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HMM
生信步骤|MAFFT结合
HMM
ER进行多序列比对和基于隐马模型的基因搜索
蛋白质都是由相似的小型结构域组成的。如果我们有若干个已知的蛋白序列,那我们就可以根据这些蛋白序列比较其含有的保守域,寻找在蛋白数据库中上是否也有一样保守域的蛋白。而后根据统计学模型,将显著性较高的蛋白序列预测为同一类基因家族蛋白。随着蛋白质数据库的日趋完善,使用蛋白质结构域进行序列比对相比起传统的序列全长比对更具优势。对于每个蛋白质家族,通常有数千个已知的同源蛋白可以比对成较深的多重序列。序列比对
学术程稻属
·
2022-11-20 11:31
生信步骤
bash
开发语言
学习笔记——详解马尔可夫,马尔可夫链,马尔可夫模型,隐马
目录(一),马尔可夫(Markov)综述1.1,随机过程是啥玩意儿1.2.马尔可夫链(MarkovChain)又是什么鬼1.3一个经典的马尔科夫链实例(二),隐马尔可夫
HMM
2.1马尔可夫引言2.2下边是隐马尔可夫
小樊努力努力再努力
·
2022-11-20 10:45
python
自然语言处理
机器学习
分类
隐马尔可夫模型学习笔记(一)
其主要是应用时序数据建模,比如语音识别、自然语言处理等要理解隐马尔可夫首先需要梳理几个步骤:1.如何理解概念2.什么叫转移概率矩阵和生成概率矩阵3.模型公式5.公式的求解过程6.python代码串接一、如何理解概念
HMM
陆撄宁
·
2022-11-20 10:42
NLP系列
机器学习
算法
自然语言处理
马尔可夫链
当然这么说可能有些武断,但是这样做可以大大简化模型的复杂度,因此马尔科夫链在很多时间序列模型中得到广泛的应用,比如循环神经网络RNN,隐式马尔科夫模型
HMM
等,当然MCMC也需要它。2.马尔
m0_65726092
·
2022-11-20 06:45
python
(ISCSLP 16)End-to-end keywords spotting based on connectionist temporal classification for Mandarin
End-to-endkeywordsspottingbasedonconnectionisttemporalclassificationforMandarin作者:YeBai;JiangyanYi;HaoNi;ZhengqiWen;BinLiu;YaLi;JianhuaTaoAbstract传统的基于DNN-
HMM
IMU_Pandade
·
2022-11-20 04:46
条件随机场(CRF)——1 理论详解
需要的基础:马尔科夫模型隐马尔科夫模型本文仔细介绍条件场的提出及基础;下一文会介绍CRF如何应用在NER领域,以及CRF,LR和
HMM
之间的关系和比较。
Weiyaner
·
2022-11-20 03:58
数学理论
自然语言处理
知识图谱
人工智能
自然语言处理
hw-2 李宏毅2022年作业2 phoneme识别 单strong-
hmm
详细解释。
目录系列文章前言:项目:一:数据:二:模型三:训练和评估四:main函数和训练过程五后处理。系列文章2022李宏毅作业hw1—新冠阳性人员数量预测。_亮子李的博客-CSDN博客目录系列文章前言:作业二真的很难。而且会出现训练集没办法过拟合的情况也就是训练集准确度没办法到百分之百数据太多了。向实验室申请了一台服务器来跑这个作业,最后在kaggle上pub达到了strongpri没有哭了试了好久都不太
亮子李
·
2022-11-19 15:28
李宏毅2022作业专题
网络
神经网络
深度学习
语音识别
人工智能
初学NLPday2笔记部分
自动摘要2.指代消解小明放学了,妈妈去接他,小明(他)3.机器翻译小心地滑翻译成:slidecarefully4.词性标注5.分词(中文、日文等)6.主题识别topicmodelBAT7.文本分类处理方法:
HMM
WJY991202
·
2022-11-19 08:34
深度学习
自然语言处理
kaldi中FST的可视化-以yesno为例
4个fst分别是H.fst、C.fst、L.fst和G.fst,分别是
HMM
模型、上下文环境、词典和语言模型对应的fst。HCLG=asl(mi
shzyiwai
·
2022-11-19 04:39
算法
计算机技术
kaldi
fst
可视化
yesno
mmsegmentation安装
readme20201115装mmseg和mmdet自从把需要build的ops放到mmcv-full里面后,install变的相当容易和快速install记住先想好torc
hmm
cv的版本,torch1.6
carry_hjr
·
2022-11-19 02:09
软件安装配置系列
HMM
和MEMM+CRF序列标注学习笔记
隐马尔可夫目标知道什么是自动机知道什么是马尔可夫链知道隐马尔可夫是什么知道隐马尔可夫的原理是什么知道如何使用隐马尔可夫完成分词,词性标注等任务知道MEMM是什么知道CRF是什么1.自动机自动机:(又称为有限自动机,有限状态自动机,FSA)是表示有限个状态以及在这些状态之间的转移和动作等行为的数学模型。例如:我们常用的正则表达式就是一种用来描述字符串出现字符的自动机。假如我们有正则表达式:baa+!
