rna聚类分析第4页

【卡梅德生物】如何制备纳米抗体?

纳米抗体的制备通常涉及到从动物源（如骆驼、羊驼）提取RNA或cDNA，然后通过分子生物学技术将其克隆并表达。

卡梅德生物·2024-01-20 12:37

数学建模学习笔记||绪论

目录比赛时间比赛结果公布时间题目分类奖项设置数学建模论文内容比赛流程建模过程数据处理插值拟合小波分析，聚类分析（高斯混合聚类，K-均值聚类）主成分分析，线性判别分析，保留局部投影等均值，方差分析，协方差分析等统计方法关联与分析灰色关联分析

展信佳：）·2024-01-20 00:41

【学习笔记】mark一篇推荐系统的文章

在做一道RNA中Dropout事件填充的建模题，里面要用到低秩矩阵的填充，基于矩阵分解的填充方法参考了推荐系统的相关算法。mark一篇推荐系统的文章基于矩阵分解的推荐算法

Jweeeeee·2024-01-19 23:53

2018年认证杯SPSSPRO杯数学建模A题(第二阶段)海豚与沙丁鱼全过程文档及程序

2018年认证杯SPSSPRO杯数学建模基于聚类分析的海豚捕食合作策略A题海豚与沙丁鱼原题再现：沙丁鱼以聚成大群的方式来对抗海豚的捕食。

数模竞赛Paid answer·2024-01-19 18:11

ceRNA：一种全新的基因表达调控模式

竞争性内源RNA（ceRNA）是近几年来备受学术界关注的对象，它代表了一种全新的基因表达调控模式，相比miRNA调控网络，ceRNA调控网络更为精细和复杂，涉及更多的RNA分子，包括mRNA、编码基因的假基因

Seurat_Satija·2024-01-19 08:51

不做WB或免疫组化，也能轻松完成蛋白验证 | 蛋白组数据库推荐

其利用转录组学和蛋白质组学技术，从RNA和蛋白水平研究人类不同组织和器官中的蛋白表达

尐尐呅·2024-01-19 00:30

新型冠状病毒

1.遗传物质：RNA2.作用特点：传染性强、致死率低3.必须寄生生活，无法独立生存。4.防护建议：病毒会从口、眼睛、鼻子等体内与外界相通的地方进入体内，建议出门戴口罩，不用手触碰眼睛。

希望珍贵·2024-01-19 00:03

结构变异SV分析(WGS/WES)和融合基因检测（RNA）

69种工具检测SV对比https://www.jianshu.com/p/85ff211b4b4ehttps://zhuanlan.zhihu.com/p/87408242?utm_campaign=rss&utm_medium=rss&utm_source=rss&utm_content=title最终决定使用wham和Manta组合，其实最优组合应该是wham，inGAP-SV组合或者inGA

wo_monic·2024-01-18 16:31

唾液 RNA 提取试剂提取后的 RNA 可用于核酸检测使用？

产品特点◎提取RNA纯度高，无抑制剂，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多；◎可用于唾液样本中RNA的提取，提取后的RNA可用于核酸检测使用；◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂

清风拂面vv·2024-01-18 15:19

纯生信分析套路甲基转移酶相关因子的预后分析

本文主要是基于TCGA数据和中国胶质瘤基因组图谱RNA测序数据集，通过一

音十千寻·2024-01-18 13:04

文献阅读：单细胞 RNA 测序揭示分子定义的肌间神经元类别的多样化

文献介绍「文献题目」Diversificationofmolecularlydefinedmyentericneuronclassesrevealedbysingle-cellRNAsequencing「研究团队」UlrikaMarklund（KarolinskaInstitutet）「发表时间」2020-12-07「发表期刊」NatureNeuroscience「影响因子」25.0「DOI」10

Tiger Z·2024-01-18 12:30

一文带你读懂单细胞测序

单细胞转录技术（scRNA-seq）非常适合研究样本中各个细胞基因表达的异质性，其经典流程：分离单细胞（核），将RNA转换为cDN

生信大碗·2024-01-18 00:53

2022-07-01

NatureCellBiology|活细胞动态RNA成像技术原创苏安图灵基因2022-07-0109:13发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：苏安IF：28.824推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文的作者带我们回顾了

