甲基化

易基因｜DNA甲基化揭示应激反应影响婴儿免疫相关基因的表观遗传调控机制 | 表观发育

易基因｜DNA甲基化揭示应激反应影响婴儿免疫相关基因的表观遗传调控机制|表观发育大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。
易基因科技·2022-12-17 07:41

在B站学习大名鼎鼎的StatQuest 系列统计和生信分析视频（中文字幕）- 也见证助理教授到创业者的华丽转身...

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析
生信宝典·2022-12-12 14:49

245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵

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生信宝典·2022-12-12 02:47

肿瘤纯度计算（InfiniumPurify基于甲基化）

概念来源肿瘤纯度（tumorpurity）指的是样本中肿瘤细胞占所有细胞的比例。原始文献Systematicpan-canceranalysisoftumourpurity为什么要用这个概念：因为取样过程很难保证取到的所有细胞都是肿瘤细胞，并且混杂的正常体细胞会对后续的分析产生影响（比如基因的表达水平），因此在生物信息学分析中最好计算肿瘤纯度并做相应的校正。InfiniumPurify基本情况In
生信小鹏·2022-12-09 21:43

一文掌握Conda软件安装：虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移

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生信宝典·2022-12-06 08:29

艾美捷双链RNA定量试剂盒试验方案

IgG2a-kappa/IgM-kappa克隆编号：J2/K2物种反应性：全体的艾美捷双链RNA定量试剂盒来源：本试剂盒中使用的两种dsRNA抗体如下：雌性DBA/2小鼠腹腔注射50ugL-dsRNA和75ug甲基化牛血
Sylvia_sc·2022-11-29 12:27

RNA-seq最强综述名词解释&思维导图|关于RNA-seq，你想知道的都在这（续）

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生信宝典·2022-11-28 04:28

一招解决Conda安装卡在solving environment这一步！

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生信宝典·2022-11-27 19:52

收藏|北大生信平台"单细胞分析、染色质分析"视频和PPT分享

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生信宝典·2022-11-26 13:41

单细胞测序原理10X UMI Barcode

目前，测序可以回答以下6类问题：DNA的序列：ATCG怎么排列，以及各序列的丰度；DNA的表观遗传修饰：比如甲基化、羟甲基化，以及组蛋白的各种修饰；RNA的序列：AUCG怎么排列
hs6605015·2022-11-25 15:06

MGF6mARice：利用分子图特征和残差块预测水稻DNAn6-甲基腺嘌呤位点

期刊：BriefingsinBioinformatics代码链接：https://github.com/zhlSunLab/MGF6mARice摘要DNAN6-甲基腺嘌呤(6mA)是由腺嘌呤的N6位置被甲基化产生的
HXH@·2022-11-25 09:33

利用m7Ghub数据库查询并使用iRNA-m7G软件预测RNA m7G修饰位点

什么是RNAm7G甲基化？m7GRNA甲基化是在甲基转移酶的作用下，在鸟嘌呤（G）第七位N上加上甲基的一种化学修饰。
余丁，微生信·2022-11-21 14:43

哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （六）

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析
生信宝典·2022-11-20 21:11

易基因技术推介｜m1A RNA甲基化测序（MeRIP-seq/m1A-seq）

m1ARNA修饰的检测，易基因采用基于抗体富集的甲基化RNA免疫沉淀测序方法（MeRIP-seq/m1
易基因科技·2022-11-19 11:57

易基因｜性别分化：DNA甲基化表观遗传调控性别表型可塑性，诱导斑马鱼性别比例失调

易基因｜性别分化：DNA甲基化表观遗传调控性别表型可塑性，诱导斑马鱼性别比例失调大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。
易基因科技·2022-11-19 11:56

