MAF

《耐力：无伤.燃脂.轻松的MAF训练法》

读书进度第15章，第332页从20岁开始，包括最大摄氧量.最大心率.肺活量.肌肉总量和力量在内的人体生理指标就开始衰退。速度的下降与全面健康状况关系密切，尤其是与有氧运动能力相关。随着这些与年龄有关的变化的出现，人体的脂肪含量开始提升。①如何减掉超标的脂肪简单来说，就是在心率监测仪的帮助下建立有氧基础，进而燃烧多余的脂肪②体脂超标的危害体内存储的脂肪可以产生导致人体发炎的化学物质，对于伤病的康复与
雪天使9797·2024-02-07 16:51

GenVisR包：突变类型不在waterfall函数指定范围？

在学习该包的使用时，发现网上有许多不错的介绍该包用法的博文，已经详细介绍了基因突变瀑布图绘制的详细参数，但是大多都是基于该函数中作者定义的MAF/MGI格式进行讲解：MAF/MGIformat所以突变的类型仅限于表格中展示的
jlyq617·2024-02-06 12:09

.NETCORE 开发登录接口MFA谷歌多因子身份验证

1.maf帮助类publicclassGoogleAuthenticator{privatereadonlystaticDateTime_epoch=newDateTime(1970,1,1,0,0,0
行走的生活·2024-01-31 07:50

vcf文件转换为maf格式

假设已经安装了VEP软件，对自己的vcf进行了注释，然后就可以进行转换：https://github.com/mskcc/vcf2maf安装GitHub上面的小工具cd~/biosoft/vcf2maf
Dr家硕的科研之路·2024-01-26 19:13

maftools包分析突变数据，绘制瀑布图

前面给大家介绍了MAF文件格式☞MAF格式（mutationannotationformat）以及如何从TCGA数据库下载MAF格式的突变数据。
生信交流平台·2024-01-12 01:37

264 今日总结➕明日计划

今日总结英语英语语法复习完毕做了一小节长难句分析力学主要是对机械能守恒的利用1.绳子绕过定滑轮，一侧挂着重物，一侧用力F拉着绳使其沿水平方向以恒定速度V0运动，求F下的功率P=Fds/dt=FV力沿着绳的方向，把V0在绳上作投影F=T对物体T-mg=maF
原是北方姑娘·2024-01-03 03:16

11.2 GWAS流程学习

plink和structure：1、在snp-calling后得到vcf文件2、基因型填充：https://www.jianshu.com/p/dafd1e6e4a98使用beagle3、数据质量控制MAF-geno-mind4
KK_f2d5·2024-01-02 17:39

Multiz 使用陷阱

REF:https://www.biochen.org/cn/blog/axtToMaf处最终命名为maf/${TARGET_GENOME}.
杨康chin·2023-12-28 18:39

人类的耳朵：听觉的动态范围

另一类是最小可听场（MAF），是声场中双耳通过扬声器得到的
听觉健康科普·2023-12-21 06:20

新版TCGA的突变SNP数据下载和整理

今天继续学习如何使用TCGAbiolinks下载和整理MAF格式的突变数据。
医学和生信笔记·2023-12-16 17:57

单行命令

geno）后样本(mind)SNP缺失率多少用不了-CSDN1.缺失率--geno0.05删除基因型缺失率大于5%的SNPs，大于95%的个体都具有的变异位点才保留就是缺失，没测出来2.最小等位基因频率--maf0.01
琴酒martini·2023-12-06 19:52

电机伺服驱动学习笔记（3）电机参数选型

转矩与负载转动惯量折算转矩折算负载惯量折算二、电机参数1.额定转矩2.额定转速3.额定功率4.电机惯量[^2][^3]参考文献电机拖动的基本方程式，电机参数（含电机惯量选择方法）一、电机拖动基本方程式1.转矩方程直线运动时有牛顿第二定律F=maF
北海不咸鱼·2023-11-28 15:55

