P-value

p-value值

P值：观察到极端值的概率image.png观察到的概率越低，结果就越显著。观察到概率低于P值时，认为足够证据支持H1（显著）类似于反证法，先假设H0，A和B没有关系观察到结果概率非常低，几乎不可能发生，推翻原假设H0H1成立（有显著关系）image.png显著性不能证明任何事情是真，而只能拒绝两者没有关系（证明两者有显著关系）显著性不能量化差异性显著性不能夸大两者差异性有现实意义显著性不能解释为什
readilen·2024-02-05 08:50

P-value

Repeatedfrom:浅谈p值（p-value是什么）-LJ的博客-博客园https://www.cnblogs.com/lijingblog/p/11043513.html当我们说到p-value
寒山梦绮·2024-01-30 13:44

统计学--基于R（第3版）（基于R应用的统计学丛书）作者：贾俊平 习题答案 第七章

exercise/ch7/exercise7_1.RData')exercise7_1chisq.test(exercise7_1$销售量)#在该次检验中，X-squared=80.924,df=11,p-value
悲伤猪大肠.·2024-01-26 09:40

2021-11-18 统计学-基于R（第四版）第七章课后习题记录及总结

1chisq.test(example7_1$销售量)Chi-squaredtestforgivenprobabilitiesdata:example7_1$销售量X-squared=80.924,df=11,p-value
椰子鸡米花·2024-01-26 09:07

统计学--基于R（第三版）第七章答案！！

#7.1H0:符合均匀分布H1：不符合均匀分布load('C:/exercise/ch7/exercise7_1.RData')chisq.test(exercise7_1$销售量)#结论：p-value
DDKsolo·2024-01-26 09:34

让 P-value 更加的浅显易懂

0.普通逻辑复习一下普通逻辑的基本思路。假设以下陈述为真：你打了某种疫苗P，就不会得某种流行病Q。我们把这个先决条件表述如下：如果P则非Q其中，P表示打了疫苗P，Q表示得流行病Q或者，更形式化一点：ifPthenNOTQ然后，如果观察到你得了流行病Q，那么就可以推出你没有打疫苗P——这个推断只不过是上述前提条件的逆反命题而已。我们把以上推理过程表述如下：ifPthenNOTQ(先决条件)Q(前提)
Andy-Han·2024-01-24 12:02

科研绘图（四）火山图

它通常将每个点表示为一个基因，x轴显示对数比率（logratio），表示基因表达的变化大小；y轴显示-log10(p-value)，表示变化的统计显著性。
BZD数模社·2024-01-15 20:55

python单样本t检验

t-test：比较样本均值和宣称值有误显著差异image.png受试人群的抑郁评分和总体人群的抑郁评分有没有显著差异，如果有则不能有效代表总体人群t-value：-2.38；p-value=0.22<
constant007·2024-01-03 16:24

r语言独立性检验

卡方检验>library(vcd)>mytablechisq.test(mytable)Pearson'sChi-squaredtestdata:mytableX-squared=13.055,df=2,p-value
肖玉贤·2023-12-30 03:31

R语言存在NA的p-value计算

Summary：t.test计算存在NA值的data时，默认的mean格式为mean(x,na.rm=TRUE),也就是每组的NA不计入每组的个数中。验证：1.data如下：Fig1.data预览2.在NA存在的条件下直接计算p.valuegroup<-factor(rep(c("M","C"),c(40,20)))t.test(as.numeric(test)~group)Fig2.NA存在条件
MJades·2023-11-25 00:40

假设检验 p-value，FDR，q-value

1、p-value单个假设检验中主要依靠p值(或统计量t)做出是否拒绝零假设H0的决定：p-value和预先设定的检验水准α做对比，如果p-value小于等于α，拒绝原假设，否则不拒绝原假设。
奔跑的Forrest·2023-11-23 06:40

FDR 和 q-value

关于假设检验的指标，脑海中第一反应便是p-value，众多科学家做统计的主要目标常常就是为了追逐一个小于0.05的p值。一般p<0.05表示实验具有统计学差异，今天看
thychan·2023-11-06 00:05

