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SRA 数据下载自救指南

这飞一般的感觉~还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA快到飞起？还在难过用wget下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA下载自救尝试指南供你参考。
思考问题的熊·2018-09-05 22:55

关于stm32的BOOT1和BOOT0

当BOOT1=1，BOOT0=1时，从内部SRA
KYYK·2018-07-26 17:21

0044-【宏基因组】-16S分析qiime1极简教程

1.数据介绍FASTQ数据下载-EBI-SRA数据地址：https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJNA246490Study:PRJNA24649016SrRNAsequencingofsoilmicrobialcommunitymetagenome
leadingsci·2018-06-15 11:15

高并发大容量NoSQL解决方案探索

本文将基于个推SRA孟显耀先生所负责的DBA工作，和大数据运维相关经验，分享两大方向内容：一、公司在KV存储上的架构演进以及运维需要解决的问题；二、对NoSQL如何选型以及未来发展的一些思考。
ERIIISED·2018-05-22 15:22

转录组数据上传到SRA

转录组数据上传教程（SRA）为什么要上传我们在投稿之前都要把数据上传才能发表。但是，数据上传如果不知道一些套路的话，会很麻烦。笔者曾经在博士期间被转录组数据上传弄得焦头烂额，直接被老板鄙视。
石博士·2018-05-10 17:45

RNA-seq常用命令（无参）

#用于存放QC结果04.trinity_result#用于存放trinity结果数据处理的顺序：01.raw_data>02.fastq>03.fastqc>04.trinity_result1.下载SRA
卖萌哥·2018-04-11 17:50

RNASEQ分析入门笔记2-下载原始数据

AKAP95regulatessplicingthroughscaffoldingRNAsandRNAprocessingfactors.NatCommun2016Nov8;7:13347.PMID:27824034根据文献，原始数据下载地址如下：ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra
括囊无誉·2018-03-22 05:31

震撼的洞穴壁画艺术中心【环球设计1542期】

建筑事务所Snhetta、SRA与演员CassonMann及一批考古学家紧密合作，打造了一个博物馆式的教育体验。解说中心设有最先进的体验式讲诉故事的技术，艺术中心为游客营造了一个惊奇和神秘感的世界。
环球设计·2017-11-03 00:00

SRA Toolkit - prefetch

SRAToolkit:prefetchSRAToolkitDocumentationBacktoListoftheToolsTool:prefetchUsage:prefetch[options]FrequentlyUsedOptions:General:-h|–helpDisplaysALLoptions,generalusage,andversioninformation.帮助信息-V|–ve
Cs_mary·2017-10-28 19:57

转录组入门(3)：了解fastq测序数据

转录组入门(3)：了解fastq测序数据需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量！
_eason_·2017-09-11 22:40

转录组入门（2）：读文章获取测序数据

AKAP95regulatessplicingthroughscaffoldingRNAsandRNAprocessingfactors.NatCommun2016Nov8;7:13347.PMID:27824034很容易在文章里面找到数据地址GSE81916这样就可以下载sra
_eason_·2017-09-07 01:03

转录组入门（1）：计算机与软件准备

需要安装的软件包括sra
_eason_·2017-08-31 22:18

RNA-seq分析服务器安装生信工具过程

，存放各工具mkdirRNAseq_tool二.各生信工具在测试服务器下的安装1.sratoolkit下载及安装#下载并解压wget"ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra
寂桐·2017-08-31 14:03

ascp下载ebi ncbi数据库大文件

ebi千人基因组计划数据下载代码ascp-iasperaweb_id_dsa.openssh-Tr-Q-l6M-P33001-L--k1era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1
zd200572·2017-08-22 16:54

转录组（3）：了解fastq测序数据

学习目标：前面下载了SRR3589956.sra-SRR3589962.sra的RNA-seq数据，本次用sratoolkit.2.6.3软件解压，并查看fastq数据的格式，用fastqc软件检验其数据质量
Richard_Zhou·2017-08-04 18:19

