环状RNA 第11页

14-IF8+:纯生信分析m6A基因与白血病预后的关系

一.研究背景近两年，科学家们首次发现了一种可逆性的RNA甲基化—m6A，m6A是真核生物mRNA中最常见的修饰[1]，m6A修饰能调控基因表达、蛋白质的转录和mRNA的可变剪切[2,3]。

AAA肿瘤信息学王协·2023-10-15 07:39

IF：4+ 膀胱癌RNA结合蛋白相关预后模型

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你71篇原创内容-->公众号最近分享了很多转录组的高级别分析，有同学问我这些分析怎么才能运用到文章中，文章的都应该分析哪些，才能够发篇SCI文章呢？这期我们就选择一篇最近发表的文章，利用桓峰基因的公众号里面的教程来搞一篇paper吧！21年3月发表

90066456ace6·2023-10-15 04:17

2022-10-21

2022-10-2110:11发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=68.164推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、作者开发了MultiVelo，一种基因表达的微分方程模型，它扩展了RNA

图灵基因·2023-10-15 04:08

幻日

温柔的七彩光透过云层的冰晶带在太阳周围反射弯曲成环状。那光亮的日影挂在中间，日晕的两边宛若两个小一号的太阳。宇文陌眼底闪过一丝忧虑。“将军大人，今有三日凌空。恐有大灾降临，请将军速速撤兵。”

诃子_c846·2023-10-15 02:46

DRESIS：全球首个综合耐药性数据库

：https://idrblab.org/dresis/01、ADTT:药物治疗靶点的变异;02、IDUE:药物摄取和药物排出的不规律;03、DISM:结构修饰导致的药物失活;04、EADR:DNA、RNA

SHANGHAILINGEN·2023-10-14 23:04

完整的单细胞分析通用流程——质控

最明显的原因是细胞损伤后线粒体比例增加或核RNA富集。在最坏的情况下

麒麟991·2023-10-14 16:15

TT-seq文献阅读(TT-seq maps the human transient transcriptome)

今天的笔记是关于另一种RNA测序的方法，称为TT-seq。其实这些测序方法在几年前被人们所使用了，但是因为自己并不了解这些知识，所以要慢慢的补起来。

生信start_site·2023-10-14 15:34

转录组数据分析流程

转录组是在特定时空条件下细胞中基因转录表达产物，广义的转录组包括信使RNA，核糖体RNA，转运RNA及非编码RNA，狭义上是指所有mRNA的集合，转录组分析能够获得不同基因的表达情况。

队长的生物实验室·2023-10-14 14:47

医学分析专业名词解释

表观遗传学的调节机制主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA作用等多种形式，其中，DNA甲基化是目前研究的比较清楚的表观遗传修饰方式。DNA高度甲基化首先会影响DNA结构，

LazyHaokj·2023-10-14 11:27

2019汇总之从4个关键词看单细胞与肝癌文献

的单细胞与病毒感染在讲单细胞与肝癌之前，我们先去看一下单细胞揭示正常肝脏细胞特征的分析，该文章于2019年7月发表于***Nature***，研究团队对来自9位人类供体的正常肝脏组织中的大约10,000个细胞进行了单细胞RNA

生信宝典·2023-10-14 11:22

易基因｜深度综述：RNA m5C修饰的生物学及在肿瘤发生和免疫治疗中的作用

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年4月1日，《BiomarkRes》杂志发表了题为“BiologicalrolesofRNAm5CmodificationanditsimplicationsinCancerimmunotherapy”的综述文章，综述了RNAm5C甲基化修饰的生物学作用及其在癌症免疫治疗中的潜在机制。期刊：BiomarkerResearch日期

易基因科技·2023-10-14 11:47

M6A rna甲基化最新研究成果进展、论文合集（2021年）

甲基化介导的RMRP稳定性通过调控TGFBR1/SMAD2/SMAD3通路，导致非小细胞肺癌的增殖和进展2021-11-04报道，基于TheCancerGenomeAtlas数据库的综合分析，作者发现线粒体RNA