程哥哥吖
·
2022-11-17 20:36
NLP自然语言处理
数据挖掘
序列标注
HMM+CRF
数据挖掘
NLP
机器学习-概率图模型:隐马尔可夫模型(
HMM
)【解决序列问题】【前提假设:隐层状态序列符合马尔可夫性、观测序列的各观测值相互独立】【被RNN等神经网络模型取代】【生成模型:对联合概率建模】
一、概述隐马尔科夫模型(HiddenMarkovModel,以下简称
HMM
)是比较经典的机器学习模型了,
HMM
是解决序列(时间序列、状态序列)问题的模型。
u013250861
·
2022-11-17 13:40
#
ML/经典模型
人工智能
机器学习
自然语言处理
隐马尔可夫模型
HMM
隐马尔可夫模型python_隐马尔可夫模型
HMM
及Python实现
在调用分词函数时就采用的隐马尔可夫模型
HMM
原理来进行切词。具体原理解释介绍如下:1隐马尔可夫模型定义隐马尔可夫
欧希笛坦
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2022-11-16 08:15
隐马尔可夫模型python
条件随机场 python_【归纳综述】马尔可夫、隐马尔可夫
HMM
、条件随机场 CRF 全解析及其python实现...
PRStructuredⅢ:马尔可夫、隐马尔可夫
HMM
、条件随机场CRF全解析及其python实现Content归纳性长文,不断更新中...欢迎关注收藏本章承接概率图知识马尔可夫不仅是强化学习在时序决策上的理论基础
weixin_39678103
·
2022-11-16 08:45
条件随机场
python
Scala 获取时间,时间戳,时间差
经常遇到处理时间与获取当前时间,记录一下:1.获取时间1)获取当前时间dateFormat规定好想要的数据格式常用的对应如下:格式yyyyMMddH
Hmm
ss对应年月日小时分钟秒编程中常用的:常用模式yyyyMMddyyyy-MM-ddH
Hmm
ssHH-mm-ssvaldateFormat
BIT_666
·
2022-11-15 09:58
Scala
scala
时间戳
时间差
机器学习极简入门笔记-4-有监督学习进阶-
HMM
目录15.1基本概念概率模型生成模型与判别模型概率图模型马尔可夫链,马尔可夫随机场和CRF15.2数学中的
HMM
HMM
的两个基本假设15.3
HMM
的三个基本问题概率计算问题预测问题学习问题15.4
HMM
3
南鸢北折
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2022-11-15 09:29
ML极简入门读书笔记
学习
AI大语音(八)——GMM-
HMM
声学模型(深度解析)
本文来自公众号“AI大道理”。这里既有AI,又有生活大道理,无数渺小的思考填满了一生。基于GMM的0-9孤立词识别系统以词为训练单位,添加新词汇需要重新进行训练,若要涵盖所以词,差不多6万个词,训练量极大,预测时也要计算6万个模型的似然,哪个大预测出哪个,在实际应用中有局限性,只能应用于小词汇量场合。孤立词识别系统识别了0-9的数字的英文单词,但是假如有人用英文报电话号码,是识别不了整个号码的,甚
AI大道理
·
2022-11-13 17:35
语音识别(ASR)
人工智能
语音识别
[Unity]OCR识别--OpenCV篇
在Unity使用OCR技术大致会写三篇吧,主要是介绍一下OpenCV、例子里的OCR
HMM
Decoder和Tesseract。心急的同学可以直接跳过前两篇,直接看Tesseract。
PangCoder
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2022-11-12 15:42
Unity
unity
opencv
游戏引擎
机器学习笔记之条件随机场(三)MEMM的标注偏置问题
