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PyG
图卷积神经网络笔记——第五章:(2)基于
PyG
库构造自己的数据集&查阅其他GCN方法
这一小节看基于
PyG
库构造自己的数据集和查阅其他GCN方法。
Ma Sizhou
·
2022-12-08 19:25
PyTorch
数据与处理
图卷积神经网络笔记
【
PyG
】文档总结以及项目经验(持续更新
文章目录1.介绍1.1图数据处理1.2常用的图神经网络数据集1.3使用batch加载数据集1.4数据转换DataTransforms2.建立消息传递MessagePassing网络2.1MessagePassing基类2.2GCN实现2.3EdgeConvolution的实现3.创建自己的数据集3.1创建一个能够完全放入内存中的图数据集InMemoryDataset3.2创建无法完全放入(更大的)
来包番茄沙司
·
2022-12-08 19:25
python项目
#学习记录
生物化学&图神经
深度学习
人工智能
机器学习
yelp数据集_
pyg
学习04:数据集创建
引言在
pyg
的torch_geometric.datasets的包中,已经包含许多常见的数据集,但是针对的自己的需求去构建或者引用其他的一些数据集的时候,我们需要在
pyg
提供的函数的基础上进行数据的规范化
weixin_39793105
·
2022-12-08 19:55
yelp数据集
PyG
教程(4):自定义数据集
一.前言在
PyG
中,除了直接使用它自带的benchmark数据集外,用户还可以自定义数据集,其方式与Pytorch类似,需要继承数据集类。
斯曦巍峨
·
2022-12-08 19:24
图神经网络框架
人工智能
GNN
深度学习
PyG
中的数据集Cora等
https://blog.csdn.net/weixin_34570232/article/details/114452066数据集PyTorchGeometric已经包含有很多常见的基准数据集,包括:Cora:一个根据科学论文之间相互引用关系而构建的Graph数据集合,论文分为7类:Genetic_Algorithms,Neural_Networks,Probabilistic_Methods,
糖醋鸡翅不加醋
·
2022-12-08 19:24
图神经网络
深度学习
自然语言处理
知识图谱
PyG
学习 - Dataset, DataLoader, Tranforms
目录自定义DatasetDataLoaderTransforms复制自:图神经网络PyTorchGeometric入门教程-掘金
PyG
的Dataset继承自torch.utils.data.Dataset
无脑敲代码,bug漫天飞
·
2022-12-08 19:23
编程
GNN
深度学习
python
【
PyG
】创建自己的数据集-图神经网络
即使
PyG
已经包含了很多数据集,但是如果大家想使用自己的或非公开数据集,还是需要实现自己的dataset。
c橘子
·
2022-12-08 19:23
图神经网络
神经网络
pytorch
深度学习
人工智能
在
PyG
上构建自己的数据集
PyG
构建自己数据集
PyG
简介
PyG
(PyTorchGeometric)是一个建立在PyTorch基础上的库,用于轻松编写和训练图神经网络(GNN),用于与结构化数据相关的广泛应用。
为援不可图
·
2022-12-08 19:52
技术之路
Torch
PyG
PyG
创建数据集
PyG
创建数据集使用自己的数据集,通过
PyG
封装的库来转变为Pytorch的数据集文章目录
PyG
创建数据集前言一、封装的库二、创建内存数据集1.一个例子三、创建较大的数据集1.例子代码如下:四、总结1.
battle不停息
·
2022-12-08 19:52
PyG官方文档学习
神经网络
深度学习
pytorch
PyG
框架构建GCN、GAT、GraphSAGE模型
获取Cora数据集,查看训练、测试、验证集比例fromtorch_geometric.datasetsimportPlanetoid#'''#下载报错,将所有data文件下载到本地#https://github.com/kimiyoung/planetoid#将cora相关文件放入到raw文件中#'''dataset=Planetoid(root='./tmp/Cora',name='Cora
调包调参侠
·
2022-12-08 19:22
图神经网络论文阅读
深度学习
pytorch
人工智能
【Pygame实战】这游戏有毒,刷爆朋友圈:小编已与病毒版贪吃蛇大战了三百回合,最高分339?
