illumina测序

隐马尔可夫模型（HMM）

隐马尔可夫模型（HiddenMarkovModel，HMM）描述由隐藏的马尔可夫链随机生成观测序列的过程，属于生成模型。
轩儿毛肚·2023-01-02 16:32

9--序列模型

9.1.1自回归模型第一种假设在xt只与它之前的个序列相关，即使用观测序列就能预测出xt的值，这样做的好处是保证了在t>τ时，参数的数量是固定的，这种模型被称
pepsi_w·2023-01-02 10:58

利用R实现乳腺癌样本的分子分型

乳腺癌的分子分型主要是从肿瘤样本的转录组测序数据出发，对肿瘤样本进行分类。目前
理生·2023-01-01 13:30

Science Advances：利用iSpatial对全基因组空间表达进行精确推断

基于FISH和原位测序的ST技术，如MERFISH、seqFISH、osm
wen05054105·2022-12-31 16:19

节后开课 | 转录组分析的正确姿势你了解了吗？

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典·2022-12-31 16:17

2021年最后一期 | 转录组分析的正确姿势你了解了吗？

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典·2022-12-31 16:17

生信入门转录组和可视化学习捷径

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典·2022-12-31 16:47

最后一周！导师推荐的转录组和可视化学习捷径

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典·2022-12-31 16:46

最后3天！生信入门转录组和可视化学习捷径

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典·2022-12-31 16:46

【毕设学习之转录组技术二：转录流程】

转录组分析转录组分析包括（湿）实验和干实验/数据分析湿实验（由于要用到试剂，所以称湿）主要包括实验设计，样本准备和处理，交给公司处理（包括提取rna,建库，测序）（相比实验室，测序公司能用更低的价格买到试剂
一生平安喜乐·2022-12-31 16:45

生信小白如何进行单基因的鉴定及功能分析

1、如果是测序得到的一段新的核酸序列（如果知道基因的CDS就省了看这一步）首先，我们需要预测该段核酸序列的ORF，可以用在线的网站NCBI（https://www.ncbi.nlm.nih.
生信漫谈·2022-12-30 22:32

为行业赋能 助力行业客户业务大放异彩

医疗与生命科学BristolMyersSquibb致力于利用数据洞察服务人类健康，例如通过单细胞测序新技术将海量数据存储和分析
ZN海景·2022-12-30 15:54

（Research）深度迁移学习使循环肿瘤细胞的病变追踪成为可能

单细胞测序技术，作为目前最强大的细胞表征鉴定技术，如果能够和CTC进行结合，那么就能够实现CTC溯源。本文基于回顾性研究设计了
TTS56·2022-12-30 12:34

没有网也可以安装 Conda 环境

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2022-12-30 09:47

深度学习入门（六十六）循环神经网络——束搜索

束搜索课件贪心搜索穷举搜索束搜索总结教材1贪心搜索2穷举搜索3束搜索4小结前言核心内容来自博客链接1博客连接2希望大家多多支持作者本文记录用，防止遗忘循环神经网络——束搜索课件贪心搜索在seq2seq中我们使用了贪心搜索来预测序列将当前时刻预测概率最大的词输出但贪心很可能不是最优的
澪mio·2022-12-30 08:22

16S全长测序解密转基因玉米根瘤菌群落组成

论文题目：Decipheringtherhizobacterialassemblagesundertheinfluenceofgeneticallyengineeredmaizecarryingmcrygenes期刊：EnvironmentalScienceandPollutionResearch研究背景玉米是我国的重要粮食作物，但虫害和草害一直是阻碍我国玉米丰收的两大绊脚石。本文的实验材料是携带
SHANGHAILINGEN·2022-12-30 04:16

送书 | 222Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述
生信宝典·2022-12-29 15:55

整合基因组学和蛋白质结构的致病机制分析

一般而言，大部分的文章仅仅局限于“样本-测序-信息分析-致病突变发现”之模式。
生信宝典·2022-12-29 15:25

关于RNA-seq 的那点事Count 数的标准化 （一) RPKM 和FPKM，TPM及C(R）PM

图片来自网络我们都知道，在RNAseq测序的过程中，我们测完序的最终目的是想根据测序的结果，最终分析得到差异基因以及潜在可能的功能分析，那么在进行差异分析以及对表达量进行分析的时候，对基因原始的Count
forever luckness·2022-12-29 15:52

ATAC-seq分析：数据介绍（2）

1.简介ATACseq(AssayforTransposase-AccessibleChromatinusingsequencing)使用转座酶在测序前有效地片段化可访问的DNA（DNA可极性）。
冷冻工厂·2022-12-29 13:51

2020.9.12丨变异检测的原理&应用方向

变异检测的原理&技术要点定义：变异检测是指通过测序技术对某一物种个体或群体的基因组进行测序及差异分析，获得单核苷酸多态性SNP）、插入缺失InDel）、结构变异（SV）、拷贝数变异CNV）等大量的遗传变异信息用于开发分子标记建立遗传多态性数据库
穆易青·2022-12-29 03:05

