单细胞转录因子分析第11页

发展心理学第二章读书笔记

一、最早的发育：人类个体最早始于单细胞，这些细胞被称为“配子”每个配子含有大量的遗传信息，当男女的生殖细胞相遇，精子进入卵子约一个小时后，两者融合会变成受精卵，两者的遗传最终结合在一起。

e50396cab161·2023-12-26 02:17

人类为什么要吃盐

是因为所有生物体内，包括单细胞体内全都含有一个原始盐分，也就是我们通常所说的生理盐水的那个含盐量0.9%。它是因为原始海洋，海洋实际上是不含任何物的纯净水，覆盖在地球表面，然后溶

姜地主·2023-12-26 02:26

成人、猕猴和猪海马和内嗅细胞的转录组学分类和神经源性轨迹

Transcriptomictaxonomyandneurogenictrajectoriesofadulthuman,macaque,andpighippocampalandentorhinalcells成人、猕猴和猪海马和内嗅细胞的转录组学分类和神经源性轨迹发表时间

科研菜鸟·2023-12-25 16:41

喜讯连连捷报传，文章累累创佳绩，平均IF 18分!!!

爱基百客专注于提供领先的表观组学服务，目前已在表观组学、单细胞时空组学和高通量测序等方向积累了大量的项目经验。

爱基百客·2023-12-25 15:34

十大开源语音识别项目

AutomaticSpeechRecognition（ASR）是一项自动语音识别技术，其目标是通过计算机自动将人类口头语音转录为文本。

virtaitech·2023-12-25 15:39

单细胞分析实录(18): 基于CellPhoneDB的细胞通讯分析及可视化 (上篇)

细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息，这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合，传递信号来实现的。不同的分化、疾病过程，可能存在特异的细胞通讯关系，因此阐明这些通讯关系至关重要。CellPhoneDB配有详实的受配体数据库，其整合了此前的公共数据库，还会手动矫正，以得到更加准确的受配体注释。此外，针对受配体有多个亚基的情况，也进行了注释。下面这张图显示了CellPhoneDB配

TOP生物信息·2023-12-25 13:00

体外转录法制备dsRNA

该方案是简单而且得到广泛应用的、利用PCR模板制备双链RNA的体外转录反应。该方法制备的dsRNA可以用于在某些细胞或者组织中诱发RNA干扰。

英格恩·2023-12-25 12:00

sc-RNA-seq数据分析|| UMAP与t-NSE的区别

一样作为高纬数据可视化的利器，并且优于tsne.UMAP与t-SNE均是非线性降维，多用于数据可视化UMAP结构与t-SNE一致UMAP计算更快UMAP能更好地反映高纬结构，比t-SNE有着更好的连续性这种连续性反映到单细胞分析中就是能更好滴可视化细胞的分化状态

周运来就是我·2023-12-25 07:59

2022-04-28

MolCell|单细胞分析转录组和组蛋白修饰细化表达调控研究图灵基因图灵基因2022-04-2813:44收录于合集#前沿生物大数据分析单细胞技术的进步不仅使分析单个细胞中的多个分子家族成为可能，而且还使科学家能够解析由于测量参数的细胞间多样性引起的数据分析的局限性

图灵基因·2023-12-25 01:00

2021-12-01每日文献

LepRb激活信号转导子和转录激活子（STAT，包括STAT1、STAT3和STAT5）以控制基因表达。由于STAT3对瘦素的生理作用至关重要，使用TRAP-seq检测了切除

橘子味儿的小蜜蜂·2023-12-25 00:33

大队列免疫治疗测序数据的巧妙切入

接受PD-L1单抗治疗的患者中，B细胞转录特征与较长的OS有关作者首先利用两个平行的临床数据集（每个数据集都包含免疫治疗和化疗的病人），分别在免疫治疗、化疗病人里面，将

Carrington·2023-12-24 19:20

chatgpt告诉你如何设计RNA引物？

答：RNA引物设计是指设计一段短的RNA序列，用于在反转录过程中特异性地与目标RNA分子结合，并在此基础上进行扩增、检测等操作。

伍鸿荣·2023-12-24 19:48

Trinity软件对转录组进行无参比对教程

写在前面2023年将结束，小杜的生信笔记分享个人学习笔记也有2年的时间。在这2年的时间中，分享算是成为工作、学习和生活中的一部分。自己为了运行和维护社群也算花费大量的时间和精力，自己认为还算满意吧。对于个人来说，自己一直的目的都是分享自己的学习笔记，以及多多少少可以帮助解决一下需要帮助的同学。我们这里所说的是需要帮助的人，而不是大部分人。自己的能力和精力自己清楚，自己研究的方向也是比较局限，我们并