之前也给大家写过几款蛇蛇大作战,也就是类似手机游戏的贪吃蛇游戏,大家还记得嘛❗❗不记得也没关系等下给大家拉出来回忆一下啦~(*^▽^*)项目2.7贪吃蛇小游戏
Pyg
顾木子吖
·
2022-12-08 17:56
python合集
程序员合集
Pygame合集
python
pygame
贪吃蛇游戏
游戏源码
开发语言
【GNN图神经网络】邻接矩阵转化coo格式的稀疏矩阵
刚开始学习图神经网络,在使用
PyG
框架编程的时候,有一件事很让我纠结:
PyG
要求输入的邻接矩阵X应该是稀疏矩阵的形式(edge_index),而不是我制作的NxN邻接矩阵形式。
Mr.zwX
·
2022-12-07 11:25
【图神经网络】Graph
Neural
Networks
【深度学习/神经网络】Deep
Learning
神经网络
矩阵
pytorch
解决
PyG
(PyTorch Geometric)库安装以及import时sklearn报错等问题
解决
PyG
(PyTorchGeometric)库安装以及import时sklearn报错等问题2021-3-26ByJunwuChenatCASIPE,Beijing1.安装pytorch由于我们组服务器的
ccjjww25
·
2022-12-06 08:41
deep
learning
linux
python
pytorch
深度学习
《Fast graph representation learning with PyTorch Geometric》阅读笔记【
PyG
-paper】
这篇文章是
PyG
的官方paper,里面提供了很多有价值的信息,在这里进行一下汇总和思考。
智慧的旋风
·
2022-12-06 06:32
论文和书籍阅读(GNN)
深度学习
PyG
PyTorch
Geometric
图神经网络
PyTorch & PyTorch Geometric图神经网络(GNN)实战
://www.360doc.com/content/19/0601/13/7673502_839610173.shtmlhttp://www.jintiankansha.me/t/OsNpfQP895
PyG
法相
·
2022-12-06 06:32
深度学习
PyTorch
PyTorch
Geometric
图神经网络
GNN
实战
图神经网络库(PyTorch geometric:
PYG
)安装
一、
PYG
简介PyTorchGeometric是Pytorch的图深度学习扩展库。
PYG
包含已公开发表的论文中关于在图和非规则结构上进行深度学习的各种方法。
很爱吃土豆
·
2022-12-06 06:58
PyG
(PyTorch Geometric) Dropbox系图数据集无法下载的解决方案(AMiner, DBLP, IMDB, LastFM)(持续更新ing...)
诸神缄默不语-个人CSDN博文目录本文主要关注
PyG
官方提供的数据集中,因为数据下载源是Dropbox,所以不能直接下载的解决方案。
诸神缄默不语
·
2022-12-06 06:25
人工智能学习笔记
GNN
PyG
Dropbox
AMiner
图神经网络
RuntimeError: CUDA error: device-side assert triggered
诸神缄默不语-个人CSDN博文目录我在运行
PyG
和transformers代码时两次遇到了这一问题,在此加以记录。
诸神缄默不语
·
2022-12-06 06:55
人工智能学习笔记
RuntimeError
cuda
PyG
PyTorch
bug
PyG
(PyTorch Geometric) 异质图神经网络HGNN
诸神缄默不语-个人CSDN博文目录PyTorchGeometric(
PyG
)包文档与官方代码示例学习笔记(持续更新ing…)本文介绍使用
PyG
实现异质图神经网络(HGNN)的相关操作。
诸神缄默不语
·
2022-12-06 06:52
人工智能学习笔记
HGNN
图神经网络
异质图神经网络
PyG
异质图
ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement torch-scatter==2.0.4+cu100
cu100torch-scatter、torch-cluster等等,通用,打开torch_geometric的文档torch_geometric官网pipinstalltorch-scatter-fhttps://data.