“泽平科技”公众号24h在线答疑·2023-10-14 11:16

肘关节痛针刀.断与治疗 - 草稿

一，环状韧带经以上'1一3条检查阴性的患者检查：旋转抗阻试验，手腕左右旋转阳性(肘部痛外上踝)定点：伸臂在肱桡关节缝向下半横指(0,5厘米)再曲肘医者左手按压同时向内拉将肌肉移向内侧，在侧面定点。

5b174e87ee68·2023-10-14 08:05

miRNA数据分析专题

miRNA是一类长度在18到36bp的非编码RNA,其功能属于转后后修饰调控，主要通过和mRNA的3’UTR区进行结合，结合区域称之为`seed`，当结合区域的序列完全配对时，诱导mRNA降解，当只有部分序列配对时

生信修炼手册·2023-10-13 20:25

生信学习笔记：生物信息学测序分析基本流程入门笔记

文章目录前言短序列比对软件sam文件insertsize基因差异表达计算变异检测物种组成与丰富度计算kmer估计基因组大小序列拼接Pregraph常用序列拼接软件基因组污染分析RNA-seq与meta序列拼接基因功能注释非编码

twocanis·2023-10-13 20:54

RNA-seq生信分析流程

RNA-seq生信分析流程RNA-seq是近些年发展起来的针对转录组的测序技术，其能够获得mRNA、smallRNA以及各种非编码RNA的序列。

wangchuang2017·2023-10-13 20:54

文献学习笔记丨转录组表达数据的生信挖掘研究

引言基因表达特征：时空特异性转录层面研究基因表达的技术：PCR、基因芯片、转录组测序（RNA-seq）、Nanostring等高通量技术：检测样品中的大量基因表达情况，目前的热门研究领域。

生信分析笔记·2023-10-13 20:48

数据类型的转换2021-01-28

在网络上找到的代码###先下载对应关系，得到一个个单独的表格rm(list=ls())#####################################downloadmiRNA_RNA_interaction

流光溢彩426·2023-10-13 16:57

外泌体介绍 - MedChemExpress

走近外泌体此前，小M已经给大家介绍过外泌体了，它是由细胞分泌的包含RNA和蛋白质的小囊泡，广泛存在于血液、唾液、尿液及乳汁等体液中，具有细胞信使功能，参与细胞通讯。

MedChemExpress·2023-10-13 13:26

学术爆款“空间转录组技术”，都有哪些技术？ | 空间转录组学方法综述

本综述中提及的已发表方法的简要时间表空间转录组技术的比较基于微解剖基因表达的技术捕捉空间基因表达信息的方法只是通过从样本中分离出目标区域，然后将这些区域单独放入试管中进行RNA提取和后续的

尐尐呅·2023-10-13 04:49

二代测序文库构建-概述与挑战（1）

本文，我们研究了影响测序文库质量的关键因素，以及，在DNA来源和RNA来源文库准备过程中存在的挑战。

Juan_NF·2023-10-13 03:49

2021-12-17

单细胞RNA测序和多重免疫荧光分析显示，p-ER

图灵基因·2023-10-12 14:22

matlab 图片中花体字母,banal(26字母花体英文可复制)

rna?t]v.结果是；生产；出现；关闭；翻转；证明是okay核心词汇英[???'ke?]美[o?'ke?]

