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染色体
文章复现-全外显子数据分析学习7-bam文件载入igv可视化
记录了每一条reads比对到参考基因组的结果,主要有11列比较重要的信息(每一列以制表符分开):bam文件的格式,如今我们的
染色体
那一列没有chr了,只有数字更多的说明可以
jiarf
·
2023-10-22 16:30
究竟谁是遗传物质?
在细胞中拥有细胞核,而细胞核中包含着
染色体
,
染色体
里还有个DNA。那么是细胞还是细胞核?或者是
染色体
还是DNA是遗传物质呢?探究这个问题,就要知道这些物质中哪个具有稳定性。因为一旦没有稳定性的话。
我的世界我的天下
·
2023-10-22 16:10
主要组织相容性复合体MHC
HLA位于人的6号
染色体
短臂上,H-2位于小鼠的17号
染色体
上。MHC可以分为经典MHC与非经典MHC两类,经典MHC
Seurat_Satija
·
2023-10-22 09:15
眼之城
因为阿伟跟我说,有可能小孬子的性
染色体
有问题,通常一名男性的性
染色体
是XY型,一名女性的性
染色体
是XX型。我问阿伟什么是性
染色体
,阿伟说:你就当做人肚子里面
卫子
·
2023-10-21 05:25
把基因画在
染色体
上
之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的
染色体
上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggplot2画了。。。
果蝇饲养员的生信笔记
·
2023-10-20 02:14
【纠错】遗传算法求解VRP计算车辆容量限制的代码有bug
关联文章关联的博客文章为:《遗传算法求解带时间窗的VRP问题(python)》原出错函数源程序代码如下:defvehicle_capacity_restraint(chrom):#计算一条
染色体
的车辆容量限制
Logintern09
·
2023-10-19 22:38
#
VRP车辆路径规划问题
算法
遗传算法
21世纪的心理学--基因与肥胖
21世纪以一个伟大的科学宣言拉开序幕:人类
染色体
的研究人员宣布他们很快就能研究出人类
染色体
化学碱基配对的序列图。这个计划最终目的是对组成
染色体
的基因提供一个全面的解释。
cloudsrosy
·
2023-10-19 07:49
如何绘制漂亮的Circos图
在生信分析中,如何在
染色体
层面查看不同区域/基因的表达情况,差异显著性呢?能否有一个图能够通过不同的图表样式,展示P值、上下调表达差异、均值等不同类别数据特征呢?
菌小落
·
2023-10-18 18:07
python
数据挖掘
开发语言
特发性婴儿动脉钙化的基因治疗模拟
研究背景特发性婴儿动脉钙化(IIAC)是一种罕见的常
染色体
隐性疾病,此种遗传病父母双方均为致病基因携带者,血缘关系会增加患该疾病的风险。
丰能医药
·
2023-10-18 01:16
【群体遗传学】1.0群体遗传学简介
进化开始于一个个体的一条
染色体
上的一个突变。分子群体遗传学研究的是这些突变在群体中频率的升高或降低。许多进化力量能够通过群体来加速或减缓这些突变的传递。
研究僧小蓝哥
·
2023-10-18 00:02
图位克隆的方法、过程及优缺点
用图位克隆法克隆目的基因,有三个步骤:第一步是目的基因的
染色体
定位并找到与目的基因紧密连锁的分子标记。一般说来,第一步的完成并不
天明豆豆
·
2023-10-17 16:51
以「同源蛋白」为参考,高效提升「基因结构注释」质量
大体上,应该是花了两三天时间,优化了20Mb*3,一共三条
染色体
的基因结构注释。当然,我们知道,二代测序数据,更或者是三代测序数据从某个角度来说是最优标准?