pyg
.org
_syntax_error_
·
2022-12-03 07:27
pytorch
深度学习
神经网络
图神经网络
pyg
,使用Cora数据集
关于Cora数据集的手动导入问题,见博客https://blog.csdn.net/qq_42969578/article/details/121450994?spm=1001.2014.3001.5501关于Core数据集的一些问题importosos.environ["CUDA_DEVICE_ORDER"]="PCI_BUS_ID"#导入数据集fromtorch_geometric.datas
fVector
·
2022-12-03 05:03
图神经网络
神经网络
深度学习
【
PyG
】图神经网络GCN代码自学
本文考虑了一个具有分层传播规则的多层图卷积网络(GCN),图卷积网络(GCN)是一个对图数据进行操作的神经网络架构,它非常强大,即使是随机初始化的两层GCN也可以生成图网络中节点的有用特征表示。本文引用参考GCN原作者论文及代码,供自学自用,原作者github网址如下:https://github.com/tkipf/pygcn论文原图及核心公式Datacora.cites如下图所示:conten
双子syl
·
2022-12-03 05:02
GNN
神经网络
深度学习
python
【
PyG
】图神经网络GAT代码自学
图方法分为谱方法和空间方法,空间方法是直接在图上进行操作,代表方法之一GAT;谱方法是将图映射到谱域上,例如拉普拉斯矩阵经过特征分解得到的空间,代表方法之一是GCN。本文介绍GAT的代码实现。本文参考论文原作者代码https://github.com/PetarV-/GAT论文原图与核心公式utils相关代码分析见之前写的GCN那篇博客https://blog.csdn.net/qq_428590
双子syl
·
2022-12-03 05:02
GNN
神经网络
pytorch
深度学习
PyG
异质图神经网络NotImplementedError问题
诸神缄默不语-个人CSDN博文目录以
PyG
官方的数据集和示例代码来复现一下这个问题:importtorchimporttorch_geometric.transformsasTfromtorch_geometric.datasetsimportOGB_MAGfromtorch_geometric.nnimportSAGEConv
诸神缄默不语
·
2022-12-03 05:59
人工智能学习笔记
PyG
图神经网络
异质图
NotImplementedE
bug
基于
PyG
Temporal的DCRNN(扩散卷积递归神经网络)代码实现
论文名称:DiffusionConvolutionalRecurrentNeuralNetwork:Data-DrivenTrafficForecasting论文下载:https://arxiv.org/abs/1707.01926论文解读:论文翻译。由于我们这里主要进行论文代码的展示,论文的解读就不进行详细的讲解。代码PyGTemporal中提供了大量已经编译好的图卷积递归神经网络模型,DCRN
m0_53961910
·
2022-12-03 05:29
图神经网络
神经网络
pytorch
深度学习
rnn
GCN 图神经网络介绍 可视化 Pytorch
本内容介绍一些关于通过基于PyTorch几何(
PyG
)库的图神经网络对图进行深度学习的基本概念。PyTorchgeometry是流行的深度学习框架PyTorch的扩展库
LZZ and MYY
·
2022-12-02 15:52
GCN
神经网络
可视化
深度学习
gcn
python
【
PyG
】简介 - 图神经网络
最近在学习图神经网络相关的知识,发现主要使用的库有两个:dgl和
pyg
,但是
pyg
的资料是英文的,而且网上资料也比较少,就翻译一下分享。
c橘子
·
2022-12-02 12:34
图神经网络
神经网络
机器学习
python
pytorch
深度学习
模型跑不通,师姐帮改记录
文件位置:F:\anaconda\envs\
pyG
\Lib\site-packages\torch_scatter\scatter.py更改27,29行中变量数据类型更改前:importimportlibimportos.pathasospfromtypingimportOptional
仙女笔记
·
2022-12-01 19:02
仙女日记
python
python
深度学习
开发语言
开源python-向
pyg
学习
transformers学习开源python-向timm学习开源python-向tensorflow-addons学习开源python-向mmdetection学习开源python-向tytorch学习开源python-向
pyg
YueTann
·
2022-12-01 02:05
python
学习
开发语言
Python——报错解决:error: command ‘:/usr/local/cuda-11.2/bin/nvcc‘ failed: No such file or directory
直接如下命令安装报错:pipinstalltorch-scattertorch-sparsetorch-clustertorch-spline-convtorch-geometric-fhttps://data.
