Acer宏基第7页

测序组学助力新的酶发现

宏基因组学产生的大量测序数据，让人们得已窥见未经培养的微生物的生物合成潜力。与初级代谢途径相比，参与次级代谢的酶往往催化不同底物的特殊反应，这些途径为发现新的酶学提供了丰富的资源。

谷禾牛博·2022-12-06 11:00

移动边缘缓存2

流行内容也可以缓存在BSs处，例如，中继、femto基站（fbs）、微微基站（pbs）、小型基站（sbs）和宏基站（mbs）。

动物园警铃大作-·2022-12-05 23:22

Prokka安装和使用

Prokka协调了一套现有的软件工具，可以对原核基因组和宏基因组进行快速高效的功能注释。目前常用对基因进行注释的工具有两款：Prokka和RAST。在webofscience上RAST引用次数62

xq_ing·2022-12-01 19:51

本周开课 | 第 5 期全基因组/外显子组家系分析理论和实战

临床基因组学线上/线下开课时间：2022/4/22-2022/02/24宏基因组线上/线下开课时间：202

生信宝典·2022-11-28 18:55

爆款入门 | 第 14 期微生物组-扩增子16S分析和可视化(线上/线下同时开课，2022.4)...

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。

生信宝典·2022-11-28 18:25

利用metaphlan2结果计算alpha多样性

结果计算alpha多样性前期回顾结果展示格式转化什么是α多样性什么是Shannon指数Shannon指数如何计算前期回顾MetaPhlAn2是分析微生物群落(细菌、古菌、真核生物和病毒)组成的工具，可以基于宏基因组数据

大尾猫·2022-11-26 21:08

新鲜出炉 | 临床基因组学数据分析实战将于2021年11月12-14开课！！！

转录组线上/线下开课时间：2021/10/29-2021/10/31宏基因组线上/线下开

生信宝典·2022-11-24 18:28

强化学习论文分析4---异构网络_强化学习_功率控制《Deep Reinforcement Learning for Multi-Agent....》

目录一、文章概述二、系统目标三、应用场景四、算法架构1.微基站处----DQN2.宏基站处---Actor-Critic五、伪代码六、算法流程图七、性能表征1.收敛时间2.信道总容量本文是对论文《DeepReinforcementLearningforMulti-AgentPowerControlinHeterogeneousNetworks

@白圭·2022-11-22 21:16

在Anaconda建立的虚拟环境中安装keras时报错，显示超时报错--Read timed out.

今天学习SSD需要用到keras库，在安装时遇到了一些问题如下：(tensorflow)C:\Users\Acer>pipinstallkeras==1.2.2Collectingkeras==1.2.2DownloadingKeras

CZB97·2022-11-19 22:27

病毒宏基因组学（Meta-virome）

宏基因组学（Meta-virome）是在宏基因组学理论的基础上，结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支，是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle

易基因科技·2022-11-19 10:52

北鲲云超算平台对于基因组学研究能够提供哪些帮助？

从高通量/多组学，到单分子/单细胞；从多倍体/单倍型到宏基因组/环境基因组；从精准医疗到系统医学等等，后基因组时代的基因组技术正在颠覆传统生物学和医学的方式。

北鲲云_beikun·2022-11-11 11:11

AlphaFold对手来了：Meta发布6亿“暗物质”蛋白预测结果，仅用2周完成

Meta的蛋白质预测大模型ESMFold，刚刚公布了其最新成果：6亿多种蛋白结构预测结果，而且还是“蛋白质中的暗物质”——宏基因组蛋白（MetagenomicProteins）。

QbitAl·2022-11-07 09:22

微生物组+代谢组，发现基于肠道微生物的疾病标志物

为了探究肠道菌群与各类疾病的联系，可借助微生物组学——扩增子、宏基因组、宏转录组技术探究肠道中“存在哪些微生物，这些微生物能做什么以及正在做什么”。

ee00dc6faab7·2022-11-04 17:09

宏转录组方法_高级转录组分析和R语言数据可视化第12期 (线上线下同时开课)

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。

weixin_39704314·2022-10-30 18:45

微生物组-扩增子16S分析和可视化(2022.10)

课程改为长直播模式，报名后就可以学习，时间更充裕，练习更充分具体见：易生信培训改为长周期模式福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上

生信宝典·2022-10-30 18:14

Jason自习室导航

RRShiny(更新中)ggplot2图形艺术(更新中)2.BioScience生信工具箱vcf数据分析系列(已完结)NGS高通量分析管道(更新中)WGS全基因组分析管道GATK4RNA-seq分析管道教程宏基因组

Jason数据分析生信教室·2022-10-29 16:34

Nature子刊|“二代+三代”宏基因组学揭示肠道微生物群的个性化结构变异

2022年，《Naturecommunications》期刊发表的“Short-andlong-readmetagenomicsexpandindividualizedstructuralvariationsingutmicrobiomes”研究论文中，通过建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装的新方法，表征了来自健康人类的数百个肠道微生物组中结构变异（SV）的精细遗传变异。研