第3章 R语言编程基础——基于R软件的传统计算（超详细）

3.1统计分析多元统计分析常用的R包和函数3.1.1多元回归分析随机误差ε：计量模型案例分析：M2的建模与预测残差的五数估计参数的回归值、标准差、t检验量、p-value单变量显著性检验拟合优度和F检验
村里小公举·2023-10-21 05:37

p-value与显著性优势

https://blog.csdn.net/rongbaohan/article/details/53521147
Iverson_henry·2023-10-10 22:30

一文看懂火山图

纵坐标用-log10p-value表示，对P值进行-log10的转化，-log10（p-value=0.05）约等于1.30，（-log10
庄小尽·2023-10-08 08:48

Shapiro-Francia正态检验

检验的结果会生成一个p-value，如果p-value较小（通常小
铁松溜达py·2023-10-03 05:18

p-value，q-value,FDR

假阴性错误（false-negativeerrors）:高水平的基因可能偶尔没有检测到假阳性错误（false-positiveerrors）:低水平表达的基因由于扩增偏差，可能显得过于丰富，导致假阳性错误错误发现率(FalseDiscoveryRate,FDR)：事先犯I-型错误的最大概率，控制FDR值来决定p值的值域，FDR用比较温和的方法对p值进行了校正。其试图在假阳性和假阴性间达到平衡，将假
hyena_7·2023-08-07 15:47

R语言警告：Cannot compute exact p-value with ties的处理方法

R语言警告：Cannotcomputeexactp-valuewithties的处理方法一、问题[1]"检验Spearman相关性的显著性为："Warningincor.test.default(death$Female_Exp,death$Male_Exp,alternative="two.sided",:Cannotcomputeexactp-valuewithties二、解决办法在R中对Sp
XRT_knives·2023-06-16 15:09

Evaluation

这个被问过两次，正好有个契机重新回顾下：1.p-value解释p-value会条件反射0.05，即假设检验p(A|h0)(拒绝域的概率)若p<0.05，那么可以认为是小概率事件，接受原假设。
睡眠相位后移的起床困难户·2023-04-06 15:00

Python气象数据处理与绘图(4)：显著性检验

相关系数(回归系数)检验其实在(2)中已经提到了相关系数和回归系数，在计算过程中，直接返回了对应的p-value，因此可以直接使用p-value。
摸鱼咯·2023-04-03 15:34

statannotations.Annotator使用自定义P-value添加显著性差异

用seaborn绘制箱线图时，需要添加显著性差异。在查了一些资料后，了解到可以用Annotator添加注释importseabornassnsimportmatplotlib.pyplotaspltfromstatannotations.AnnotatorimportAnnotator#绘制箱线图ax=sns.boxplot(x='label',y=name,data=data)#--------
m0_61314700·2023-03-31 19:11

超几何分布检验（hypergeometric test）以及R中实现

用venn图表示为：image.png用R语言计算：p-value=phyper(10-1,11,18,16,lower.tail=F)=0.003135274可以看出此结果跟我们在2中手
余绕·2023-03-30 04:28

SNP功能注释网站合集

彩蛋在最后，请坚持看完1、GWAS4D,推荐指数：****网址：http://mulinlab.tmu.edu.cn/gwas4d支持输入格式1)VariantsCoordinates:Chr,Pos,[P-value
橙子牛奶糖·2023-03-14 04:32

线性拟合的 R2 和p值怎么计算

线性拟合的R2和p值怎么计算，及其物理含义；R^2可以量化模型响应变量与因变量间的关系强弱p-value检验可以决定拟合方程的可靠程度。R方反映的是自变量对因变量方差的解释比例，这是人话吗？
fK0pS·2023-02-07 09:50

R语言---分布检验

Kolmogorov-Smirnov检验，具体代码如下：比如正态性检验：xxks.test(x,'pnorm')One-sampleKolmogorov-Smirnovtestdata:xD=0.14897,p-value
ww111111e·2023-02-04 00:20

显著性测试，p-value/p值

p-value的意义就是当前模型要显著的好于别的模型，先计算chi-square值，然后根据值去查卡方图，得到p-value值，大于0.05（经验值），则说明拒绝假设H0的概率小，H0成立。
taozhulin·2023-01-26 14:54