图灵基因·2024-01-18 00:28

互联网方法论之十三——依靠广度感知细微变化

于是再往内在走，通过穿刺获得样本，分析那些核心部位的DNA和RNA分子，蛋白质分子。越往内在走，要求的

891e64c433d2·2024-01-16 20:18

易基因： RNA m7G甲基化修饰的生物学功能及其在癌症中的作用｜综述

m7G修饰是RNA转录后修饰之一，存在于许多不同类型的RNA中。通过对RNA中m7G修饰的准确鉴定，揭示了m7G在基因表达调控和不同生理功能中的作用。

易基因科技·2024-01-16 13:51

易基因： WGBS+RNA-seq揭示黄瓜作物的“源-库”关系受DNA甲基化调控｜项目文章

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。作物产量取决于库（sink，获得同化物）的潜力和源（source，供给同化物）的能力，“源—库”关系的优化对作物产量调控具有重要意义。黄瓜（CucumissativusL.）是世界范围内广泛种植的蔬菜，是我国具有巨大经济价值的七大蔬菜之一，叶片和速生果实属于黄瓜的“源”和“库”器官。黄瓜是典型的棉子糖家族系列寡糖(Raffinosefa

易基因科技·2024-01-16 13:46

外泌体多组学15-尿液外泌体sRNA建库优化-增加切胶回收扩增-比对率20%提升至33%

外泌体，40-130nm的膜衍生囊泡，已被鉴定为细胞间遗传物质交换和通信的新载体，包含各种核酸物种，包括mrna、小的非编码rna(sncRNAs)，特别是miRNAs。

_十三·2024-01-15 19:08

基础分子结构(1): exon, intron, CDS, ORF, 3',5'-UTR

换句话说，它主要聚焦于对DNA、RNA和蛋白质及它们之间的相互作用。分子生物学的基础知识对正确运用生物信息学工具有着举足轻重的作用。因此我想对其中重要的概念进行学习。

逐鸿·2024-01-15 17:57

如何鉴定数据的建库方式（链特异性或非链特异性）

所以在数据处理前明确其建库方式尤为重要什么是链特异性建库在RNA-Seq建库的时候，第一步都是进行RNA到cDNA的反转录，在反转录以后，普通的RNA-Seq就直接使用randomprimer进行第2条链合成

生信助手·2024-01-15 07:29

哺乳动物器官中基因表达水平的进化

在这里，为了了解哺乳动物转录组进化的动态，我们报道了来自10种主要哺乳动物谱系(胎盘类、有袋类和单孔类)和鸟类(进化外群)的6个器官的多聚腺苷化RNA的测序。我们发现，由于选择压力的

亦是旅人呐·2024-01-15 04:33

13.时间序列数据分析

www.jianshu.com/p/94520ce07c95转录组时间序列数据处理（软件中利用的一些模型和计算差异基因的方法）https://www.jianshu.com/p/468a8ff9c2eaMfuzz进行时序表达聚类分析

夏大希·2024-01-14 21:17

circNet:人类环状RNA数据库

circNet是一个环状RNA的数据库，不仅收录了cirRNA的基本信息，还提供了环状RNA在不同组织中的表达谱数据以及circRNA-miRNA-gene的ceRNA调控网络，网址如下http://syslab5

生信修炼手册·2024-01-14 19:38

RNA转染（entranster-R）与mir-155调节胶质瘤细胞增殖和侵袭研究

现分享一篇RNA转染（Entranster）与mir-155通过靶向FXO3

实验小助手·2024-01-14 16:30

RNA binding protein PCBP1 is an intracellular immune checkpoint for shaping T cell responses i...

