DICOM

简单的Dicom图像显示和保存的方法(利用dcmtk库和opencv库)

视频教程：一种简单的Dicom图像显示和保存的方法(利用dcmtk库和opencv库)Git:https://github.com/JasonLiThirty/Dicomopencv的下载官网：https
JasonLiThirty·2023-02-05 18:58

DICOM

其中有一项要求是要把MRT，PET/CT等影像资料转化成DICOM格式刻到光盘上，寄到美国去。长辈之前已经请中介把从医院copy出来的dcm文件导出来，看起来我只要到外面找个复印店刻录就行了。
Funfun而谈·2023-02-03 11:40

python3.7如何安装库_如何将Python 3.7软件包安装到Docker？

文件时出现错误.FROMalpineMAINTAINERFROMpython:3.7RUNpipinstall--upgradepip&&\pipinstall--no-cache-dirnibabelpydicommatplotlibpil
weixin_39950083·2023-02-02 16:33

DICOM: Whole Slide Image

DICOM:WholeSlideImage具体程序具体示例程序见：https://github.com/Wa-Ma/WSILIB简介：WholeSlideImage:全视野数字切片(WholeSlideImage
@alittlehorse·2023-02-02 11:01

python dicom 3d,python医学影像2Ddicom文件转成3Dnii文件(保留原始dicom信息)

最近处理医院影像数据时,遇到的需求:把预处理后的MRI影像的每个序列的所有dicom文件保存成nii文件,并且要保留原始的dicom信息预处理后的MRI影像序列image.png每个序列下有多张dicom
读书猫CC·2023-02-01 13:21

医学图像格式转换 -- .dcm转为.nii.gz

#coding=utf-8importSimpleITKassitkdefdcm2nii(dcms_path,nii_path):#1.构建dicom序列文件阅读器，并执行（即将dicom序列文件“打包整合
dreamandgo·2023-02-01 13:19

python+itk+读取dicom数据，并保存为nii文件

上代码importitkimportnumpyasnpif__name__=='__main__':file_path="D:/test/004HeRuiPing_CT"image=itk.imread(file_path,pixel_type=itk.D)spacing=image["spacing"]direction=image["direction"]origin=image["origi
吴天德少侠·2023-02-01 13:49

dcm转换为nii

#path_read:读取dicom的文件路径path_save:保存nii的文件路径defdcm2nii(path_read,path_save):#GetGDCMSeriesIDs读取序列号相同的dcm
一..一·2023-02-01 13:19

记录贴：转换dcm/dicom数据为nii格式

本文记录如何将dcm/dicom数据转换为nii数据现在常用的医学图像格式包括有nii和dicom数据，如何完成这两种格式的转换十分有用，此文主要记录的怎么将dicom数据转换为你并保持空间关系的对应。
吊炸天的小鸿鸿·2023-02-01 13:18

用python将dycom .dcm格式图像转换为nifti .nii

第一步安装dicom2nifti库，在你的环境中使用pip安装：pipinstalldicom2nifti第二步，在你的python代码中使用dicom2nifti.convert_directory(
Rabbitdeng1009·2023-02-01 13:18

推荐一个开源还在维护的标注工具（支持图像、文本、视频、医疗图像）

架构，纯Web页面操作，集成视频抽帧，目标检测、视频跟踪、ReID分类等算法，实现了对图像，视频的自动标注，并可以对自动算法的结果进行人工标注，最终得到标注结果，同时也可以对视频、文本、图片、医疗（包括dicom
风沙无痕·2023-01-31 17:47

基于DCMTK和OpenCV的DR图像拼接

下肢：图像张数：4；图像大小：1984*2492；数据位数：16bit；平均拼接速度4秒左右（初略统计）拼接结果DICOM文件用三方软件（RadiAntDICOMViewer）打开躯干部位：对齐部分，放大显示
伍心·2023-01-24 10:10

数字图像处理基础笔记

医学图像的存储—PACS和DICOM标准PACS的定义：把从不同地点不同成像装置产生的图像经数字化后,通过计算机网络送至中央数据管理系统(含数据库),再经计算机网络送至不同的显示工作站,供放射科医生、病房医生及其他医务人员调用
FANCY PANDA·2023-01-14 08:22

itk.js读取dicom文件，vtk.js进行渲染

itk.js读取dicom文件时，我们只需要用到readImageDICOMFileSeries即可其余的均为vtk.js中调用letfiles_paths=[];//path为dicom文件files_paths.push
小江江12·2023-01-13 13:47

python-读取dcm文件-2021.5.24

读取dcm文件#采用pydicom模块importpydicom#数据路径file_path=r"C:\Users\孔啊吱\Desktop\kaggle_covid19\data\3dcdfc352a06
孔胖·2023-01-12 16:10

DICOM图像像素值（灰度值）转换为CT值

在DICOM图像读取的过程中，我们会发现图像的像素值有可能不是这个范围，通常是0-4096，这是我们常见到的像素值或者灰度值，这就需要我们在图像像素值（灰度值）转换为CT值。
weixin_30564785·2023-01-12 16:39

