E-COM-NET
首页
在线工具
Layui镜像站
SUI文档
联系我们
推荐频道
Java
PHP
C++
C
C#
Python
Ruby
go语言
Scala
Servlet
Vue
MySQL
NoSQL
Redis
CSS
Oracle
SQL Server
DB2
HBase
Http
HTML5
Spring
Ajax
Jquery
JavaScript
Json
XML
NodeJs
mybatis
Hibernate
算法
设计模式
shell
数据结构
大数据
JS
消息中间件
正则表达式
Tomcat
SQL
Nginx
Shiro
Maven
Linux
cox)
生存分析之
Cox
比例风险模型
cox
比例风险模型则适合衡量具体某一因素对生存的影响程度,用HR(hazardratio)值体现,HR是某一因素影响生存的比率。
cox
模型公式如下。
BeeBee生信
·
2021-06-19 18:02
TCGA学习04:建模预测-
cox
回归
TCGA学习01:数据下载与整理-TCGA学习02:差异分析-TCGA学习03:生存分析-TCGA学习04:建模预测-
cox
回归-TCGA学习04:建模预测-lasso回归-TCGA学习04:建模预测-
小贝学生信
·
2021-06-13 20:15
TCGA学习04:建模预测-随机森林&向量机
TCGA学习01:数据下载与整理-TCGA学习02:差异分析-TCGA学习03:生存分析-TCGA学习04:建模预测-
cox
回归-TCGA学习04:建模预测-lasso回归-TCGA学习04:建模预测-
小贝学生信
·
2021-06-11 23:16
Nat Commun&JAMA INTERN MED|浅析两篇LASSO+Logistic/
Cox
套路文章
Lasso+
cox
.jpgNatCommun&JAMAINTERNMED|浅析两篇LASSO+Logistic/
Cox
套路文章两篇文章分别是来自NATURECOMMUNICATIONS的EarlytriageofcriticallyillCOVID
木舟笔记
·
2021-06-08 19:31
TCGA学习02:差异分析
TCGA学习01:数据下载与整理-TCGA学习02:差异分析-TCGA学习03:生存分析-TCGA学习04:建模预测-
cox
回归-TCGA学习04:建模预测-lasso回归-TCGA学习04:建模预测-
小贝学生信
·
2021-06-06 23:00
森林图快速绘制工具
“把数据格式用Excel整理好,在粘贴到小工具中,点击鼠标,即可做出高颜值的森林图”01—研究背景前面给小伙伴们分享的《简易批量生存分析工具》,使用
cox
比例风险分析和KM曲线来展示每个基因对患者生存状态的影响
生信学霸
·
2021-06-05 01:37
野樱莓 | 传说中的不老莓
在日本,研究人员发现野樱莓可以阻断
COX
-2的作用,
COX
ZAHRA飒赫拉
·
2021-06-04 07:47
R语言绘制限制立方条图2(基于logistic回归和线性回归)
既往教程中我们介绍了使用R语言在
COX
回归模型基础上绘制限制立方条图,后台有不少粉丝说道不
天桥下的卖艺者
·
2021-05-17 16:57
R语言
科研绘图
大数据
FK 3311
COX
-2??????????????????????????????
莫小枫
·
2021-05-14 22:07
R语言之生信⑦
Cox
比例风险模型(单因素)
原文:R语言之生信⑦
Cox
比例风险模型(单因素)目录R语言之生信①差异基因分析1R语言之生信②差异基因分析2R语言之生信③差异基因分析3R语言之生信④TCGA生存分析1R语言之生信⑤TCGA生存分析2R
天道昭然
·
2021-05-12 05:55
基于DNA甲基化的分子亚型构建发5+分
MolecularsubtypesbasedonDNAmethylationpredictprognosisincolonadenocarcinomapatients”,文章作者基于TCGA-COAD队列甲基化数据对COAD进行分型,并根据亚型特异甲基化位点构建COAD的
COX
科研菌
·
2021-05-05 13:56
Gartner报告解读:IBM全球DC业务SWOT分析
SWOT:IBM,DataCenterBusiness,WorldwideAnalyst(s):NareshSingh,RogerW.