pyg
.org
Irving.Gao
·
2022-11-30 08:41
python
Linux
python
PyTorch Geometric(
PyG
)+Cuda+Pytorch安装与使用
问题主要是各个版本之间的对应问题,这里以cuda11.3,Pytorch11.2进行说明安装Cuda地址:https://developer.nvidia.com/cuda-toolkit-archive选择11.3.0下载安装。安装python3.7condainstallpython=3.7安装Pytorch网址:https://pytorch.org/get-started/locally/
摩天崖FuJunWANG
·
2022-11-29 14:57
算法
python
工具使用
pytorch
深度学习
python
【Pytorch Geometric学习】 Message Passing 函数解析
在此处介绍
pyg
的消息传递方式。 图中的卷积计算通常被称为邻域聚合或者消息传递(neighborhoodaggregationormessagepas
一穷二白到年薪百万
·
2022-11-29 14:27
#
图机器学习
Pytorch
geometric
PyTorch Geometric的Mini-batches
官方文档链接文章目录加载ENZYMES数据集batch取出单个数据`ptr`属性`batch`属性`batch`是怎么区分数据包括哪些的PyTorchGeometric(
PYG
)-实现小批量data类中
F_aF_a
·
2022-11-29 14:26
Python
#
图神经网络
【Python】吊打pyecharts,又一超级棒的开源可视化库
这个开源项目就是:
PyG
2Plot。
风度78
·
2022-11-28 15:56
人工智能
python
java
编程语言
js
【
PyG
】pytorch和torch_geometric离线安装教程
1、首先要安装pytorch,有两类cpu版本和cuda版本,我通过pip下载的是cpu版本。进入python交互环境,通过以下代码获得torch版本importtorchprint(torch.__version__)#注意是双下划线比如我的就是1.8.1+cpu2、下载四个轮子https://pytorch-geometric.com/whl/进入该网址,根据torch版本和python版本和
JENCY_PAN
·
2022-11-26 19:47
pytorch
深度学习
python
RuntimeError: indices should be either on cpu or on the same device as the indexed tensor (cpu)
解决的办法最终解决的办法是conda此时的环境复制一份,在复制的环境上将torch和
pyg
降级。
Chemist_Dong
·
2022-11-26 01:33
pytorch
python
深度学习
神经网络
图论
CS224W课程笔记 第一章 Introduction: Machine Learning with Graphs
ApplicationsofGraphMLChoiceofGraphRepresentation1.CourseLogisticsGraphRepresentationLearningBook课程推荐的参考书Tools(工具):PyTorchGeometric(
PyG
Temple_of_light
·
2022-11-25 16:10
GNN
python
人工智能
机器学习
深度学习
神经网络
GC-LSTM原理+代码(下)代码部分基于
PyG
Temporal
上一篇文章GC-LSTM原理部分中具体介绍了GC-LSTM的原理,这里基于PyGTemporal中的GCLSTM模块对实现一个基于GC-LSTM的预测模型。注:这里可以是流量预测等各种节点特征。一、数据预处理这里图拓扑的结构和邻接矩阵如图所示,:节点特征矩阵,这里只展示了其中一个节点的特征向量随时间的变化,只选取了一个指标即:接下来我们需要对数据进行预处理,具体过程如代码所示:defclean_t
m0_53961910
·
2022-11-24 21:30
图神经网络
lstm
深度学习
pytorch_geometric(
pyg
)复现T-GCN
前言上一篇文章从
pyg
提供的基本工具出发,介绍了
pyg
。但是大家用三方库,一般是将其作为积木来构建一个比较大的模型,把它用在自己的数据集上,而不是满足于跑跑demo里的简单模型和标准数据集。
卡拉叽里呱啦
·
2022-11-24 20:48
在深度学习的海洋里
pytorch
深度学习
pyg
GNN
PyG
教程1:数据的介绍
1.图的创建数据描述的是同构图的数据,可以用于节点,边预和图属性的关系。classData(x:Optional[Tensor]=None,edge_index:Optional[Tensor]=None,edge_attr:Optional[Tensor]=None,y:Optional[Tensor]=None,pos:Optional[Tensor]=None,**kwargs)属性介绍:d
yihanyifan
·
2022-11-24 17:42
论文研读
深度学习
pytorch
人工智能
