蛋白组学

2021-6-24晨间日记

今天是什么日子起床：6.30就寝：11.00天气：阴心情：良好任务清单昨日完成的任务，最重要的三件事：实验写作运动周目标·完成进度跑出一样——0学习·信息·阅读《狂人日记》蛋白组学工作·思考如何做出好东西最美好的三件事
追光女孩一一·2024-01-27 18:58

尿液及其胞外囊泡蛋白组学发现前列腺癌诊断的潜在标志物

尿液作为常见的临床检测样本，不仅反映泌尿生殖系统组织的状态，也反映了机体整体生理状态。尿液中既含有分泌蛋白，也含有包裹在组织来源细胞外囊泡(EVs)中的多种蛋白，有作为疾病诊断生物标志物的作用潜能。近期，一篇“ProstateCancerReshapestheSecretedandExtracellularVesicleUrinaryProteomes”的研究文章，通过对190名男性(包括前列腺癌
华盈生物·2024-01-26 17:20

临床蛋白组综述 | 如何利用蛋白组学技术进行癌症临床研究？

肿瘤基因组和转录组的分析现在已经成为发现新生物标记物的工具，但是蛋白质组表达的改变更可能反映肿瘤病理生理学的变化。过去，临床诊断依赖于基于抗体的检测策略，但这些方法有一定的局限性。质谱（MS）是一种强有力的方法，使人们越来越全面地了解蛋白质组的变化，从而推动个性化药物的发展。来自加拿大多伦多大学健康网络玛格丽特公主癌症中心的研究人员在《ClinicalProteomics》杂志发表了基于MS的临床
尐尐呅·2024-01-22 04:38

这个工具让你５分钟搞定GSEA分析！还不来看看？

在某一项研究中，我们通过转录组或者蛋白组学研究了干预组和对照组的表达谱，获得了数千个基因的变化信息，如何从这些表达谱中发掘有用的信息？
科研小行星·2024-01-11 15:56

ROC曲线+生存曲线如何发6+分？

ProteomicTissue-BasedClassifierforEarlyPredictionofProstateCancerProgression”，作者对338例接受根治性前列腺癌切除术患者的FFPE样本进行了蛋白组学的分析
科研菌·2023-12-24 20:22

蹭热点的代价是失去科研深度！

多年前，蛋白组学、基因组学火了。很多人便立即着手将研究内容往组学上靠。无论研究什么，你没点组学内容，都不好意思说自己是做科研的。于是，大家在检索文献时，会发现组学相关
聊点学术·2023-12-16 20:59

2022-03-21

NatComm|寻找可靶向激酶：T细胞急性淋巴细胞白血病的磷酸蛋白组学分析原创图灵基因图灵基因收录于话题#前沿分子生物学机制T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）是一种侵袭性白血病，在骨髓和血液中发现了过多的
图灵基因·2023-11-27 10:56

Physiol Rev（IF 37.312）| 高分综述带你走进O-GlcNAc糖基化应用

图1O-GlcNAc研究进展及文献发表中科新生命近期重磅推出O-GlcNAc糖基化修饰蛋白组学，为各位科研小伙伴的研究带来“全新亮点”，助力提升课题及文章的“创新性”。那么O-
中科新生命·2023-11-25 15:19

多组学高分文献13-高级浆液性卵巢癌的蛋白组学和糖蛋白组学特征

IntegratedProteomicandGlycoproteomicCharacterizationofHumanHigh-GradeSerousOvarianCarcinoma人高级浆液性卵巢癌的蛋白质组学和糖代谢组学特征期刊：CellReports；影响因子：8.109发表单位：约翰霍普金斯大学等导读高级浆液性卵巢癌（HGSC）是导致大多数与卵巢癌相关的死亡的最常见和致命的卵巢癌类型，了解
纪伟讲测序·2023-11-25 11:41

各种常用数据库合集

蛋白网站UniProt（强大的蛋白结构和功能注释网站）HPA（可查看蛋白表达以及亚细胞定位）String（PPI）BioGRID(相互作用蛋白的PPI网络图)TCPA与TCGA相对应，用于访问可视化肿瘤蛋白组学网站
期待未来·2023-11-22 15:01

notes_质谱&蛋白组学数据分析基础知识

目录蛋白组学方法学液相-质谱法基本原理bottom-up策略的基本流程PEA/Olink质谱数据分析1.原始数据格式2.分析过程1）鉴定2）定量3）预处理3.下游分析参考附录蛋白组学方法学目前常见的蛋白组学方法学如下图
子诚之·2023-11-09 08:29