小杜的生信筆記·2023-12-24 17:46

转录组无参比对教程

写在前面2023年将结束，小杜的生信笔记分享个人学习笔记也有2年的时间。在这2年的时间中，分享算是成为工作、学习和生活中的一部分。自己为了运行和维护社群也算花费大量的时间和精力，自己认为还算满意吧。对于个人来说，自己一直的目的都是分享自己的学习笔记，以及多多少少可以帮助解决一下需要帮助的同学。我们这里所说的是需要帮助的人，而不是大部分人。自己的能力和精力自己清楚，自己研究的方向也是比较局限，我们并

小杜的生信筆記·2023-12-24 17:45

组学无参比对教程

转录组无参比对教程当作物是没有参考基因组时，需要无参进行比对。Trinity是现在使用最广泛的转录组Denovo组装软件。

小杜的生信筆記·2023-12-24 17:43

空间转录组

空转写在前面一些概念下载数据三级目录写在前面尝试尝试理解空转参考：1.Seurat空间转录组分析（一）数据读入：https://mp.weixin.qq.com/s/06qiP4_yE8UOvXt4eP6org

愿航·2023-12-24 17:37

教程 | 规模化物种同源基因分析 - orthofinder [上篇]

相比于几年前火爆的通过转录组测序挖掘生物学问题策略，通过基因组，尤其是比较基因组分析，往往可以给我们带来更多确定性结果，如相比于近源物种A为何物种B的果皮更红？这完全有可能是特定家族成员扩张导致。

生信石头·2023-12-24 17:22

android语音识别服务,使用语音服务 API 的语音识别 - Xamarin | Microsoft Docs

AzureSpeechService是一种基于云的API，它提供以下功能：AzureSpeechServiceisacloud-basedAPIthatoffersthefollowingfunctionality:语音到文本转录音频文件或

柯西饭·2023-12-24 10:52

超详细讲解CTC理论和实战

CTC简介对于语音识别来说，训练数据的输入是一段音频，输出是它转录的文字(transcript)，但是我们是不知道字母和语音是怎么对齐(align)的。这使得训练语音识别比看起来更加复杂。

奈何缘浅wyj·2023-12-24 08:00

RNA-seq数据库（ChatGPT）

截至我最后更新知识的时间（2022年1月），存在许多RNA测序（RNA-seq）数据库，这些数据库提供了大量的基因表达和转录组学数据。

素材积累·2023-12-24 07:11

评价模型（二）主成分分析、因子分析、二者对比及其对应 PYTHON 实现代码和例题解释

：以下是个人在准备数模国赛时候的一些模型算法和代码整理，有空会不断更新内容：评价模型（一）层次分析法（AHP）,熵权法，TOPSIS分析及其对应PYTHON实现代码和例题解释评价模型（二）主成分分析、因子分析

herry_drj·2023-12-24 07:28

一种具有翻译功能的circRNA在肌细胞生成中的作用

Circ-ZNF609isacircularRNAthatcanbetranslatedandfunctionsinmyogenesis期刊：MolecularCell影响因子：14.248主要技术：RNA-Seq、CRISPR/Cas9、circRNAFISH研究背景环状RNAs（circRNAs）是一个具有独特结构的转录子家族

d5c9c866171f·2023-12-24 04:04

2021-12-15

NatBiotech|深度数据融合得到超分辨率空间转录组学原创huacishu图灵基因2021-12-1509:00收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=54.900推荐度：⭐⭐⭐⭐

图灵基因·2023-12-24 02:22

论“水”的神秘性

地球是从水里，孕育出来单细胞生物，暗涵水相生的情况，逐渐生成其他五行。就连生物进化到人类这种高级动物的时候，也自然离不开水。胎儿在母体中孕育的时候，周围由羊水包裹，也代表在水中孕育形成生命。

