16s

tc溜溜865手机投屏卡_魅族17官宣！| 3799起 红魔5G游戏手机小白体验视频

值得一提的是，魅族使用的配图主体还被不少网友猜测是魅族17，但细看发现其实是熟悉的魅族16s，海报里面还集齐了历代的正面设计，1-8应该依次是：魅
彭元鸿·2020-12-16 21:27

微生物组数据学习笔记

Microbiota微生物群：与微生物组同义，仅指16S扩增子研究细菌组。Metagenome宏基因组：狭义仅指宏基因组测序分析基因组和功能基因，广义泛指研究微生物组的学科。
曲凉不见·2020-12-10 14:38

微生物多样性qiime2分析流程(4) 训练特征分类器进行16s数据注释

经过前面的分析步骤，我们得到了特征表，代表序列及进化树文件，并更改了其名称；接下来就让我们根据silva138数据库训练特征分类器来对代表序列进行注释:1.导入参考序列数据库timeqiimetoolsimport\--type'FeatureData[Sequence]'\--input-pathsilva.16s_bacteria.fasta\--output-pathsilva.16s_ba
R语言数据分析指南·2020-10-31 10:45

16S测序分析（三）用LEfSe寻找组间差异细菌

导读前面已经介绍了获取菌属相对丰度表的方法，以及多样性分析中的基本概念和计算方法。接下来将开始介绍一种寻找组间差异细菌的常用方法LEfSe。LEfSe（LineardiscriminantanalysisEffectSize）是哈佛大学的CurtisHuttenhower教授在2011年以第一通讯发表在GenomeBiology中的统计方法。现在这篇文章的引用已经达到1100余次。LEfSe能用于
胡童远·2020-10-28 16:50

微生物多样性qiime2分析流程(7) 运用blast比对方法对16s数据进行注释

前面介绍了如何使用qiime2训练特征分类器对16s数据进行分类注释，但是由于其占用内存较高，个人电脑难以运行，现在介绍如何利用blast比对的方法进行数据注释。
R语言数据分析指南·2020-10-28 10:02

寻找一部用起来最舒适的骁龙855Plus旗舰机：魅族 16s Pro

这一次的魅族，依旧是熟悉的影子，从魅族16th，到魅族16s，到现在的魅族16sPro，看似不变的外观，内在悄悄的发生改变了。
Vsun·2020-10-10 07:55

16S测序分析（二）菌群多样性分析

导读多样性分析是16S测序分析中常见的分析方法。
小白菜学生信·2020-09-17 14:01

向NCBI上传16S rDNA数据的操作详解

目录写在前面的话正文登录NCBI上传网页查看一些引导信息提交数据上传数据的结果总结其他的发现写在前面的话百度了一下，发现并专门向NCBI上传16SrDNA数据的方法不太多。因为自己有上传数据的需要，所以决定边摸索边写下操作流程。如果这篇博文帮到你的话，还请点赞收藏。正文登录NCBI上传网页https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/登录这个网页可以看到NCBI现在做的比较人性化
月司·2020-09-16 17:37

R语言重现STAMP结果图

数据准备这里我将使用一套同一环境位点水体和沉积物16S扩增子测序的P
一个人旅行*-*·2020-09-15 08:14

最后1天|宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam·2020-09-15 06:34

最后3天|宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam·2020-09-15 06:33

最后一周 | 微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam·2020-09-15 06:33

16S扩增子分析 | 02 去噪和聚类

读前须知nohup后台运行nohup后台运行时，要将qiime2-2019.7环境激活，否则会报错！一定要记得激活！激活！激活！nohupbash01.sh&nohup指不间断地运行，是nohangup的缩写。当运行一个进程的时候，不想让其在你退出账号时关闭，即可用nohup。nohup在不规定的情况下，所有输出内容会保存到nohup.out中。后缀&是让程序后台运行，但注意，后台运行不代表不受S
小虎牙儿·2020-09-15 06:21

