rna聚类分析

细胞RNA提取的操作步骤

操作步骤（请自行准备无水乙醇、异丙醇、灭菌1.5mL离心管）：1.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：按终浓度30%比例加入无水乙醇，如7mL加入3mL无水乙醇；21mL加入9mL无水乙醇，充分混匀。b)洗涤液B：按终浓度70%比例加入无水乙醇，如3mL加入7mL无水乙醇；9mL加入21mL无水乙醇，充分混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀，可在37℃溶解，摇匀后使用。2.取1.5mL离心管，加入
清风拂面vv·2023-12-19 18:26

RNA剪接机制

根据中心法则，DNA编码的遗传信息被转录成RNA，然后翻译成蛋白质。在将初级mRNA翻译成蛋白质之前，必须先对其进行修饰和编辑。
阿尔法约塔·2023-12-19 16:54

《数量生态学：R语言的应用》—第四章聚类分析1 概述

数量生态学：R语言的应用—第四章聚类分析之前我们了解了关联测度与矩阵，主要是Q模式与R模式。从今天开始给大家带来《数量生态学：R语言的应用》—第四章聚类分析。
fafu生信小蘑菇·2023-12-19 10:09

RNA-seq数据如何做PCA

PCAworksbestwhentheinputdataisapproximatelynormallydistributedoneachdimension.Itwouldbeagoodideatodosomeinitialdataqualitycheckstoverifythatthisisthecase(andtransformthedataappropriatelyifnot),oratlea
OmicsAcademy·2023-12-19 08:49

体内内源基因调控之CRISPRi与CRISPRa

众所周知，CRISPR/Cas9系统可以用来操纵基因组：规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA（gRNA）的指引下，靶向基因组中的特定区域并切割DNA，产生DNA双链断裂
辛晓红·2023-12-19 04:19

聚类算法之K-均值聚类

于是，镇长决定采用聚类分析的方法来解决这个问题。他首先收集了每个商店的位置信息、营业额和经营类型等数据，然后运用K-均值聚类算法对商店进行聚类。
Uingll·2023-12-19 04:41

生信数据挖掘 单细胞测序

其收稿要求涵盖了癌基因的结构和功能的各个方面，尤其是:细胞癌基因及其激活机制，其编码蛋白的结构和功能，DNA和RNA的癌基因，肿瘤病毒，人类肿瘤的分子肿瘤学，肿瘤抑制基因，生长调控基因，细胞周期控制生长
概普生信·2023-12-18 10:06

2022-03-18

NatComm|非编码RNA参与DNA修复调控机制原创图灵基因图灵基因收录于话题#前沿分子生物学机制瑞典Karolinska研究所的研究人员发表了一篇论文，展示了某些RNA分子如何控制癌细胞中受损DNA
图灵基因·2023-12-17 21:52

血液微生物RNA提取注意事项

操作步骤（请自行准备无水乙醇、异丙醇和1.5mL灭菌RNase-free离心管）1.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：按终浓度30%比例加入无水乙醇，如7mL加入3mL无水乙醇；21mL加入9mL无水乙醇，充分混匀。b)洗涤液B：按终浓度70%比例加入无水乙醇，如3mL加入7mL无水乙醇；9mL加入21mL无水乙醇，充分混匀。2.取1.5mLRNase-free灭菌离心管，加入200μL血液样
清风拂面vv·2023-12-17 19:58

Nat. Mach. Intell. | 通过深度神经网络联合建模多个切片来构建一个三维全生物体空间图谱

通过联合建模多个切片并将其与单细胞RNA测序数据整合，S
DrugAI·2023-12-17 19:06

石蜡包埋组织RNA提取步骤有哪些？

操作步骤：1.请自行准备：无水乙醇、异丙醇、灭菌双蒸水、二甲苯及1.5mL离心管。2.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：按终浓度30%的比例加入无水乙醇，如7mL加入3mL无水乙醇，14mL加入6mL无水乙醇，充分混匀。b)洗涤液B：按终浓度70%的比例加入无水乙醇，如3mL加入7mL无水乙醇；6mL加入14mL无水乙醇，充分混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀，可在37℃溶解，摇匀后使用。3.
清风拂面vv·2023-12-17 18:00

