sra 第7页

一种基于C++的扑克牌实现

第一步、利用sra

currydua·2020-08-16 10:32

基于verilog的单周期处理器设计

本单周期处理器支持R型指令add,addu,sub,subu,slt,sltu;I型指令ori,lw,sw,beq,bne,移位指令sll,srl,sra指令;J型指令的J指令和Jr指令。

里程。。·2020-08-16 01:35

从一堆（大量的）无序不重复数组成的数组中寻找一指定数出现的位置

；代码：#include#include#include#include#includeusingnamespacestd;templatevoidgenerateArray(vector&vec){sra

life_爱水的鱼·2020-08-14 11:42

如何下载生物数据（四）：SRA数据下载

基因学苑Q群：32798724应用场景：如果自己没有测序数据，比如Pacbio数据，nanopore数据等，想要测试一些软件，或者想重复文章的内容，就需要从SRA数据库下载数据。

基因学苑·2020-08-13 23:48

送书 | 耗时很长的程序忘加nohup就运行了怎么办？

在NGS基础：测序原始数据下载一文中提到可以使用SRA-toolkit中的命令fastq-dump从NCBI下载原始测序数据，命令如下。

生信宝典·2020-08-11 17:08

FPGA第一篇：SRAM工作原理

查找表的原理类似于ROM，其物理结构是静态存储器（SRAM），N个输入项的逻辑函数可以由一个2^N位容量的SRAM实现，函数值存放在SRAM中，SRA

qq_30866297·2020-08-11 12:43

Linux下从NCBI批量下载SRA数据的sra和aspera方法

[email protected]#从NCBI下载SRA数据,最近在疯狂下载宏基因组数据，试着解决一下这个问题~方法一：软件准备：使用ncbi提供的下载工具

minus_yao·2020-08-10 18:09

深入理解计算机系统(第二版) 家庭作业第二章

2.60unsignedreplace_byte(unsignedx,unsignedcharb,inti){return(x&~(0xFF>((sizeof(int)-1)>1)==-1;}2.63对于sra

FrostFighter·2020-08-09 04:52

Linux011 Sra toolkit安装及使用

SRA（SequenceReadArchive）数据库是用于存储二代测序的原始数据，包括454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos和CompleteGenomics。

caoqiansheng·2020-08-09 00:43

计算机组成原理 7储存层次结构

写要借助特殊的设备随机访问+访问时间主存高于硬盘加加加(Cache)看表SRAM2010年SRAM价格是DRAM价格的1000倍DRAM和SRAM为什么DRAM慢而SRAM快通过行列选择信号在SDRAM上进行的改进SRA

weixin_30457065·2020-08-08 23:35

微生物组数据库（http://egcloud.cib.cn）正式上线

环境微生物研究中基于高通量测序技术产生了海量的微生物组数据，在文章发表时一般要求将测序数据存储到国际生物信息数据库，如：SRA、EBI和MG-RAST，但也有很多数据埋藏在文献中，不容易找到，同时缺少与测序数据对应的环境因子数据

刘永鑫Adam·2020-08-08 01:21

原始数据极速上传NCBI SRA教程

今天小美就老话再谈，各位老师跟着小美再乘坐一次极速上传SRA的高铁，准备好了吗？Let'sgo!!!

刘永鑫Adam·2020-08-08 01:47

耗时很长的程序忘加nohup就运行了怎么办？

在NGS基础：测序原始数据下载一文中提到可以使用SRA-toolkit中的命令fastq-dump从NCBI下载原始测序数据，命令如下。

刘永鑫Adam·2020-08-08 01:12

北京大学生物信息学-第三周-序列数据库 BLAST

序列数据库Genbank是美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI)建立的DNA序列数据库，从公共资源中获取序列数据SRA（

Leesuha·2020-08-05 12:38

Mac下使用Aspera Connect下载NCBI Sra 数据

Mac下使用AsperaConnect全速下载大型NCBI文件的方法1，下载安装SRAToolkitDocumentationSRAToolkit下载2，下载安装AsperaConnect的dmg文件AsperaConnect3，建议使用prefetch命令下载prefetch,fastq-dump,vdb-dump的简介prefetch命令的使用简介https://trace.ncbi.nlm.

melodyhaya·2020-08-03 20:51

ACM卡常优化模板（C++/Java）

pragmaGCCoptimize("inline")#pragmaGCCoptimize("-fgcse")#pragmaGCCoptimize("-fgcse-lm")#pragmaGCCoptimize("-fipa-sra

nefu_ljw·2020-08-03 01:07

2018-04-13 从genbank中下载SRA文件（SRA Toolkit的安装和使用）

最开始的时候，我只是从NCBI上面之间点击下载fastq文件，用浏览器自带的下载工具下载，但是有些时候，你会发现并没有fastq文件可以下载，取而代之的是SRA。那么什么是SRA呢？