从一组给定位置的点集构建图并生成Data类数据
PyG
、networkx
Pytorch_geometric、networkx从一组给定位置的点集构建图并生成Data类数据从一组给定位置的点集构建图并生成Data类数据
PyG
、networkx本文的目的是根据已知位置的点数据构建图
xttttt想吃排骨
·
2022-11-24 17:41
算法
python
图论
networkx 标签_在PyTorch框架下使用
PyG
和networkx对Graph进行可视化
简介:本文介绍如何将PytorchGeometric运行过程中得到的data或者tensor转换成networkx可以处理的格式,进行可视化。其中Pytorchgeometric的地址为PyTorchGeometricDocumentationpytorch-geometric.readthedocs.io方法一根据networkx的文档draw_networkx-NetworkX1.10docu
weixin_39566882
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2022-11-24 17:10
networkx
标签
利用
PyG
实现图池化minCUT Pool(图分类任务)
文章目录图池化论文介绍技术原理SpectralClusteringwithGNNs基于
PyG
实现图池化minCUTPool导入需要的包数据集导入和处理***模型搭建***模型训练函数模型测试函数模型训练与测试图池化在我的理解
Coconut Shao
·
2022-11-24 17:36
图神经网络
图分类
分类
机器学习
聚类
神经网络
深度学习
PyG
教程(2):图数据
一.概述
PyG
是面向图数据的,它同时支持同构图(homogeneousgraphs)和异构图(heterogeneous)。同构图指只包含一种类型的节点和边的图(下图左)。
斯曦巍峨
·
2022-11-24 17:35
图神经网络框架
深度学习
GNN
人工智能
学习官方
PyG
文档
文章目录前言一、
PyG
安装二、
PyG
快速入门(理解)1.
PyG
的主要功能:图形的数据处理如何将数据转化为图数据?
battle不停息
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2022-11-24 17:33
机器学习
深度学习
pytorch
pyg
的COLAB NOTEBOOKS1.Introduction: Hands-on Graph Neural Networks
原文链接:(需要梯子)https://colab.research.google.com/drive/1h3-vJGRVloF5zStxL5I0rSy4ZUPNsjy8?usp=sharing&pli=1#scrollTo=AkQAVluLuxT_可视化代码#Installrequiredpackages.importosimporttorchos.environ['TORCH']=torch._
苦逼学习pytorch中
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2022-11-24 17:03
pytorch学习
python
深度学习
开发语言
简单图论与
PyG
环境配置
一、简单图论图的表示图用节点表示实体(entities),用边表示实体间的关系(relations)通过邻接矩阵来构造图在无向图中,从结点viv_ivi到vjv_jvj的边存在,意味着从结点vjv_jvj到viv_ivi的边也存在。因而无向图的邻接矩阵是对称的。在无权图中,各条边的权重被认为是等价的,即认为各条边的权重为1对于有权图,其对应的邻接矩阵通常被记为W∈{0,1}N∗NW\in\{0,1
happiless
·
2022-11-24 17:02
AI
深度学习
图神经网络
图论
pytorch
神经网络
PyG
笔记
1.如果把
pyg
转换成networkx时选择转换成无向图(to_undirected=True),则
pyg
的每一组edge_index一定要先写index小的node,再写index大的node,否则该条边会被直接忽略掉
cunane
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2022-11-24 17:31
python
python
深度学习
机器学习
【
PyG
】与networkx的图转换
在使用图神经网络的过程中,往往需要使用到相关的GNN库,而在这些GNN库中,一款比较高效热门的图神经网络库是PyTorch中的
PyG
库。
zz.YE
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2022-11-24 17:00
PyG
深度学习
神经网络
人工智能
python
PyG
|邻接矩阵转为coo_matrix格式
在使用
PyG
框架的时候,
PyG
要求输入的是edge_index格式,而不是我们所使用的邻接矩阵格式,即NxN。
xiao黄
·
2022-11-24 17:00
图神经网络
深度学习
复杂网络
pytorch
深度学习
机器学习
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