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Heatmap
matlab聚类热图,不用 R 语言,学会这两招,科研小白也能轻松搞定聚类热图的绘制...
想必大家对聚类热图
Heatmap
并不陌生,聚类热图是我们展示基因芯片或测序结果比较常用的方式,可以直观地反映样品间的相似程度。
weixin_39833469
·
2022-11-26 13:23
matlab聚类热图
R绘制带显著性标记的热图
测试数据文件:①table1.txt②col_group.txt③row_group.txt1.导入p
heatmap
包,读取数据;#导入包library(p
heatmap
)#读取数据data0.12,"
作图帮
·
2022-11-26 13:53
我的避难日记-《R:p
heatmap
》,热图,
heatmap
,聚类
首先生成测试用的matrix:library(p
heatmap
)test=matrix(rnorm(200),20,10)test[1:10,seq(1,10,2)]=test[1:10,seq(1,10,2
wangshuo0782
·
2022-11-26 13:23
生信技能学习-R
R语言:p
heatmap
R包做聚类分析热图
1.原始数据表1:表1原始数据geneABCDEgene10.0340.3510.0640.3670.063gene20.0370.110.0560.1270.05gene30.0110.1130.0130.1060.025gene40.0210.0730.0160.0780.012gene50.0090.0860.0190.0560.016gene60.3440.0530.3270.3510.3
达尔不是贝吉塔
·
2022-11-26 13:52
r语言
开发语言
R | p
heatmap
: Error in convert_annotations(annotation_col, annotation_colors) : Factor levels on
运行p
heatmap
包构建分组时报错,报错内容:Errorinconvert_annotations(annotation_col,annotation_colors):FactorlevelsonvariableTimedonotmatchwithannotation_colors
跳动的喵尾巴
·
2022-11-26 13:22
R
pheatmap
相关性热图的完美解决方案 -- p
heatmap
包
相关性热图的完美解决方案–p
heatmap
包install.packages('p
heatmap
')#安装包,加载数据library(p
heatmap
)#生成测试数据集test=matrix(rnorm
罗曼罗兰learnote
·
2022-11-26 13:20
数据分析
r语言
R | p
heatmap
: Error in convert_annotations(annotation_col, annotation_colors) : Factor levels on var
>p
heatmap
(e2,cluster_rows=F,cluster_cols=F,scale="row",+border_color=NA,+gaps_row=cumsum(as.numeric(table
hanlyi
·
2022-11-26 13:50
r语言
开发语言
R语言p
heatmap
包绘制热图
能绘制热图的R包很多,今天我们来介绍p
heatmap
包,这个包的特点是简单易学,图片精美。
天桥下的卖艺者
·
2022-11-26 13:49
R语言
r语言
聚类
机器学习
R:热图解释 | p
heatmap
包参数及详细聚类图绘制流程(一篇解决热图绘制问题)
热图解释及p
heatmap
绘制热图一、热图绘制原理1.1热图介绍1.2热图绘制准备——均一化1.3热图绘制方式1.4热图数据查看示例二、p
heatmap
包简介2.1p
heatmap
介绍2.2p
heatmap
跳动的喵尾巴
·
2022-11-26 13:48
R
经验分享
数据可视化
R
热图
【目标检测】英雄联盟能用YOLOv5实时目标检测了 支持onnx推理
目录一、项目介绍二、项目结构三、准备数据1.数据标注2.数据转换格式四、执行训练1.anchors文件2.标签文件3.预训练模型4.训练数据5.修改配置6.执行训练五、执行预测1.检测图片2.检测视频3.