Microdicom使用：dicom转png/jpg格式

转自https://www.pianshen.com/article/3328465030/1.下载网址：http://www.microdicom.com/downloads.html64位系统下载标黄的那个
Kaia_H·2023-01-12 16:37

3D医学图像CT dcm格式转换为png

医学图像CTdcm格式转换为png在normalize_hu（）中修改像素值，需要具体数据对象具体分析只需要在main函数中更改dcm文件路径"""读取dicom图像并将其转换为png图像读取某文件夹内的所有
为了待会去码头整点薯条·2023-01-12 16:06

Python处理DICOM（02）--DICOM转PNG

一、基础环境准备使用pipinstallXXX命令安装pydicom，SimpleITK，NumPy，opencv-python，tqdm几个模块。
baccolee·2023-01-12 16:33

python读取dicom格式的图像并转为png格式

所以就先对读取到的原始像素矩阵做归一化，在*255变为灰度图，代码如下：importSimpleITKassitKimportnumpyasnpimportcv2importosdefconvert_from_dicom_to_png
spectrelwf·2023-01-12 16:31

DICOM图像坐标系和病人坐标系的相互转换

本代码是https://nipy.org/nibabel/dicom/dicom_orientation.html#dicom-slice-affine的实现，关于两个坐标系的描述，可参考：https:
pangsmao·2023-01-10 17:30

深度学习踩坑记录

或者‘read_excel’3.RuntimeError:CUDAerror:device-sideasserttriggered4.opencv-pythoncv2.imshow()等函数调用报错5.dicom2nifti.exceptions.ConversionValid
丨高山流水丨·2023-01-10 12:20

实战3：基于EfficientNetV2网络实现乳腺 X 光图像乳腺癌检测

乳房X线照片，dicom格式。隐藏测试集中大约有8,000名患者。每个患者通常有4张图像，但并非总是如此。请注意，许多
甜辣uu·2023-01-09 13:49

使用freesurfer和3Dslicer进行脑区分割和电极定点（日常记录）

Freesurfer、MATLAB插件spm12、fieldtrip，Windows下载mricron、Slicer3D（需要插件SlicerFreeSurfer）软件文件准备ct和mrit1文件，格式为dicom
zQIANYUN·2023-01-08 16:04

使用pip+清华镜像源安装软件

3.4.2.17pipinstall-ihttps://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simpleSimpleITKpipinstall-ihttps://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simplepydicom
此人姓于名叫罩百灵·2023-01-07 08:39

python dicom 三维重建_CT扫描图的三维重建

文件格式：raw/mdh/dicom/nii/nd|文件类型位深度(BitDepth)是数位影像中所有的像素所呈现出来的色调数量。
虚幻引擎·2023-01-07 07:11

ITK与VTK数据转换

以常用的dicom图像为例，图像的第一个像素定义为左上角。当使用VTK进行读取时，VTK
menjiawan·2023-01-07 07:35

LIDC数据集XML标注信息的介绍+处理

LIDC数据集共有1012例数据（CT数据文件类型为Dicom），这里不讲Dicom的数据读取，只介绍XML标注文件及处理方法。
是你的小鱼·2023-01-04 07:16

matlab dicom格式图像转为tif格式的读取

Matlab当将多帧dicom图像经MeVislab转为tif格式后的图像读取问题：t=Tiff('CTA.tif','r');subimage_one=t.read();%subimage_one为4
爱看吃播的胃胀青年·2023-01-02 07:10

基于FSL的DTI数据预处理流程

原始数据：包括3DT1数据和高分辨率DTI数据，均是dicom格式。工具：MRICRON和FSL，所有的命令均在Linux的终端中运行。
zaza_zaza·2023-01-01 10:25

FSL、MRICRON预处理DICOM数据，python读取nii,并降采样

1.FSL和MRICRON预处理DICOM数据软件安装见：https://blog.csdn.net/qq_29477893/article/details/89376758。
kether_·2023-01-01 10:51

用于深度学习的医学图像预处理

用于深度学习的医学图像数据，往往非常庞大，如果从网上下载公开数据集数据，往往有几十GB的图象数据，我们需要先进行预处理，将其转换成适合深度学习网络训练的形式：变为或者我们还需要：Dicom变为nii，变为
张小懒君·2023-01-01 09:01

python编程Demo：将dicom图片转换成jpg图片

主要原理：调整dicom的窗宽，使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。
GoHowz·2022-12-30 07:28

医疗影像分割

介绍内容：医学影像常用图像格式：（1）DICOM（2）MHD/RAW（3）NRRD1.1U-Net的架构U-Net的U形结构如下图所示。网络是一个经典的全卷积网络（即网络中没有全连接操作）。
HammerHe·2022-12-28 17:44

