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Linux
生物信息学ATAC
文献阅读 — Clustering by Fast Search and Find of Density Peaks
聚类分析的目标是基于元素的相似性进行归类,在
生物信息学
和模式识别等领域有着广泛的应用,常用的聚类算法有:knn、K-means、K-m
binzeng
·
2017-08-28 09:11
【Fast
ATAC
protocol】减少线粒体DNA干扰(wet-2)
参考原文:http://www.nature.com/ng/journal/v48/n10/full/ng.3646.html#methodsFast-ATACsequencing.Thisprotocolhasbeenoptimizedforbloodcells.Wenotethatdigitoninisagentledetergentandthisprotocolmaynotbeidealfo
Runuply
·
2017-08-18 16:57
#分子模拟#PUTRACER:一个在多结构域蛋白中预测连续域的在线软件
蛋白质结构域的计算机辅助预测被认为是结构
生物信息学
中的一个重要问题。
生信杂谈
·
2017-07-31 23:15
表达富集分析软件ABAEnrichment (1)
以下介绍引用自表达谱芯片数据的基因功能富集分析刘明1王米渠2丁维俊2综述毕锋1审校基因富集分析是
生物信息学
分析领域的一种分析方法。
赵晨西西西西
·
2017-07-18 22:21
乔治城大学商学院硕士申请条件及专业设置
乔治城大学商学院硕士申请条件及专业设置艺术与科学研究生院生物化学与分子生物学:
生物信息学
方向托福80分或雅思7分,GRE,GPA要求3.0以上,学费$46,578/年,申请截止日期:春季11月1日,秋季
美国大学研究生排名
·
2017-06-14 21:33
Nature:用2斤DNA就能存储世界上所有的数据
高德曼正在德国汉堡的一个酒店里,与几个
生物信息学
家讨论如何解决铺天盖地而来的海量基因组序列以及其他数据的存储难题。他记得科学家们差不多要被传统计算技术的所耗费用和局限性难倒时,他们开始对其他方
weixin_34324081
·
2017-06-06 16:00
大数据
数据库
人工智能
动态规划
什么是动态规划维基百科上的解释:动态规划(dp)是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
生物信息学
中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
sshpp
·
2017-05-15 09:03
经济学
计算机科学
return
生物信息学
入门级的常用软件
https://www.zhihu.com/question/23566982
生物信息学
是为生物学研究者提供分析工具的学科,渗透到生物学的几乎每一个研究领域。
11010tianyi
·
2017-03-05 09:10
生物信息学
(BioInfo) - Linux 常用操作
切换目录cd参数效果无参数或~返回home目录..切换到上级目录-切换至之前工作的目录打印文件(目录)列表ls(不作特殊说明时,下文“所有文件及目录”等表达指不包含隐藏文件的所有文件及目录)参数效果-a列出当前目录所有文件及目录,包括以”.”开头的隐藏文件、以”..”开头的有父目录的文件-A列出当前目录所有除”.”、”..”开头的文件及目录-l列出当前目录所有文件、目录及其所有者、文件大小、修改日
QimaoRyan
·
2017-01-17 17:11
Linux
BioInfo
lintcode 最长公共子序列
该问题是典型的计算机科学问题,是文件差异比较程序的基础,在
生物信息学
中也有所应用。https://en.wikipedia.org/wiki/Longest_common_subsequence_pr
yzawyx0220
·
2017-01-13 11:00
老司机辣评 | 基因大数据再受关注,壹基因与阿里云达成战略合作伙伴关系
点评嘉宾陈卫华博士,曾在瑞士
生物信息学
研究所从事系统生物学及转化医学、计算生物学、整合
生物信息学
和进化生物学方面的研究。
基因空间
·
2016-12-12 17:36
老司机辣评 | 23andMe总裁佩奇离职背后的战略选择
德国慕尼黑工业大学
生物信息学
博士。互联网医疗中国会特约研究员,中国康复技术转化及发展促进会精准医学与肿瘤康复专业委员会副秘书长。
基因空间
·
2016-11-29 17:45
基于RNA-seq的基因表达分析
我的青春最近在做一些小麦基因的表达分析,想到使用RNA-seq的数据进行
生物信息学
分析,并且比我做实验用的组织还要多。
msw521sg
·
2016-09-23 14:17
数据
RNA-seq
软件
基因表达
生物信息
生物
基于随机森林的特征选择算法
http://xuebao.jlu.edu.cn/gxb/article/2014/1671-5497-44-1-137.html0引言图像处理、信息检索以及
生物信息学
等技术的发展,产生了以超大规模特征为特点的高维数据集
荪荪
·
2016-07-18 09:46
机器学习
Bio::DB::GenBank, Bio::SeqIO
bioperl(http://bioperl.org/)模块使用--
生物信息学
中用的模块功能:根据核酸的gi号自动从GenBank中提取FASTA格式的序列,可以多序列提取。#!