生信石头
·
2023-10-17 09:54
R语言处理基因芯片测序得到的SNP数据的一个简单小例子~进化树和PCA
最终拿到的数据格式如下image.png第一列是探针id第二列是
染色体
编号第三类是
染色体
位置第四列是第一个样本的基因型接下来依次是每个样本的基因型相当于是每行是一个位点,每列是一个样本这个数据集下载自链接
小明的数据分析笔记本
·
2023-10-17 06:50
五勤记·463:悄然以至②
虽然医学技术突飞猛进,消除很多致命的疾病,延长了寿命,但对衰老的速度依旧束手无策,尽管我们已经破解了衰老密码:
染色体
末端的DNA序列(端粒)。端粒长,衰老就
潭客的语文生活
·
2023-10-15 22:14
人类或小鼠
染色体
长度文件获取 hg19 mm10.chrom.sizes
创作日志:scHiCluster源代码中只给了人类的常
染色体
长度文件,小鼠的还需自己补充。
Crayon小鱼干
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2023-10-15 20:33
生物信息学
染色体长度
生物信息
基因组
数据分析
超级负责的高我
今晚同步连线案主和她的高我,全清结束了高我还是有很多事情要帮她做,请来光明天使做疗愈,请来高灵给她祝福,做DNA
染色体
清理,又提醒要做关于健康的意识转化,真的是超级负责和爱心满满的高我团队呀。
光行者Stella
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2023-10-15 02:18
祭看看(二)
染色体
有问题的你将会是不
杏花林
·
2023-10-14 19:06
NIPT(无创产前DNA检测)技术的解说及运用(二)
NonInvasivePrenatalTesting(以下简称“NIPT”),NIPT称为无创产前DNA检测又称为无创胎儿
染色体
非整倍体检测等。
生物菌君
·
2023-10-14 11:10
ChIP-Seq分析流程记录
ChIP-seq简介概念:ChIP-Seq是用于在全基因组范围中研究DNA结合蛋白(相互反应)、组蛋白修饰(表观遗传标记)和核小体的技术,研究这三个主题可有助于了解基因之间的相互调控以及
染色体
的功能结构
Zhai1994
·
2023-10-14 06:01
致女儿书
比起生物学意义上的X、Y
染色体
大冒险,妈妈更爱民间关于孕育的诸多美丽传说:前世人儿喝了孟婆汤踏上转世路,分男女两拨成批被运至人间,常有眷恋不
美玲_518
·
2023-10-12 16:05
4. Chromosome
A课时数:2(第4次课)B课程内容4.1DNA的"包装"4.2
染色体
结构4.3核小体C主要知识点专业名词染色质Chromatin
染色体
Chromosome常染色质Euchromatin异染色质Heterochromatin
KXie
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2023-10-12 12:53
遗传算法
遗传算法步骤:1、产生初始种群、编码
染色体
,基因2、利用适应度函数,计算每个个体的适应度3、选择适应度高的个体,留下来4、交叉5、变异满足设定阈值或迭代结束,否则跳入第二步。
被强煎的荷包蛋
·
2023-10-12 04:08
微卫星不稳定性(MSI)
微卫星序列以1-6bp为一个重复单元,重复次数不超过60次,人类基因组中有数以万计的微卫星位点,这些微卫星位点近似均匀的分布在各个
染色体
上,所有的微卫星序列约占整个基因组的3%,微卫星序列按照
Seurat_Satija
·
2023-10-11 20:38
BCR-ABL融合基因及检测
费城
染色体
费城
染色体
(Philadelphiachromosome,Ph(orPh')chromosome),或称费城
染色体
易位(Philadelphiatranslocation),是一种与慢性粒细胞性白血病
weixin_30672295
·
2023-10-11 08:38
端粒效应
我们都知道,人体的每个细胞里有23对
染色体
。
染色体
包含一个人的完整遗传信息,它是由DNA和蛋白质组成。DNA代表遗传信息编码,
辰_cc
·
2023-10-11 02:29
2022-01-12 感受态细胞转化实验
质粒:存在于许多细菌以及酵母菌等生物中,是细胞
染色体
外能够自主复制的很小的环状DNA分子。原
黎洛007
·
2023-10-10 17:12
肥胖问题,真的就是基因导致的吗?别急着甩锅
遗传性肥胖也被称为基因肥胖,这是科学能证明的,目前,与肥胖相关的基因有300多个,分布在除Y
染色体
以外的所有
染色体
上。
4d1ace664e0a
·
2023-10-10 01:12
分子生物学词汇(A~B)
AbandA带AchromosomeA
染色体
[二倍体
染色体
组中的正常
染色体
(不同于B
染色体
)]Asite[核糖体]A部位ABA脱落酸abasicsite脱碱基位点,无碱基位点abaxial远轴的abequose