JAMA Cardiol（IF 14.7）| 组学大牛Matthias Mann利用4D蛋白组学揭示新冠病毒诱导的心肌炎分子特征

炎症性心肌病是一种以心脏免疫细胞浸润为特征的常见疾病，常由病毒、系统性免疫紊乱和药物毒性引起。近期发现SARS-CoV-2感染的患者也伴有炎症性心肌病，但是其具体的分子特征仍未知。2021年12月，德国心血管研究中心ChristianSchulz和马克斯·普朗克生物化学研究所MatthiasMann等团队合作在心血管医学领域权威期刊JAMACardiology（IF14.7）杂志上发表了一篇参与的
中科新生命·2023-11-04 20:22

使用aspera下载组学数据

1.安装#使用conda安装condainstall-chccaspera-cli#测试是否安装成功ascp-h2.蛋白组学用例1.从iprox下载蛋白组ascp-d-v-QT-l100m-P33001
子诚之·2023-10-31 10:26

非因解读| Reverse Phase Protein Array（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用

ReversePhaseProteinArray（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用外泌体（Exosome）是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡，也是细胞外囊泡（EV）的一种主要类型，直径大约40
FynnBio·2023-09-25 06:06

计算机辅助药物设计的基本原理

当今，随着人类基因组计划的完成、蛋白组学的迅猛发展，以及大量与人类疾病相关基因的发现，药
hdpai2018·2023-09-21 00:02

计算机辅助药物设计的基本原理是什么

当今，随着人类基因组计划的完成、蛋白组学的迅猛发展，以及大量与人类疾病相关基因的发现，药
WangLy_2008·2023-09-21 00:00

HPA数据库概要（Human Protein Atlas）

HPA数据库（HumanProteinAtlas）是基于蛋白组学,转录组学以及系统生物学数据，可以绘制组织、细胞、器官等图谱。
翾格格·2023-09-17 02:52

非因解读 | RPPA蛋白组学平台助力慢性淋巴细胞白血病不同表观遗传特征的识别

RPPA蛋白组学平台助力慢性淋巴细胞白血病不同表观遗传特征的识别慢性淋巴细胞白血病（CLL）是最常见的血液系统恶性肿瘤，其特征是在骨髓、外周血、脾脏和其他淋巴器官出现大量B淋巴细胞的恶性增殖。
FynnBio·2023-09-10 23:00

数据上传（三）：蛋白质组学数据

蛋白组学数
bioyigene·2023-08-26 12:57

学习小组Day4笔记--素还真

二代测序流程图image.png组学分类：基因组学：image.png转录组：image.png蛋白组学：image.png代谢组学：image.png
素还真_cf26·2023-08-20 19:12

偏最小二乘法的原理与实现

然而，在诸如基因组学、转录组学、蛋白组学以及代谢组学等高通量数据的一大特点是特征量多、样本数少。以转录组数据为例，特征量个数通常为基因个数，达到万级，而样本数一般是几十到几百例。
生信阿拉丁·2023-08-10 09:07

生信专题十余种案例

集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用原文链接案例部分图示：案例图示一：基于自编码器的单细胞转录组-蛋白组学整合分析案例图示二：基于蛋白组学-代谢组学的肿瘤生物标志物发现案例图示三：基于GWAS-表型组学的肺癌风险因子研究案例图示四
lixuegaoyunfeng·2023-07-28 01:35

2020年最值得收藏的蛋白组学相关文献解读10篇

科研|2020年最值得收藏的蛋白组学相关文献解读10篇！附送文献包微科享今天原创微文，欢迎转发转载。
高锰酸钾配甲醛_ab83·2023-07-22 06:50

蛋白组学富集分析 uniport id蛋白ID如何进行KEGG和GO富集分析 代谢组学

使用蛋白ID如何进行KEGG和GO富集分析-知乎(zhihu.com)昨天，有个童鞋咨询如何使用蛋白ID进行功能富集分析，功能富集分析主要是KEGG和GO。思路蛋白ID转UniProt数据库IDUniProt数据库ID转KEGG和GO号使用KEGG和GO号进行富集分析教程（实操开始）蛋白ID数据类型蛋白ID的数据是的使用;进行隔分的，如果要整理成一列数据，我最开始想到的就是使用sed进行处理。「注
Young.Dr·2023-07-21 22:57

临床代谢组学分析全流程

基因组学和蛋白组学告诉你可能发生什么，而代谢组学则告诉你已经发生了什么。
左大肚·2023-04-18 16:02

多组学方案｜外泌体转录组学与质谱蛋白组学强势来袭！

导语：外泌体研究与应用已经渗透到多个领域，在医学方向（肿瘤、免疫、神经、心血管、糖尿病等）、农学方向（植物、微生物）以及工业化方向（靶向药物递送、美容制品）的研究成果更是层出不穷。诺禾致源外泌体测序产品结合自身平台优势，提供外泌体富集、鉴定、测序、多组学生信分析、个性化分析作图、售后云平台一系列服务，利用全面技术手段、多样化测序平台助力外泌体研究。外泌体概念与特征外泌体是由细胞质中产生、经细胞膜释
诺禾致源·2023-04-12 03:33