在这里，我们发现RNA结合蛋白，聚(C)结合蛋白1(PCBP1)是一个细胞内免疫检查点，通过限制Teff细胞固有的Treg承诺程序的表达，在激活的T细胞中上调，以防止效应T(Teff)细胞转变为调节性T

一个没有感情的文献阅读机·2024-01-14 11:11

RNA-seq分析流程二：DEseq2做不同组间差异表达分析

使用DEseq2循环做多组间差异表达分析当有多组RNA-seq数据时，有时需要对多个组合进行差异表达分析，例如当我有CIM0/CIM7/CIM14/CIM28四组时，我需要得到每个组合间的差异表达情况，

纵纵纵小鸮·2024-01-14 06:51

机器学习---流形学习

1.流形学习作为机器学习研究的热点问题之一，流形学习是要从高维数据集中发现内在的低维流形，并基于低维流形来实现随后的各种机器学习任务，如模式识别，聚类分析。

三月七꧁ ꧂·2024-01-13 18:52

KMeans clustering如何验证K点最佳 - silhouette analysis

、TheElbowMethod二、DistortionScoreElbowforKMeansClustering三、silhouetteanalysis介绍：Silhouetteanalysis是一种聚类分析的方法

取名真难.·2024-01-13 18:42

模糊控制：MATLAB实现

基于模糊理论的广西城市的分类利用MATLAB的模糊聚类分析实现城市分类的智能计算文章简介：利用MATLAB的模糊聚类分析实现城市分类的智能计算，使用到了模糊控制算法，有兴趣的友友可以看看。

竹字头虫字底·2024-01-13 02:53

干扰RNA-基因沉默

干扰RNA进行基因沉默的原理和方法：越来越多的实验室利用siRNA敲低技术来评估细胞内蛋白质的功能。这项技术常被用于确定从细胞中去除蛋白质之后所产生的影响：是否导致细胞死亡？是否为致死敲除？

期待未来·2024-01-12 20:19

基于K-Means聚类算法与随机森林模型评估信贷风险客户【500010101】

项目背景本数据集来自一家德国银行，由加州大学霍夫曼教授于2016年收集整理，每条记录代表了一个接受银行信贷的客户，这也就说明了，这些客户都是通过了贷款申请的，通过可视化分析对数据进行初步探索，并利用聚类分析将客户分为不同的风险群体

神仙别闹·2024-01-12 15:47

叶酸怎样吃才科学合理

叶酸能维持细胞遗传基因，调节细胞分裂，合成DHA、RNA等胎儿发育必不可缺的物质。早期胚胎发育过程中，存在着快速的细胞分裂和生长过程，对叶酸的需求增加。叶酸怎么“工作”？叶酸在

欧贝尔曼·2024-01-12 13:36

觉得RNA研究太普通了？来探索一下增强子吧！

Comprehensivelandscapeofepigenetic-dysregulatedlncRNAsrevealsaprofoundroleofenhancersincarcinogenesisinBCsubtypes表观遗传失调lncRNAs的综合景观揭示了增强子在BC亚型致癌中的深刻作用发表期刊：molthernucleicacids发表日期：2021Jan1影响因子：7.032DOI

生信学霸·2024-01-12 03:13

2021-09-08 批次TCGA（1）

样本过滤完后，质控先：样本过滤基因过滤过滤完后，做质控，有下面三个图箱线图，密度图PCA图层次聚类分析现在做完后，究竟是先标准化还是先去去除批次差异需要做批次矫正因为在不同样本中，有一些基因的表达量是恒定的

多去看看·2024-01-11 06:20

单细胞测序文献阅读及补充

Single-cellRNAsequencing:Technicaladvancementsandbiologicalapplications[1]Abstract：单个细胞是生物的基本构件，并且每个细胞都是唯一的，单细胞RNA

瞌睡斋主人·2024-01-11 06:33

2021-08-04 mRNA display

在体外利用T7RNA聚合酶将DNA转录成RNA，把RNA的3′端和带有嘌昤霉素的RNA

NAome·2024-01-11 05:18

生命的演化5——真核生物的繁荣

非细胞构成的生命即病毒，它只有一条DNA（或RNA）长链，外面包裹着一层蛋白质。因此，病毒既不能自己进行新陈代谢，也无法自我繁殖，它必须借助宿主的细胞来完成这些功能。

