以比较菌群的丰度。

概普生信·2023-07-13 17:15

10X单细胞 & 10XATAC 联合分析表征细胞调控网络（MIRA）

10X单细胞&10XATAC联合之调控网络分析（IReNA）空间转录组+单细胞核+单细胞ATAC联合分析揭示人心肌梗死多组学图谱10X单细胞核转录组+10X单细胞ATAC的联合分析（WNN）10X单细胞转录组与

单细胞空间交响乐·2023-07-13 16:18

转录因子研究思路

一、什么是转录因子？转录因子是起正调控作用的反式作用因子，是一类蛋白分子，它能通过与基因上游５’端特定序列专一性结合的方式来使目的基因顺利表达。在转录起始过程中，可调控RNA聚合酶与DNA模板的结合。

Han_zh·2023-07-11 08:44

采用Trinotate对拼接结果进行注释

一：开始之前需要准备三个东西：第一：安装软件1.Trinity（用于生成拼接后的转录本fasta文件）2.TransDecoder（用于预测转录本的蛋白编码区域）3.SQLite（用于整合数据库数据，我下的是

多啦A梦的时光机_648d·2023-06-28 20:17

复现原文（二）：Single-cell RNA sequencing of human

imageimageNGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：

生信宝典·2023-06-24 11:04

用Python实现AI声音克隆的原理和代码示例

可以使用Python中的librosa库读取音频数据，并通过音频编辑软件标记声音片段的语音文字转录以用作训练数据。2.特征提取对于声音克隆，

技术老张·2023-06-24 11:26

渐进式学习：如何用R和GO富集可视化捕捉生命的关键信号？

在这个领域，GO（GeneOntology）富集分析已成为一种常见的技术，用于识别在给定的基因集合中与特定生物过程和机制有关的基因集合，是研究生物信息学、基因组学和转录组学的重要方法之一[1,2]。

笑不语·2023-06-23 23:14

Elasticsearch：如何通过 3 个简单步骤从 Elastic 数据中删除个人身份信息

或者也许是呼叫中心转录？Elasticsearch凭借其在机

Elastic 中国社区官方博客·2023-06-23 12:57

还在找实时英语录音转写中文软件哪个好？

而语音转写技术的出现为我们提供了一种更加便捷高效的方式来转录语音内容。录音转写软件是一类创新工具，利用先进的语音识别和自然语言处理技术，能够将音频文件中的内容自动转录为文字。

Nightowls__·2023-06-23 11:04

机器学习识别肿瘤干性指数mRNAsi

2018年发表在Cell上面的一篇文章采用创新的单类逻辑回归(OCLR)机器学习算法，通过对干细胞转录组、甲基化组和转录因子结合位点的多平台分析，得到了两个独立的干性指数，其中mRNAsi可以反映干细胞的基因表达特征

博士苑·2023-06-23 10:46

AI时代的三类人：探索掌握AIGC，引领未来的人才之路

我们只需要将录音通过语音识别转录后输入ChatGPT，再告诉它需要转化为某种风格的

叶锦鲤·2023-06-22 16:49

易基因｜m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析

一、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)测序技术原理表观转录组指RNA序列不发生改变的情况下，由RNA上的化学修饰调节基因表达的现象。

易基因科技·2023-06-22 16:18

网络药理学+转录组AD候选药物筛选纯生信分析套路

今天跟大家分享的是六月份发表在Bioinformatics杂志（IF：5.61）上的一篇通过对疾病相关基因和药物靶标进行网络分析，筛选出潜在药物，并根据其基因表达谱进一步过滤获得有效药物的文章。ScreeningnoveldrugcandidatesforAlzheimer’sdiseasebyanintegratednetworkandtranscriptomeanalysis通过整合的网络和转

概普生信·2023-06-22 14:40

软件安装不上，可能是网速慢！Conda/R/pip/brew等国内镜像大全拿走不谢~~

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞

生信宝典·2023-06-21 12:39

生信学习——转录组测序分析的大致流程

转录组测序的分析流程大致可以分成三类，包括基因组比对（Genomemapping）、转录组比对（Transcriptomemapping）、转录组组装（Reference-freeassembly）有大牛写的很好

Lifelrving·2023-06-20 19:50

单细胞转录组高级分析五：GSEA与GSVA分析

以下文章来源于生信会客厅，作者Kinesin生信会客厅分享单细胞转录组、空间转录组、转录调控及微生物多样性的分析流程、代码及相关生信知识。

Seurat_·2023-06-20 10:51

paddlespeech asr语音转录文字；sherpa 实时语音转录

1、paddlespeechasr语音转录文字参考：https://github.com/PaddlePaddle/PaddleSpeech安装后运行可能会numpy相关报错；可能是python和numpy

loong_XL·2023-06-19 20:08

单细胞 Drop-seq数据分析教程

Drop-seq是一种单细胞RNA测序技术，通过在微滴中捕获单个细胞并进行RNA扩增，从而获得单个细胞的转录组数据。该技术通过微滴分离单个细胞并将细胞裂解，随后在微滴中添