heatmap
小殊小殊
·
2022-11-26 07:45
目标检测
目标检测
计算机视觉
深度学习
LSTM/GRU详细代码解析+完整代码实现
在这里整理一下详细的LSTM/GRU的代码,并基于
heatmap
热力图实现对结果的展示。
m0_53961910
·
2022-11-25 21:28
lstm
gru
CenterNet原理详解
对于CenterNet的理解主要在于四方面:网络结构,
heatmap
生成,数据增强,loss函数理解。1.CenterNet网络结构除了检测任务外,
zsffuture
·
2022-11-25 08:17
深度学习
论文笔记:Objects as Points(CenterNet)
通过一个全卷积神经网络,生成一个
heatmap
,找到这个
heatmap
的峰值就是物体的中心。这个方法同时也可用于人体关键点检测和单目深度估计。方法简单来说,就是通过一个全卷积网络,输出
CvBeginner
·
2022-11-25 08:46
论文笔记
目标检测
【机器学习】线性回归之预测商品的销售额
目录情境:一、读取数据二、分析数据1、热度图
heatmap
()2、散点图三、特征集和标签集1、学会查看数据2、拆分训练集和测试集四、线性回归五、开始预测六、评价测度七、模拟效果对比图ROC曲线八、给模型打分情境
Fx_2003
·
2022-11-25 02:23
Machine
Learning
线性回归
2022.08.24【R语言】|p
heatmap
外接函数调用时不能有NA/NaN/Inf(arg10)报错问题及解决方案
目录项目场景问题描述原因分析解决方案总结项目场景差不多接近4个月没有写博客,不能说个人没有学习新的知识,由于疫情反复,防疫政策让整个人也比较浮躁。最近部门有新同事入职,自己也接了新的业务,忙起来反而觉得该把遇到的问题整理记下,帮助新人学习。今天就把16S里面绘制物种丰度的热图报错进行整理问题描述在已确认脚本没有问题、已经绘制过多个16S物种丰度项目热图的情况下发生报错。Errorinhclust(
穆易青
·
2022-11-25 01:56
R语言
扩增子
r语言
开发语言
python语法基础
目录1.import和from…import模块的变量、方法引用差异2.python中出现''int'objectisnotcallable'的错误3.seaborn.
heatmap
(参数介绍)4.pd.date_range
Alex_81D
·
2022-11-24 20:33
python
python
开发语言
tensorflow
YOLO-Pose: Enhancing YOLO for Multi Person Pose Estimation Using Object Keypoint Similarity Loss 笔记
YOLO-Pose:使用OKSLoss增强YOLO多人姿态估计CVPRW2022论文链接代码链接摘要:本文引入了一种新的
heatmap
-free联合检测法:YOLO-Pose,基于YOLO目标检测框架进行
AnZhiJiaShu
·
2022-11-24 13:07
深度学习
计算机视觉
目标检测
YOLOv5永不缺席 | YOLO-Pose带来实时性高且易部署的姿态估计模型!!!
点击上方“小白学视觉”,选择加"星标"或“置顶”重磅干货,第一时间送达本文介绍了YOLO-Pose,一种新的无
Heatmap
联合检测方法,是基于YOLOv5目标检测框架的姿态估计。
小白学视觉
·
2022-11-24 13:35
python
计算机视觉
机器学习
人工智能
深度学习
Free space基础知识及相关论文
常用装逼词汇freespace综述freespace相关论文及基础知识CenterNetCenterNet原理CenterNet中的
Heatmap
HDMapNet:AnOnlineHDMapConstructionandEvaluationFramework
Ricardo_che
·
2022-11-24 00:06
深度学习
python colorbar详解
第一个参数为colorbar传入参数,代表colorbar所关联的contourf/
heatmap
/cmap/scatter(下面皆以contourf举例),这种方式是最简单的默认传入,绘制出来的colorbar
痴儿CE
·
2022-11-23 12:24
colorbar
python
开发语言
【特征工程】——绘图
【特征工程】——绘图1DataFrame.plt更改字体2plt.plot更改字体3sns.
heatmap
更改字体1DataFrame.plt更改字体fromsklearn.feature_selectionimportmutual_info_classifimportmatplotlib.pyplotaspltfrommatplotlib.figureimportFigurefrommatplo
小羊星球
·
2022-11-23 09:13
机器学习
python
机器学习
sklearn
python使用show_
heatmap
s函数 不报错,也不显示图像的解决方式
源代码:importtorchfromd2limporttorchasd2l#以后调用该函数来显示att权重defshow_
heatmap
s(matrices,xlabel,ylabel,titles=
小白小王
·
2022-11-22 23:40
深度学习
numpy
python
开发语言
论文阅读|TokenPose
AbstractIntroductioncontributionsMethodFCN-basedHumanposeestimationToken-basedKeypointRepresentationVisualtokensKeypointtokensTransformer
Heatmap
estimation
xiaoweiyuya
·
2022-11-22 22:41
人体姿态估计
深度学习
人工智能
HRNet论文阅读及部分代码标注
Sequentialmulti-resolutionsubnetworks2.Parallelmulti-resolutionsubnetworks3.Repeatedmulti-scalefusion4.