731英语第一·2023-10-12 09:09

那么多的基因，我只想要mRNA和lncRNA（或者miRNA）怎么办？

这个功能在GDCRNATools里好像上不支持的，因为这个包都是下载全部的RNA数据（包括其他的TCGA工具基本都是只下载RNA数据），具体要区分mRNA和lncRNA是要有专门注释文件的。

欧阳松·2023-10-12 07:47

生信知识补充

serialanalysisofgeneexpression)、LongSAGE和MPSS(massivelyparallelsignaturesequencing)；（3）基于第二代测序技术的转录组测序，又称为RNA-Seq

Bio_Learner·2023-10-12 05:10

ESP8266 WiFi物联网智能插座—下位机软件实现

目录1、软件架构2、开发环境3、软件功能4、程序设计4.1、初始化4.2、主循环状态机4.3、初始化模式4.4、配置模式4.5、运行模式4.6、重启模式4.7、升级模式5、程序功能特点5.1、日志管理5.2

不脱发的程序猿·2023-10-11 18:27

空转旋转 seurat spatial rotate 图片翻转数据结构对象 seurat的空转数据存储

如果取的一级结构Assays的下属内容：无差别>class(pbmc[['RNA']])[1]"Assay"attr(

Young.Dr·2023-10-11 11:44

约瑟夫环-猴子选大王(变型题)

这篇我们来说，从任意猴子k的位置开始报数，当报到n时，第n个猴子出去，从n+1猴子开始，从1继续报数问题描述：约瑟夫环运作如下：1、一群猴子围在一起坐成环状（如：N）2、从某个编号开始报数（如：K）3、

做一个体面人·2023-10-11 10:47

2022-01-06

图灵基因·2023-10-11 04:08

The pipeline of RNA-seq（菜鸟教学）

一、准备工作1.1设置好专门的用于RNA分析的环境在SRA中下载目标序列，使用wget指令使用conda激活rna分析环境1.2工作目录管理##示例如下：├──database#数据库存放目录，包括参考基因组

理想吃饭没·2023-10-11 04:00

转录组测序原理

RNA-seq应用通过RNA-seq，也就是转录组测序，可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括：正常组织与肿

Peng_001·2023-10-11 04:32

单细胞转录调控网络分析工具（TF，motifs）-SCENIC

SCENIC(Single-CellrEgulatoryNetworkInferenceandClustering)是从单细胞RNA数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具。

清竹饮酒·2023-10-11 02:27

2021-06-25 点亮RNA——CRISPR/Cas系统

点亮RNA——RNA可视化与追踪的方法有很多，其中基于CRISPR/Cas系统的活细胞RNA可视化是近年来随着CRISPR相关技术发展而衍生的。

NAome·2023-10-11 01:11

2022-01-12 感受态细胞转化实验

质粒：存在于许多细菌以及酵母菌等生物中，是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA分子。原

黎洛007·2023-10-10 17:12

核酸结果背后的检测人员

核酸检测实验室分为三个区：一区扩增试剂配制区，正常压力；二区核酸提取区（负压区），检测检测人员首先将标本放在震荡器剧烈震荡五分钟，然后用加样枪将保存液转移到含有磁珠的提取液96孔板，然后放到放进提取仪，通过酶和剧烈震荡将RNA

墨清_·2023-10-10 07:53

MC：m6A相关lncRNA组织特异性

m6A是癌症研究的热点，而今天小编要和大家分享的是今年一月份发表在MolecularCancer（IF:15.302）杂志上的关于泛癌中m6A相关长非编码RNA的文章。

概普生信·2023-10-10 04:30

环形缓冲RingBuffer和无锁

环形缓冲区的特点是其终点和起点是相连的，形成一个环状结构。这种数据结构在处理流数据和实现数据缓存等场景中具有广泛的应用。环形缓冲区的主要作用是存储和管理数据。

only_·2023-10-10 04:43

专注的魅力

加遥控器在手频道的选择更陷入一中循环状态。手机发展的迅速跟谁的网络浏览室，只要时间稍久。速度过慢，别让人失去耐心。指头开始无意识的点击鼠标造成心智是觉的状态你是在孩子训专注力的训练过程当中。

大H小Q的日常·2023-10-09 23:15

c语言数组模拟环状,简单实用的环形队列(C语言)