SRA下载工具fastq-dump参数理解

fastq-dump是常用用来下载NCBI原始测序SRA数据的工具，但是它的参数也是比较杂乱，我根据查到的数据说下我的体会--outdir#输出文件夹名--gzip#使用gzip压缩结果（目的是减少占用硬盘大小
bioinfo2011·2017-07-31 21:08

转录组入门（3）：了解fastq测序数据

作业要求需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量！
lxmic·2017-07-23 09:23

转录组入门（3）：质量控制

需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量！
徐洲更hoptop·2017-07-11 18:35

RNA_Seq差异表达分析流程

RNA_Seq差异表达分析流程1、数据下载ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR122/005/SRR1228245/SRR1228245_1.fastq.gz;ftp.sra.ebi.ac.uk
msw521sg·2017-02-28 14:14

使用GEOquery下载GEO数据

最近需要下载一大批GEO上的数据，问题是我要下载的Methylation数据根本就没有sra文件，换言之不能使用Aspera之类的数据进行下载。
joshua_hit·2017-02-26 11:12

奥卡姆剃刀定律与极简主义生活

奥卡姆剃刀定律（Occam'sRazor,Ockham'sRa
Jane_gz·2016-09-03 22:34

<二代测序> 批量下载 NCBI sra 文件

tanzuozhev/article/details/51078460前文http://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/51077222介绍了如何采用sra-toolkit
tanzuozhev·2016-04-06 21:00

<二代测序> 下载 NCBI sra 文件

NCBI提供了SRA数据库存储这些数据。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra为了方便更好的分析这些数据，NCBI提供了下载的命令行工具：sra-toolkit。
tanzuozhev·2016-04-06 18:00

NCBI sra数据下载软件安装

引用网址：http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?
drxin·2016-01-14 14:29

用Aspera connect从NCBI上下载SRA格式数据

用Asperaconnect从NCBI上下载SRA格式数据：一.window1.下载地址：http://downloads.asperasoft.com/connect2/2.安装很简单，略3.下载：数据下载地址
bob601450868·2016-01-13 22:00

BWA软件安装和使用

BWA软件安装和使用：1.安装请参考【1】2.使用：hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/down-sratool/sra$bwaaln../..
KeepLearningBigData·2016-01-13 20:48

BWA软件安装和使用

BWA软件安装和使用：1.安装请参考【1】2.使用：hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/down-sratool/sra$bwaaln../..
bob601450868·2016-01-13 20:00

使用fastq-dump下载SRA数据

使用fastq-dump下载SRA数据环境和配置请见系列博文1.下载：fastq-dump-ZDRR047093 然后会显示信息：如果文件过大会有很多可以显示制定条数fastq-dump-X5-ZDRR047093
bob601450868·2016-01-13 19:00

ubuntu下使用sratoolkit将sra文件转换成fastq文件

ubuntu下使用sratoolkit将sra文件转换成fastq文件：环境：ubuntu14.04sratoolkit.2.5.5-ubuntu641.下载下载地址：http://trace.ncbi.nlm.nih.gov
bob601450868·2016-01-13 13:00

window下使用sratoolkit将sra文件转换成fastq

window下使用sratoolkit将sra文件转换成fastq并将fastq转换成fasta文件1.ncbi下载sra文件ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant
bob601450868·2016-01-12 22:00

SRAtoolkit使用

SRAtoolkit使用1.下载安装：http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?
bob601450868·2016-01-12 22:00

学习点滴

两台主机之间如何添加互相信任 生成秘钥并将私钥发送到对方主机 [root@docker_test~]#ssh-keygen-trsa会在当前目录的.ssh下生成id_rsa和id_rsa.pub文件将id_sra.pub
suqingbin·2015-12-04 19:54

fastq-dump 报错 解决方案

tools/sratoolkit/sratoolkit.2.3.2-5-centos_linux64/bin/fastq-dump --split-spot --gzip rhesus_b_heart.sra
·2015-11-13 09:36

NCBI SRA数据预处理

SRA数据的的处理流程大概如下 一、SRA数据下载、 NCBI 上存储的数据现在大都存储为SRA格式。 下载以后就是以SRA为后缀名。 这里可以通过三种方式下载SRA格式的数据。
·2015-11-12 10:39