易基因｜病毒抗性：全基因组DNA甲基化揭示草鱼年龄相关病毒易感性的表观遗传机制

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年06月02日，淡水生态与生物技术国家重点实验室（中国科学院水生生物研究所）何利波副研究员为第一作者和通讯作者，汪亚平研究员为共同通讯作者在《ImmunAgeing》杂志发表了题为“Genome-wideDNAmethylationrevealspotentialepigeneticmechanismofage-dependen
易基因科技·2022-11-19 11:56

易基因｜疾病研究：DNA甲基化与转录组分析联合揭示吸烟免疫相关疾病的表观遗传机制

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2021年12月09日，《ClinEpigenetics》杂志发表了题为“Genome-widemethylationandexpressionanalysesrevealtheepigeneticlandscapeofimmune-relateddiseasesfortobaccosmoking”的研究论文，该研究通过转录组测序（RN
易基因科技·2022-11-19 11:56

易基因｜动物发育：DNA甲基化组与转录组综合分析绒山羊胚胎期毛囊发育的调控机制

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。西北农林科技大学动物科技学院博士研究生王善禾和李芳为共同第一作者、王昕教授和榆林学院屈雷教授为共同通讯作者以“IntegrativeAnalysisofMethylomeandTranscriptomeRevealstheRegulatoryMechanismsofHairFollic”为题在《Cells》杂志上发表研究论文，通过全基因
易基因科技·2022-11-19 11:25

易基因｜DNA甲基化和单细胞RNA-seq联合揭示空气污染对复发性流产的表观遗传影响

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年08月23日，《ClinEpigenetics》杂志发表了题为“Integratedsingle-cellRNA-seqandDNAmethylationrevealtheeffectsofairpollutioninpatientswithrecurrentspontaneousabortion”的研究文章，该研究通过常规R
易基因科技·2022-11-19 11:25

易基因｜综合DNA甲基化测序揭示前列腺癌死亡率的预后表观遗传生物标志物 | 文献速递

Comprehensivemethylomesequencingrevealsprognosticepigeneticbiomarkersforprostatecancermortality”的研究文章，通过全基因组DNA甲基化测序技术
易基因科技·2022-11-19 11:55

易基因综述：表观遗传学和表观育种在作物品种改良的重要作用（水稻+玉米+番茄+大豆+油菜）

2022年8月15日，《FrontPlantSci》杂志发表了题为“Epigeneticsanditsroleineffectingagronomicaltraits”的综述文章，讨论了DNA甲基化、组蛋白修饰
易基因科技·2022-11-19 11:54

易基因｜典型案例：MeRIP-seq综合分析肺腺癌中的转录组m6A甲基化组

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年8月11日，南方科技大学王玉琨教授团队以“ComprehensiveAnalysisoftheTranscriptome-widem6AMethylomeinLungAdenocarcinomabyMeRIPSequencing”为题在《FrontiersinOncology》杂志上发表研究论文，通过MeRIP-seq和对应的
易基因科技·2022-11-19 11:54

易基因｜DNA甲基化和转录组联合揭示代际遗传对高龄产妇的影响 | 表观遗传研究

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年09月14日，北京大学第三医院妇产科生殖医学中心乔杰院士团队在《ClinTranslMed》杂志发表了题为“ThecombinationofDNAmethylomeandtranscriptomerevealedtheintergenerationalinheritanceontheinfluenceofadvancedmat
易基因科技·2022-11-19 11:24

易基因项目文章｜WGBS+RNA-seq揭示PM2.5引起男性生殖障碍的DNA甲基化调控机制

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年09月24日，陆军医科大学（第三军医大学）预防医学院毒理学研究所张中豪博士等为第一作者，曹佳教授、刘晋祎教授为通讯作者以"Genome-widealternationandeffectofDNAmethylationintheimpairmentsofsteroidogenesisandspermatogenesisafter
易基因科技·2022-11-19 11:24

易基因｜深度综述：表观遗传机制在慢性疼痛中的作用(DNA甲基化+组蛋白修饰+非编码RNA)

2022年8月22日，德国海德堡大学DanielaMauceri在《Cells》杂志发表了“RoleofEpigeneticMechanismsinChronicPain”的综述文章，讨论了DNA甲基化
易基因科技·2022-11-19 11:23