差异表达基因变化倍数_差异表达分析：高颜值火山图轻松拿下

在火山图中，横坐标为Log2fold-change，越偏离中心差异倍数越大；纵轴为-Log10(p-value)(通常采用调整后的p值,即p-adjust)，沿纵轴的数值越大差异越显著。
延静斋孙·2023-01-19 08:16

R语言绘图-1-火山图

以基因的差异表达为例：x轴对应foldchange，y轴对应p-value。
蓄起大胡子·2023-01-13 13:24

cibersortx怎么用_【搬砖】Cibersort p-value含义

使用cibersort对不同的GSE文件进行免疫细胞类别计算，发现得出的p-value各不相同，有的全是0，有的(0，1)之中散在分布。。。
我投三分·2022-12-26 17:33

python 卡方分布值_饱和模型与偏差计算R方与p值

但joshstarmer老师指出，广义线性模型中R2更常见的计算方法还包括饱和模型(参考：Logistic回归：R2与P-value的计算)。
weixin_39831493·2022-12-24 14:16

【定量分析、量化金融与统计学】各种检验的H0假设与p-value究竟是什么含义

目录一、各种检验的分类二、事前检验1.正态性检验2.方差齐次性检验3.共线性检验4.协方差齐次性检验三、事后检验1.Turkey检验2.tamhaneT2检验3.交叉图检验4.拟合优度检验5.显著性检验F检验：ANOVAT检验：小样本的显著性检验6.区间估计可能刚接触量化分析的人都会对各种检验感觉到懵，这个检验究竟检验什么？p值小于0.05，究竟拒绝了什么假设？是什么意思？我刚学的时候也有这样的疑
旋转跳跃我闭着眼·2022-12-10 11:50

小孩都看得懂的 HMM

小孩都看得懂的神经网络小孩都看得懂的推荐系统小孩都看得懂的逐步提升小孩都看得懂的聚类小孩都看得懂的主成分分析小孩都看得懂的循环神经网络小孩都看得懂的Embedding小孩都看得懂的熵、交叉熵和KL散度小孩都看得懂的p-value
weixin_38753422·2022-12-09 09:12

【机器学习】小孩都看得懂的 GAN

小孩都看得懂的神经网络小孩都看得懂的推荐系统小孩都看得懂的逐步提升小孩都看得懂的聚类小孩都看得懂的主成分分析小孩都看得懂的循环神经网络小孩都看得懂的Embedding小孩都看得懂的熵、交叉熵和KL散度小孩都看得懂的p-value
风度78·2022-12-09 09:05

R语言卡方验证 chisq.test

;abchisq.test(rbind(a,b),correct=FALSE)Pearson'sChi-squaredtestdata:rbind(a,b)X-squared=0.7619,df=1,p-value
zj360202·2022-11-30 16:38

R语言plot(lm)绘图结果解读

在任何线性模型中，能够直接“lm”（模型有意义），既要考虑各个参数的t-test所得出的p-value，也要考虑总体模型F-检验得出的p-value。
AlphaJun_zero·2022-11-25 15:31

Python笔记-假设检验之双样本T检验（两样本是否相似）

Python代码逻辑：①构造2个样本；②先进行方差齐性检查，我们规定一个阈值，这2个样本方差齐性的p-value大于0.05说明满足方差相等，可以进行双样本T检验；③进行双样本T检验，p值越大说明消费水平越相同
IT1995·2022-11-24 19:04

【R语言】他说每个生存曲线一定要看到p值，不能0.05，0.01，0.001

一、P值关于显著性检验偷懒，找到一篇很典型的抛硬币可以回顾或预习，浅谈p值（p-value是什么）P值P值解释统计意义>0.05碰巧出现的可能性大于5%，不能否定原假设无统计学差异<0.05碰巧出现的可能性小于
Senoh.·2022-11-24 16:09

python计算p-value

有的时候新方法有效果提升，但是为了验证这种提升是否是显著的(防止有的方法具有随机性)，需要进行ttt检验，根据计算的ppp-valuevaluevalue来决定两种方法的均值是否真的存在显著差异。ttt检验通常有1.单样本ttt检验本次不涉及2.独立样本ttt检验两独立样本t检验要求两样本所代表的总体服从正态分布,且两总体方差相等。计算时只需要两样本的均值、方差、样本数即可。fromscipyim
npupengsir·2022-11-16 11:00