小郑的学习笔记·2020-07-30 22:44

SRA Toolkit

一、简介：SRAToolkit是将ncbi上.sra文件（文献中的各种数据，如：Chip、Rna-seq等一般都以sra格式储存在ncbi数据库中https://www.ncbi.nlm.nih.gov

DL_ec5d·2020-07-30 19:37

基因数据处理1之mapping_to_cram

AWorkedExampleObtainsomepublicdataWewillusethefirst100,000read-pairsfromayeastdataset.curlftp://ftp.sra.ebi.ac.uk

KeepLearningBigData·2020-07-30 18:52

网络——定义安全区DMZ

网络攻击最好的防御方法之一是网络的安全拓扑设计现代安全网络设计最关键的思想之一是用区去隔离开网络上的不同区域创建区域的基本策略：1.具有最大安全需求（私有设备）的设备在网络的最安全的区域；只允许很少或者不允许公共网络和其他网络访问；访问通常使用防火墙或者其他安全部件控制，如安全远程访问SRA

gam0n·2020-07-30 01:15

快速从NCBI下载sra数据

hzau_yang·2020-07-29 19:53

NGS小技能（2）：如何进行SRA到fastq格式的快速转换

前言生物信息分析人员一般会接触到从NCBI等网站下载的SRA数据，之前也介绍了下载SRA数据的几种方式。下面，我就简单介绍一下如何将下载的sra格式数据转换成为常用的fastq等格式。

魚晨光·2020-07-29 19:01

NCBI SRA格式转换

最近NCBI的数据格式由于空间缘故都转换成了*.sra格式，不再支持*.fastq.gz，因此需要一个特别的转化工具来转换下载的*.sra数据文件。

doudou8486·2020-07-29 18:18

FPGA工作原理与简介

查找表可以很好地满足这一要求，目前主流FPGA都采用了基于SRA

EDA365????·2020-07-29 00:30

NCBI下载SRA数据的4种方法

作为生命科学的从事者，不论是老师或者学生都应该用过NCBI((NationalCenterforBiotechnologyInformationSearchdatabase，一个综合性的生命科学资源网站）。那么作为一个生命科学中的一员，如果你们没用过NCBI网站，这就好像是在说“知网是啥”。希望提到这个网站的事情，你的表情不会是下面这个样子，哈哈哈。。。不管你是否了解NCBI网站，这都不重

生信店小二·2020-07-26 11:58

RNA-seq，生信技能树

sra文件地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/下载测序数据#循环下载sra文件1，for((i=677;i1ls*

bettermaan·2020-07-15 00:59

下载SRA数据技巧

假如你要下载PRJNA310071的所有SRA数据，你可以通过下面命令获取全部的SRRid前提是你得安装entrezdirect工具包command：wgetftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov

sober01·2020-07-13 23:55

【原创】新一轮的sra2fastq2018-10-15

fastq-dump.shfastq-dump--gzip--split-3-O~/microRNA_seq/fastq/-A~/microRNA_seq/sra/SRR5593145fastq-dump

酷睿_1991·2020-07-12 11:40

新兴内存技术准备突围

报告发现，到2029年，新兴内存市场的总收入有望达到200亿美元，这主要是因为它取代了目前效率较低的存储技术，如NORflash和SRA

吴建明wujianming·2020-07-12 06:00

高速下载 EBI NCBI 测序数据（SRA，Fastq等）

文章目录一、测试环境及工具二、Aspera下载三、安装及配置1.解压2.安装3.配置许可4.配置程序环境变量5.配置秘钥四、测试1.一个例子2.常用参数介绍3.下载地址的构建4.EBI查询整个项目的资源文件6.查看下载链接五、为什么这里要建议选EBI，而不用NCBI？一、测试环境及工具Linux（Ubuntu18.04.1）Aspera（AsperaConnectversion3.9.9.1778

白墨石·2020-07-12 02:15

QT 5.9 实现 QWebEngineView 打印html内容

英文引用网址:https://www3.sra.co.jp/qt/relation/doc/qtwebengine/qtwebengine-webenginewidgets-printme-example.html

Nano_hello·2020-07-11 03:59

NCBI SRA数据预处理

SRA数据的的处理流程大概如下一、SRA数据下载、NCBI上存储的数据现在大都存储为SRA格式。下载以后就是以SRA为后缀名。这里可以通过三种方式下载SRA格式的数据。

OpenHero·2020-07-10 23:01

BWA软件安装和使用

BWA软件安装和使用：1.安装请参考【1】2.使用：hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/down-sratool/sra$bwaaln../..