16S扩增子分析 | 05 Alpha和Beta多样性分析

利用宏基因组、16SrRNA测序等高通量测序技术分析微生物群体结构的时候，常见的有α和β多样性两个指标。Alpha多样性分析Alpha多样性主要反映样本内多样性。在肠道菌群分析中，是用来衡量个体内菌群的多样性，注意是单个个体，不涉及个体间的比较。Alpha多样性主要与两个因素有关：一是种类数目，即丰富度；二是多样性，群落中个体分配上的均匀性。通常有三类相关指数，测序深度指数（Observedspi
小虎牙儿·2020-09-15 06:21

微生物组-宏基因组分析第8期 (报名直播课免费参加线下课2020.7，最后一周)

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
生信宝典·2020-09-15 05:30

Java格式化字串输出固定长度

字串格式化输出经常用到，将字串固定输出长度可以使用如下方式格式化输出：Stringname="youxiong";name=String.format("%-16s",name);System.out.println
IT_熊·2020-09-13 05:18

opencv像素基本操作及图像遍历at

矩阵元素的表达：对于单通道图像，其元素类型一般为8U（即8位无符号整数），当然也可以是16S、32F32F等；这些类型可以直接用uchar、short、float等C/C++语言中的基本数据类型表达。
sbaban·2020-09-12 21:59

16S测序分析（四）用MaAsLin寻找组间差异细菌

导读MaAsLin（MultivariateAnalysisbyLinearModels，多变量线性回归模型）功能：相关性分析特点：多表型同时分析，矫正协变量数据输入：表型，微生物群丰度或功能数据类型：连续型，布尔型（二分类型），离散型数据要求：矫正到1MaAsLin在线工具地址：https://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/一、输入数据格式应如下：图片.p
胡童远·2020-09-11 17:05

16S测序分析（五）用RandomForest寻找关键细菌

导读用随机森林“分类”的方法寻找16S测序数据中与分组有关的细菌。
胡童远·2020-09-11 17:53

四款855旗舰对比：除开价格，各有优点

截止目前已经有多款国产855旗舰手机发布了，今天小编就来大家简单的对比一下当下最火的四款手机，它们分别是小米9、iQOO手机、联想Z6Pro和魅族16s，价格上它们都相差无异，起步配置也都是6GB+128GB
techweb·2020-08-26 23:19

扩增子图表解读5火山图：差异OTU的数量及变化规律

作者:刘永鑫日期：2017-7-1阅读时长：10min背景介绍(Introduction)宏基因组学宏基因组学目前的主要研究方法包括：16S/ITS/18S扩增子、宏基因组、宏转录组和代谢组，其中以扩增子研究最为广泛
刘永鑫Adam·2020-08-25 17:52

小米9降价血拼魅族16s，评论区却一边倒？

近日小米9直降200，意图想要反攻荣耀，没想到却使得价格与魅族16s齐平，被魅族16s阻击。两款旗舰再次狭路相逢，这也让网友发出了疑问，同价同配置小米9和魅族16s，到底选谁好呢？
蒋先森科技杂谈·2020-08-25 05:28

魅族16s对决小米9，618大促该如何选择

不过，在后台私信笔者最多的机型，永远是魅族、小米这两家的旗舰手机，不仅仅是因为这两家手机厂商一对老冤家，更多的原因是因为魅族16s、小米9都是表现优秀的旗舰手机，这两部手机中该如何选择呢？
海风数码·2020-08-25 05:02

618 旗舰手机就选魅族16s

不少小伙伴都纠结目前市面上魅族16s
玩转数码·2020-08-24 08:39

Fit健身APP产品体验报告

Fit健身APP产品体验报告一、体验环境体验机型：魅族16s；操作系统：安卓9/Flyme7.3.0.1；体验版本：5.0.8。
MintMr·2020-08-21 16:56

OpenCV学习之路（三）——Mat对象基本操作

矩阵的基本元素表达对于单通道图像，其元素类型一般为8U(即8位无符号整数)，当然也可以是16S、32F等；这些类型可以直接用uchar、short、float等C/C++语言中的基本数据类型表达。
_imp_·2020-08-20 22:06