使用VTK和Matlab读取DICOM图像数据失真问题

最近在处理DICOM数据时，发现使用VTK的vtkDICOMImageReader类以及使用Matlab的dicomread函数读取到的Dicom图像存在像素值失真的问题，即使用上述两种方式读取到的图像像素值与使用
Skyline_98·2022-12-28 10:49

python dicom unet_使用U-Net进行肺结节分割案例分析：DSB3Tutorial

使用U-Net进行肺结节分割案例分析：DSB3Tutorial本文要分析的代码作者是jonrmulholland，这里是其链接地址数据集：LUNA2016，这里是LUNA2016数据集详细说明链接重要文件介绍：LUNA_mask_extraction.py，LUNA_segment_lung_ROI.py，LUNA_train_unet.py第一步：运行LUNA_mask_extraction.p
weixin_39539684·2022-12-26 16:26

Matlab 批量CT图像进行肺实质分割

这不是对dicom格式的CT图进行分割的，是对png、jpg等格式的CT图进行分割的。
红枣参须水·2022-12-26 16:55

python 多线程数据处理——处理图片获取时间，提取正面xray图片

commonutilsimportosimportmathimportitertoolsimportwarningsimportnumpyasnpimportpandasaspdfromcollectionsimportCounterimportmultiprocessingimportpydicom
TTS56·2022-12-25 19:22

python-多线程数据处理（一）——将dicom数据转化为jpg文件输出头文件

commonutilsimportosimportmathimportitertoolsimportwarningsimportnumpyasnpimportpandasaspdfromcollectionsimportCounterimportmultiprocessingimportpydicom
TTS56·2022-12-25 19:51

MATLAB下载处理.nii文件资源包（NIfTI_20140122zip)

大部分医学领域导出dicom格式，但是太复杂了
小柴狗·2022-12-23 07:34

nii格式和nii.gz格式详解

文章目录nii基础hdr/headerExtensionImage坐标体素转换矩阵转换矩阵内部参数概念转换矩阵组成转换矩阵应用nii格式最后nii基础大部分医学领域导出dicom格式，但是太复杂了。
三丰杂货铺·2022-12-23 07:34

利用python把dcm格式转化为jpg格式

dcm文件是DICOM（DigitalImagingandCommunicationsinMedicine）即医学数字成像和通信中记录医学图像和相关信息的文件，在用于医学图像处理的时候我们需要将·.dcm
壹万1w·2022-12-22 23:05

LEADTOOLS 入门教程: 使用 H264 视频创建 DICOM 文件 - 控制台 C#

LEADTOOLS是一个综合工具包的集合，用于将识别、文档、医疗、成像和多媒体技术整合到桌面、服务器、平板电脑、网络和移动解决方案中，是一项企业级文档自动化解决方案，有捕捉，OCR，OMR，表单识别和处理，PDF，打印捕获，归档，注释和显示功能。利用业界领先的图像处理技术，能够智能识别文件，可以用来识别任何类型的扫描或传真形式的图像。LEADTOOLS最新下载（qun：731259648）http
爱分享的小妮子·2022-12-22 10:45

基于SPM8或CAT12进行的VBM分析

基于SPM8或CAT12进行的VBM分析需要的工具：Matlab及SPM8/SPM12一、SPM8/12的VBM分析1）首先将DICOM格式转换为NIFTI格式；2）用display查看图像，可以手动进行
mollyue·2022-12-20 07:32

SimpleITK Dicom序列数据读取

importsysimportosimportnumpyasnpimportSimpleITKassitkdefsitk_dcms_read2(dcm_dir):reader=sitk.ImageSeriesReader();seriesIDs=reader.GetGDCMSeriesIDs(dcm_dir)dcm_series=reader.GetGDCMSeriesFileNames(dcm_
mikeyNa·2022-12-16 07:20

SimpleITK、pydicom的安装使用——踏上python生物医学图像处理的初学之路

一、两个库的安装pip均可直接安装。这里说说conda怎么安装SimpleITK。首先这个库是不在默认的channel里面的所以不能够直接安装。因此需使用：来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/SimpleITK这个"channel/package"的项目。然后：来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/Sim
hdpai2018·2022-12-16 07:44

安装SimpleITK

python利用SimpleITK来读取DICOM文件在命令中输入：python-mpipinstallSimpleITK
iamcfb_·2022-12-16 07:14

卢家峰课程系列-- advanced rs-fmri analysis 1/6 基本介绍与DICOM

advancedrs-fmrianalysis1/6基本介绍与DICOM提示：本系列课程的目录第一章基本介绍与DICOM第二章SPM预处理与batch第三章SPMbatch修改第四章groupICA与Q
馒头没有馅儿yolo·2022-12-13 20:24

医学图像查看软件MicroDicom官网

这软件很多人推荐用，但网上搜到的担心有病毒，找了官网半天，终于找到了，地址放在这里，大家可以点进去下载MicroDicom-FreeDICOMviewerandsoftware
wwee1223·2022-12-12 20:25

学习笔记｜fmri_1 任务态 SPM数据分析 部分概念理解

1拿到数据，后缀是IMA格式什么意思，以及如何打开，和分析软件提到的DICOM有什么区别？
Ten years old·2022-12-12 15:25
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