casularm
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2023-10-09 19:53
03.Biology
生物
inheritance
system
basic
structure
buffer
2021-06-15遗传咨询要点
HBOC)、林奇综合征(Lynchsyndromes,LS)和Peutz-Jeghers综合征(Peutz-Jegherssyndromes,PJS)与遗传性卵巢癌、子宫内膜癌、子宫颈癌相关,三者均为常
染色体
显性遗传
drseven
·
2023-10-09 07:07
ggibo
1、Addideogramtrack:Plotsinglechromosomewithcytobandlibrary(ggbio)画一条
染色体
或片段:#chr1isautomaticallydrawnbydefault
小七玩数据
·
2023-10-09 02:59
ATACseq--染色质开放性测序
ATAC-seq:利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术
染色体
/质结构:细胞核DNA与组蛋白相结合,DNA缠绕在组蛋白上形成串珠式结构,因此染色质结构高度折叠(压缩)。
HOLLYxiao
·
2023-10-09 02:26
2022-11-29
CellSystems|男性癌症中体细胞XIST激活和X
染色体
失活的特征原创图灵基因图灵基因2022-11-2910:11发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制癌细胞的基因发生变化,使其能够不受抑制地生长和增殖
图灵基因
·
2023-10-09 01:00
植物基因组测序二十年:成就与挑战
采用新型支架策略的长读测序进一步彻底改变了基因组测序,使得随着基因组复杂性和大小的增加,可以获得更多的植物物种
染色体
规模的装配。
Bioture
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2023-10-08 11:01
HIC测序数据生信分析——第三节,HIC数据挂载
HIC测序数据生信分析——第三节,HIC数据挂载将预处理后的HIC数据挂载到人工
染色体
上方法一:ALLHiC软件——接前面《HIC测序数据生信分析——第二节,预处理HIC数据》这一篇里面的方法一:Hicup
彼岸花128
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2023-10-08 08:00
HIC分析
生物信息学
linux
遗传图谱的绘制
以遗传图距(cM)为单位绘制的
染色体
上基因或标记之间相对位置的连锁图。
wo_monic
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2023-10-08 07:15
共济失调遗传家族
病因:大多数患者有遗传家族史,遗传方式可为常
染色体
显性、隐性遗传、性连遗传和没有遗传家族史的散发病例。二、表现1.本病各地区均有发生,患病率为1.1—3.7/10万。
QJY丶初见
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2023-10-07 04:52
计算机智能专题-遗传算法(1不带约束的)
通过模仿遗传学中
染色体
的交叉、变异、并通过“优选”,使父代产生更优的“子代”,在不断的“优胜略汰”中,最终得到最优的组合。更新ing,,,,本篇文章讲的是:遗传算法的整数编码,原理较为简单可以用作入门
没蜡笔的小新q
·
2023-10-06 02:11
算法
算法
林川老师:分享身体强壮的男人更容易生儿子
因为,胎儿的性别取决于
染色体
的结合,男性正常
染色体
为46,XY;女性则为46,XX,如果带X
染色体
的精子跟卵子结合就会生女孩,Y
染色体
精子与卵子结合则生男孩。
Teacher小雷
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2023-10-05 22:17
基因和
染色体
_基因是DNA_DNA是动物细胞的遗传物质-YHM-20191020
利用DNA可引入新的遗传特性给动物细胞或整个动物-将DNA加入到培养生长的真核生物细胞群体中,核算进入细胞,有一些会导致产生新的蛋白质。当使用纯化的DNA时,DNA加入到细胞中可以产生特殊的蛋白质。由于历史原因,用真核生物细胞做这些实验时称为转染(transfection),他们是细菌转化的直接辅证。-当初,这些实验仅对适于培养基生长的个体细胞是成功的。然而,自此以后,将DNA通过微注射导入小鼠卵
天空的小白
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2023-10-05 15:08
连锁分析方法介绍