小技巧：Linux实用命令之cut, sort, uniq

将文本分隔成一段一段后，-f用来取出第几段-c:指定取出第几个字符，也可以指定从第N个到第M个按区间取示例1查出last中有哪些人登录过root@~$lastrootpts/0192.168.18.1WedApr306:16s
鼯鼠的柏拉图之洞·2020-08-20 18:32

2020中兴捧月-傅里叶-丰收祭赛题常规解法

语言：python耗时：一阶段256*640：16s，二阶段1344*1344：600s。复赛入围题目要求可以概括为无向图找环。
这名字都能重？·2020-08-20 06:19

魅族 16s爆款旗舰限时直降500元

其中优惠力度最大的产品莫过于魅族16s，作为
小小的科技·2020-08-19 20:07

四大图像库:OpenCV/FreeImage/CImg/CxImage

但该库似乎不大稳定，对32F和16S
际宇凡星·2020-08-18 15:36

Java基础面试（String，泛型，关键字、IO）

不可变的好处JVM创建String的2中方法subString方法equals和compareTo关键字finalstatic接口和抽象类javaIO/NIOJava基础基本类型和包装类型byte/8char/16s
Aaron.JJJ·2020-08-14 18:27

使用R语言获得16S物种丰度

还是获得16S物种丰度得老问题，最近在一台新机器上安装qiime1，发现有报错，对于这种停止维护的软件，也是正常现象吧，于是想别的办法解决，恰巧最近读R几本R语言的入门书，发现prop.table()这个函数是可以实现相关功能的
zd200572·2020-08-08 01:11

使用ComplexHeatmap包绘制个性化热图

包绘制个性化热图作者：刘梦瑶诺禾致源微生物信息审稿：刘永鑫中国科学院遗传与发育生物学研究所ComplexHeatmap包由顾祖光博士创建，是一个非常全面的绘制热图的R包，可以利用它来绘制许多文献中的美图，例如下图展示的16S
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:04

Microbiome：16S扩增子测序研究中定量变异和生物量影响

16S扩增子测序研究中定量变异和生物量影响Quantificationofvariationandtheimpactofbiomassintargeted16SrRNAgenesequencingstudiesMicrobiome
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:32

16s扩增子分析注意事项和经验总结Tips

个人1年多16s/ITS扩增子分析中积累的点点滴滴，此文适合新人了解相关零散知识，也适合有分析经验的人交流与讨论。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:27

扩增子图表解读2散点图：组间整体差异分析(Beta多样性)

“宏基因组”公众号作者:刘永鑫日期：2017-6-29阅读时长：10min背景介绍(Introduction)宏基因组学宏基因组学目前的主要研究方法包括：16S/ITS/18S扩增子、宏基因组、宏转录组和代谢组
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:26

微生物绝对定量研究知多少

目前细菌群落研究常用的技术是16S相对定量扩增子测序，而最近越来越多的研究者开始采用绝对丰度（即菌群的实际数量）对细菌群落进行绝对定量研究，今天小编就微生物绝对定量研究的一些常见问题在此总结一下。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:26

普鲁克分析（Procrustes Analysis）评估物种-环境/功能关联度的一个示例

（Zhaoetal,2019）大体意思是，作者测量了活性污泥（AS）中的细菌群落（16S）组成和抗生素抗性基因（ARGs）丰度，然后分别执行了OTUs和ARGs亚型的非度量多维标度（NMDS）分析，基于获得的两组
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:25

KOMODO：用16S rDNA序列预测其培养基配方的网站

本文转载自“微生物生态”，己获授权，本平台编辑对内容进行测试和更新。今天卢瑟菌给大家隆重推出一个超级好的网站，网站名字叫KOMODO(KnownMediaDatabase)，没错，网站作者就是严(tiao)肃(pi)地把科莫多巨蜥的照片放在了网站主页，见下图1左上角。言归正传，这个网站的神奇之处就在于可以根据细菌或古菌16SrDNA的序列来预测培养该菌的培养基配方！文章发表在2015年10月13号
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:25