用户-权限-菜单

url=srA54aAcot14eb4rF72LnL_HmfVIO6A8wuhKkgmz1PDqaJSncaKbjPdWfbCcRwFit6OIOrxdkpkRCkQFANk2s7iVZSdmKuzvjF70c0ca
·2015-11-11 01:22

PHP生成强密码两种方法

() {list($usec, $sec) = explode(’ ‘, microtime());return (float) $sec + ((float) $usec * 100000);} sra
·2015-11-08 15:40

6、深入理解计算机系统笔记：存储器层次结构，存储技术（1）

SRA
·2015-11-01 13:27

fastq-dump 报错 解决方案

命令行： ~/sratoolkit/sratoolkit.2.3.2/bin/fastq-dump --split-spot --gzip xxxx.sra 报错信息: fastq-dump.2.3.2
·2015-10-23 08:37

如何把sra格式转成fastq格式(fq格式)

sra是NCBI 推出的存储高通量数据的格式，而平常我们工作用得多是fastq格式。
·2015-10-23 08:29

编写猜数字游戏

代码如下：#include #include #include void game(int times) { int ret,input,i; printf("欢迎使用猜数字游戏"); sra
威尼斯小艇·2015-10-17 21:30

SRA解密报错：Data must start with zero

项目背景：要对打印地址进行加密，用公钥加密后会乱码需要base64decode一下，但是在解密时报错：javax.crypto.BadPaddingException:Datamuststartwithzero解决办法：1.加解密时KeyFactorykeyFactory=KeyFactory.getInstance("RSA");2.将加解密的Ciphercipher=Cipher.getIns
javaofliang·2015-10-09 21:00

初级网络技术支持

掌握端口绑定含义以及配置；3.掌握LAN口IP地址修改以及第二IP含义；4.掌握MAC地址克隆含义以及配置；5.掌握×××通过以及ALG含义和配置；6.掌握DSL调制模式、Annex种类以及BitSwap和SRA
宇文永·2015-06-03 15:53

Ram简介

RAM的分类  1)静态RAM（StaticRAM/SRAM），SRA
u010657219·2015-02-05 16:00

如何使用随机数函数

不过常常使用系统时间来初始化，即使用  time函数来获得系统时间，它的返回值为从00:00:00GMT,January1,1970  到现在所持续的秒数，然后将time_t型数据转化为(unsigned)型在传给sra
hustyangju·2014-11-24 03:00

软考程序员-笔试-考前练习试题【四】

-考前练习试题【汇总篇】 1.与十六进制数值CD等值的十进制数是A.204B.205C.206D.2032.在微型计算机内存储器中，不能用指令修改其存储内容的部分是A.RAMB.DRAMC.ROMD.SRA
51CTO学院·2014-08-13 15:59

自己动手写CPU之第五阶段（3）——MIPS指令集中的逻辑、移位与空指令

MIPS32指令集架构中定义的移位操作指令有6条：sll、sllv、sra、srav、srl、srlv。MIPS32
leishangwen·2014-08-01 13:52

《CS：APP》 chapter 6 The Memory Hierarchy笔记

6.1.1Random-AccessMemoryRandom-accessmemory(RAM)comesintwovarieties—staticanddynamic.StaticRAM(SRA
JasonLeaster·2014-07-16 15:49

深入理解计算机系统 2.63（转）

sra实现用逻辑右移完成算数右移srl实现用算数右移完成逻辑右移记住！
fengjingge·2014-04-22 21:00

RAM与Nand/Nor flash之间的区别 .

另一种称为动态RAM（DynamicRAM/DRAM），DRAM保留数据的时间很短，速度也比SRA
TopicDev·2014-01-13 20:00

Impdp Fails with ORA-39126 ORA-911 During Create Function (文档 ID 1254246.1)

PROBLEMInthisDocument  Symptoms  Cause  Solution  ReferencesThisdocumentisbeingdeliveredtoyouviaOracleSupport'sRa
royjj·2013-10-22 15:00
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