聚类分析实例

K-MEANS算法基本概念工作流程K-Means算法实例K值对结果的影响DBSCAN算法算法步骤基本步骤工作流程参数选择层次聚类概述层次聚类（HierarchicalClustering）是一种无监督学习的聚类分析方法
llovew.·2023-12-17 06:45

逆转录酶性质 – 六个关键注意事项

DNA聚合酶活性RNaseH活性热稳定性持续合成能力保真度末端核苷酸转移酶（TdT）活性逆转录酶是从RNA模板合成互补DNA（cDNA）链过程中的必需试剂。
evolisgreat·2023-12-17 00:17

派森诺转录+代谢组联合分析，4.599分的项目文章

文章题目：MetabolomeandTranscriptomeAnalysisofLiverandOocytesofSchizothoraxo’connoriRaisedinCaptivity技术手段：RNA-seq
felix108·2023-12-16 23:08

我的数据仓库与数据挖掘期末大作业重置版

JupyterNotebook的预设定调整MatPlotLib和Pandas的输出设置任务1：预测问题数据的保存和读取数据的分析和预处理模型的选择和构建线性回归一元多项式回归拟合预测拟合优度的评估任务2：聚类分析问题数据的保存和读取数据的分析和预处理聚类的实现聚类结果有效性评估任务
BOXonline1396529·2023-12-16 17:05

2021-11-17

CanRes|抑制前列腺肿瘤的RNA分子原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制尽管许多前列腺癌患者接受了阻断促进肿瘤生长的激素的治疗，但大多数患者对这些治疗产生了耐药性。
图灵基因·2023-12-16 16:34

[源码和文档分享]python数据分析（6）——挖掘建模（1）分类与预测

经过数据探索与数据预处理，得到了可以直接建模的数据.根据挖掘目标与数据形式可以建立分类与预测、聚类分析、关联规则、时序模式和偏差检测等模型。
ggdd5151·2023-12-16 09:29

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十三讲-相关分析（含Matlab代码）

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十三讲-相关分析（含Matlab代码）基本概念典型相关分析综合评价模型对应分析因子分析聚类分析习题10.41.题目要求2.解题过程3.程序习题10.51.题目要求
zhushatong·2023-12-16 05:53

CeRNA才是人生赢家，一篇著名的赤果果的文(tao)献(lu)

首先肯定要先搞清楚ceRNA是个啥，英文名competingendogenousRNAs，咱给翻译成——竞争性内源RNA。
医科研·2023-12-15 19:06

实验1：总RNA的提取——Trizol

实验一：细胞中总RNA的提取及鉴定一、目的：掌握Trizol提取总RNA的原理和步骤，学习电泳鉴定总RNA的方法。二、原理：RNA是核酸，具有较好的水溶性。
猪莎爱学习·2023-12-15 14:47

JupyterHub 如何切换 conda 小环境

然后安装conda，方法请见Q4，在conda中创建小环境（这里示例rna），并且安装ipykernel# conda 创建 小环境conda  creat
生信小博士·2023-12-15 04:40

尿液RNA提取产率高吗？

产品特点◎提取RNA纯度高，无抑制剂，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多；◎提取纯化的RNA应用范围广，可应用于Northern杂交、RT-PCR、RealTimeRT-PCR
清风拂面vv·2023-12-15 03:55

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十二讲-因子分析、判别分析（含Matlab代码）

程序4.结果习题10.6（1）1.题目要求2.解题过程——对应分析3.程序4.结果习题10.6（2）1.题目要求2.解题过程——R型因子分析3.程序4.结果习题10.6（3）1.题目要求2.解题过程——聚类分析
zhushatong·2023-12-15 03:00

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十一讲-因子分析、聚类与主成分（含Matlab代码）

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十一讲-因子分析、聚类与主成分（含Matlab代码）基本概念聚类分析Q型聚类分析R型聚类分析主成分分析因子分析习题10.11.题目要求2.解题过程3.程序4.结果习题
zhushatong·2023-12-15 03:59