twc829
·
2016-05-24 16:00
字符串匹配(BF,BM,Sunday,KMP算法解析)
字符串匹配算法有着很强的实用价值,应用于信息搜索,拼写检查,
生物信息学
等多个领域。
l953972252
·
2016-05-06 21:00
字符串
匹配
bf
字符串匹配(BF,BM,Sunday,KMP算法解析)
字符串匹配算法有着很强的实用价值,应用于信息搜索,拼写检查,
生物信息学
等多个领域。
l953972252
·
2016-05-06 13:00
算法
KMP
七步理解深度学习
深度学习是机器学习的一个分支,拥有很多的相似性,但是却也不同,深度神经网络结构在自然语言处理、计算机视觉、
生物信息学
和其他领域解决了各种各样的问题。
Real_Myth
·
2016-04-27 19:00
直系同源基因数据库以及网站开发
直系同源基因数据库以及网站开发项目描述近年来,随着第二代测序技术的快速发展,,测序数据急剧增加.因此,需要更多的
生物信息学
方法对其进行分析研究.由于直系同源基因之间具有相似的生物学功能,它的识别对于分析生物的系统进化以及预测新基因与蛋白质的功能至关重要
u014374031
·
2016-04-12 14:00
数据库
生物
数据
大数据存储之报告(一)
一、大数据特点随着互联网Web2.0应用的大规模兴起,大量结构化(零售、财务、
生物信息学
、地理数据)、半结构化(Web日志、电子邮件、文档)和非结构化(图像、视频、传感器数据、网页)数据产生,对这些数据的存储
玫瑰小鹿angelina
·
2016-04-06 13:44
大数据存储之报告(一)
一、大数据特点随着互联网Web2.0应用的大规模兴起,大量结构化(零售、财务、
生物信息学
、地理数据)、半结构化(Web日志、电子邮件、文档)和非结构化(图像、视频、传感器数据、网页)数据产生,对这些数据的存储
玫瑰小鹿angelina
·
2016-04-06 13:44
生物信息学
菜鸟成长日记开通!
清明节假日归来~从今天起,每天晚上花上半个小时总结记录一下一的工作!一方面是督促自己,要每天做些实际的东西,真正沉下心来,心无旁骛,专注于科研工作;另一方面,记下自己的一些思考或者发现,或者从别处吸收到的一些好的东西。好记性终不如烂笔头,况且自己总觉得自己记性越来越差了。再者,自己从网友的各种分享中受益良多,总是一贯索取,绝不是我们中华民族的传统作风;另外,在搜找一些东西的时候,发现有很多信息或者
u013816205
·
2016-04-04 22:00
心情
随感
算法课笔记系列(三)—— 动态规划
动态规划可以应用在
生物信息学
,控制理论,信息理论,运筹学(Operationsresearch)和计算机科学中的理论、图像、人工智能、编译器等等。首先,对着之前的算法思路进行一个
Ying_Xu
·
2016-04-02 22:00
算法
动态规划
算法课笔记系列(四)—— 动态规划
动态规划可以应用在
生物信息学
,控制理论,信息理论,运筹学(Operationsresearch)和计算机科学中的理论、图像、人工智能、编译器等等。首先,对着之前的算法思路进行一个
小胖子小胖子
·
2016-04-02 00:00
算法
SVD:奇异值分解
今天来讲讲SVD是怎么回事首先说说什么是SVD,这货可不是SVM,SVD(SingularValueDecomposition)是奇异值分解的缩写,该方法应用在
生物信息学
到金融学等很多应用之中,SVD都是提取信息的强大工具
chixujohnny
·
2016-03-20 16:49
机器学习
SVD:奇异值分解
今天来讲讲SVD是怎么回事首先说说什么是SVD,这货可不是SVM,SVD(SingularValueDecomposition)是奇异值分解的缩写,该方法应用在
生物信息学
到金融学等很多应用之中,SVD都是提取信息的强大工具
chixujohnny
·
2016-03-20 16:00
SVD
2016年阅读计划
生物信息学
专业类:1.《python语言》2.每月2篇SCI文章 经济类:1.《国富论》(上、下)2.《美国货币史》 心理类:1.《少有人走的路Ⅱ:与心灵对话》2.
Sam_Yang
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2016-02-18 11:00
七步理解深度学习
深度学习是机器学习的一个分支,拥有很多的相似性,但是却也不同,深度神经网络结构在自然语言处理、计算机视觉、
生物信息学
和其他领域解决了各种各样的问题。
andrewseu
·
2016-01-18 17:43
MachineLearning
DeepLearning
七步理解深度学习
深度学习是机器学习的一个分支,拥有很多的相似性,但是却也不同,深度神经网络结构在自然语言处理、计算机视觉、
生物信息学
和其他领域解决了各种各样的问题。
Andrewseu
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2016-01-18 17:00
cnn
深度学习
caffe
RNN
待学习
bioscala—Scala语言可用的
生物信息学
程序库论文:https://scholar.google.com/scholar?