KeepLearningBigData·2020-07-09 13:16

使用tophat2和cufflinks进行转录组分析

将比对所需参考基因组的索引文件和基因组注释文件存放于hg19文件夹，并将sra文件解压至Fastq文件夹。主要步骤：1.用Ttimmomatic对fastq数据去接头。

孤久成瘾_1180·2020-07-09 06:20

MIPS 指令集(共31条）

.0R-typeoprsrtrdshamtfuncadd000000rsrtrd00000100000add$1,$2,$3$1=$2+$3rd>10rd>shamt；(logical)，其中rt=$2,rd=$1sra0000000000

yixilee·2020-07-09 03:38

linux下使用Aspera Connect下载sra数据

参考链接：https://www.jianshu.com/p/680e8d7205161.下载AsperaConnect：在命令行输入如下命令wgethttp://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.4/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz2.解压：tarzxvfaspera-connec

铭&婵旭·2020-07-05 08:44

VHDL移位操作

通过SLL实现五比特数的移动，另外常见的还有SRL逻辑右移----实现数据右移，左端补0；SLA算术左移----实现数据左移，同时复制最右端的位，填充在右端空出的位置；SRA算术右移----实现数据右移

Harlen018·2020-07-04 05:12

SRT《现金流与金钱管理》5月中国首次开课

美国灵性反应疗法协会SRA的资深教师，教育委员会委员Xen

光行者Stella·2020-07-04 04:06

tophat2+cufflinks转录组测序（2)—去接头>比对>差异分析

在将原始数据和参考基因组数据处理好以后，就开始开始比对分析了比对所用到的参考基因组的索引文件和基因组注释文件都存放在hg19文件夹将sra文件解压至Fastq文件夹主要步骤有下列几步1用Ttimmomatic

孤独巡礼_435a·2020-07-02 04:55

从ncbi下载sra数据的几种种方式

并添加环境变量，具体看以前的内容下载sratoolkit加环境变量下载EDirect用yeast的几个数据说明1.直接用runidprefetchSRR15536102.写入文件下载echoSRR1553608>sra.idsechoSRR1553605

Y大宽·2020-07-01 17:21

Linux之获得NVIDIA显卡GPU_ARCHS方法

/deviceQuery如上，运行后输出信息如下nvidia@nvidia-X10SRA:/usr/local/

ZONG_XP·2020-06-30 18:59

Altera FPGA 使用JIC文件配置固化教程

Altera或Xilinx的FPGA芯片，使用的是基于SRA

yundanfengqing_nuc·2020-06-30 10:34

RNA-seq流程学习笔记（1）-Ubuntu系统安装SRA数据下载软件Aspera connect和SRT-Toolkit

SRA数据主要使用两种工具下载Asperaco

垚垚爸爱学习·2020-06-30 00:11

sra-tools 新 feature

sra-tools新feature官方文档–2020-3-2618:02:21–最近重装了conda环境,于是重新安装了sra-tools.使用时发现fasterq-dump的功能已经转移到fastq-dump

weixin_44881875·2020-06-29 14:26

2019年8月5-12日杭州SRT基础/进阶/主题课程，由SRA协会前教育委员会主席Xenia Ioannidou授课

很难得请到了SRA灵性反应疗法协会的资深老师，也是协会前教育委员会的主席XeniaIoannidou老师在今年8月份在杭州开SRT基础/进阶/主题课程。

光行者Stella·2020-06-26 19:45

如何从NCBI下载SRA数据

经常需要在GEO中下载测序数据原始文件，得到sra编号之后，有两种方法下载：一、可以通过在ebi（http://www.ebi.ac.uk/）中搜索SRA编号，然后用aspera直接下载fastq文件，

wangyunpeng_bio·2020-06-25 04:20

NGS基础：测序原始数据下载

NCBI的SRA(SequenceReadArchive)数据库(http://

生信宝典·2020-06-24 21:53

如何从ncbi上下载sra数据

如何从ncbi上下载sra数据我参考了网上的一个贴子http://www.plob.org/2014/02/16/7338.html，里面描述了如何用aspera来进行下载，在使用它下载单个数据的时候成功了

会口遁的naruto·2020-06-24 08:33

PHP生成可读的字符串

"k","l","m","n","p","r","s","t","v","w","x","y","z");$vocal=array("a","e","i","o","u");$password="";sra

MingSha·2020-06-24 06:31

剑指offer--快速排序

将数组中比枢纽元大的元素都移动数组的右边#includeusingnamespacestd;#includeintRandomInRange(intstart,intend){if(end>start){sra

jw903·2020-06-23 23:52

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