基于16S的细菌群落功能预测工具Tax4Fun2

基于16S的细菌群落功能预测工具Tax4Fun2回想第一次接触微生物组分析时是2017年，那会儿主流的两个基于16S的细菌群落功能预测工具就是PICRUSt和Tax4Fun，均可以获得类似于宏基因组的功能丰度数据
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:25

扩增子16S分析专题研讨论会——背景介绍

整理一下我近期报告的PPT、文稿和视频，分享给大家，希望对同行有所帮助。本节课程视频共分3部分。https://v.qq.com/x/page/t3015tp7d5u.htmlPart1.21扩增子分析背景介绍p1-23，23minhttps://v.qq.com/x/page/j3015gkf92g.htmlPart2.21扩增子分析背景介绍p24-39，32minhttps://v.qq.co
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:24

16S预测细菌表型-bugbase：革兰氏阴阳、生物膜、致病力、移动元件、氧气消耗等...

基于16SOTU表预测细菌表型数据库，同时可进行组间差异分析BugBasePredictsOrganismLevelMicrobiomePhenotypesTonyaWard,JakeLarson,JeremyMeulemans,BenHillmann,JoshuaLynch,DimitriSidiropoulos,JohnSpear,GregCaporaso,RanBlekhman,RobKni
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:53

Cell子刊：16s分析之FishTaco分析

一次偶然的机会我看到了这篇文章，发表于CellHost&Microbe上，这个期刊也不怎么熟悉，偏机理，就点了WOS上的期刊信息：SystematicCharacterizationandAnalysisoftheTaxonomicDriversofFunctionalShiftsintheHumanMicrobiome这篇文章提出的有关功能上的改变同微生物分类单元之间的关系，运用于人体微生物原理
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:53

如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？

另外可以安利一下他们的肠道菌群检测产品做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:52

PICRUSt2：OTU/ASV等16S序列随意预测宏基因组，参考数据库增大10倍

PICRUSt推出了近6年，引用2500余次。现推出PICRUSt2https://github.com/picrust/picrust2具有以下三大优势：任何OTU/ASV直接预测功能；数据库扩大10倍；一条命令完成全部分析。简介https://github.com/picrust/picrust2/wikiPICRUSt2(PhylogeneticInvestigationofCommunit
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:20

功能预测之Tax4Fun

之前在公众号的文章《根据16S预测微生物群落功能最全攻略》阅读人数近3000人，有需求的用户还是非常多的。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:48

PICRUSt：16S预测宏基因组-扩增子分析锦上添花

写在前面16S分析能获得的信息比较有限，一般找到差异OTU，就很难再深入分析了。如何把差异OTU与细菌自身的基因组功能建立联系呢？很多人在这方面做出了努力。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:48

如何快速评估16S rRNA基因引物的覆盖率及特异性

背景无论是在进行细菌、古菌高通量测序前，还是细菌、古菌qPCR前，最纠结的问题永远是引物选择。评估引物效果最重要的两个指标是覆盖率（coverage）和特异性（specificity）。简单讲，覆盖率就是指目标引物能捕获现有数据库中靶序列的比例，比如，共有100种细菌的不同16SrRNA基因序列，某引物能扩增出其中的90种，那么该引物的覆盖率就是90%；特异性是指目标引物是否只靶标某特定类群，比如
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:46

微生物16S测序数据的正确打开方式

对于新手，如果收到一份不讲“人话”的16S测序分析报告，很快就会被各种生态学术语、各种指数、各种分析方法弄晕。7个问题串起16S测序的核心结果怎么办？用你的研究逻辑来梳理16S测序数据（图1）。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:44

微生物组学研究手段概览2——宏基因组和宏转录组

相比于16S扩增子测序，宏基因组测序能够使物种鉴定深度达
宇宙实验媛·2020-08-08 00:52
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