甲基化第2页

人和狗的年龄换算公式

超甜吖·2023-12-18 16:04

每周文献 2021-08-02

大家好，最近因为有需要了解甲基化作用，看到这篇文献，拿出来给大家分享一下，这是一篇关于揭示蛋白BANP与基因组的CGCG基序结合，从而激活必需基因表达的文章。

杨博士聊生信·2023-12-18 10:54

7+m6A+分型+实验，甲基化方向的生信思路，没有思路的同学可参考

今天给同学们分享一篇生信文章“Landscapeanalysisofm6Amodificationregulatorsrelatedbiologicalfunctionsandimmunecharacteristicsinmyastheniagravis”，这篇文章发表在JTranslMed期刊上，影响因子为7.4。结果解读：MG相关m6A修饰调控因子的鉴定在这项研究中，作者比较了MG样本和健康样

生信风暴·2023-12-16 14:36

BS-seq分析时候ViewBS可视化时候一定要加基因的方向

是一个很便捷的BS-seq数据可视化软件,在根据bw文件和指定的bed文件可视化时候，以前年少无知，老是bed文件只放三列，即image.png然后我在使用ViewBS进行可视化时候，命令如下,得到CHH甲基化的分布一直不对劲

热衷组培的二货潜·2023-12-15 02:37

不会做QTL分析，也能轻松找sQTL、eQTL、meQTL | 癌症研究数据库推荐

尐尐呅·2023-12-06 14:28

疯狂咖啡因 | 细数你身边那些随处可见的一勺致命物

如果你也对这些问题好奇请接着划滑猾磆螖……咖啡因的真面目咖啡因是一种植物生物碱，化学上称之为甲基化黄嘌呤(Xanthine)。

YulohEdu·2023-12-03 10:54

分子生物学习笔记（1）

基本概念学习及复习：DpnI酶:是一种限制性核酸酶，特异性切除甲基化的DNA链。被常常用于PCR后切除模板DNA。定点突变后，要区分原始DNA和突变DNA。

打工小博·2023-12-02 05:26

你知道鱼的记忆有多久么？……论记录这件小事

你是鱼的记忆么”“怎么讲”“鱼只有7秒的记忆”他说刚刚问我的事情，咋就忘了……我关注的是鱼有这么短的记忆么今天特别百度了一下，有些金鱼不但有1个月的记忆，甚至有一种鱼，叫斑马鱼，可以通过传递DNA甲基化来把记忆传递给后代

媛儿妙不可言·2023-12-01 15:13

甲基化-全基因组甲基化测序WGBS & RRBS

回顾表观基因组中5mC(DNA甲基化)概述：在甲基转移酶的作用下，DNA序列中的胞嘧啶(C)5`碳位结合一个甲基基团形成5`-甲基胞嘧啶的现象。

b2ad98a9e7bd·2023-11-30 08:43

6分SCI（医学类）-按这个思路很好发！

我们最近推出了一门重现6分医学文章分析内容的课程《TCGA-甲基化生存分析》，下面通过一篇6分SCI文章跟大家介绍一下该课程内容。

组学大讲堂·2023-11-30 00:50

RNA甲基化专题 | 癌症研究篇

m6ARNA甲基化是最常见、最丰富的真核生物mRNA转录后修饰。研究表明，m6A在不同组织，细胞系中是一个复杂的调控网路，m6ARNA甲基化参与RNA的代谢过程，并与肿瘤的发生和发展密切相关。

诺禾致源·2023-11-29 13:10

计算不同组别间差异甲基化位点和区域的R包—DSS

主要应用于BS-seq（亚硫酸氢盐测序）中计算不同组别间差异甲基化位点（DML）和差异甲基化区域（DMR）即CallDMLorDMR。

黄晶_id·2023-11-28 16:39

Chapter1-miRNA

miRNAturnoverfig1植物miRNA受HEN1催化的3'端2'-O-甲基化作用而免受降解。拟南芥中HEN1的缺失导致大多数miRNA的积累减少以及miRNA大小异质性。

阿花吖·2023-11-26 00:41

谈一谈今天使用ViewBS 和 deeptools的坑（二）

就ViewBS甲基化数据分析差别见BS-seq分析时候ViewBS可视化时候一定要加基因的方向就deeptools对ChIP-seq数据的可视化分析差别strand列放错了的图放对了的图这一放错就把H3K27me3

热衷组培的二货潜·2023-11-22 17:03

一篇综述读懂m6A甲基化+分型+免疫浸润+机器学习。快来get

结果解读：m6A甲基化调节

生信风暴·2023-11-16 03:42

ggThemeAssist｜鼠标调整主题，并返回代码

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析

生信宝典·2023-11-14 22:57

植物DNA甲基化专题 | nature：油棕Karma转座子表观遗传重要发现

关于植物DNA甲基化研究，此前已推出见刊于NAR的文章：拟南芥AtHDA6与着丝粒周围DNA甲基化关系研究。https://mp.weixin.qq.com/s?