数学建模算法

算法部分1.评价类模型2.TOPSIS3.线性规划4.聚类分析5.预测模型6.拉伊达准则(对异常值进行剔除)7.数据拟合8.图论代码练习1.模拟圆周率2.斐波那契数列3.四只鸭子落在一个圆中概率4.方程
`流年づ·2023-12-14 23:02

机器学习---微博聚类案例

1、微博聚类分析要实现广告的精准投放，需要使用聚类找出兴趣一致的用户群体，这样就需要对用户进行聚类找出行为一致的用户，当对所有用户完成聚类之后，再使用关键词分析找出每个聚类群体中的用户的讨论主题，如果主题符合广告内容或者和广告内容相关
30岁老阿姨·2023-12-14 22:40

【生信分析】基因组学导论

祝我成功目标：通过一周的学习能对对不同高通量测序数据集（RNA-seq、ChIP-seq、BS-seq和多组学集成）进行分析。配置环境if(!
大桃子技术·2023-12-06 21:11

AGNES层次聚类

AGNES（AgglomerativeNesting）算法是一种层次聚类算法，它属于聚类分析中的一种。该算法通过不断地将最相似的数据
微笑伴你而行·2023-12-06 19:17

RT-PCR、QPCR、Real-time PCR、real-time RT-PCR你真的区分的开吗？

在RT-PCR中，一条RNA链被逆转录成为互补DNA，再以此为模板通过PCR进行
喵喵456·2023-12-06 12:27

2022-09-08

淋巴结靶向递送mRNA癌症疫苗引发强烈的CD8+T细胞反应原创图灵基因图灵基因2022-09-0810:48发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制mRNA技术，特别是癌症疫苗的体内应用面临的挑战仍然是将信使RNA
图灵基因·2023-12-06 12:08

Nature子刊综述帮你总结知识点：癌症中的RNA，每个都是研究热点

RNA对基因表达至关重要，无论是以蛋白编码RNA（mRNAs）的形式，还是以参与和调节转录的非编码RNA形式（lncRNAs或snRNA）、剪接（snRNAs）和翻译（核糖体RNAs、tRNAs和microRNAs
尐尐呅·2023-12-06 07:10

python基因差异分析_差异表达基因的分析（2）

专题一给出了聚类分析的示例，本专题主要谈在表达谱芯片分析中如何利用Bioconductor鉴定差异表达基因。鉴定差异表达基因是表达谱芯片分析pipeline中必须的分析步骤。
weixin_39633113·2023-12-05 10:45

k中心点聚类算法伪代码_第十三篇：K-Means 聚类算法原理分析与代码实现

现实中的聚类分析问题-总统大选假设M国又开始全民选举总统了，目前Mr
杨姓美少年·2023-12-05 05:03

【单细胞】scRNA-seq VS snRNA-seq

https://isbscience.org/about/what-is-systems-biology/单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的飞速发展使人们对组织中细胞种类、细胞的特殊状态有了深入认识
jjjscuedu·2023-12-04 19:44

Analysis of single cell RNA-seq data 学习笔记(六)

这一节，我们介绍一下单细胞生物学分析的内容PCA#加载包library(pcaMethods)library(pcaReduce)library(SC3)library(scater)library(SingleCellExperiment)library(pheatmap)library(mclust)#读取数据deng<-readRDS("deng/deng-reads.rds")接下来，我们
小潤澤·2023-12-04 18:04

利用Biopython来进行序列比对

序列比对一般针对的是两条或者多条序列，可以是DNA、RNA或者蛋白序列，来推测序列间的区域的相似度。
生信阿拉丁·2023-12-04 13:09

生信流程1 - Nanopore 三代测序生信分析流程简介

Nanopore三代测序技术可以用于研究与DNA、RNA和蛋白质相关的各种科学问题。
生信与遗传解读·2023-12-04 06:18

巜吃的营养科学观》第8天

三、叶酸是身体细胞繁殖和产生遗传物质RNA和DNA所必需的。没有叶酸，身体也就无法生长，甚至是头发、精子或指甲也无法生长，身体出现疾病后也无法康复。
贝美康读书会吴老师·2023-12-03 23:59