蛋白和转录组联合分析数据库推荐

现在多组学研究很火，今天小编给大家介绍几个蛋白组学和转录组学联合分析实用数据库：1CRN（CancerRNA-SeqNexus）数据库网址：http://syslab4.nchu.edu.tw数据库说明
bioyangyang·2023-04-12 03:13

【宏蛋白组】iMetaLab平台分析肠道宏蛋白质组数据

一、iMetaLab简介宏蛋白组学是个非常小众的领域，即使从事的学者也并非专门做这个，大多是作为系统生物学的延伸研究。
Bioinfarmer·2023-04-04 13:29

跨组学大数据系列论坛之基因组学统计分析方法与应用

高通量组学技术的成熟与发展，实验室检测成本的大幅降低，使在人群中获得各层面跨组学数据（基因组学、转录组学、蛋白组学、微生物组学、单细胞组学）成为可能，这为从群体水平上探讨复杂疾病（心血管疾病、肿瘤等）的内在遗传机制提供了重大机遇
秦小琮SK·2023-03-26 10:13

单细胞空间数据分析之CNV进化树

单细胞多组学的技术发展让研究人员可以从单个细胞的维度进行遗传学、转录组学、蛋白组学等方面的深入解析，空间多组学则从细胞空间排布的角度帮助研究者洞悉细胞之间的相互协作及动态迁移，单细胞空间技术的联合使用已经成了科研手段的研究利器
Evil_Genius·2023-02-05 12:22

Nature发布迄今最大规模人类蛋白互作图谱

HuRI是Dana-Farber癌症研究所癌症系统生物学中心（CCSB）蛋白组研究项目的第三阶段，包含大约53000个蛋白互作信息，是以往研究规模的4倍，是一个将基因组变异与表型结果联系起来的系统的蛋白组学参考图谱
尐尐呅·2023-02-02 11:16

偏最小二乘法 Partial Least Squares

诸如基因组学、转录组学、蛋白组学及代谢组学等高通量数据分析，由于自变量数目大于病例数（未知数大于方程个数），无法直接使用传统的统计分析模型。
FarmerJohn·2023-01-24 11:18

CADD药物设计以及Gromacs分子动力

当今，随着人类基因组计划的完成、蛋白组学的迅猛发展，以及大量与人类疾病相关基因的发现，药物作用的靶标分子急剧增加；计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系，设计和优化先导化合物的方法
姆姆子·2023-01-05 16:32

百趣代谢组学解读，从蛋白组学和代谢组学角度，浅析白番石榴成熟过程

文章标题：IntegratingproteomicsandmetabolomicsapproachestoelucidatetheripeningprocessinwhitePsidiumguajava发表期刊：FoodChemistry发表时间：2022.01影响因子：7.514/Q1组学技术：代谢组学、蛋白质组学1、研究背景番石榴(PsidiumGuajava)，是一种营养丰富的热带水果，大小
代谢组学相关资讯分享·2022-12-29 15:46

3D完整空间蛋白组学

pii=S0092-8674%2822%2901465-92022年12月22日德国马普所MatthiasMann教授在Cell上发表了3D空间蛋白组学技术在小鼠和人类器官中的应用，这篇文章真可谓是充分体现了多学科交叉
forever luckness·2022-12-29 15:15

集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用专题

明确机器学习方法的适用性，优势，以及局限性等什么是机器学习机器学习的应用实例生物组学简介（基因组学，转录组学，蛋白组学，代谢组学）机器学习在在多组学数据分析的应用：机器学习主流实现是python
lixuegaoyunfeng·2022-12-01 04:44

TCPA:肿瘤RPPA蛋白芯片数据中心

蛋白组学数据的分析是肿瘤病理生理学领域常用的手段之一，在TCGA项目中，广泛使用了反相蛋白芯片reverse-phaseproteinarrays(RPPA)技术来进行肿瘤蛋白质组的研究。
生信修炼手册·2022-11-23 07:45

非因解读 | RPPA蛋白组学平台助力慢性淋巴细胞白血病不同表观遗传特征的识别

RPPA蛋白组学平台助力慢性淋巴细胞白血病不同表观遗传特征的识别慢性淋巴细胞白血病（CLL）是最常见的血液系统恶性肿瘤，其特征是在骨髓、外周血、脾脏和其他淋巴器官出现大量B淋巴细胞的恶性增殖。
BroH·2022-11-23 07:05