SNP注释神器——VEP（生信）

背景知识2.vep功能2.1可注释变异类型2.2注释结果信息2.3过滤筛选3.软件下载与安装3.1安装vep的方式4.vep的使用4.1.使用基本的参数进行测试4.2在docker下使用1.背景知识二代测序发现的变异数量是巨大的
小飞棍来喽~·2022-12-29 03:34

自学生物信息学（思维+超全常用网站）

一个基因或一种蛋白质1、在DNA水平上2、在转录层面3、在蛋白质水平上一组基因/蛋白质芯片高通量测序数一系列测序数据生物学问题一个基因或一种蛋白质1、在DNA水平上这个基因的基因组位置是什么？
小飞棍来喽~·2022-12-29 03:34

基因测序股贝康医疗在港交所上市；舜宇集团战略投资汽车芯片企业地平线 | 美通企业日报...

今日看点：港交所基因测序第一股贝康医疗上市。舜宇集团战略投资汽车智能芯片企业地平线。山东裕龙石化炼化一体化项目采用霍尼韦尔技术。特灵科技公布2020年第四季度和全年业绩。
美通社·2022-12-29 02:39

DNA测序技术发展史：一代、二代、三代测序技术简要原理及比较

一代、二代、三代测序技术简要原理及比较1.一代测序1.1Sanger测序2.二代测序2.1.IlluminaSolexa合成测序2.2.Roche454焦磷酸测序2.3.ABISOLiD连接法测序2.4
爱做饭的电饭煲·2022-12-28 20:13

Recurrent Neural Network - 从零开始实现循环神经网络(RNN循环神经网络)

隐状态是记录时间序列的参数，即上个时间的结果信息，有利于处理和预测序列数据。如股价预测、有逻辑的一段话等。所以也常应用于NLP领域。无隐状态的神经网
Gaolw1102·2022-12-27 22:01

链特异性测序的read depth绘制

以酿酒酵母为例，用到的数据如下，随便找一个链特异性测序的fastq用常见比对软件跑一下都行。
陈有朴·2022-12-27 20:40

条件随机场java实现_条件随机场 conditional random fields 及代码实现

它在观测序列的基础上对目标序列进行建模,重点解决序列化标注的问题条件随机场模型既具有判别式模型的优点,又具有产生式模型考虑到上下文标记间的转移概率,以序列化形式进行全局参数优化和解码的特点,解决了其他判别式模型
爱你不会累·2022-12-26 22:17

机器学习之概率图模型

文章目录0.背景介绍1.隐马尔科夫模型（HiddenMarkovModel,HMM）1.1.HMM的数学定义1.2.HMM的实际应用问题描述1.2.1.观测序列概率计算问题1.2.1.1.直接暴力计算法
lankuohsing·2022-12-26 22:05

5 印刷检测----halcon例程

系列文章目录1Halcon数据结构2一致性增强扩散3锯片检测4序列号读取5印刷检测序列号读取系列文章目录1应用背景2检测算法逻辑3Halcon例程代码4按照算法逻辑分析代码总结参考资料1应用背景  本次例程是检测继电器上的文字和电路图
Coldor·2022-12-26 17:39

4 序列号读取----halcon例程

系列文章目录1Halcon数据结构2一致性增强扩散3锯片检测4序列号读取5印刷检测序列号读取系列文章目录1应用背景2检测算法逻辑3Halcon例程代码4按照算法逻辑分析代码总结参考资料1应用背景  本次例程是读取
Coldor·2022-12-26 17:07

神经网络模型预测步骤_神经网络预测值范围

根据表2，预测序号15的跳高成绩。
阳阳2013哈哈·2022-12-26 12:00

r语言确定最优滞后阶数_R时间序列分析（7）平稳性、白噪声和自相关

之前，我们从数据探索的角度所讨论的时间序列，是按时间顺序排列的一个观测序列。从模型的角度，一个时间序列可以视为来自某个随机过程的一个样本，而随机过程是一个随机变量的序列。
weixin_39614060·2022-12-26 11:40

LncFinder | 非编码RNA的识别与分析神器！！！~

在我们完成测序后，一个很重要的步骤就是识别序列，本期我们介绍一个基于Loga
生信卷·2022-12-26 11:46

SuperSeries 超gse号geo下载并处理表达矩阵duqiang同一个gse数据集里存在不同的测序平台产生的数据 生信技能树——GEO芯片数据的合并 如何去除批次效应 rnaseq去除批次效应

GSE70867ThisSuperSeriesiscomposedofthefollowingSubSeries:Less…GSE70864BALcellgeneexpressionispredictiveofMortalityinIdiopathicPulmonaryFibrosisandenrichedforGenesofAirwayBasalCells(I)GSE70866BALcellge
YoungLeelight·2022-12-25 23:37

RNA-seq 详细教程：注释（15）

学习内容了解可用的基因组注释数据库和存储信息的不同类型比较和对比可用于基因组注释数据库的工具应用各种R包检索基因组注释基因组注释对二代测序结果的分析需要将基因、转录本、蛋白质等与功能或调控信息相关联。
冷冻工厂·2022-12-25 14:13