李斌0302耐力读书笔记||Follow心跳去跑步，MAF耐力训练法

图片发自AppMAF是MaximumAerobicFunction（最大有氧能力耐力训练法）的简称，旨在依循每个人的年龄和体质而设定的有氧心率进行耐力训练。此法是由著名耐力运动教练菲尔马佛东博士（Dr.PhilMaffetone）创立并推广的，该训练模式已被许多知名的马拉松好手、三铁选手所采用。Maffetone博士是《耐力训练和参赛圣经》一书的作者，他的书中，没有训练课表，也没有饮食卡路里图表，
学霸教练李斌·2023-11-22 14:10

《耐力：无伤.燃脂.轻松的MAF训练法》

读书进度第13章第298页①膳食脂肪膳食脂肪的基本组成叫做脂肪酸，它的相对平衡是保持最佳健康和耐力状况的关键耐力远手中最常见的损伤都与疼痛，骨质流失，以及肌肉.关节.韧.带和肌腱的炎症相关，很多还会涉及过敏和哮喘，都与膳食脂肪中某些特定脂肪酸的不平衡有关②一个有关脂肪的谎言很多时候，我们总是觉得脂肪是日常饮食中“坏的东西，事实上，脂肪是我们饮食中最重要的有益物质之一健康脂肪是那些天然存在的脂肪（像
雪天使9797·2023-11-19 14:08

13 对发生拷贝数变异的基因进行 KEGG 注释

我们同样用VEP注释后的maf文件，然后取出需要用到的几列rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)library(dplyr)library(stringr)#读入数据
正在输入中…………·2023-11-16 11:28

使用pixy计算群体遗传学统计量

1数据过滤过滤参数：过滤掉次等位基因频率（minorallelefrequency，MAF）低于0.05、哈达-温伯格平衡（Hardy–Weinbergequilibrium，HWE）对应的P值低于1e
Odd_guy·2023-11-15 22:41

加州大学提出MAF多反馈框架

作者|谢年年最近，多篇文章《GPT-4的推理能力非常有限，有两篇论文为证》、《DeepMind：无法自我纠正推理，除非提前得知正确答案》指出大模型在推理任务中似乎没有自我改进的能力。即在无任何外部反馈的情况下无法通过自我纠正的形式来改进输出，除非LLM在自我纠正的过程中已经知道了正确答案。大模型研究测试传送门GPT-4传送门（免墙，可直接测试，遇浏览器警告点高级/继续访问即可）：http://hu
夕小瑶·2023-11-05 23:21

用maftools一行代码画出瀑布图

library(maftools)laml.maf<-system.file("extdata","tcga_laml.
gtt儿_生物信息学习·2023-11-02 16:22

4. 标记的开发和分型

按等位基因频率过滤：通常去除第二等位基因频率（MAF）小于5%的位点，样本量较大的群体中可以降到1%。多等位位点的过滤：这个过滤是因为多数软件（群体结构、关联分析等）只接受二等位位点。
Wei_Sun·2023-10-25 15:42

四种常用的meterpreter木马后门

小提示：maf即是metasploit，venom即是病毒如果不知道msfvenom怎么用，可以msfvenom-h查看，四种生成后门的命令：windows可执行程序后门：msfvenom-pwindows
孤独的一颗星·2023-10-20 12:09

单个vcf文件转maf文件，单样本maf合并成多样本maf文件

本文章旨在解决两个问题，一，vcf转maf过程；二，单样本maf如何合并成多样本maf，并输入maftools进行作图。在网上看教程，提到细节的很少。
拔了一颗牙·2023-10-10 18:14

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：CNV的可视化

上篇文章《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变的数据分析》介绍了使用maftools分析MAF格式的突变数据，但maftools本身功能不限于此，它也可以针对拷贝数变异进行一些分析。
Seurat_Satija·2023-10-02 01:19

根据GWAS数据估算样本量N和使用千人基因组填充maf的参考文献

https://github.com/GenomicSEM/GenomicSEM/wiki/2.1-Calculating-Sum-of-Effective-Sample-Size-and-Preparing-GWAS-Summary-Statistics
帅锅不识字·2023-10-01 15:11