Cox
,GregYoung,JoeSkorupa,ErrolRasitPublished
燕刀刀
·
2021-05-04 05:16
2019-12-22 Day10-14-学习 TCGA数据库单基因文章套路
提取矩阵中基因表达量,然后做差异表达分析-散点图-疾病和正常或肿瘤与癌旁比较,配对的差异分析-肿瘤与癌旁,然后对TCGA临床数据进行下载和整理,生产分析与基因联合,然后临床相关性分析-与性别-分期等是否有关,然后
COX
卅衣
·
2021-04-28 20:58
R语言 生存分析与
cox
模型的学习笔记
K-M曲线可视化2、Log-Rank检验三、TheCoxproportionalhazardsmodel(PH模型)1、Coxproportionalhazardsmodel基础概念2、R代码实现3、验证
Cox
菠萝西斯
·
2021-04-28 19:33
学习笔记
r语言
生物信息学
OC基础教程之语法 【转载】
20世纪80年代早期由BradJ.
Cox
设计,2007年苹果公司
十年落魄
·
2021-04-24 20:02
R语言配色方案02-RcolorBrewer包
作者:白介素2相关阅读:R语言配色方案01-colortoolsR语言生存分析03-
Cox
比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生(二)ggstatsplot
医科研
·
2021-04-21 11:43
Objective-C 程序设计(第四版)复习摘要(上)
分享给大家(很基础哈,高手勿喷)BradJ.
Cox
在20世纪80年代早期设计了Objective-C这门编程语言。1988年,Objective-C的语言库和开发环境(NEXTSTEP)产生了。
herbert
·
2021-04-20 22:01
R语言ggboxplot-一文掌握箱线图绘制所有细节
作者:白介素2相关阅读:R语言ggplot2绘制箱线图R语言生存分析04-
Cox
比例风险模型诊断R语言生存分析03-
Cox
比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr
医科研
·
2021-04-19 21:40
R语言进行数据结构化转换:Box-
Cox
变换、“凸规则”变换方法
在讨论回归模型中的变换时,我们通常会简单地使用Box-
Cox
变换,或局部回归和非参数估计。这里的要点是,在标准线性回归模型中,我们有但是有时候,线性关系是不合适的。
拓端研究室
·
2021-04-19 18:22
R语言
数理统计
回归
R语言
数据结构化转换
Box-Cox
凸规则
R语言:生存分析
Cox
回归分析 survival analysis
Cox
模型是干什么的?
Cox
模型的目的是同时评估几个因素对生存的影响。换句话说,它使我们能够检查特定因素在特定时间点如何影响特定事件(例如,感染,死亡)的发生率。这个速度通常被称为危险率。
生信频道
·
2021-04-19 13:27
R语言之生信(12)一分钟学会绘制
cox
/meta森林图
目录R语言之生信①差异基因分析1R语言之生信②差异基因分析2R语言之生信③差异基因分析3R语言之生信④TCGA生存分析1R语言之生信⑤TCGA生存分析2R语言之生信⑥TCGA生存分析3R语言之生信⑦
Cox
柳叶刀与小鼠标
·
2021-04-19 13:04
TCGA学习04:建模预测-lasso回归
TCGA学习01:数据下载与整理-TCGA学习02:差异分析-TCGA学习03:生存分析-TCGA学习04:建模预测-
cox
回归-TCGA学习04:建模预测-lasso回归-TCGA学习04:建模预测-
小贝学生信
·
2021-04-19 09:23
R绘制森林图(forestplot)
前面我们讲过了单因素和多因素
cox
回归分析,那么怎么样将结果以森林图的形式来展示呢?