11的雾·2023-06-19 15:18

AI+Science：基于飞桨的AlphaFold2，带你入门蛋白质结构预测

1958年F.H.C.克里克提出了生物学中重要的中心法则，DNA->RNA->蛋白质，中心法则说明，DNA可以转录形成RNA，RNA再翻译成一个个氨基酸，最后组合形成蛋白质。

·2023-06-19 10:43

Day-3 单细胞转录组RCA分析揭示结直肠癌细胞异质性

热烈庆祝sci-hub合法化，这下大家可以自由自在使用了之前的单细胞转录组研究中，许多实验检测的肿瘤微环境分辨率不足，或者忽视了肿瘤与对应的正常样品的比较。

刘小泽·2023-06-19 07:22

faster-whisper-webui

Luke Ewin·2023-06-19 02:25

NBIS系列单细胞转录组数据分析实战（七）：空间转录组分析

第七节：空间转录组分析在本节教程中，我们将学习空间转录组的一些分析方法。

Davey1220·2023-06-19 00:08

甲基化知识点

斗战胜佛oh·2023-06-18 16:13

pySCENIC单细胞转录因子分析更新：数据库、软件更新

***pySCENIC全部往期精彩系列：1、PySCENIC（一）：python版单细胞转录组转录因子分析2、PySCENIC（二）：pyscenic单细胞转录组转录因子分析3、PySCENIC（三）：

TS的美梦·2023-06-17 20:24

如何将Seurat聚类结果导入到Loupe Browser

而Seurat作为使用最广泛的单细胞转录组分析软件，可以对数据进行各种质控以及下游分析。然而其官方可视化软件LoupeBrowser对于没有R语言基础的老师来说，是十分方便的分析工具。

生信阿拉丁·2023-06-17 05:56

MultiQC软件安装运行的过程

1.MultiQC介绍不少生信工具都可以给样品生成一个评估结果，如FastQC、Qualimap和RSeQC等(39个转录组分析工具，120种组合评估)。

千万英里·2023-06-16 21:06

VirSorter2识别病毒序列

从宏基因/转录组数据中识别病毒信号缺少1.广谱基因marker2.数据库代表3.有效工具。但VirSorter2很OK。

小白菜学生信·2023-06-16 17:51

CheckV评估病毒序列

checkv评估meta组装病毒基因组的完整性杂志：NatureBiotechnology时间：2020CheckV通过将序列与完整病毒基因组的大型数据库进行比较来估计完整性，其中包括从公开可用的宏基因组、宏转录组和宏病毒组的系统搜索中确定的

小白菜学生信·2023-06-16 17:18

10X单细胞和空间联合分析的方法---cell2location

10X空间转录组和单细胞转录组都在如火如荼的进行当中，单细胞提供了单个细胞的精度来研究组织，而空间转录组则是提供了细胞类型在组织中的具体位置，精度和空间位置几乎具有同等的研究价值，而两种技术上的联合分析正是优势互补的选择

Evil_Genius·2023-06-16 14:53

whisper 语音识别AI 声音To文字

1、Whisper支持语音转录和翻译两项功能并接受各种语音格式，模型中、英、法、德、意、日等主流语言上取得85%以上的准确率，完全符合工业准确率标准，未来有望打开商业化空间；2、Whisper模型根据参数量和语言不同

绀目澄清·2023-06-16 10:23

Whisper OpenAI开源语音识别模型

除了可以用于语音识别，Whisper还能实现多种语言的转录，以及将这些语

Sanfor·2023-06-16 10:53

pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2)：python版分析及可视化

****pySCENIC全部往期精彩系列：1、PySCENIC（一）：python版单细胞转录组转录因子分析2、PySCENIC（二）：pyscenic单细胞转录组转录因子分析3、PySCENIC（三）

TS的美梦·2023-06-15 20:14

UCell:单细胞评分分析R包及可视化应用

****单细胞评分我们之前说过AUCell和seurat自带的打分函数：跟着Cell学单细胞转录组分析(十一):单细胞基因评分|AUCell评分我们之前讲过单细胞评分，一个是Seurat自带的打分函AddModuleScore

TS的美梦·2023-06-15 20:14

跟着Cell学单细胞转录组分析(六):细胞比例计算及可视化

今天接着单细胞文章的内容：从Cell学单细胞转录组分析(一):开端！！！

TS的美梦·2023-06-15 20:13

使用OpenAI的Whisper 模型进行语音识别

而我们最常见的就是语音转录，语音转录可以语音转换为文字记录或字幕。wav2vec2、Conformer和Hubert等最先进模型

javastart·2023-06-15 18:22

非因解读 | DSP空间转录组+单细胞核测序揭示新辅助疗法后胰腺癌样本中多重区域功能的变化

DSP空间转录组+单细胞核测序揭示新辅助疗法后胰腺癌样本中多重区域功能的变化胰腺导管腺癌（PDAC）作为最为常见的胰腺癌病理亚型，近年来发病率逐步上升，预计到2030年，会成为美国癌症相关死亡的第二大原因