SHANGHAILINGEN·2022-10-22 07:34

易基因｜宏病毒组测序技术介绍

病毒宏基因组学（Meta-virome）是在宏基因组学理论的基础上，结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支，是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle

易基因科技·2022-10-10 19:18

分不清：Microbiota, metagenome, microbiome 来看看Nature综述怎么说？

这篇Nature的Review，用图形的方法对这三个词进行了定义和描述：图1.本综述中对微生物群、宏基因组和微生物组的定义。每张图代表的是相同的群体，然而不同

笺牒九州的怪咖·2022-10-09 17:04

宏基因组 - (3)使用KofamKOALA对非冗余基因集进行KEGG注释

0.仅作笔记使用我所用到的所有脚本可以+Q840842906索简单介绍一下方向也可以，说不定以后能互相帮忙～1.这个工具有在线网页版，当然KEGG注释还有其他很多工具可以选择比如Diamond，KAAS等等https://www.genome.jp/tools/kofamkoala/2.安装和使用都可以参考，这里主要是后续分析https://blog.csdn.net/woodcorpse/art

深山夕照深秋雨OvO·2022-09-15 22:21

在NCBI查找指定物种基因组信息

枫狂灬呆子·2022-08-31 13:23

解决宏基acer电脑开机出现start pxe over ipv4 press esc exit

通常出现pxe字样的提示，一般是启用了网卡启动，如果不需要，可以在bios中将其禁用，或者设置为硬盘启动（不同电脑bios界面不一样，一下以本机为例)开机按住f2进入bios界面（有的电脑是按delete，或者f12）进入bios界面后选择main菜单选择networkboot，此时默认为enable，按enter键，会出现选项，enable，disable选择disable，就表示禁用网卡启动，

只想看世界·2022-08-19 10:51

TP，FP，TN，FN，FAR，FRR，HTER等常见实验指标理解

目录一、TP，TN，FP，FN二、FAR，FRR三、Recall，Precision，Accuracy四、ROC，TPR，FPR，AUC五、HTER，EER六、APCER，NPCER（BPCER），ACER

MaZhe丶·2022-06-28 07:24

宏基因组分析-基于组装

一、介绍宏基因组(Metagenome)指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。

微基生物·2022-05-27 07:14

Tools:eggnog-mapper全新的功能注释工具,构建自己的Orgdb数据库

主要使用环境是：用于注释新的基因组、转录组、微生物（宏基因组）最新版本的是V2版本github新增加了GO、KEGG的数据库优点是：使用的是直系同源的序列进行功能注释使用conda安装emappercondainstall

wo_monic·2022-05-16 15:32

高级转录组分析和R语言数据可视化第十二期（线上线下同时开课）

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。

生信宝典·2022-04-22 07:11

Co-occurrence网络图绘制教程（附详细代码）

杨齐家·2022-04-17 07:04

R plot图片背景设置为透明_一文学会网络分析——Cooccurrence网络图在R中的实现...

这么好的知识，当然希望和大家分享，故约稿陈博士在“宏基因组”发布一下他的经验，感谢陈博士的整理和分享。

weixin_39617502·2022-04-17 07:58

编程模板-R语言脚本写作：最简单的统计与绘图，包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出

2014年在中科院遗传发育所获生物信息学博士学位，2016年博士后出站留所工作，任宏基因组学实验室工程师，目前主要研究方向为宏基因组学数据分析方法、培养组学方法优化。

R语言中文社区·2022-03-27 07:51

u盘装机，UEFI模式下无法识别u盘的情况解决

自己的电脑是acer暗影骑士3，win10系统，想用u盘装ubuntu，如图所示，SecureBoot已设为disabled，u盘启动项第一，保存退出，但重启电脑仍然自动进入win10系统，根本识别不出

BRiAq·2022-03-24 07:45

R 绘制 GWAS 研究的 Manhattan 图

近几年，在宏基因组领域，尤其是差异OTU结合分类学结果，采用Manhattanplot展示有非常好的效果，倍受推崇。

BioIT爱好者·2022-03-21 05:17

R count函数_R最快且比dplyr最高效的大数据处理R包：tidyfst

随着扩增子的平稳，我逐渐转入宏基因组，软件更多，平台跨度更大，R语言显示出来很多弊端：数据处理过程不够快，无法快速读入，输出；近年来出现了许多工具解决这个问题，本着适合之前的习惯，我想通过da

weixin_39769703·2022-03-09 08:58

最后一周 | 微生物组-宏基因组分析(线上/线下同时开课，2021.1)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。

生信宝典·2022-03-03 07:58

微生物组-宏基因组分析第9期(报名直播课免费参加线下2020.10本年最后一期)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。

生信宝典·2022-03-03 07:27

IDMIL：一种无对齐可解释深度多实例学习：从宏基因组数据预测疾病

多示例学习MIL假设训练数据集中的每个数据是一个包(Bag)，每个包都是一个示例(instance)的集合，每个包都有一个训练标记，而包中的示例是没有标记的；如果包中至少存在一个正标记的示例，则包被赋予正标记；而对于一个有负标记的包，其中所有的示例均为负标记。包是由多个示例组成的，在多示例学习中，包带有类别标签而示例不带类别标签，最终的目的是给出对新的包的类别预测。如果一个包里面存在至少一个被分类