Heatmap
estimation5
yizhi_hao
·
2022-11-22 22:33
姿态估计
深度学习
python
值得参考的可视化与误差分析|HRNet团队的另一款Bottom-up人体姿态估计方法
文章:Bottom-UpHumanPoseEstimationbyRanking
Heatmap
-GuidedAdaptiveKeypointEstimates代码:https://github.com/
Patricia_daye
·
2022-11-22 22:56
HPE
深度学习
python
计算机视觉
遮挡行人重识别论文阅读(2020)
LearningRelationandTopologyforOccludedPersonRe-Identification(CVPR2022,中科院自动化所,旷视)模型由三大部分组成:1.一阶语义信息的提取(semanticfeature):使用一个CNN骨干网络得到featuremap和姿态估计器得到关键点
heatmap
wyl2077
·
2022-11-22 11:48
重识别
计算机视觉
深度学习
CenterNet :Objects as Points 部分过程个人理解
训练过程:注意:以下提到的坐标都是以图像左上角为原点(0,0)来计算的①先读取图片信息,然后根据标签标注的物体中心点将一张图片不是物体中心点的地方全部设为0即黑化,这时就得到了一张热图(
heatmap
)
月下无人江自流丶
·
2022-11-22 10:29
python
计算机视觉
卷积神经网络
机器学习
pytorch
单细胞基因可视化之热图的根本改造2
我们前面已经说过了单细胞marker/或者其他任意基因的热图的简单修饰(单细胞基因可视化之热图改造修饰1),仅仅是基于颜色和Do
Heatmap
函数的参数修饰。
TS的美梦
·
2022-11-21 15:54
r语言
开发语言
数据挖掘
聚类
数据分析
2D姿态估计regression-based之RLE损失函数
参考:镜子,Indigo6
Heatmap
-based
Heatmap
-based方法通过显式地渲染高斯热图,让模型学习输出的目标分布,也可以看成模型单纯地在学习一种滤波方式,将输入图片滤波成为最终希望得到的高斯热图即可
daoboker
·
2022-11-21 10:28
深度学习
目标检测论文阶段性总结——Anchor-Free Detectors
目录背景(针对anchor-basedmodel)CornerNet1.主干网络——HourglassNetwork2.DetectingCorner-Pairs1)
Heatmap
s2)Offests3
wutongxdf
·
2022-11-19 20:28
目标检测
深度学习
计算机视觉
图像分割-FCN全卷积神经网络(完整代码详解)
目录FCN全卷积神经网络实现过程全卷积反卷积FCN的三点创新codeFCN全卷积神经网络FCN为深度学习在语义分割领域的开山之作,提出使用卷积层代替CNN中的全连接操作,生成热力图
heatmap
而不是类别
爱吃酸菜鱼的小猫咪
·
2022-11-19 05:28
图像分割模型
算法
深度学习
pytorch
cnn
HigherHRNet 源码分析
HigherHRNet训练时采用多分辨率监督,简单来说就是输出多分辨率的
heatmap
实现也就是在HRNet的后面添加一个反卷积分支,让其输出一个更大尺寸的
heatmap
关于HRNet可以参考:HRNet
那时那月那人
·
2022-11-15 17:51
源码分析
人体姿态估计
论文解析
计算机视觉
基于骨骼的动作识别:PoseConv3D
RelatedWork2.1基于3D-CNN的rgb视频动作识别2.2基于GCN的骨骼动作识别2.3基于CNN的骨骼动作识别3.Framework3.1PoseExtraction3.2From2DPosesto3D
Heatmap
Volumes3.3
Airs_Gao
·
2022-11-15 13:11
论文笔记
3d
人工智能
深度学习
动作识别
优化姿态估计模型
本文优化了一个regression-based轻量级姿态估计模型,最终精度和
heatmap
-based的精度差不多,速度超越了
heatmap
-based的方法。实验大部分参考了镜子大佬知乎的优化过程。
Ctrl_Cver
·
2022-11-15 11:18
深度学习
深度学习
姿态估计
Complex
Heatmap
复杂热图绘制学习——2.单个热图(二)
2.7热图分割Complex
Heatmap
包的一个主要优点是它支持按行和列拆分热图以更好地对特征进行分组,便于突出显示各组的信息。
denghb001
·
2022-11-01 17:08
Complex
Heatmap
复杂热图绘制学习——2.单个热图(一)
虽然Complex
Heatmap
包的“亮点”在于它可以同时高效可视化一个热图列表,作为热图列表的基本单元,配置好单个热图是很重要的。
denghb001
·
2022-11-01 14:16
Complex
Heatmap
复杂热图绘制学习——介绍
在绘制热图过程中,我们可以常用的R包有
heatmap
、p
heatmap
,如果想要对现有的热图进行更多的注解,并展示出更多信息,这个时候就需要R的高级热图绘制包---Complex
Heatmap
,这个包可以有效地可视化不同数据集源之间的关联并揭示潜在模式
denghb001
·
2022-11-01 09:47
plot1cell:优雅的可视化你的单细胞数据