#include#include#include#definetrue1#definefalse0typedefintQueueType;typedefstruct_tQUEUE_{QueueType*pValue;intfront;intrear;unsignedinttotalSize;unsignedcharinitFlag;}MyQueue;unsignedcharQueueIsEmpty

咱也不敢说·2023-10-09 23:55

小RNA ----计算miRNA 表达量

https://www.biostars.org/p/302465/https://www.biostars.org/p/297272/啊啊啊啊啊啊选取唯一比对的序列uniqereadnohupls*sam|whilereadid;dosamtoolsview-S-F4$id|grep-v"XS:">${id%%%_*}.sam;done&比对到miRNAbase上的reads数目的统计，没有好办

Weiyx·2023-10-09 15:09

【R语言可视化】-- 环形柱状图

把柱状图画成环状的！别看成了饼图哦！它们还是柱状图哦！本期代码+示例数据+效果图+课程笔记，均可在公众号可视化艺术后台回复20220228获得！本期效果展示制作不易，欢迎点赞+在看！

可视化艺术·2023-10-09 14:30

2020-12-23

选择适当的运动，可以改善高血压患者的微血管状况，从而改善高血压患者的血液循环状况。高血压患者在运动中千万不要选择剧烈运动，而步行是高血压患者最安全、最有效的运动方式。

芊秋堂·2023-10-09 06:12

代码随想录算法训练营day59 | 503.下一个更大元素II，42. 接雨水

代码随想录算法训练营day59|503.下一个更大元素II，42.接雨水503.下一个更大元素II解法一：单调栈（两次遍历解决环状问题）42.接雨水解法一：单调栈（横向累计）解法二：暴力解法解法三：双指针优化总结

小鲨鱼冲冲冲·2023-10-09 05:51

第三代慢病毒载体系统

第三代慢病毒载体系统又增加了两个安全特性：一是构建了自身失活的慢病毒载体，即删除了U3区的3’LTR，使载体失去HIV-1增强子及启动子序列，即使存在所有的病毒蛋白也不能转录出RNA；二是去除了tat基因

实验小助手·2023-10-09 00:51

RNA m6A甲基化检测方法

前面给大家简单介绍过m6A甲基化的概念，也给大家介绍了☞m6A甲基化数据分析流程☞corrplot展示m6a甲基化基因表达相关性☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值☞m6a甲基化相关基因根据临床信息分组绘制boxplot并显示p值m6A检测方法最近几年来m6A研究迅速发展，正是得益于meRIP-seq技术的开发及应用。meRIP-seq高通量测序技术的出现，能够高效精确检测全转录组不同的

生信交流平台·2023-10-08 13:48

日本建筑之东北

大唐环状列石：藤森照信先生已经把世界上的环状列石看遍了，此处位于秋田县的鹿岛市，是贵重的绳文遗迹。

Sammy元·2023-10-08 12:50

定量PCR Taqman探针设计与体系优化

第一步：在第一步目的基因查找比对过程中可以利用NCBIgenbank序列以及DNAstar等软件完成目的DNA或者RNA的查找与比对——这在分析测序报告的时候相信很多人操作过，这一步需要注意的就是要保证所分析的序列在一个

weixinsuoxian·2023-10-08 01:39

启动子作用功能以及分类介绍

启动子可以被RNA聚合酶辨认，并开始转录合成RNA。

期待未来·2023-10-07 20:18

【scRW】[4]Single-cell RNA-seq: Quality control set-up

Understandhowtobringindatafromsingle-cellRNA-seqexperimentsQualitycontrolset-up1.Exploringtheexampledataset在本次研讨会上，我们将使用单细胞RNA-seq

RachaelRiggs·2023-10-07 12:48

#日常#-2022-09-18

用pct做个miRNA线性，再提个血清的外泌体RNA吧。平凡科研狗的日常，明天认真干活吧。嗐，今天没有扫地拖地。

Lilliandoing·2023-10-07 11:52

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