机器学习笔记之条件随机场——MEMM的标注偏置问题引言回顾:最大熵马尔可夫模型最大熵马尔可夫模型的优点最大熵马尔可夫模型的缺陷标注偏置问题标注偏置问题示例引言上一节介绍了隐马尔可夫模型(HiddenMarkovModel,
HMM
静静的喝酒
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2022-11-10 13:06
机器学习
算法
MEMM
标注偏置问题
隐马尔可夫模型:
hmm
learn库的使用
hmm
learn库的使用安装和使用
hmm
learn一共实现了三种
HMM
模型类,按照数据的观测状态是离散的还是连续的可以划分为两类。
Starry memory
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2022-11-10 07:27
人工智能
自然语言处理
人工智能
算法
机器学习笔记之隐马尔可夫模型(二)背景介绍
动态概率图模型隐马尔可夫模型场景介绍隐马尔可夫模型的特殊性质齐次马尔可夫假设观测独立性假设隐马尔可夫模型需要解决的任务引言上一节对整个概率模型的划分进行了阶段性介绍,本节将系统介绍隐马尔可夫模型(HiddenMarkovModel,
HMM
静静的喝酒
·
2022-11-09 13:06
机器学习
机器学习
隐马尔可夫模型
观测独立性假设
齐次马尔可夫假设
Decoding问题
机器学习NLP领域入门
-知乎Ⅰ.统计机器学习一、
HMM
隐含马尔科夫模型在NLP领域,
HMM
用来解决文本序列标注问题.如分词,词性标注,命名实体识别都可以看作是序列标注问题。
noobiee
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2022-11-08 13:42
机器学习
自然语言处理
机器学习
人工智能
【自然语言处理】一篇文章入门分词(Tokenization)
HMM
-------->True表示采用
HMM
(隐马尔可夫模型)。默认不使用。
samarua
·
2022-11-07 23:01
#
NLP
自然语言处理
python
自然语言处理
NLP
机器学习
图像算法五 —— EM算法
EM算法是最常见的隐变量估计方法,在机器学习中有极广泛的用途,例如常被用用来学习:高斯混合模型(GMM)的参数;隐式马尔科夫算法(
HMM
);
L☆★
·
2022-11-07 17:46
#
图像算法
算法
机器学习
概率论
机器学习算法 09 —— EM算法(马尔科夫算法
HMM
前置学习,EM用硬币案例进行说明)
文章目录系列文章EM算法1初识EM算法2EM算法介绍2.1最大似然估计2.2EM算法实例描述2.3EM算法流程3EM算法实例3.1一个简单案例3.2加入隐变量z后的求解3.3EM初级版3.4EM进阶版系列文章机器学习算法01——K-近邻算法(数据集划分、归一化、标准化)机器学习算法02——线性回归算法(正规方程、梯度下降、模型保存)机器学习算法03——逻辑回归算法(精确率和召回率、ROC曲线和AU
来一碗锅巴洋芋
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2022-11-07 17:15
机器学习
机器学习
EM算法
隐马尔可夫模型
HMM
推导
隐马尔可夫模型
HMM
推导机器学习-白板推导系列(十四)-隐马尔可夫模型
HMM
(HiddenMarkovModel)课程笔记背景介绍介绍一下频率派和贝叶斯派两大流派发展出的建模方式。
Adenialzz
·
2022-11-04 06:09
机器学习
机器学习
算法
NER系列之 《各类NER经典模型:
HMM
, Bi-LSTM, CRF, BERT, NEZHA, GlobalPointer》代码实现
NER-Model也欢迎各位帮项目仓库点个星星⭐⭐(每多10颗星,更新一个经典新模型)记录经典NER模型,目前仓库包含如下模型代码:【以下模型已在一些NER相关竞赛中测试过,没有错误,可以使用】⭐1.