HaploView使用-OutofMemory

1分析结果1.1数据统计导入数据后自动计算位点的maf、缺失等信息，会汇总成统计表，可以导出，示例如下haploview-result-table统计结果中，标红的部分是未通过过滤的位点，系统会自动全选所有通过过滤的位点参与单倍型的计算
xiaoji_hb·2023-08-24 11:51

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求

Maftools简介Maftools是一款可以对MAF格式（MutationAnnotationFormat）的变异数据进行统计、分析和可视化的R包。
Seurat_Satija·2023-08-24 08:00

el-table数据更新了，但是展示并没有更新

$forceUpdate();进行强制更新法三：更改引用，创建一个新的数组或对象，替换旧的数组或对象，这将强制Vue更新视图//对于数组this.maf_version_list=[...this.maf_ver
ChangYan.·2023-08-19 16:38

el-row的@click.stop并没有阻止事件冒泡，还是会触发外层div的点击事件

可以通过给click加stop来阻止事件冒泡，如：@click.stop=“search_maf_version(version)”，但是发现给el-row加上@click.stop并没有生效，还是会触发外部的点击事件我的问题代码为
ChangYan.·2023-08-19 16:08

vue中数组使用push并不能动态更改页面展示，需要使用$set来实现

1.当没有这个属性，想要新增一个数组值//给this.maf_empty_version新增一个children值，children为数组this.
ChangYan.·2023-08-19 16:08

TCGA pan-cancer 分析

泛癌分析的基础数据可以从如下网站轻松下载：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/pancanatlas其中突变数据为.maf格式，可以采用R语言的
judyhappy·2023-08-07 07:30

DNA 3. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools

桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你81篇原创内容-->公众号前言随着癌症基因组学的进步，突变注释格式(MAF
桓峰基因·2023-07-21 00:56

2021-06-30 一些概念的记录

比如一个位点有AA或者AT或者TT，那么就可以计算A的基因频率和T的基因频率，qA+qT=1，这里谁比较小，谁就是最小等位基因频率，比如qA=0.3,qT=0.7，那么这个位点的MAF为0.3.之所以用这个过滤标准
小郑的学习笔记·2023-07-18 06:22

正则表达式截取

问题的话是从(AAA62&AAF30&KAG40&KAQ30|MAE30&MAF30&MAG30&PAA55&TBK10&VAFA1)&(BAH72&AAA10)中截取出AAA开头的一串解决代码的话是写了一个方法
Apollo_lm·2023-07-17 21:37

sql数据库框架

sqlserver数据库一、体系结构文件--服务--界面文件---.maf.ldf.ndf服务--MSSqlserver，别名（实例名）界面--宋庆龄serve如何windouws身份验证，如何从windows
diansuojian9479·2023-07-17 19:29

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图）

原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/G-0PtaoO6bYuhx_D_Rlrlw对于组学数据的分析和展示来说，maftools算是一个宝藏“R包”，可用于MAF格式的组学数据的汇总
生信补给站·2023-07-16 08:00

2019-01-06

vcftools--vcfmy.vcf--plink--outplinkplink--noweb--fileplink--geno0.1--maf0.05--hwe0.0001--make-bed--outoutforKin12345
対MS特技兵·2023-06-10 07:51

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据下载和可视化

数据下载和处理在TCGA官网下载TCGA-LUAD项目中mutect2输出的MAF格式的突变以及临床信息：$ls-lhrttotal50M-rw-r--r--1xiaofeixiaofei50MMay1422
Seurat_Satija·2023-04-18 17:23

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变的数据分析

这篇文章更详细介绍可以利用maftools对肿瘤MAF格式的突变数据做哪些分析。
Seurat_Satija·2023-04-15 11:46

maftools : WES外显子测序数据分析总结、分析、可视化-汇总分析

maftools_2clp02June,2020maftools:总结、分析、可视化MAF文件maftools:总结、分析、可视化MAF文件1简介随着肿瘤基因组学的发展，突变注释格式(MAF)正被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变异
Seurat_Satija·2023-04-07 15:55