bob601450868
·
2016-01-07 15:00
scala
生物
阿里云于生物信息分析专业
最近在阿里云上买了个账号,根据了解到的初步的信息,云计算将在我们
生物信息学
领域得到广泛应用,当然前提是阿里能够提供相应的服务,让客户,特别是小白客户更容易的上手,甚至生物分析爱好者或者提供生物信息分析服务的小型公司可以在阿里云上运行
马省伟
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2015-12-18 11:03
云计算
淘宝
阿里云
生物信息分析
OpenResty最佳实践
moonbingbing.gitbooks.io/openresty-best-practices/content/lua/brief.html1、Lua入门1.1Lua简介Lua在游戏开发、机器人控制、分布式应用、图像处理、
生物信息学
等各种各样的领域中得到了越来越广泛的应用
wangqiaowqo
·
2015-12-08 14:00
AHOI 基因匹配 dp LCS LIS
卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦,而可可这些日子正在研究
生物信息学
中的基因匹配问题,于是他决定为这个奇怪星球
qq_32451161
·
2015-12-08 12:00
dp
应用
Lis-Lcs
关联规则
今天,关联规则已广泛应用于金融、营销以及
生物信息学
等领域。 2、概念 1)基本概念: 项集:一个或多个项目的集合。 例如: {Mi
·
2015-11-12 16:08
关联
生物信息学
--研究方向
生物信息学
利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。目前的
生物信息学
基本上只是分子生物学与信息技术(尤其是因特网技术)的结合体。
·
2015-11-12 09:34
生物
字符串和字符串模式匹配
字符串在计算机中的处理非常广泛,人机之间信息的交互,文字信息的处理,
生物信息学
中基因信息的提取以及Web信息的提取等,都离不开字符串的处理。 C++和C语言都有很多写好的库函数。
·
2015-11-11 02:51
字符串
生物信息学
必读100篇论文
生物信息学
:
生物信息学
时应用信息科学的知识和方法,搜集、整理、贮存、分析生命科学的一门新兴学科,是现代医学生物学研究和分析的必备工具。
·
2015-11-02 19:05
生物
DNA分子结构3D模型
生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为
生物信息学
的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。
·
2015-11-01 10:34
3D
生物信息学
相关网站
生物信息学
与生物计算:http://bioinformatics.weizmann.ac.il/ 这是
生物信息学
和生物计算学的网站,由Weizmann科学研究所,生物服务部和Crown人类基因组学中心支持
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2015-10-31 17:57
生物
研究多个基因间相互作用的频域方法
事实上,这是当今
生物信息学
中一个热门且具有挑战性
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2015-10-31 10:04
方法
[zz]使用 Python 为 KVM 编写脚本,第 1 部分: libvirt
Paul Ferrill, CTO,
ATAC
简介: 本系列文章由两部分组成,将探讨如何使用 Python 创建脚本,用这些脚本管理使用 KVM 的虚拟机。
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2015-10-30 18:47
python
[zz]Scripting KVM with Python, Part 1: libvirt
www.ibm.com/developerworks/opensource/library/os-python-kvm-scripting1/ Paul Ferrill, CTO,
ATAC
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2015-10-21 11:26
python
基础研究与国家目标——国家重点基础研究发展计划[转自科学社]
就生命科学领域而言,当前的科学前沿是:
生物信息学
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2015-10-21 11:12
基础
算法导论28(矩阵运算)
最小二乘逼近
ATAc
=ATy⇒c=(ATA)−1ATy⇒A+=(ATA)−1AT,c=A+yvectorLUPSolve(vec
hz5034
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2015-06-26 10:00
破解生物大数据建模核心技术
据论文通讯作者、中心主任邬荣领教授介绍,这项技术被命名为2HiGWAS,日前发表在国际
生物信息学
期刊《
生物信息学
简讯》上。
数据分析师
·
2015-06-25 13:00
生物信息-related
生物信息学
的研究重点主要体现在基因组学(genomics)和蛋白质组学(proteomics)两个方面,intron内含子,exon外显子1.DNA的双螺旋结构双螺旋结构是基于对碱基配对规律的认识:氢键结合只发生于互补的碱基
拾毅者
·
2015-05-18 09:42
BioMed
生物信息-related
生物信息学
的研究重点主要体现在基因组学(genomics)和蛋白质组学(proteomics)两个方面,intron内含子,exon外显子1.DNA的双螺旋结构双螺旋结构是基于对碱基配对规律的认识:氢键结合只发生于互补的碱基
Dream_angel_Z
·
2015-05-18 09:00
c
模板
结构
信息
[
生物信息学
] 文献阅读汇报笔记(1)
基于网络的协同过滤方法在推荐系统里用的很多,这篇文章也与之有关,其实
生物信息学
的很多问题,还是很偏算法的,对生物的背景要求不高。
SA14023053
·
2015-05-16 16:00
SVM
生物信息学
二分图
基于网络的方法
《图解机器学习》
时至今日,机器学习研究的重要性与可行性已得到广泛承认,并在模式识别、通信、控制、金融、机器人、
生物信息学
等许多领域都有着广泛的应用。详细解读和小伙伴们一起来吐槽
李航421
·
2015-04-22 13:00
机器学习
图解
DNA分子结构3D模型
生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为
生物信息学
的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。
MonoLog
·
2015-04-22 01:00
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