小小淘SD·2022-03-01 11:12

一文学会网络分析——Co-occurrence网络图在R中的实现

这么好的知识，当然希望和大家分享，故约稿陈博士在“宏基因组”发布一下他的经验，感谢陈博士的整理和分享。

生信宝典·2022-02-26 07:29

盘点宏转录组分析方法

如果说宏基因组能告诉我们微生物群，那么宏转录组则能告诉我们这些微生物，这有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物与环境、疾病、动植物等关系的机制。2.宏转录组分析从以G为单位的高

小白菜学生信·2022-02-22 03:52

COVID-19患者血清代谢小分子谱分析

——写在前面因为我的研究方向主要是宿主宏基因组及其代谢产物与宿主互作，所以关于COVID-19方面研究，我

Dayueban·2022-02-22 03:22

扩增子培训小结

扩增子分析扩增子分析，指的是对生物高度保守的DNA序列进行分析，鉴定生物的种类与含量的方法，是宏基因组学的研究方法之一。amplicon.jpg注：以下扩增子均指微生物16SrDNA片段。

见龙在田007er2770·2022-02-20 11:33

堆叠柱状图各成分连线画图的R脚本

18年1月29日宏基因组转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》。其中的图3基于堆叠柱状图，添加组间各成分连线，可以更容易的观察和比较组间的变化。

邱俊辉·2022-02-18 08:36

宏RNA测序去除宿主核糖体rRNA（一）-实验端去除

病毒宏基因组测序时，需从样本中提取总RNA核酸。总RNA中除含有病毒RNA核酸外，还包含宿主细胞转录RNA。

韩小早儿·2022-02-15 14:45

常用的生物信息学数据库（核酸，蛋白）

dUTPase[TIAB]Beijing[AD]2、GenBank核酸序列数据库一级核酸数据库包括：GenBank(NCBI)、ENA（EMBL）、DDBJ（NIJ)3、基因组数据库Ensemble4、微生物宏基因组数据库

吴涛_631b·2022-02-13 21:41

Nature | 2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联研究

文章信息：标题：Ametagenome-wideassociationstudyofgutmicrobiotaintype2diabetes中文：2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联研究杂志：Nature

小白菜学生信·2022-02-10 07:00

使用anvi'o进行宏基因组的组装和分箱

这部分教程来自HappyBellyBioinformatics网站,主要比较宏基因组的单样品组装和多样品联合组装这两种组装策略以及宏基因组数据的可视化。

你猜我菜不菜·2022-02-09 19:17

一座5g基站造价多少？

下面就来仔细说说5G基站（宏基站）为什么这么贵。先来看看5G基站的构成5G基站主要由BBU和AAU组成，其成本一般来说，是由主设备（BBU、AAU）、动力配套设备（电源、电池、空调、监控）、

一口Linux·2022-02-09 10:47

宏基因组—探秘肠道菌群与疾病作用机制

宏基因组测序可用于解析环境微生物的群落结构、物种组成、系统进化、基因功能和代谢网络等，已经广泛应用于肠道微生物的研究。一、构建人肠道微生物组的参考基因集宏基因组测

贝瑞科服·2022-02-07 09:41

宏基因组分析3-数据质量控制(trimmomatic)

trimmomatic安装trimmomatic是用JAVA编写的程序，将软件下载解压后就可直接使用cd/home/llt/softwarewgethttp://www.usadellab.org/cms/uploads/supplementary/Trimmomatic/Trimmomatic-0.38.zipunzipTrimmomatic-0.38.ziptrimmomatic使用trimm

nitrostarch·2022-02-05 23:35

当年第一次拥有自己的电脑

OliverWorldsFile117从第一台笔记本电脑入手到现在已经过了至少9年了，从宏基到MBA，再到SurfacePro，最后再换乘MBP，也算是体验了各种机型了，其中最让自己懊悔和遗憾的就是最早的一台宏基

OliverWorlds·2022-02-05 20:27

宏基因组（mNGS）简介（一）——临床领域的应用场景

迄今为止，临床宏基因组学的应用场景包括以下几个方面：1、各种综合征和样本类型的传染病诊断2、患病和健康状态下的微生物组特征分析3、宿主转录学分析确定人类宿主对感染的反应特征4、肿瘤领域的应用包括鉴定肿瘤相关病毒及鉴定基因组整合位点

生信小书童·2022-01-29 18:29

shell-for循环处理宏基因组数据 - 2021-12-27

Megahit-宏基因组组装流程foriinXH*_1.fq.gz;doI=${i%_*}_2.fq.gzbase=${i%%_*}.megahitmegahit-1$i-2$I--k-list21,29,39,59,79,99,119,141

子春零六·2021-12-27 16:23

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