添加p-value和显著性标记：ggsignif和ggpubr

在数据分析过程中，常常需要把组间的显著性添加到图形中，但是在ggplot2中实现起来略显麻烦，幸运的是，有很多R包可以帮助我们实现这一操作，比如ggsignif和ggpubr。1.统计方法一般根据数据是否符合正态分布，选择合适的统计方法：统计方法适用情况t.test()比较两组(参数)wilcox.test()比较两组(非参数)aov()或anova()比较多组(参数)kruskal.test()
Hayley笔记·2022-06-30 09:05

【R绘图】如何在图上显示显著性和p-value？

以鸢尾花数据集为例，展示如何在R上绘制出显著度和p-value。
陈有朴·2022-06-21 23:55

贾俊平《统计学》第十章方差分析知识点总结及课后习题答案

由于P-value＝0.040877＞α＝0.01（或F＝4.6574＜F0.01（2，9
无二三事·2022-06-20 07:17

R多元线性回归模型与模型选择

用矩阵来进行表示为：实现模型的p-value表示我这三个系数要不要的显著性注：大部分操作与简单线性回归完全相同把所有变量都用来分析：快捷可以发现：MultipleR-squared随着变量数量的增加始终提升
hhyy_d·2022-03-12 12:20

R语言可视化学习笔记之添加p-value和显著性标记

上篇文章中提了一下如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记,本文将详细介绍。
taoyan·2022-02-21 20:19

多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正

摘抄于网页多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正总结起来就三句话：（1）当同一个数据集有n次（n>=2）假设检验时，要做多重假设检验校正（2）对于Bonferroni校正，是将p-value
胡杨奋进·2022-02-18 22:10

差异表达基因分析：差异倍数(fold change), 差异的显著性(P-value)

Differentialgeneexpressionanalysis：差异表达基因分析Differentiallyexpressedgene(DEG)：差异表达基因差异表达分析是目前比较常用的识别疾病相关miRNA以及基因的方法，目前也有很多差异表达分析的方法，但比较简单也比较常用的是Foldchange方法。它的优点是计算简单直观，缺点是没有考虑到差异表达的统计显著性；通常以2倍差异为阈值，判断
小白要变大神·2021-12-02 20:24

小孩都看得懂的 GAN

小孩都看得懂的神经网络小孩都看得懂的推荐系统小孩都看得懂的逐步提升小孩都看得懂的聚类小孩都看得懂的主成分分析小孩都看得懂的循环神经网络小孩都看得懂的Embedding小孩都看得懂的熵、交叉熵和KL散度小孩都看得懂的p-value
weixin_38753422·2021-11-13 16:03

生统笔记1- 转录组差异表达分析中的log2FC和FDR

FDRFDR即FalseDiscoveryRate，错误发现率，是通过对差异显著性p值（p-value）进行校正得到的。由于转录组测序的差异表达分析是对大量的基因表达值进行独立的统计假设
江湾青年·2021-06-30 10:27

NO.3-描述统计分析，逐步回归等

825,215,1070,550,480,920,1350,325,670,1215)y<-c(3.5,1,4,2,1,3,4.5,1.5,3,5)plot(x,y)#画散点图(2)cor(x,y)#x与y的相关系数cor.test(x,y)#当p-value
小乐墩·2021-06-27 18:18

R语言学习笔记--ggplot2一步到位绘制误差线及p-value（或显著性标记）

采用ggplot2绘制误差线需要对数据转换求得mean和sd（或se等），可以通过Rmisc包summarySE函数、dplyr包group_by与summarise两个函数等实现，添加p-value（
逍遥尐生·2021-06-19 21:27

【r<-高级|方案】如何在相关矩阵图上添加p-value

这篇文章可以说是怎么分析和展示RNAseq基因表达数据中基因的相关性的延续。上次绘制了下图：可以发现只有两个基因的表达表现出了较强的相关(ETV3-ELK4)。一般教材描述相关性大小为：相关系数r是否是：·|r|>0.95存在显著性相关；·|r|≥0.8高度相关；·0.5≤|r|<0.8中度相关；·0.3≤|r|<0.5低度相关；·|r|<0.3关系极弱，认为不相关计算公式为：公式可见这两个基因属
王诗翔·2021-06-09 08:15
上一页 1 2 3 4 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他