DNA 2. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools

桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你80篇原创内容-->公众号前言随着癌症基因组学的进步，突变注释格式(MAF
桓峰基因·2023-04-06 01:56

物理学公式的英文含义解释

s:displacement（移位）v:velocity(速度)t:time（时间）牛顿第二定律:施加于物体的外力等于质量与加速度的乘积F=maF:force(力)m:mass（质量）a:acceleration
小盒子的技术分享·2023-03-23 09:02

snp数据PCA分析

1.质控和LD过滤1.1质控:删除信息缺失严重的个体和位点plink2--vcfzy_bsz-bi.vcf--mind0.10--maf0.05--geno0.05--hwe0.0001\--outzy_bsz_fi
铃_0d92·2023-03-21 11:24

哈哈哈

安装包【/i317xmb】安装包表情包【/i31fc4f】表情包音乐【/b579300/】音乐密码【密码☞8ng7】密码视频【/i332maf】视频下载方法【软件提供一个网址，然后按照网址进行下载，下载完成后会自行解压数据
自虐超强·2023-03-21 01:26

利用perl脚本统计标记的信息

输入数据格式为：输入文件示例利用该脚本，可以获得标记的等位信息、杂合率、MAF、缺失率及PIC值。perlstat_info_marker.plexample.txt#!
qujingtao·2023-03-14 20:52

VAF，MAF，肿瘤纯度，MCF，CCF的概念和计算方法 （转载）

VAF的概念和计算方法VAF的全称是VariantAlleleFrequency（变异等位基因频率）或VariantAlleleFraction（变异等位基因分数）。简单来说就是在基因组某个位点支持alternate/mutantallele的reads覆盖深度占这个位点总reads覆盖深度的比例。以VCF文件中的字段为例，其中DP代表TotalDepth，AD代表AlleleDepth，因此VA
是Billy呐~·2023-02-23 21:55

TCGA肿瘤突变负荷分析

TCGAsnp数据分析总结1下载突变数据现在case中选择肿瘤类型然后再files中选择突变数据，选择最后一个公司的数据进行下载下载cart文件，然后解压得到maf.gz文件，用于后续计算TMB2计算TMBTMB
医学小白学生信·2023-02-04 02:25

week2：Dissecting Cell Lineage Specification and Sex Fate Determination in Gonadal Somatic Cells U...

C1:代表早期前体细胞，来源于E10.5~E13.5的性腺体细胞，主要表达标志物Nr2f1，在XY的性腺早期前体细胞也表达C2:代表基质前体细胞，来源E13.5以后的性腺体细胞，主要表达基质细胞的标志物Maf
阿糖胞苷_SYSU·2023-02-03 12:54

训练日记 | 2019-06-18 周二（MAF11-1/12）

-01MAF180慢跑（11-1/12）-距离：6.49km时间：00:52:2712周标准MAF180慢跑，第11周第1次。膝盖还没有明显好转，配速再次直降30秒，最大有氧心率下降1点到50。
崔宏雷·2023-01-29 20:17

用GCTA计算亲缘关系矩阵和遗传力

$gcta--bfile1kg_EU_BMI--autosome--maf0.01--make-grm--out1kg_gcta--bfile，类似与plink，指定用于分析的基因型文件的名字。
紫霄zixiao·2022-12-25 16:52

MAF-YOLO: Multi-modal attention fusion based YOLO forpedestrian detection

MAF-YOLO:基于多模态注意力融合的行人检测YOLOABSTRACT实现自然环境中行人的快速准确检测是人工智能系统的重要应用。
yBooooo·2022-12-20 21:19

多旋翼无人机建模-牛顿欧拉法

首先来看线运动方程的建立过程：我们取地理坐标系为北东地(NED)，机体系为前右下：由牛顿第二定律有：F=maF=maF=ma即F=m[axayaz]F=m\left[\begin{array}{l}{a
Aromash·2022-12-17 21:00
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