生信交流平台
·
2021-04-19 04:06
m5C纯生信分析套路 m5C预后模型构建+验证
使用单变量
Cox
回归和LASSOCox回归算
呆呆聊生信
·
2021-04-18 15:13
TCGA数据差异分析后生存分析(批量单因素
cox
回归/Lasso筛选,多因素
cox
建模,时间依赖ROC曲线及KM plot可视化)
测序上游分析系列:mRNA-seq转录组二代测序从rawreads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从rawreads,鉴定已知miRNA-预测新miRNA,到表达矩阵【一】miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从rawreads,鉴定已知miRNA-预测新miRNA,到表达矩阵【二】其他文章系列:ggplot2作图篇:(1
ZZZZZZ_XX
·
2021-04-18 06:57
一致性指数:Harrell’concordance index:C-index
concordanceindex,中文里有人翻译成一致性指数,最早是由范德堡大学(VanderbiltUniversity)生物统计教教授FrankEHarrellJr1996年提出,主要用于计算生存分析中的
COX
医科研
·
2021-04-18 05:28
R语言生存分析04-
Cox
比例风险模型诊断
作者:白介素2相关阅读:R语言生存分析04-
Cox
比例风险模型诊断R语言生存分析03-
Cox
比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生(二)ggstatsplot
医科研
·
2021-04-14 21:01
生存分析(二)--
Cox
比例风险模型(
Cox
proportional-hazards model)
翻译自:http://www.sthda.com/english/wiki/
cox
-proportional-hazards-modelCox比例风险模型(考克斯,1972年)是常用的统计在医学研究调查的患者和一个或多个预测变量的存活时间之间的关联回归模型
你有康娜可爱吗
·
2021-04-13 20:46
【搬砖】构建预后signature 实践
Cox
回归模型写在最开头:诚心推荐解螺旋麦子的
Cox
回归模型R教学视频!!!如果你对
cox
还稀里糊涂的,下面的链接,点!
yadandb
·
2021-04-13 12:37
forestplot R 森林图绘制
1单因素
COX
和多因素COXclinical.txtlibrary(survival)rt=read.table("clinical.txt",header=T,sep="\t",check.names
医学小白学生信
·
2021-04-12 23:27
论文模板丨最基本的生信套路换了miRNA也能发6分+
文章利用了从TCGA数据库中搜集的头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)RNA测序数据和miRNA测序数据进行了综合分析,通过与临床数据结合,利用
Cox
回归分析,得到了7个与HNSCC相关的标志性miRNA,确定为用于头颈部鳞状细胞癌预后的新型
WOSCI沃斯编辑
·
2021-04-12 22:02
数据分析:基于glmnet的
Cox
-PH分析
glmnet提供了LASSO或ridgeregression的
Cox
-PH分析模式,用于研究预测变量与生存时间的关系。具体做法先训练模型再使用最佳参数构建模型。
华仔少年
·
2021-04-12 20:04
没有想到就这样就发了6.68分的SCI
更多资料可以关注微信公众号SCI狂人在这里分享一篇比较新的文章,这篇文章于2019Oct5发表在EBioMedicine上,目前EBioMedicine的最新IF为6.68,文章内容也不多,也就是我们经常提到的分析,
Cox
SCI狂人团队
·
2021-04-12 20:51
差异分析+火山图+
COX
模型构建
:没有生物学重复的转录组数据怎么进行差异分析?edgeR需要的数据是reads数,可以设置BCV值,做单样本的差异分析。edgeR包可以做无重复的差异分析,不过需要认为指定一个dispersion值(设置BCV值),这样得到的结果比较主观,不同的人就可以有不同的结果。通常如果是实验控制的好的人类数据,那么选择BCV=0.4,比较好的模式生物选择BCV=0.1。6LUAD验证6.2差异基因分析和功能
医学小白学生信
·
2021-04-01 20:12
R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析
该算法速度快,可以利用输入矩阵x中的稀疏性,拟合线性、logistic和多项式、poisson和
Cox
回归模型。可以通过拟合模型进行各种预测。它还可以拟合多元线性回归。”
·
2021-03-26 14:44
R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析
该算法速度快,可以利用输入矩阵x中的稀疏性,拟合线性、logistic和多项式、poisson和
Cox
回归模型。可以通过拟合模型进行各种预测。它还可以拟合多元线性回归。”
·
2021-03-25 16:06
R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析
该算法速度快,可以利用输入矩阵x中的稀疏性,拟合线性、logistic和多项式、poisson和
Cox
回归模型。可以通过拟合模型进行各种预测。它还可以拟合多元线性回归。”
拓端研究室
·
2021-03-25 14:20
回归
数理统计
R语言
R语言
自适应LASSO
多项式回归
逻辑回归
岭回归
R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据
p=20828本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归,GLM和
Cox
回归模型的正则化,特别是_最小_最_大凹_度_惩罚_函数_(MCP)_和光滑切片绝对偏差惩罚(SCAD),以及其他L2惩罚的选项(“
·
2021-03-10 21:08
R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据
p=20828本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归,GLM和
Cox
回归模型的正则化,特别是_最小_最_大凹_度_惩罚_函数_(MCP)_和光滑切片绝对偏差惩罚(SCAD),以及其他L2惩罚的选项(“
·
2021-03-09 22:24
“误用姓名”,前哈佛教授炮轰中国学者“碰瓷”:“整件事都让人讨厌!