一、基础知识1、基因连锁:基因连锁是指在有性生殖的减数分裂过程中,
染色体
上的DNA序列紧密结合在一起的倾向。
bioyangyang
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2023-10-05 10:42
参考基因组的选择
人参考基因组参考基因组的contig指连续的序列,比如一号
染色体
chr1.contig人种参考基因组包含以下部分:chromosomes|包含ch1-chr22,chrX,chrY,chrMunlocalizedsequence
BeeBee生信
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2023-10-05 07:24
OmicCircos-解救长热图
如下:圆圆的热图原来很多文章里面用来画
染色体
分布的图,也可以用来呈现热图呢。附上我的小代码:library(OmicCircos)##Mydataisinput.corrs,colunm'a','b'
judyhappy
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2023-10-05 01:33
Hi-C辅助基因组组装原理|主流软件
导语Hi-C是高通量
染色体
构象捕获(High-throughputChromosomeConformationCapture,Hi-C)技术的简称,开发于2009年,最初用于捕获全基因组范围内所有的染色质内和染色质间的空间互作信息
lixingze
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2023-10-03 22:59
基因组学
基因组概论基因组(Genome)指的是细胞内全套
染色体
及其所携带的全部基因,包括基因序列和基因间序列。C值(CValue):在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量。
没有眼镜
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2023-10-03 06:29
我与寒冷性荨麻疹。
前者属常
染色体
显性遗传,出生后或早年即可发病,可持续终生,后者多见于女青年。本病特点是接触冷水或其他冰冷物质后,受冷区出现瘙痒性水肿和风团,半小时至1小时左右可消失。
他年梦花
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2023-09-30 20:18
2022-07-20
Nature|单细胞测序揭示核
染色体
的位置决定了分离错误的频率原创骄阳似我图灵基因2022-07-2007:13发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制语音朗读本文音频:00:0009:48撰文:骄阳似我
图灵基因
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2023-09-30 13:03
质粒转化与质粒小提/大提
质粒是细菌、酵母菌和放线菌等生物中
染色体
(或拟核)以外的DNA分子,存在于细胞质中(但酵母除外,酵母的2μm质粒存在于细胞核中),具有自主复制能力,使其在子代细胞中也能保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息
XIAO油菜花
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2023-09-29 09:12
分子标记(包括基因测序)
背景在最开头,我们来说下两种遗传模式:1核基因组是双亲遗传的(一条
染色体
来自母本,一条来自父本),只有性
染色体
是单亲遗传的,但不是所有生物都有性
染色体
。
xiaoxianyu
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2023-09-29 08:44
基因富集分析 GSEA for time-course
即综合现有的对基因的定位、性质、功能、生物学意义等信息基础,构建一个分子标签数据库,在此数据库中将已知基因按照
染色体
位置、已建立基因集、模序、肿瘤相关基因集和GO基因集等多个功能基因集进行分组与归类。
易易欢欢
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2023-09-28 23:10
GSEA
生信
gene
expression
matrix
我有二胎了
查了
染色体
,体检查了全身,除了有点低血压和气血亏虚外,没有发现任何问题。想着等自己补好身体
飘飘无心云
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2023-09-27 22:18
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