易基因科技·2023-11-09 10:17

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画分组折线图展示甲基化水平

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一

小明的数据分析笔记本·2023-11-06 07:42

第三代测序技术在微生物研究中的应用

第三代测序技术是一种集高通量、快速度、长读长及低成本等多种优点于一身的新型测序技术，它的出现为基因组学、转录组学及DNA甲基化等研究

wangchuang2017·2023-11-04 09:02

生信交流平台·2023-11-03 11:40

NGS基础 - GTF/GFF文件格式解读和转换

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析

生信宝典·2023-11-03 04:45

WGBS vs RRBS

DNA甲基化分析是NGS技术中越来越广泛的一项应用。原因很简单:DNA甲基化是表观遗传修饰的主要机制之一，对基因表达和细胞活性有根本的影响。

生信start_site·2023-11-01 03:21

查询一个基因启动子区域的CpG岛

我们建议两种方法结合起来，用UCSC查询出某基因启动子区域所有的CpG岛，参考别人的研究，最终确定自己想要研究的甲基化位点。以EPB41L1为例，为大家展示一下获取基因启动子区

weixinsuoxian·2023-10-31 19:09

一些关于DNA甲基化修饰的图(一)

整理了单个基因的DNA甲基化探针的部分可视化分析图。

克里克的钟·2023-10-31 09:18

DNA甲基化数据分析(二)

它可以检测来自RNA-seq的差异表达基因（DEG），以及来自亚硫酸氢盐测序（BS-seq）的差异甲基化位点或区域（DML/DMR）。

杨博士聊生信·2023-10-30 10:21

corrplot展示m6a甲基化基因表达相关性

生信交流平台·2023-10-28 10:57

18-IF6+:纯生信分析甲基化和基因表达整合鉴定三阴性乳腺癌的预后标志物和药物靶标

一.研究背景三阴性乳腺癌(TNBC)临床预后差，而且临床上缺少有效的特异性生物标志物。此外，三阴性乳腺癌具有雌激素受体(ER)、黄体酮受体(PR)和表皮生长因子受体2(HER2)缺失的特点，这三种受体是基于激素的有效治疗的靶点。TNBC常发生于青年患者，它的侵袭性强，易复发、转移，预后差，具有基因易感性，如BRCA1的生殖系突变，被认为识TNBC的促进因素。临床上TNBC治疗进展缓慢，这正是由于缺

AAA肿瘤信息学王协·2023-10-26 04:24

Molecular Oncology|黑色素瘤免疫微环境+DNA甲基化

不知不觉小编的假期已经被延长到了四月，什么迎春花、丁香花、海棠花都陆陆续续的开了，却迟迟等不到复学的通知，小编真的是没想到自己竟然会有期待开学的那么一天(在家学习真的是太不方便、太考验定力啦)！有没有小伙伴一篇文章看了一周就只读了个摘要的，或者是课题卡在那进展不下去的，哈哈，那就赶快随小编来看一下这篇3月份发表在MolecularOncology(IF：5+)杂志上的文章吧，说不定会有收获吆！An

概普生信·2023-10-26 02:25

上海见 | 易基因科技与您相约2023年中国微生物学会学术年会

图片来源：中国微生物学会公众号易基因科技受邀参加会议，将携原核三代甲基化、原核转录组、宏病毒组、细菌ChIP-s

易基因科技·2023-10-25 10:03

易基因：WGBS等揭示植物基因体动态DNA甲基化与基因表达可塑性相关｜Genome Biol

在一些真核生物中，DNA甲基化发生在基因编码区，称为基因体甲基化(genebodymethylation，GbM)。

易基因科技·2023-10-25 10:33

生信分析＋实验验证探究m6A RNA甲基化调节因子与癌症转移的关系（IF10+）

Analysisandidentificationofm6ARNAmethylationregulatorsinmetastaticosteosarcoma转移性骨肉瘤中m6ARNA甲基化调节因子的分析和鉴定发表期刊

生信学霸·2023-10-24 15:27

DNA甲基化

DNA的甲基化是在DNA的序列不变的条件下，在其中某些碱基上加上甲基的这样一个过程。DNA甲基化的结果，一般是使甲基化位点的下游的基因表达量变少。

七白七白七七白·2023-10-23 13:54

细菌基因功能-大肠杆菌O157:H7

flis鞭毛虫生物合成蛋白flid鞭毛丝封盖蛋白motA运动蛋白AcheA趋化蛋白CheAcsgBcurlifimA1型鞭毛ppdD前纤毛虫型N端裂解/甲基化结构域含蛋白rpoS是定量感应系统中的一个调节因子在参与鞭毛合成的基因中

Ci女士爱吃芒果·2023-10-20 10:57

Bismark Bisulfite Mapper学习笔记（二）甲基化信息提取以及文件解读

(IV)Bismark甲基化提取Bismark附带一个补充的bismark_methylation_extractor脚本，它对Bismark结果文件进行操作，并对每个C进行提取甲基化call。

生信start_site·2023-10-18 11:54

衰老～《健康的真相》.6

一种对基因起作用的甲基化作用的化学反应会影响健康状态，2005年公布的西班牙国家肿瘤中心马里奥·佛拉加博士及其同事的研究成果首次从直观的物质层面上成功证实了这点。