易基因｜ctDNA甲基化测序分析（ctDNA-WGBS）用于癌症检测和分子分型 | 精准医学

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。多项研究已证明，循环肿瘤DNA（circulatingtumorDNA，ctDNA）是癌症诊断和预后的潜在标志物。2022年08月23日，中国医学科学院北京协和医学院国家肿瘤中心吴志宏/佟仲生/赫捷/孙英丽团队在《ClinTranslMed》杂志发表了题为“Whole-genomebisulfitesequencinganalysiso
易基因科技·2022-11-19 11:23

易基因｜全基因组cfDNA甲基化分析提高了早期乳腺癌无创诊断成像的准确性

而携带DNA甲基化信息的游离DNA(cfDNA)已经成为一种非侵入性的癌症检测方法。在本文中，作者进行了一项前瞻
易基因科技·2022-11-19 11:53

易基因｜新品：新型肿瘤标志物检测利器——cfDNA甲基化测序（cfDNA-RBS）

ctDNA（CirculatingtumorDNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，ctDNA甲基化是重要的表观学修饰之一，可以在不改变基因序列的情况下，改变遗传表现，从而控制基因的表达。基因甲
易基因科技·2022-11-19 11:53

易基因｜疾病研究：DNA甲基化和转录组学特征在高浆卵巢癌复发和耐药过程中高度保守

易基因｜疾病研究：DNA甲基化和转录组学特征在高浆卵巢癌复发和耐药过程中高度保守大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。
易基因科技·2022-11-19 10:18

聚苯乙烯微球固载2,6-双(2-苯并咪唑)吡啶Fe(Ⅲ)配合物/哑铃形聚苯乙烯基CuBTC复合微球制备

聚苯乙烯微球固载2,6-双(2-苯并咪唑)吡啶Fe(Ⅲ)配合物的研究:2,6-双(2-苯并咪唑)吡啶(bbp)在氯甲基化交联聚苯乙烯(CPS)微球上进行烷基化反应制得CPS-bbp,然后与FeCl_3·
瑞禧生物小晓·2022-10-25 16:59

分子生物学知识点归纳

DNA的甲基化：DNA的一级结构中，有一些碱基可以通过加上一个甲基而被修饰，称为DNA的甲基化。甲基化修饰在原核生物DNA中多为对一些酶切位点的修饰，其作用是对自身DNA产生保护作用。真核生物中的D
Kyle942·2022-10-14 18:54

RNA m5C甲基化相关基因列表

前面小编给大家介绍过几个研究热点相关的基因集☞m6A甲基化相关基因集☞铁死亡相关基因集☞SCI文章中经常出现的免疫相关基因集☞科研新热点——血管生成相关基因☞自噬相关基因集合在上一期的内容里面，我们给大家简单的介绍了
生信交流平台·2022-10-04 19:29

单细胞文章专列——细胞图谱

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析
生信宝典·2022-10-01 19:21

论文解读:《EMDLP：RNA甲基化位点预测的合奏多尺度深度学习模型》

目录1.摘要2.背景3.数据集4.方法4.1特征提取4.2扩张的卷积神经网络(Dilatedconvolutionalneuralnetwork)4.3BidirectionalLSTM4.4SitepredictionbasedondilatedconvolutionalBidirectionalLSTM5.结果5.1Comparisonwithotherdifferentlearningmod
YZT8848·2022-08-08 18:04

跟随美国博导12年，我学到最深刻的不是科研，而是这个。。。

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生信宝典·2022-07-22 10:06

Nat.Rev.Genet丨十二位分子遗传学家万字长文，烛照遗传学和基因组学的未来

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生信宝典·2022-06-22 12:46

从DNA甲基化的角度为急性心梗的早期临床诊断和治疗靶点提供潜在的生物标志物

IntegrativeanalysisofDNAmethylationandgeneexpressionrevealskeymolecularsignaturesinacutemyocardialinfarctionDNA甲基化和基因表达的综合分析揭示了急性心肌梗塞的关键分子特征发表期刊
生信学霸·2022-06-20 09:34