RNN（Recurrent Neural Networks 循环神经网络） 戳进来就赚到了！

RNNRNN是一种用来处理和预测序列数据的特殊的神经网络，这种神经网络的功能与人的思考习惯类似。RNN是为了**解
乔YI·2022-12-24 12:21

r语言和python的区别_生物医学绘图，Python 并不比R语言差

做过基因测序，尤其是做过RNAseq的同学都知道，R语言中有一款数据可视化神器ggplot2，其绘图功能强大，但它的缺陷是不能绘制3D图形，需要加载扩展包，很麻烦。
weixin_39958112·2022-12-24 08:07

多行业借助亚马逊云科技的新品解决挑战，驱动业务增长

医疗与生命科学BristolMyersSquibb致力于利用数据洞察服务人类健康，例如通过单细胞测序新技术将海量数据存储和分析
m0_75092401·2022-12-24 08:15

芯片数据分析笔记【02】 | 芯片数据库

NCBI的GEO，欧洲EMBL-EBI的ArrayExpress，日本DDBJ的GEA，不过这个GEA直接连接到ArrayExpress，还有TCGA数据库中也有大量肿瘤芯片数据，不要误以为TCGA全是测序数据
【云森】·2022-12-24 08:06

来自NCBI GEO原始数据上传的一个“bug”！

现在发文章，如果使用了测序，芯片等技术，杂志社一般会要求你将原始数据上传到公共数据库中，以保证数据的真实性和可重复性，常见的公共数据库有：NCBIGEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov
余丁，微生信·2022-12-24 08:06

geo差异表达分析_如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析

如何分析芯片数据我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而最近有一个学员在看生信技能树在腾讯课堂发布的课程GEO数据库表达芯片处理之
weixin_39727976·2022-12-24 08:06

HMM隐马尔科夫模型及MATLAB实现

隐马尔科夫模型文章目录隐马尔科夫模型前言一、定义二、三个基本问题1、观测序列概率2、模型参数学习3、预测（解码）问题三、三个问题的代码1、观测序列概率2、模型参数学习总结前言隐马尔科夫模型（HMM）是在马尔科夫链上的一个扩展
好奇小圈·2022-12-23 19:36

自然语言处理学习笔记-lecture3-隐马尔科夫模型

首先讲解了马尔科夫模型，之后讲述了马尔科夫模型的学习过程，之后深入到隐马尔可夫模型，涉及到观测序列概率的计算和在给定观测序列的情况下最可能的隐状态序列，最后给出了隐马尔可夫模型的学习马尔科夫模型状态集合
尔呦·2022-12-23 08:59

python处理数据之 --- 批量分割数据，并计算分割后的数据总数量，并将结果保存在新的CSV文件中

/illumina/protein/test.csv',encoding='utf-8')a
佛系盼毕业·2022-12-22 17:55

python数学建模--灰色预测

目录灰色预测一阶灰色方程GM(1,1)建模步骤应用及其求解步骤求级比一次累加序列求参数矩阵uuu时间响应式求预测序列模型检验实际值与预测值比较及可视化二阶灰色方程GM(2,1)灰色预测灰色预测模型是通过少量的
夺笋123·2022-12-22 14:18

单细胞测序分析-T细胞注释

T细胞注释PBMC中淋巴细胞约占70%-90%，在PBMC中占多数的淋巴细胞中，约70%-85%为CD3+T细胞（约占PBMC的比例为45%-70%），5%-20%为B细胞（约占PBMC比例的15%），5%-20%为NK细胞（约占PBMC比例的15%）T细胞因为成熟于胸腺而得名，主要功能为介导细胞免疫和调节机体的免疫应答，T细胞来源于骨髓干细胞（胚胎期来源于卵黄囊和胚肝），在胸腺中发育和分化。成熟
weixin_52505487·2022-12-22 11:29

fastq与fasta文件格式解析

fastq与fasta文件格式解析一、fasta格式二、fastq格式2.1格式说明2.2碱基质量计算2.3QualityScore简化三、二代测序的fastq文件格式介绍四、补充说明4.1illumina
中原H·2022-12-22 08:25

隐马尔可夫模型（HMM）——从理论证明、算法实现到实际应用

目录历史简述建模HMM一般表述观测序列生成机理经典问题一之前向算法经典问题二经典问题三之viterbi算法viterbi算法求解案例viterbi算法代码实现HMM模型应用历史简述对于马尔可夫链，比较多的说法是
leboop-L·2022-12-21 23:52

R语言中的时间序列分析模型：ARIMA-ARCH / GARCH模型分析股票价格|附代码数据

时间序列分析是统计学中的一个主要分支，主要侧重于分析数据集以研究数据的特征并提取有意义的统计信息来预测序列的未来值简介时序分析有两种方法，即频域和时域。
·2022-12-21 17:51
上一页 33 34 35 36 37 38 39 40 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他