715c6e6682d0·2023-10-18 09:31

全基因组甲基化分析-基本流程图

http://www.biomarker.com.cn/technology-services/methylation

桁_COLA·2023-10-17 17:08

易基因｜ONT：三代原核甲基化在痤疮杆菌噬菌体表观遗传印迹中的工程选择性研究

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。痤疮表皮杆菌（Cutibacteriumacnes，C.acnes）是一种革兰氏阳性细菌，是人类皮肤微生物组成员。尽管是最丰富的皮肤共生体，但某些成员与常见的炎症性疾病（如痤疮）有关。各种C.acnes分支的完整基因组序列可以鉴定推定的甲基转移酶，其中一些可能属于保护入侵DNA宿主的限制性修饰（restriction-modificat

易基因科技·2023-10-17 10:11

易基因：细菌微生物基因表达调控表观研究方案｜原核三代甲基化+转录组

1、原核甲基化原核生物中的DNA甲基化原核生物甲基化为什么基于三代测序？

易基因科技·2023-10-17 10:38

一文理清常见的基因富集分析

前言对于很多小伙伴来说，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，即在基因组层面可以算突变率差异，转录组层面可以算基因表达水平差异，表观组可以观察甲基化水平差异，蛋白质组/代谢组可以看蛋白/代谢物丰度差异，甚至是宏基因组也可以比较菌群的丰度

生信宝库·2023-10-16 13:51

14-IF8+:纯生信分析m6A基因与白血病预后的关系

一.研究背景近两年，科学家们首次发现了一种可逆性的RNA甲基化—m6A，m6A是真核生物mRNA中最常见的修饰[1]，m6A修饰能调控基因表达、蛋白质的转录和mRNA的可变剪切[2,3]。

AAA肿瘤信息学王协·2023-10-15 07:39

亚硫酸盐定序

亚硫酸盐定序用于测定甲基化及其位点。甲基化都发生了DNA链的C（胞嘧啶）碱基上。

yuzaifei11·2023-10-14 14:24

医学分析专业名词解释

甲基化：真核生物基因表达受多种机制、多层面的综合调控。基因的DNA序列不发生改变的情况下，基因的表达水平与功能发生改变，并可遗传现象，称为表观遗传(epigenetic)现象。

LazyHaokj·2023-10-14 11:27

易基因｜深度综述：RNA m5C修饰的生物学及在肿瘤发生和免疫治疗中的作用

BiomarkRes》杂志发表了题为“BiologicalrolesofRNAm5CmodificationanditsimplicationsinCancerimmunotherapy”的综述文章，综述了RNAm5C甲基化修饰的生物学作用及其在癌症免疫治疗中的潜在机制

易基因科技·2023-10-14 11:47

M6A rna甲基化最新研究成果进展、论文合集（2021年）

【1】M6ARNA甲基化介导的RMRP稳定性通过调控TGFBR1/SMAD2/SMAD3通路，导致非小细胞肺癌的增殖和进展2021-11-04报道，基于TheCancerGenomeAtlas数据库的综合分析

“泽平科技”公众号24h在线答疑·2023-10-14 11:16

5+甲基化+预后模型搭配实验

今天给同学们分享一篇甲基化+预后模型+实验的生信文章“Siximmune-relatedpromisingbiomarkersmaypromotehepatocellularcarcinomaprognosis

生信风暴·2023-10-14 11:16

童年时期的一些重大的创伤性记忆是否会影响成年

重大的创伤性事件可能会改变大脑神经元的基因表达，而改变后的基因表达（甲基化）可能陪伴个体非常长的时间，甚至终身。但是另外一方面，其实我们童年的记忆能力并不好。

庾信FINANCE·2023-10-13 07:00

二代测序文库构建-概述与挑战（1）

这些因素包括，DNA/RNA材料的定量和物理性质以及潜在应用（比如，基因组测序、靶向测序、RNA-seq、ChIP-seq、RIP-seq和甲基化），在制备高质量测序文库的内容中将提到。另

Juan_NF·2023-10-13 03:49

Topic 1. 临床标志物生信分析常规思路

顺便就整理了一些关于临床预测模型构建的方法，当然书籍和网络上也能获得这些资源，但是我们将结合TCGA和GEO等NGS的数据来讲解，比如我们在做多组学分析的分组差异之后，对筛选之后的差异突变基因，或者差异甲基化基因

桓峰基因·2023-10-11 13:03

2022-01-12 感受态细胞转化实验

转化过程所用的受体细胞一般是限制修饰系统缺陷的变异株，即不含限制性内切酶和甲基化酶的突变体(R-,M-)，它可以容忍外源DNA分子进入体内并稳定地遗传给后代。

黎洛007·2023-10-10 17:12

端粒/端粒酶生信切入点，6+端粒酶+泛癌+甲基化+实验。

今天给同学们分享一篇端粒酶+泛癌+甲基化+实验的生信文章“Genomic,epigenomic,andtranscriptomicsignaturesfortelomerasecomplexcomponents

生信风暴·2023-10-09 20:29

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