HMM
#苦行僧
·
2022-11-04 06:08
NLP
NER
命名体识别
NLP
深度学习
人工智能
李航《统计学习方法》第2版 第10章
HMM
课后习题答案
HMM
这一章比较简单,把原理弄熟,看着公式,用numpy实现很简单。
#苦行僧
·
2022-11-04 06:37
李航统计学习课后解答
机器学习
统计学
用机器学习识别不断变化的股市状况—隐马尔可夫模型(
HMM
)股票指数预测实战
全文链接:http://tecdat.cn/?p=1557原文出处:拓端数据部落公众号相关视频:马尔可夫链原理可视化解释与R语言区制转换Markovregimeswitching实例马尔可夫链原理可视化解释与R语言区制转换Markovregimeswitching实例,时长07:25相关视频:马尔可夫链蒙特卡罗方法MCMC原理与R语言实现|数据分享马尔可夫链蒙特卡罗方法MCMC原理与R语言实现,时
拓端研究室TRL
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2022-11-03 18:11
拓端
拓端tecdat
拓端数据
python
人工智能
算法
Chapter1-4_Speech_Recognition(
HMM
)
文章目录1
HMM
用在哪里2
HMM
的state3改造成DNN3.1Tandem3.2DNN-
HMM
Hybrid本文为李弘毅老师【SpeechRecognition-
HMM
(optional)】的课程笔记,
zjuPeco
·
2022-10-28 05:36
课程笔记
自然语言处理
神经网络
深度学习
李弘毅
Chapter1-6_Speech_Recognition(RNN-T Training)
文章索引:上篇-1-5Alignmentof
HMM
,CTC
zjuPeco
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2022-10-28 05:36
课程笔记
自然语言处理
神经网络
深度学习
李弘毅
【微信小程序 | 实战开发】实现ES6转ES5开关
个人名片:作者简介:一名大二在校生,喜欢编程❄️个人主页:小新爱学习.个人WeChat:
hmm
wx53️系列专栏:️零基础学Java——小白入门必备重识C语言——复习回顾计算机网络体系———深度详讲微信小程序开发
小新爱学习.
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2022-10-27 13:01
微信小程序开发
微信小程序
es6
前端
EM算法系列--原理
本系列通过如下两部分来讲解EM算法:1.EM算法的原理2.EM算法实际应用--
HMM
EM算法原理EM算法全称是最大期望算法(Expectation-Maximizationalgorithm,EM),是一类通过迭代进行极大似然估计
yeqiustu
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2022-10-26 07:57
机器学习#EM
机器学习
算法
em
【周志华机器学习】十四、概率图模型
文章目录参考资料1.基本概念2.隐马尔可夫模型(
HMM
)2.1隐马尔可夫三大问题1.第一个问题解法2.第二个问题解法3.第三个问题解法3.马尔可夫随机场(MRF)3.1MRF性质3.2势函数4.条件随机场
CHH3213
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2022-10-25 19:55
机器学习
机器学习
人工智能
机器学习:EM算法
它是一个基础算法,是很多机器学习领域算法的基础,比如隐式马尔科夫算法(
HMM
)等等。
GeniusAng丶
·
2022-10-25 09:05
机器学习
1024程序员节
EM算法
机器学习
人工智能
概率论
机器学习学习笔记-西瓜书
西瓜书笔记文章目录模型评估和选择线性模型决策树神经网络支持向量机贝叶斯分类集成学习聚类性能度量与距离计算原型聚类密度聚类层次聚类降维与度量学习特征选择与稀疏学习计算学习理论半监督学习半监督学习的方法概率图模型规则学习强化学习误差函数卷积池化后的图像大小计算集成学习评估特征的重要性L0,L1和L2范数BNbatchnormalizationEM(最大期望)算法,
HMM
龙海L
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2022-10-24 18:17
机器学习
python
算法
算法
python
GAN网络:JS散度与Wasserstein距离
2.4KL散度(相对熵)2.5JS散度2.6Wasserstein距离1生成模型与判别模型的区别生成模型:对数据的联合分布建模,从统计角度表示数据分布与数据生成方式,收敛速度快常见生成模型有:隐马尔可夫模型
HMM
wamg潇潇
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2022-10-22 07:43
深度学习
2022李宏毅作业hw4 - 挫败感十足的一次作业。
_亮子李的博客-CSDN博客_李宏毅hw1hw-2李宏毅2022年作业2phoneme识别单strong-
hmm
详细解释。
亮子李
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2022-10-19 19:40
李宏毅2022作业专题
python
深度学习
开发语言
从决策树学习谈到贝叶斯分类算法、EM、
HMM
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>>引言最近在面试中,除了基础&算法&项目之外,经常被问到或被要求介绍和描述下自己所知道的几种分类或聚类算法(当然,这完全不代表你将来的面试中会遇到此类问题,只是因为我的简历上写了句:熟悉常见的聚类&分类算法而已),而我向来恨对一个东西只知其皮毛而不得深入,故写一个有关数据挖掘十大算法的系列文章以作为自己备试之用,甚至以备将来常常回顾思考。行文杂乱
weixin_34402090