简介plot1cell包提供了多种单细胞数据可视化的高级功能,可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图,主要依赖于SeuratV4,circlize,Complex
Heatmap
和simplifyEnrichment
Davey1220
·
2022-10-31 08:59
CenterPoint高斯核半径的计算——转
记录一下:说点Cornernet/Centernet代码里面GT
heatmap
里面如何应用高斯散射核-知乎
噗噗噗蒲
·
2022-10-29 07:00
3D目标检测
深度学习
keras CAM和Grad-cam原理简介与实现
flatten+softmax2、featureextraction+GAP+softmax二、CAM和Grad-CAMPython-OpenCV图像叠加or图像混合加权实现CAM和Grad-cam求
heatmap
cvvoid
·
2022-10-04 16:20
深度学习番外-tools
深度学习
python
tensorflow
Transformer自注意力可视化
云平台,需要的库matplotlib3.3.2(因为colab默认版本的在添加中文字体时会出错,机缘巧合换了一个版本就成功了,也是试了一上午才找出来是库的版本bug,这样的错也是很无奈了)seaborn的
heatmap
vanilla_hxy
·
2022-10-01 07:53
transformer
深度学习
神经网络
Ultra-Fast-Lane 车道线检测算法复现
0.前景车道线检测算法可分为基于segment,
heatmap
,point.本文由于设备影响,要求速度较快,采用的是基于点回归的方式,最终输出的是点,使用方程拟合车道线后计算轮胎和车道线的距离.Ultra-Fast-Lane
五小白
·
2022-09-30 07:52
记录
python
pytorch
视觉检测
深度学习
R语言绘图包08--森林图的绘制:forestplot
R语言绘图包系列:R语言绘图包01--优秀的拼图包patchworkR语言绘图包02--热图p
heatmap
R语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包04--GOplot:富集分析结果可视化
Hayley笔记
·
2022-09-29 14:02
python seaborn显示的热力图中科学技术法怎么改成普通数值+怎样用深度学习数据画热力图
省流:
heatmap
参数中加入fmt='.0f’即可,即:importseabornassns#C2是一个混淆矩阵sns.
heatmap
(C2,annot=True,ax=ax,fmt='.0f')#Drawa
heatmap
Innocent^_^
·
2022-09-28 21:33
pytorch
深度学习
在线绘制RNA-seq,microarray基因表达谱聚类热图
heatmap
一般情况下我们认为cluster(聚类)、
heatmap
(热图)两个词表达的是同一个意思,往往相互替代。然而这两个词还是有区别的,cluster是数据处理,
heatmap
是数据展示。
余丁,微生信
·
2022-09-24 07:31
MMpose代码讲解之关键点
Heatmap
可视化
请大家耐心的看完铺垫部分的内容,将代码流程摸熟摸透,不要只是简单的复制文中的代码,而是要明白遇到一个新问题该怎么去解决(*^_^*)。首先将代码定位到mmpose\models\detectors\top_down.py中,该脚本文件只有一个TopDown类,是关键点检测器整个流程的执行文件。该类的构造参数说明如下:backbone(dict):特征提取网络及配置,和config文件中的model
@会飞的毛毛虫
·
2022-09-13 20:27
关键点检测干货分享
mmpose
关键点
可视化
matlab如何绘制相关系数热力图,相关系数矩阵与热力图
heatmap
相关系数矩阵与热力图
heatmap
importnumpyasnpimportpandasaspdimportmatplotlib.pyplotaspltimportseabornassns#生成随机矩阵
朱朱wanqing
·
2022-09-03 14:18
手把手带你学习Python数据可视化
绘制直方图displot()9.绘制条形图barplot()10.绘制线性回归模型11.绘制核密度图kdeplot()12.绘制箱线图boxplot()13.绘制提琴图violinplot()13.绘制热力图
heatmap
数学是算法的灵魂
·
2022-08-09 07:59
手把手带你学python
python之数据分析可视化
python基础入门
python
CenterNet目标检测【详解】
文章目录1、Backbone2、
Heatmap
2.1
Heatmap
Loss2.2WHLoss2.3offseLoss2.4TotalLoss和decode1、BackboneHourglass:主要用于关键点检测
全息数据
·
2022-07-29 07:06
图像算法
深度学习
目标检测
深度学习
目标检测知识点
CenterNet中
heatmap
(热力图)如何生成?你知道哪些边缘端部署的
浩浩乎@
·
2022-07-22 07:21
面经
算法
计算机视觉
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