胡承元·2023-12-24 02:31

如何引导孩子拥有平稳良好的情绪与性格（转录）

一、接纳情绪，坚持原则，引导反思教育不是刻意地发生在某一个特定时段，而是发生在每一个时段。所以，生活即教育。有的父母还会问：我也理解孩子的情绪，但当他大发雷霆的时候，我到底该怎么做呢？第一，家长需要去接纳孩子的情绪。有情绪是非常正常的表现，完全没有情绪才更需要担心。要告诉自己，孩子哭哭闹闹是正常的，不要立刻去批评、指责他们，更不要压制孩子的情绪。喜怒哀惧是每个人天生就拥有的情感，过度地压抑一个孩子

绿叶_d570·2023-12-23 23:11

2022-04-13

NatBioEng|光标记与单细胞测序快速识别侵袭性癌细胞原创图灵基因图灵基因2022-04-1307:03收录于话题#前沿分子生物学机制即使在肿瘤被手术切除或用药物缩小后，一些残留的侵袭性癌细胞也会刺激新肿瘤的生长和扩散

图灵基因·2023-12-23 21:49

汇总 | 转录本表达矩阵到基因表达矩阵

写在前面前天，我写了一个TBtools插件，意在让所有人都能自主分析转录组测序数据，进而获得基因表达量矩阵（TPM）和基因读段计数矩阵（Count）。

生信石头·2023-12-23 09:13

送女儿:

好友郑忠诚女儿今日参加高考，他为女儿作诗两首，转录于此。祈盼考试顺利，如己所愿！(一)十年磨砺忆峥嵘，今朝出鞘露青锋;有梦无畏仗剑去，慈恩塔下定题名。

我心依然绽放·2023-12-23 07:59

知识分享 | 转录组个性化分析(4)——蛋白互作分析

蛋白质-蛋白质相互作用（protein-proteininteraction,PPI）是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体（proteincomplex）的过程。在进行数据挖掘的时候往往会得到很多的差异表达的基因，当你对着一堆基因毫无头绪时，此时PPI数据库对你的数据挖掘起了很大的助攻作用。接下来，跟着小编一起来学习下PPI分析吧！文中附详细代码，小伙伴们可以使用自己项目数据

百易汇能生物·2023-12-23 07:57

如何快速了解接触的质粒(三)

---启动子启动子(promoter)顾名思义就是用来启动目的基因表达的一段DNA序列，位于目的基因前端，本身不被转录，是RNA聚合酶识别，结合和开始转录的一段序列。

小乔爱科研·2023-12-23 04:42

单细胞从理论到实践-这一本书就够了

生信交流平台·2023-12-23 03:13

单细胞分析流程之Cell Ranger

单细胞分析流程之CellRanger图片大家好，我是新加入的小编Immujent，很高兴能够在这里和大家一起学习很分享单细胞的分析流程，以后就请大家多多关注啦~话不多说，直接上干货！

生信宝库·2023-12-23 00:10

项目文章丨单细胞多组学联合揭示神经元发育的进化调控网络

2022年3月，来自中科院遗传发育所许执恒团队和吴青峰教授在CellResearch杂志上合作发表了题名为“Evolutionarilyconservativeandnon-conservativeregulatorynetworksduringprimateinterneurondevelopmentrevealedbysingle-cellRNAandATACsequencing”的研究论文，

晶典教你玩转科研·2023-12-22 22:02

恐龙

距今38亿年前，地球上开始出现了生命，那是生活在海涪的一种单细胞动物——草履虫；经过了数亿年的变化，草履虫演变成了爬行动物，生活在海洋、陆地和天空中心；又经过了时代的漫长变迁，世界上的第一只恐龙出现了。

小杰g·2023-12-22 19:58

使用PtR作图

刘小泽写于19.2.16今天内容比较简单，易上手：看看如何作图评价定量结果使用Trinity组装转录本，并定量后，有了基因或者转录本的表达量矩阵，先不用着急去做差异分析，可以先检查下数据，例如：组内生物学重复间相关性是不是高于组间重复

刘小泽·2023-12-22 16:49

从RNA定向互作看基因组组织

在此类过程中的原始作用，现在已知几种类型的RNA对调节基因表达至关重要：在细胞核中，长非编码RNAs（lncRNAs）、增强子RNAs（eRNAs）、稳定的内含子序列RNAs（sisRNAs）和其他各种类型转录物在一起确保染色质