感到震惊并愤怒的
Cox
在推特上写道:“整件事都让
CSDN资讯
·
2021-02-21 19:49
人工智能
redirect
ai
webgl
vim
【信号处理】小波变换的音频水印嵌入提取【Matlab 202期】
Cox
等[提出了着名的基于图像全局变换的数字水印技术,该方案对整个图像作离散余弦变换(DCT),Barni等提出一种利用HVS掩蔽特性的基于DCT的水印算法,在水印嵌入阶段,对的图像进行的DCT变换,对
星斗月辉
·
2021-02-12 14:04
matlab
信号处理
统计科学之分析遇到非正态数据该怎么办?
这一节我们来看一下,如果数据不满足正态时该怎么办,答案就是将非正态数据通过Box-
Cox
变换进一步转换成符合正态分布的数据。这一篇就给大家分享下Box-
Cox
变换的具体内容。
·
2021-01-27 17:18
Cox
去世,他推动了苹果软件生态的发展
据外媒报道,编程语言Objective-C之父BradJ.
Cox
博士已于近日在其家中逝世,享年77岁。
·
2021-01-25 14:52
Cox
去世,他推动了苹果软件生态的发展
据外媒报道,编程语言Objective-C之父BradJ.
Cox
博士已于近日在其家中逝世,享年77岁。
·
2021-01-25 14:52
Cox
去世,他推动了今天苹果的软件生态
本文转载自机器之心近日,讣告网站Legacy.com发布消息:Objective-C之父BradJ.
Cox
博士于2021年1月2日在自己的家中逝世,享年77岁。
程序员的店小二
·
2021-01-25 14:14
【信号处理】基于matlab小波变换的音频水印嵌入提取【含Matlab源码 053期】
Cox
等[提出了着名的基于图像全局变换的数字水印技术,该方案对整个图像作离散余弦变换(DCT),Barni等提出一种利用HVS掩蔽特性的基于DCT的水印算法,在水印嵌入阶段,对的图像进行的DCT变换,对
紫极神光
·
2021-01-24 14:20
matlab
信号处理
颜值够格的风险森林图
也可以自己根据表达矩阵与临床信息生成,如下:rm(list=ls())load("
cox
_dat.Rdata")str(dat)##'data.frame':516obs.of10variables:#
小洁忘了怎么分身
·
2021-01-23 18:04
手把手教你使用R语言做竞争风险模型并绘制列线图
这是我们应该优先选择竞争风险模型来做数据分析,而不是
COX
回归。竞争风险模型在数据挖掘中经常使用到,我们将
天桥下的卖艺者
·
2021-01-06 08:27
R语言
数据挖掘
数据分析
知识小结------数据分析------Bonferroni correction(邦费罗尼校正)
系列文章目录
Cox
比例风险回归模型(proportionalhazardsmodel)知识小结------数据分析------Fisher‘sexacttest(费希尔检测)Bonferronicorrection
闲看庭前雪
·
2020-12-31 12:19
数据分析
知识小结
统计学
数据分析
知识小结------数据分析------Fisher‘s exact test(费希尔检测)
系列知识小结目录
Cox
比例风险回归模型(proportionalhazardsmodel)Fisher'sexacttest费希尔检测系列知识小结目录前言一、Fisher'sexacttest费希尔检测是什么
闲看庭前雪
·
2020-12-31 10:35
知识小结
数据分析
统计学
数据分析
上一页
3
4
5
6
7
8
9
10
下一页
按字母分类:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
其他