卵巢癌的整合基因组分析

癌症基因组图谱项目分析了489例高级别浆液性卵巢腺癌的mRNA表达、microRNA表达、启动子甲基化和DNA拷贝数
亦是旅人呐·2022-05-10 16:59

Nature | DNA甲基化测序助力人多能干细胞向胚胎全能8细胞的人工诱导｜易基因项目文章

深圳市易基因科技有限公司运用简化基因组甲基化测序、单细胞和微量细胞基因组DNA甲基
深圳市易基因科技·2022-05-07 15:00

项目文章｜DNA(羟)甲基化研究揭示铁离子依赖表观调控促进狼疮致病性T细胞分化｜易基因

易基因（羟）甲基化DNA免疫共沉淀测序（h）MeDIP-seq研究成果见刊《JournalofClinicalInvestigation》2022年5月2日，中南大学湘雅二医院赵明教授团队、中国医学科学院皮肤病医院陆前进教授团队合作在
深圳市易基因科技·2022-05-07 15:00

Shiny做网站

把自己的数据做成网页版，既提升文章的可读性又方便交流下面这几个例子都挺好，尤其第一个R:Shiny|搭建单细胞数据分析云平台一个在线火山图的Shiny应用(转帖）Shiny和Plotly实现可交互DNA甲基化分析包
落寞的橙子·2022-04-23 10:01

放弃Venn-Upset-花瓣图，拥抱二分网络

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析
生信宝典·2022-04-17 07:48

放弃Venn-Upset-花瓣图，在线拥抱二分网络

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生信宝典·2022-04-17 07:48

HRD检测方法

HRD检测方法HRD主要病因有3种：①突变(包括胚系BRCA基因、胚系HR基因和体细胞HR基因)，②结构重排(LOH，杂合性丢失;TAI，端粒等位基因失平衡；LST，大片段迁移)，③表观遗传修饰(启动子甲基化
正在输入中…………·2022-04-15 07:04

一篇所有研究生都该读的好文：阳光温热 科研静好

（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析
生信宝典·2022-04-09 07:41

Wilson病患者的肝脏和血液中的表观基因组特征包括肝脏特异性增强子的高甲基化

本研究的目的是分析来自WD患者的肝脏和血液中全基因组水平的DNA甲基化改变，以研究与WD诊断和表型相关的表观基因组改变。
机器人会画画·2022-02-18 03:32

纯生信分析套路 胃肠道癌m6A研究

胃肠癌PI3K/Akt/mTOR信号通路中m6ARNA修饰调节的研究研究概述|腺苷(m6A)N6位点的甲基化是哺乳动物蛋白编码mRNA中最常见的RNA修饰，是一种具有多种重要生物学功能的可逆修饰。
概普生信·2022-02-17 04:08

m6A三大机制思路3 - 谁来调控甲基酶

m6A是N6-腺苷酸甲基化，当RNA分子发生甲基化后，m6A甲基化识别酶可以与RNA分子结合，调控RNA的稳定或者降解。RNA分子表达量升高与降低改变正常蛋白的表达量，影响功能。
纪伟讲测序·2022-02-17 02:20

自测数据发31分，真香！

作者对77例接受抗PD-1和抗CTLA-4治疗的晚期皮肤黑色素瘤患者的全基因组数据，转录组数据和甲基化数据进行分析。
概普生信·2022-02-16 11:27

m6A三大机制思路1 - 以甲基酶切入

m6A是N6-腺苷酸甲基化，当RNA分子发生甲基化后，m6A甲基化识别酶可以与RNA分子结合，调控RNA的稳定或者降解。RNA分子表达量升高与降低改变正常蛋白的表达量，影响功能。
纪伟讲测序·2022-02-12 18:01
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