非因解读 | RPPA功能蛋白组学与单细胞测序的“双向奔赴”，携手探究黑色素瘤免疫/靶向顺序联合治疗机制

恶性肿瘤是一种由多基因参与的复杂疾病，其发生、发展到转移的过程，伴随着一连串复杂的生物学机制。虽然精准医学已经大大提高了肿瘤综合防治水平，但仍然会遇到诸多问题，如获益群体差异、耐药性发生、不良反应等。而多组学维度下的研究，能够层层深入地揭示问题根源，找到真正的阿喀琉斯之踵。单细胞测序是揭示肿瘤研究中克隆异质性研究的重要技术，而蛋白则是生命活动的直接执行者，其功能往往受到翻译后修饰的调控。目前已发现
BroH·2022-11-23 07:35

“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第二讲——RPPA技术总览、优势和应用

为了让大家深入了解非因的RPPA技术，“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第二讲如期而至，本期讲座围绕RPPA的发展历程、未来发展趋势、优势和具体应用等方面，进一步揭开RPPA技术的神秘面纱。
BroH·2022-11-23 07:04

“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第四讲——RPPA在药物研发中的应用

接下来“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第四讲，将为您分享RPPA技术在药物研发中的应用案例。
BroH·2022-11-23 07:04

距离RPPA新型蛋白组学系列第四讲还剩2天时间

接下来“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第四讲，将为您分享RPPA技术在药物研发中的应用案例。
BroH·2022-11-23 07:04

“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第一讲——RPPA技术在TCGA中的应用

非因线上讲堂——RPPA新型蛋白组学系列第一讲“非因线上讲堂”开课啦！！！
BroH·2022-11-23 07:34

“非因线上讲堂”多组学前沿技术系列讲座开始啦！！！

秋高气爽非因分享随着组学新技术的不断涌现，加快了组学研究向定量化、高通量的方向发展，尤其在后基因组时代，新型蛋白组学和空间组学已成为组学研究的新焦点，为科学家探索生命机制提供了新的方向。
BroH·2022-11-23 07:34

非因解读| Reverse Phase Protein Array（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用

ReversePhaseProteinArray（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用外泌体（Exosome）是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡，也是细胞外囊泡（EV）的一种主要类型，直径大约40
BroH·2022-11-23 07:03

非因解读 | 基于RPPA靶向蛋白组学的CellBox模型在癌症联合治疗中的应用

基于RPPA靶向蛋白组学的CellBox模型在癌症联合治疗中的应用由于肿瘤细胞在治疗环境变化和疾病进程产生的耐药性和多克隆抗性，使传统的单一药物治疗已不能满足肿瘤研究的现状，而由于样本和实验条件的限制，
BroH·2022-11-23 07:03

非因解读 | RPPA联合空间蛋白组MultiOmyx深度剖析胃癌基质微环境

RPPA联合空间蛋白组MultiOmyx深度剖析胃癌基质微环境随着肿瘤的治疗向着精准化、个体化的发展，多维度、多组学的空间联合研究逐渐成为研究肿瘤微环境的重要手段，非因生物也一直致力于通过RPPA蛋白组学和空间组学的结合
BroH·2022-11-23 07:33

非因解读 | DSP空间全转录组+单细胞测序 描绘新冠患者多器官空间组织图谱

研究人员首次在新冠病人的尸检样本中应用了单细胞测序、空间全转录组、空间靶向转录组以及空间蛋白组学，在多组学的层面上全面地剖析新冠病毒带来的影响。
FynnBio·2021-08-20 11:15

2019年9月week3 蛋白组学 精神分裂症

Sex-specifictranscriptionalandproteomicsignaturesinschizophrenia.全文NatCommun.Tiihonen,J.,etal.,(2019).使用诱导多能干细胞衍生的神经元进行建模，并且使用诱导自精神分裂症的单卵双胞胎多能干细胞衍生的神经元，从而最小化遗传异质性，增强疾病特异性信号。蛋白质组学分析结果揭示了精神分裂症更多地与糖胺聚糖、G
aprilllm·2021-06-19 09:10

这篇Nature子刊文章的蛋白组学数据PCA分析竟花费了我两天时间来重现|附全过程代码

2020年4月14日，Sanger研究团队于naturecommunication在线发表了题为Single-celltranscriptomicsidentifiesaneffectornessgradientshapingtheresponseofCD4+Tcellstocytokines的研究内容，作者使用蛋白质组学、bulkRNA-seq和单细胞转录组测序对人体40,000个以上的naïv
生信宝典·2021-06-07 12:24
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