数元·2024-01-11 01:34

数模学习day11-系统聚类法

本文参考辽宁石油化工大学于晶贤教授的演示文档聚类分析之系统聚类法及其SPSS实现。

WenJGo·2024-01-10 23:50

昨天-今天-明天

图片发自App昨天是个好日子，转运RNA行使职权的好日子。这一天我一般都会从容不迫的淡定从容的打开“国库”，浏览一下一个月的收获，喜怒不显于色的进行着调拨工作。

栗栋炜·2024-01-10 13:20

R语言学习入门（一）

R语言是基于S语言的一种方言，它提供了广泛的统计和图形技术，包括线性和非线性建模、时间序列分析、分类和聚类分析、数据可视化等。R语言的特点包括易于使用、开源免费、拥有强大的图形能力和扩展性。

亦旧sea·2024-01-10 05:44

10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之图神经网络框架

单细胞RNA测

单细胞空间交响乐·2024-01-09 22:25

RNA-seq，Ribo-seq数据分析（上）

TheTomatoTranslationalLandscapeRevealedbyTranscriptomeAssemblyandRibosomeProfifiling根据文献，从GEO数据库下载原始测序文件，RNA-seq

1yon·2024-01-09 18:21

累计IF>5000 | m6A RNA甲基化文章2021上半年发表汇总

RNA甲基化作为近年的研究热点，为科研人员解读生物学问题提供了新的观察角度，其相关研究受到国自然科学基金的青睐，同时，文章成果频发。此前，我们分享了“研究思路”和“生信分析流程”等内容。

ee00dc6faab7·2024-01-08 21:37

RNA_seq:将修剪后的序列比对到参考基因组

比对参考基因组的2种软件：hisat2、subjunchisat2软件1、构建索引：官网下载：https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/manual.shtmlhisat2官网下载官方索引通过hisat2-build构建基因组索引：（不推荐）2、关于hisat2：Hisat2主要是用来进行转录组数据的比对。使用--help查看选项和参数hisat2主要参数：-x##索

javen_spring·2024-01-08 15:16

聚类分析模型

聚类面向的是未知的类别，是按照“距离”对已知数据直接分类。优缺点分析优点：算法简单，快捷。处理大数据集的效率较高。缺点必须先确定要生成的类别的数量。对选择的初值较为敏感。容易被噪声干扰。

爱静的龙猫·2024-01-08 11:30

使用DBscan算法进行密度聚类分析

使用DBscan算法进行密度聚类分析使用DBscan算法进行密度聚类分析算法原理Python实现算法特点应用案例结论使用DBscan算法进行密度聚类分析DBscan（Density-BasedSpatialClusteringofApplicationswithNoise

OverlordDuke·2024-01-08 06:14

深度解析基于模糊数学的C均值聚类算法

深度解析基于模糊数学的C均值聚类算法模糊C均值聚类(FCM)聚类步骤：FCMPython代码：模糊C均值聚类(FCM)在数据挖掘和聚类分析领域，C均值聚类是一种广泛应用的方法。

OverlordDuke·2024-01-08 06:13

氨基酸密码子表及偏好性（2022-05-03）

密码子（codon）是指信使RNA（mRNA）分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，代表某一种氨基酸的规律。信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。

会飞的老猫·2024-01-07 18:42

机器学习系列 - 9. 主成分分析法 PCA

也可以用来削减回归分析和聚类分析中变量的数目。1.2为什么要做主成分分析在很多场景中需要对多变量数据进行观测，在一定程度上

小蘑菇1962·2024-01-07 07:20

外泌体多组学07-骨髓肥大细胞来源外泌体lncRNA与miRNA的有效数据量

目前市面上有很多公司外泌体RNA测序推荐的数据量很少，为了合理评价一个合适的有说服力的有效数据量，我们对公开发表的相关外泌体文章和数据进行检索和信息收集，此次文章如下：文章信息文献标题：Characterizationofprotein

_十三·2024-01-07 05:24

真核原核生物常用的启动子分类

常见的真核和原核表达系统的启动子真核启动子编号启动子主要用途RNA转录本描述表达备注1CMV常规表达用m

巩翔宇Ibrahimovic·2024-01-07 00:18

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