2018-11-09

能量泵满的时刻1.针对老师讲述的聚类分析能够比较快的理解并且联想到具体的应用。2.讨论问题的时候能够追根溯源，有意识的回答根本性的问题。
窝边的豆豆·2023-12-03 02:50

SAS聚类分析介绍

1聚类分析介绍1.1基本概念聚类就是一种寻找数据之间一种内在结构的技术。聚类把全体数据实例组织成一些相似组，而这些相似组被称作聚类。处于相同聚类中的数据实例彼此相同，处于不同聚类中的实例彼此不同。
TwcatL_tree·2023-12-02 21:23

RNAvelocity系列教程1：RNA速率简介及scVelo安装

(Nature,2018)引入了RNA速率的概念，利用新转录的未剪接的前体mRNA和成熟的剪接mRNA可以在常见的单细胞RNA-seq流程中区分的事实，可以恢复定向动态信息，前者可通过内含子的存在检测。
Seurat_Satija·2023-12-02 17:11

KDE指导聚类分析（一）噪声问题

作者在看文献[1]盛魁,马健.基于核密度估计的物联网聚类分析模型[J].控制工程,2018,25(06):1098-1102.DOI:10.14107/j.cnki.kzgc.170739.时发现了这句话
Joy T·2023-12-02 12:27

FlowJo软件的简单介绍 掌控流式细胞分析的科技巨匠 FlowJo10

数据分析：FlowJo10提供了多种强大的数据分析工具，如聚类分析、差异分析、细胞周期分析等，可以帮助用户深入挖掘流式细胞数据中的信息。可视化与图形生成：FlowJo10具有强大的可视
Someone_sky·2023-12-02 11:11

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其优缺点

K-均值聚类算法是一种常用于聚类分析的无监督学习算法。其基本思想是将数据集分成K个不同的簇，使得同一个簇内的数据点之间的距离尽可能小，不同簇之间的距离尽可能大。
小筱在线·2023-12-02 03:22

基于聚类模型的异常值仿真——MathorcupD题航空QAR数据分析实践

思考再三，笔者在本题中所使用的方法为聚类分析筛选异常值点。计算软件为Python。感觉做法还是存在很多问题，模型还是有很多漏洞。望读者大佬们提出建议，共同进步。
Dave-Yang·2023-12-02 02:02

处理ENCORI预测的miRNA-circRNA结果

前面给大家详细的介绍过ENCORI这个数据库，相信很多小伙伴也已经使用过这个工具了☞RNA相互作用神器——ENCORI☞starbase（ENCORI）数据库介绍（一）☞R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系
生信交流平台·2023-12-01 21:21

一文读懂LncRNA

RNA缩略词详解lncRNA：长链非编码RNA（longnon-codingRNA）miRNA：微小RNA（microRNA）circRNA：环状RNA（circularRNA）ncRNA：非编码RNA
Seurat_Satija·2023-12-01 19:31

PCR知识点小结

1.引物是DNA还是RNA?
雪切丝·2023-12-01 15:32

学习小组Day3笔记--小黑

链接清华源下载链接bash安装激活conda添加源查看软件image.pngimage.png能打开help即安装成功condaremove软件-ycondainfo--envs查看conda环境创建虚拟环境rna-seq
Great_6450·2023-12-01 11:48

聚类分析例题 （多元统计分析期末复习）

例一动态聚类，K-means法，随机选取凝聚点（题目直接给出）已知5个样品的观测值为：1，4，5，7，11。试用K均值法分为两类(凝聚点分别取1，4与1，11)解：以1，4为例STEP1确定凝聚点：X1和X5STEP2确定初始分类，G1(0){G_1^{(0)}}G1(0)={x1，x2，x3}，G2(0){G_2^{(0)}}G2(0)={x4，x5}STEP3重新计算各类的重心，以其作为新的凝
倒杯Whisky·2023-12-01 11:34
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