Ss_y·2023-12-22 13:06

10X单细胞（10X空间转录组）利用轨迹分析推断细胞间的实时通讯（TraSig）

hello，大家好，今天我们来分享一个新的内容，利用我们的轨迹分析的结果来推断细胞之间的通讯交流。文章在Inferringcell-cellinteractionsfrompseudotimeorderingofscRNA-Seqdata.这个方法对于有分化关系的细胞类型来说，是一个新的角度解读细胞间的通讯，个人认为更加的重要。我们先来看看文献，最后分享示例代码。Abstract1、Amajora

单细胞空间交响乐·2023-12-22 08:11

由于人工智能和自动化，2030 年将不存在的 6 个科技工作岗位

这项工作涉及打字和转录等重复性任务

沃趣数据库管理平台·2023-12-22 07:21

裁员滚滚财源滚滚

幸福本是璀璨之星空，如今却比个单细胞动物还不如。这也一点都不奇怪，伟

蘑菇洒脱·2023-12-22 06:46

10X空间转录组数据分析之降噪和imputation处理（SPCS）

hello，大家好，今天给大家带来一个新的内容，针对10X空间转录组的降噪和imputation分析，这两部分的分析内容大家在10X单细胞的分析上应该是经常用到的，大家可以找一找我的公开课，专门讲过这一部分的内容

单细胞空间交响乐·2023-12-21 16:41

芯周刊·第29期 | 单细胞+转录组测序：揭示GABA信号调控神经发生

为了探究复发CRC的细胞来源，本文研究者首先在单细胞水平分析了预后不良CRC患者的转录组特征，共确定了2530个预测复发的基因，然后在两个单细胞转录组数据中发现这些预后不良基因在CAF、

生物芯时空·2023-12-21 08:56

多切片联合构建3D生物空间图谱

空间转录组（ST，Spatialtranscriptomics）技术正在革新探索组织空间结构的方式。目前，ST数据分析通常仅限于单个2D组织切片，限制了我们理解3D空间中发生的生物过程。

tzc_fly·2023-12-21 07:47

2021-10-15

单细胞RNA测序显示微生物群的缺失使TME倾向于促肿瘤巨噬细胞。2.从机制上讲，本文发现微生物群衍生的干扰素基因刺激因子（STI

图灵基因·2023-12-21 06:47

Seurat用自定义的 cell type 做差异表达

通常情况下，按照Seurat的流程，对于研究单细胞数据差异表达会用“聚类”的结果，再利用FindMarkers函数找到不同类别的差异表达基因。

Janine_1991·2023-12-21 01:19

单细胞转录组学习笔记-7-重复平均表达量和变异系数相关性散点图

转载来自：刘小泽链接：https://www.jianshu.com/p/e659a2f164f7刘小泽写于19.7.4-第二单元第五讲：重复平均表达量和变异系数相关性散点图笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索

夕颜00·2023-12-21 01:39

酵母培养物行业分析：到2026 年将达到61亿美元

酵母是一种单细胞真菌，常用于烘焙、酿造和发酵。酵母是一种用途广泛的成分，几个世纪以来一直用于生产各种产品，例如面包、啤酒、葡萄酒和生物燃料。

QY调研所·2023-12-20 20:21

我们活了38亿年

浩渺的生物进化史中，从原核生物到真核生物，从单细胞生物到多细胞生物，从五次大灭绝到两栖类动物、哺乳动物的进化，再到远古人类的出现，那些曾经的弱势生物群体如何克服环境挑战生存下来，并开拓新的生命时代，作者稻垣荣洋坚持

三三在此·2023-12-20 20:06

生信分析代谢通路可视化分析R工具包ggkegg的使用案例

可视化DESeq2中的数值属性通过提供通常用于转录组分析的DESeq2软件包的结果，可以在图形的节点中反映数值结果。该函数可用于此目的。

小果运维·2023-12-20 14:22

多组学文章思路解析3-蛋白组与转录组联合分析讨论

老师们经常做的是蛋白组与转录组的多组学实验及联合分析，我们经常找蛋白组与转录组一致变化的基因。而转录组有变化，蛋白没有变化，或者转录组没有变化而蛋白有变化的情况是什么原因引起的。

纪伟讲测序·2023-12-20 10:03

whisper深入-语者分离

文章目录学习目标：如何使用whisper学习内容一：whisper转文字1.1使用whisper.load_model()方法下载，加载1.2使用实例对文件进行转录1.3实战学习内容二：语者分离（pyannote.audio

代码浪人·2023-12-20 08:11

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