FynnBio·2023-06-15 18:57

Motif分析百宝箱（一）

模体（Motif）是指序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有的一小段序列模式；与转录因子、组蛋白等结合。

生信阿拉丁·2023-06-15 15:56

干货第一弹！多组学联合分析之代谢组FAQ

通过LC-MS/GC-MS评估生物体或细胞产生的代谢产物的水平以及变化，可以进一步研究这些代谢产物与转录组学差异基因或微生物的关系。在这个系统生物学和功能

SHANGHAILINGEN·2023-06-15 13:23

芯周刊·第2期 | 单细胞&空间转录组测序文献速览导读

本文利用单细胞转录组对四种iPSC细胞不同诱导方法生成的类器官进行了研

SBC生物芯片·2023-06-15 10:17

limma/voom，edgeR，DESeq2分析注意事项，差异分析表达矩阵与分组信息

给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战，所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题，上一期：箱线图的生物学含义这一讲我们来说一下limma/voom，edgeR，DESeq2，转录组差异分析的三大R包!

无香真水_1c6c·2023-06-14 19:43

植物启动子分析网站PlantPAN3.0-不可或缺的基因表达调控数据库！

今天给大家介绍一个植物启动子分析浏览数据库：PlantPAN3.0，该数据库不仅可以对植物启动子中关键顺式和反式调控元件进行预测，而且还可重建转录因子-靶点之间网络调控关系，是植物研究不可或缺的数据库资源

组学大讲堂·2023-06-14 13:53

10X单细胞（10X空间转录组）TCR数据分析之TCRdist(2)

hello,大家好，我们继续我们的TCR数据分析，这一专题会有非常多的内容，我们慢慢分享，文献在QuantifiablepredictivefeaturesdefineepitopespecificTcellreceptorrepertoires，影响因子49（nature）。今天我们的任务还是要多学习一些基础的概念和算法。TCRsfromTcellsthatrecognizethesamepMH

Evil_Genius·2023-06-13 21:23

GPT-4的20个起飞的姿势

.社交媒体营销机构5.使用聊天GPT创建课程6.开始按需打印商店7.AI个人助理8.AI自媒体助手9.客户服务聊天机器人10.财务规划应用程序11.健康与保健应用程序12.娱乐应用13.数字副本14.转录应用程序

AI研究院·2023-06-13 09:24

2020-04-02生信工具网站MyBiosoftware

工具有26页之多，还在不断更新，分类从基因组、转录组到蛋白质组......五花八门！出名的，不出名的.......琳琅满目！

iColors·2023-06-13 06:37

综述：染色质调控区域分析：ChIP-seq和ATAC-seq发展的见解

表观基因组测序技术，如染色质免疫共沉淀测序(CHIP-seq)和转座酶开放染色质高通量测序(ATAC-seq)，使我们能够通过检测特定的染色质状态及其相应的转录因子，在时间和空间维度上剖析细胞和组织的基因组调控格局

笺牒九州的怪咖·2023-06-13 03:30

技术方法-全长转录组_Nature Communication

安哥生个信·2023-06-12 22:29

Linux系统安装conda，镜像设置，环境变量

首先得有个服务器的账号，这个要看自己的学校里面有没有专门做生信的课题组问问，或者去淘宝买，或者去那个组学大讲堂公众号里面有服务器租借的（没广告），租个好点的服务器，价格估计5000-10000半年不等的价格，能处理一些转录组等大数据

啊辉的科研·2023-06-12 18:22

3.转录组 | 富集分析（clusterProfiler）

基因富集分析(genesetenrichmentanalysis)：在一组基因或蛋白中找到过表达的基因或蛋白。常用的注释数据库：①GO(TheGeneOntologyConsortium):描述基因的层级关系②KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)：提供pathway的数据库富集分析的方法：①ORA(over-repressentationanalysis

pomela·2023-06-12 09:41

【开源工具】使用Whisper将提取视频、语音的字幕

Assets\WhisperDesktop.zip[^2]2、加载模型2.1下载模型2.1.1进入HuggingFace[^3]的仓库2.1.2选择需要下载的模型2.1.3配置模型路径3、语音转字幕4、实时语言转录功能二

少莫千华·2023-06-12 07:12

单细胞数据资源 | Nature子刊：『中性粒细胞』稳态和炎症状态下的单细胞发育和异质性图谱

北京大学生命科学学院等机构的研究人员在《NatureImmunology》发表了其最新研究成果，利用scRNA-seq技术系统性地描绘了中性粒细胞在稳态和炎症状态下成熟、分化和命运决定过程中的异质性群体和转录组动态变化

尐尐呅·2023-06-11 16:51

推荐频道

转录