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2022-10-13 14:52
人工智能
面试
java
一文教会你用正则表达式校验日期时间格式
目录日期部分校验概念验证YYYY年份:验证MMDD月日:时间部分校验校验H
Hmm
ss校验HH-mm-ss校验日期+时间部分校验yyyyMMddH
Hmm
ss校验yyyy-MM-ddHH:mm:ss应用举例总结日期部分校验概念首先
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2022-10-12 23:48
自然语言处理(NLP)学习笔记——
HMM
与CRF模型
一、
HMM
模型1、
HMM
模型的输入和输出
HMM
(HiddenMarkovModel),中文称作隐含马尔可夫模型,因俄国数学家马尔可夫而得名。它一般以文本序列数据为输入,以该序列对应得隐含序列为输出。
池佳齐
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2022-10-10 16:39
NLP
知识图谱
自然语言处理
人工智能
nlp
知识图谱
NER文献溯源-v2核心技术方法
目录1资源:2解码算法:1.HiddenMarkovModels(
HMM
)2.DecisionTrees(S.Sekine1998)——决策树3.MaximumEntropyModels(ME)4.SupportVectorMachines
做好当下,一切随缘吧
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2022-10-06 07:49
NER_named
entity
recogition
论文记录
机器学习
决策树
python
windos启动nginx和关闭nginx
方法二3.重启nginx4.其他命令1)查看nginx版本0.开启nginx在nginx所在的根目录打开dos窗口D:\Code\itheimaCode\classCode\ElasticSreach\
hmM
all
森高派
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2022-10-01 07:54
常用笔记
中间件
nginx
服务器
运维
【微信小程序 | 实战开发】配置微信小程序APPID并快速接入
个人名片:作者简介:一名大一在校生❄️个人主页:小新爱学习.个人WeChat:
hmm
wx53️系列专栏:零基础学java-----重识c语言----计算机网络每日一句:苦尽甘来的那一刻,山河星月都做贺礼
小新爱学习.
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2022-09-25 21:56
微信小程序开发
微信小程序
小程序
微信
自然语言处理——序列模型
HMM
隐马尔可夫模型马尔可夫性是指当前状态t只和前一状态t-1相关(一阶),和之前t-2之前的就不相关,这个也算是n-gram语言模型吧,都是为了控制模型复杂度(一方面模型过于复杂,数据集不够会导致模型达不到收敛
leeber_94
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2022-09-25 07:27
自然语言处理
机器学习
算法
机器学习
【微信小程序 | 实战开发】开发环境、测试环境和生产环境
个人名片:作者简介:一名大一在校生❄️个人主页:小新爱学习.个人WeChat:
hmm
wx53️系列专栏:零基础学java-----重识c语言----计算机网络每日一句:唯有热爱,可抵岁月漫长唯有热爱不畏惧世间无常文章目录运行环境开发环境
小新爱学习.
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2022-09-22 11:05
微信小程序开发
微信小程序
小程序
ECCV-2020- Ocean: Object-aware Anchor-free Tracking 阅读笔记
论文地址:https://arxiv.org/pdf/2006.10721.pdf代码地址:https://github.com/researc
hmm
/TracKit目录一、动机二、主要贡献三、主要内容算法整体架构
菜菜子hoho
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2022-09-04 07:37
目标跟踪之孪生网络文献阅读
计算机视觉
深度学习
人工智能
目标跟踪
什么是泛型?Java基础之泛型详细知识点总结
个人名片:作者简介:一名大一在校生❄️个人主页:小新爱学习.个人WeChat:
hmm
wx53️系列专栏:零基础学java-----重识c语言----计算机网络每日一句:没有太晚的开始,只有过早的放弃前言
小新爱学习.
·
2022-08-26 17:40
零基础学java
java
面试
jvm
【进阶版】 机器学习之隐马尔可夫模型、条件随机场、LDA话题模型(21)
机器学习配套资源推送进阶版机器学习文章更新~点击下方下载高清版学习知识图册概率图模型隐马尔可夫模型(
HMM
)
HMM
评估问题
HMM
解码问题
HMM
学习问题马尔可夫随机场(MRF)条件随机场(CRF)学习与推断变量消去信念传播
王小王-123
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2022-08-25 07:32
机器学习
人工智能
隐马尔可夫
条件随机
LDA
第二十天自然语言处理之传统技术
目录二、传统NLP处理技术1.中文分词1)正向最大匹配法2)逆向最大匹配法3)双向最大匹配法2.词性标注1)什么是词性标注2)词性标注的原理3)词性标注规范4)经典序列模型:
HMM
5)Jieba库词性标注
呆呆网友
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2022-08-24 09:59
人工智能系列课程
自然语言处理
python
人工智能
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